计算机”课程“识别基因组调控区域
来自约翰霍普金斯大学的研究人员成功教会了计算机如何去识别用以调控基因活性的DNA序列的共同点，并利用这些共同点预测基因组中的其它调控区域，这种新工具能帮助科学家们更好地了解疾病风险和细胞发育。这些研究成果公布在Genome Research杂志是两篇论文中。 “我们的目的是分析调控信息如何加密的，并了解哪些序列变化会导致疾病风险，“约翰霍普金斯大学的分子和比较病理学副教授Andrew McCallion说，“我们给计算机加入了一些数据，‘教’它们区分不具有生物学价值，和具有生物学价值的数据，然后建立一套规则，让计算机分析新数据，基本上我们就是让计算机上了一次课。“ 这种先进的”机器学习“技术是由约翰霍普金斯大学医学院的生化工程助理教授Michael Beer，以及生物技术信息国家实验室的Ivan Ovcharenko联合研发出来的，他们最初是想为他们的计算机设置一种”训练集“(training s......阅读全文
计算机”课程“识别基因组调控区域
来自约翰霍普金斯大学的研究人员成功教会了计算机如何去识别用以调控基因活性的DNA序列的共同点，并利用这些共同点预测基因组中的其它调控区域，这种新工具能帮助科学家们更好地了解疾病风险和细胞发育。这些研究成果公布在Genome Research杂志是两篇论文中。 “我们的目的是分析调控信息
IBM超级计算机将投身肿瘤基因组研究
日前，IBM公司与纽约基因组研究中心(New York Genome Center;下简称NYGC)宣布建立伙伴关系，联手对沃森(Watson)——曾在智力竞赛节目《危险边缘》(Jeopardy)中夺魁的计算机—— 进行测试，看它能否对癌症患者的基因组进行筛选，并帮助医生挑选药
美国约翰霍普金斯大学开发出肿瘤“液体活检”新方法
肿瘤无创诊断技术，也即液体活检（liquid biopsies）的出现，标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。日前，来自美国约翰霍普金斯医院的团队在Nature发文，论文标题为“Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with
约翰·霍普金斯医学院院长：医生不会被机器取代
约翰·霍普金斯医学院院长Paul B. Rothman 前不久，以“未来医学教育展望”为主题 的第七届国际医学教育研讨会在北京举行。研讨会邀请了美国约翰·霍普金斯大学医学院、英国牛津大学、澳大利亚墨尔本医学院等国际知名医学院校主管医学教育的院长和教育专家，以及包括北京协和医学院在内的国内一流医学院
霍普金斯研究人员发现新的结肠直肠癌生物标记
约翰�霍普金斯医学院的研究人员发现了一种蛋白质，它与细胞增殖和新血管的形成相关，可以作为早期发现结肠直肠癌的标志物。TREATMENT WITH THE DRUG D-PDMP REDUCED BETA-1,4-GALT-V PROTEIN LEVEL IN HUMAN COLORECTAL C
约翰霍普金斯大学找到更好的阿兹海默症诊断工具
约翰•霍普金斯大学医学院的研究人员发现了新的放射性"示踪剂"分子，这些分子会绑定活体人脑中的tau蛋白缠结，并使其"发亮"。Tau蛋白与许多神经退行性疾病相关，包括阿尔茨海默症和其它相关的痴呆症。两项研究将同时刊登在12月出版的《核医学杂志》上，其中一项研究为"本月焦点文章"，它介绍了三种候选分
霍普金斯大学拉尔夫·赫鲁班：癌症的发生只是概率问题
癌症早期检测无疑是当今最热门的研究方向之一。借助人类基因组计划打下的基石，和对癌症中基因突变的相关研究，科学家终于即将实现这一伟大的目标。拉尔夫·赫鲁班 约翰·霍普金斯大学（Johns Hopkins University）多个跨学科团队联合开发的 CancerSEEK 就是这类测试之一。Ca
测序大拿指出广泛使用的人类基因组缺失3亿个DNA
在过去的17年间，全球大多数科学家们一直都以来自单个个体的基因组DNA信息集合，作为一种“基线”来比对遗传突变。 比如，人类基因组参考基因组：GRCh38就是来自定期更新的个体DNA序列。但是在一项最新研究中，约翰霍普金斯大学的科学家们发现，910名非洲人后裔的集体基因组中出现了很大一块的缺失
节能计算机获突破：更快自旋波催生新型计算机
世界各地的科学家正在努力寻找当前电子计算技术的替代方案，而磁学领域正在出现一种新的信息传输方式：磁介质中产生的波可代替电子交换用于传输，但迄今为止，计算速度仍太慢。奥地利维也纳大学科学家发现了一种新方法，能让自旋波变得更短且更快。该发现是迈向磁振子计算的重要一步，研究成果发表在最新的《科学进展》上。
蛋白质组的研究与发展
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组的研究进展
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组的研究进展介绍
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。 上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白
世界首台!我国量子计算机超越早期经典计算机
近日，中国科学技术大学潘建伟教授及其同事陆朝阳、朱晓波等，联合浙江大学王浩华教授研究组，成功构建了世界首台超越早期经典计算机的光量子计算机。中国科学院量子信息和量子科技创新研究院今日在上海举行新闻发布会，介绍了这一研究进展。“量子计算机在求解某类特定问题上具有巨大的优势。”中科院院士、中国科学技术大
量子计算机与超级计算机“协同学习”框架发布
记者13日从安徽省量子计算工程研究中心获悉，支持量子计算机和超级计算机“协同学习”的量子机器学习框架——VQNet2.0发布，该框架可与量子计算操作系统深度结合，支持同时调度量子和经典计算资源进行机器学习的训练与预测。 本次发布的量子机器学习框架由合肥本源量子计算科技有限责任公司开发。据安
量子计算机研制进展
本人在2010年就曾在科学网上介绍D-Wave量子计算机（D-Wave系统是量子计算吗？（100123））8年过去了，大公司都在量子计算领域进行探索。超级计算机按老路走下去，已经碰到瓶颈了，不能靠扎钱走下去了。而另一方面，计算机应用，譬如人工智能、大数据却叫得很响，这些应用的基础设备必须跟上。
计算机辅助精子分析
（一）计算机辅助精子分析概述 计算机辅助精子分析（CASA）是利用计算机视屏技术，通过一台与显微镜相连接的录像机，确定和跟踪个体精子细胞的活动和计算精子活动的一系列“运动学”参数。CASA对精液既可定量分析精子总数、活动力、活动率，又可分析精子运动速度和运动轨迹特征，所有参数均按WHO规定的标
－震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！
震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！ 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低，全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源，但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用，使得基因组数据面临很多问题。 近日，约翰霍
培养皿中生长的癌细胞在基因上与人类来源最不相似
为了找到或改进癌症的实验室研究模型，使之能更好地与活人身上发生的情况进行比较，科学家们报告说，他们开发了一种新的基于计算机的技术，表明培养皿中生长的人类癌细胞在基因上与人类来源最不相似。 他们说，这一发现应该有助于将更多的资源集中在癌症研究模型上，比如基因工程小鼠和被称为“类肿瘤tumor
Science医学：捕捉癌症的蛛丝马迹
约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家们在一项测试中将血液癌症DNA检测与基因组测序技术结合到一起，证实其可用于筛查癌症，监控癌症患者复发，以及寻找手术后的残留癌。 “这种方法利用了基因组测序能够检测血液中循环肿瘤DNA的能力,为我们提供了一种敏感的途径来检测和监控癌症，”约翰霍普金
计算机算法预测分子气味
这不是一件可被嗤之以鼻的事情。计算机破解了一道困扰化学家几个世纪的难题：从分子的结构预测它的味道。这一壮举或许使香水制造商和味道专家得以在试验和错误大大减少的情况下创造新产品。相关成果日前发表于生命科学预印本网站bioRxiv。和结果可通过分析光波长或声音被预测出来的视觉和听觉不同，人类的嗅觉一直很
无需电力，新型计算机“气动”
一种由玻璃和硅树脂制成的气动计算机利用压力替代电力编码数据。它可以使芯片大小的设备执行通常由实验室技术人员完成的程序。6月2日，相关论文发表于《科学进展》。几十年来，人们一直在追求更小、更便宜、更便携的芯片实验室设备，以替代用笨重的玻璃器皿手工进行常规生物化学实验。虽然一些生物化学实验已经小型化，包
中国从此“有了”计算机
■本报记者 甘晓 实习生 李贺代码0和1，是现代信息世界的源头。1958年8月1日，对于我国“二进制”时代来说，就是那个从“0”到“1”的起点。那一天，位于北京中关村的中国科学院计算技术研究所（以下简称计算所）的一间机房里，我国研制的第一台通用数字电子计算机“103机”以每秒30次的运算速度，成功完
酶标仪数据的计算机处理
摘要 目的 通过计算机串口接收酶标仪RS232接口输出的数据，并将其转变成实际的OD值，利用判读公式对OD值进行判读，最终与相应的病员资料挂接，存入数据库中，实现酶标仪数据的计算机管理。 方法 用Microsoft Visual FoxPro 6.0中文版(或Microsoft Visual
美生物学家首次人工合成出酵母菌染色体片断
据英国《新科学家》杂志网站9月15日（北京时间）报道，美国生物学家人工合成出两个染色体片断并将其放入一个活酵母菌体内，酵母菌仍能正常存活，未出现明显异常。科学家们计划在接下来的5年内用人造基因组取代酵母菌的所有基因组，让其进化出新菌株。 约翰霍普金斯大学医学院的生物学
美首次人工合成出酵母菌染色体片断
据英国《新科学家》杂志网站9月15日（北京时间）报道，美国生物学家人工合成出两个染色体片断并将其放入一个活酵母菌体内，酵母菌仍能正常存活，未出现明显异常。科学家们计划在接下来的5年内用人造基因组取代酵母菌的所有基因组，让其进化出新菌株。 约翰霍普金斯大学医学院的生物学家杰夫·
Science：第一个真核生物染色体合成
——这是合成生物学研究领域的一项重大进展 报道：由纽约大学Langone医学中心系统遗传学研究所主任Jef Boeke领导的一个国际研究小组宣布，他们已经合成了第一个酵母功能性染色体，这是合成生物学领域的一项重大进步。这一研究成果公布在3月27日Science杂志上
Science：第一个真核生物染色体合成
由纽约大学Langone医学中心系统遗传学研究所主任Jef Boeke领导的一个国际研究小组宣布，他们已经合成了第一个酵母功能性染色体，这是合成生物学领域的一项重大进步。这一研究成果公布在3月27日Science杂志上。 在过去的五年中，科学家们已经完成了细菌染色体和病毒DNA的构建
科学怪人直击衰老奥秘－寻找长寿基因
报道：美国J. Craig Venter研究所的Craig Venter博士是科学界里一位著名的生物学家与企业家。由于其在人造人，以及对基因研究等方面的偏执热爱，因此被戏称为“科学怪人(Bad boy of Science)”。 3月4日Venter博士宣布建立一家新公司：Hum
全基因组测序助推常规巴氏检测法敏锐诊断肿瘤
来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家们开发了一种测试方法，利用常规巴氏检测（Pap test）获得的宫颈分泌物来检测卵巢癌及子宫内膜癌。在一项初步研究中，研究人员采用这种命名为“PapGene”的测试方法，依靠全基因组测序癌症特异性突变，检测出了全部24个子宫内膜癌，以及22个卵巢癌其中
量子计算机或能创造全新物质
科技日报讯 （记者刘霞）据英国《新科学家》杂志网站9日报道，英国科学家发表最新研究称，他们可以调整量子计算机内量子比特之间的相互作用，这意味着量子计算机可以创造出拥有新奇特性的物质新结构，揭示超导性等物质特性。 研究人员表示，大多数固体材料由原子或分子组成的，这些原子或分子受到来自其“邻居