gDNA 的数量和完整性SureSelectQXT WGS 方案需要高质量的 DNA 样品,以获得最佳性能和 gDNA 起始材料的精确定量结果。按照该方案使用配有 dsDNA BR 分析试剂盒的 Qubit 仪器进行系列定量分析。将相同的样品在 4200 TapeStation 系统和 NanoDrop 中均进行6次重复基因组 DNA ScreenTape 分析。图2显示了获自 4200 TapeStation 系统、Qubit 和 NanoDrop 的数据,说明了基因组 DNA ScreenTape 分析法适用于对 gDNA 起始材料进行定量分析。采用UV 光谱法测定 gDNA 所得的量常会过高,这是由于其他缓冲液成分在 UV 光谱中也可能有吸收[4]。此外,基因组 DNA ScreenTape 分析法可在同一 QC 步骤中客观评价样品完整性。样品完整性由 TapeStation 分析软件的 DNA 完整......阅读全文
近年来,新一代测序(NGS)技术的应用日益广泛。随着测序技术的不断改进,制备核酸和构建NGS文库的方法也在改进。对于各种文库制备方法,我们该如何选择?近日,美国斯克里普斯研究所的研究人员在《Biotechniques》上发表文章,比较了各种文库制备策略。 总的来说,在NGS分析之前,制备R
随着精准医学和个性化医疗从概念走向实践,从梦想走进现实,基因组学研究和基因检测技术也在不断走向高精尖,单细胞测序无疑已经成为基因组学前沿研究领域的“新宠”。 在第二十届全国临床肿瘤大会暨2017年CSCO学术年会上,BD作为全球二代测序配套设备和耗材的优质生产商,携其全新的“分子标签”核心技术
中华病理学杂志2017年3月第46卷第3期 近年二代基因测序(next-generation sequencing,NGS)技术快速发展,其应用已进展至临床检测,如遗传疾病、实体肿瘤、血液肿瘤、感染性疾病、人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前筛查等。国内外有关学会已出台相关共识与指南以推动其在临床
2016年度的基因组生物学技术进展大会(AGBT)于上周在美国奥兰多举行。Illumina的CEO Jay Flatley在大会上宣布了其半导体测序平台,即Firefly计划的更多细节。 Flatley表示,Firefly将打开新的市场,因为它是如此简单。最终目标是制成这样一种设备,输入的是
1.1.3.2 模板制备程序完全的体外大规模模板制备工作是达成高通量、低价格测序技术的前提。已广泛使用的乳液PCR扩增技术就是一种很好的方法。不过,由于很难在热循环测序反应中保证乳液微滴的稳定性,因此最开始实验的模板扩增方法是恒温扩增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助细菌的帮助就能扩增
摘要 本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完
本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完整性信息的可
本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完整性信息的可
随着十三五规划和国家健康2030纲要的陆续出台,我国政府也在不断加大对精准医疗的支持力度。P4 China国际精准医疗大会在十三五规划国家精准医疗计划开启元年隆重举办,旨在汇聚政、产、学、研、资各方力量,并将政策、监管、资本、技术、应用、商业整合在一个平台,进一步探讨从系统生物学研究、精准诊断的
如今,癌症研究人员的手头又有了一件让人激动不已的新工具:循环游离DNA(ccfDNA)——只需通过侵入性极小的液体活检即可采集得到。与从存档的FFPE肿瘤标本中采集的静态DNA相比,ccfDNA可提供原发和转移性肿瘤的实时突变信息。这将大大改善治疗决策和监控,对癌症及其他疾病的生物标志物的检测和
近年来,新一代测序(NGS)平台在甲基化研究中开始崭露头角。它们带来了非常灵敏的DNA甲基化图谱,以单分子分辨率覆盖整个CpG岛。然而,对于时下热门的5-hmC研究,似乎还缺乏专门的样品制备工具。为此,Zymo Research公司近日推出两款新的NGS文库制备试剂盒,适用于全基因组范围的5
在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上,PerkinElmer公司展示了一系列新产品,包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。 表观遗传学新品 表观遗传学生化工
上周,基因组生物学技术进展年会(AGBT) 在佛罗里达州马可岛举行,Thermo Fisher Scientific公司在会上发布了Ion Torrent测序技术的最新进展情况。 在周六召开的公司工作会议上,Ion Torrent 研发副总裁Allan Williams提前预告公司正在筹备Io
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligation
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat
对于新一代测序(NGS)而言,样品制备的重要性不言而喻。每次测序的成本可不低,若样品制备得不好,则实验就会彻底糊掉。在此,五位专家就如何改善NGS的样品制备过程,提出了他们的宝贵建议。 欧洲分子生物学实验室(EMBL)的技术人员Ferris Jung: 你需要密切留意起始材料的质量。无论样品
我们体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。近年来人们发现这些微生物对人体健康有着重要的影响,微生物组研究因此受到了极大的重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。 微生物组参与了许多重要的机体功能,比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。科学
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR
在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍
摘要本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完整性
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其专利核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其专利核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
【摘要】2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代测序
2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)样品要求: 5 μg of DNA,浓度≥300 ng/μL测序原理:焦磷酸测序在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它
摘要RNA 测序文库制备工作流程的成功与否在很大程度上取决于 RNA 起始材料的质量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法获得的 RNA 完整值当量 (RINe) 是一种评估标准 RNA 测序的样品完整性的可靠且可重现的指标。由于 RNA 降解以及样品体积有限,从福尔马
Eva Graf 安捷伦科技有限公司 Waldbronn, Germany 摘要 RNA 测序文库制备工作流程的成功与否在很大程度上取决于 RNA 起始材料的质量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法获得的 RNA 完整值当量 (RINe) 是一种评
检测一管血液或尿液,通过其中的标志物来帮助诊断或治疗疾病,这个新思路让人们激动不已。不过,尽管RNA测序(RNA-seq)越来越多地用于小片段RNA的分析,但文库制备方法的准确性和重复性还是存在问题。 密歇根大学的Muneesh Tewari教授认为:“不同的人采用不同的方法来测序小RNA,有
2018年9月8日,在华大基因集团19周年庆前夕,华大智造首次向业内公开华大智造测序仪文库构建核心序列,致敬华大基因集团。华大智造成立于2016年,一直致力于研发和生产基因测序设备。如行业内小伙伴们所知,华大智造已拥有四款高通量测序仪——BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末