Nature|张祯威等人揭示Prp5校对早期剪接体的分子机制
内含子 (intron) 是基因中非编码的区域。在转录过程中,DNA上的内含子会被保留在pre-mRNA中。因此在mRNA离开细胞核被翻译之前,内含子会被剪除,而编码蛋白质的区域外显子 (exon) 会被拼接起来。这个过程称为pre-mRNA剪接。pre-mRNA剪接是由一个被称为剪接体 (spliceosome) 的高度复杂的巨大核糖核蛋白 (RNP) 复合体负责。剪接体由5个核内小分子核糖核蛋白 (snRNP): U1 snRNP, U2 snRNP, U4/U6.U5 tri-snRNP和其他非snRNP蛋白质组成。剪接体通过识别内含子上的5端剪接位点 (5’ splice site, 5’SS)、3端剪接位点 (3’ splice site, 3’SS) 以及分枝位点 (branch site,BS) 来确保正确的剪接【1】。 剪接位点识别主要是在早期剪接体组装过程中完成的。简单地说,在早期剪接体组装过程中,U1 ......阅读全文
割裂基因的基本信息介绍
真核生物的基因组十分复杂,DNA的含量也比原核生物的大得多。噬菌体由于基因组很小,但又要编码一些必不可少的蛋白,碱基显然不够用,这样不仅几乎所有的碱基都参加编码,而且在进化中还出现了“重叠基因”,以有限的基因编码更多的遗传信息。真核基因组正好相反,DNA十分富余,这样不仅无需“重叠基因”,而且很
关于I型内含子的基本信息介绍
一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。此类内含子转录后可以形成9个由碱基配对形成的特定二级结构,分别命名为P1至P9,P1和P7是保守的。 I型内含子具有自我剪接的功能,在剪接反应中,要有一种鸟嘌呤核苷(含有游离的3'-OH)G-OH。G首先结合到内含子的5'
关于外显子基因识别的基本介绍
许多基因中遗传上的“无义”片段——即内含子,会妨碍基因指导蛋白质的合成。现在,一篇发表于3月11日期的《自然遗传学》杂志上的文章提出了基因识别这些内含子的新机制。 细胞产生一种蛋白质时,首先需要将编码蛋白质的基因转化成RNA分子,接下来,通过细胞的剪接机制除去有潜在破坏作用的内含子,再把基因序
关于Ⅱ型内含子的基本信息介绍
同I型内含子类似,是一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质(自剪接)。 Ⅱ型内含子是主要存在于线粒体中的一类内含子,它的剪接位点类似于核编码结构基因的内含子,并同样遵从GU-AG规律。剪接机理同核内含子的剪接相似,也
内含子的重要功能:帮助酵母应对压力下的生存
内含子(intron)的存在,是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中,需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说,内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长,并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂,由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准,移码错位一个碱基都会导
什么是内含子的归巢?
内含子的归巢intron homing 在I类II类的某些内含子中含有开放阅读框,可产生具有三种功能的蛋白。这些蛋白可使内含子(或以其原来的DNA形式,或作为RNA的DNA拷贝)移动(mobile),使内含子可插到一个新的靶位点,这个现象叫做归巢(homing)I组和II组内含子分布很广。
分子遗传学词汇内含子
断裂基因的非编码序列,在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。中文名称:内含子英文名称:Intron;Intervening r
内含子归巢的功能简介
在这些内含子的开放续框中编码具有三种功能的蛋白,这些蛋白与DNA或RNA的代谢有关。 (1)核酸内切酶:在DNA的靶位点剪切,使内含子得以插入; (2)反转录酶:涉及将内含子RNA变成DNA拷贝; (3)成熟酶:从前体的RNA中切掉内含子的部分。
病毒基因组的结构特点介绍
1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此
SOX1基因的结构特点和主要功能
这个无内含子的基因编码一个SOX(SRY相关HMG-box)转录因子家族的成员,该家族参与胚胎发育的调控和细胞命运的决定编码的蛋白质在与其他蛋白质形成蛋白质复合物后可作为转录激活剂在小鼠中,一种类似的蛋白质调节γ-晶体蛋白基因,对晶状体发育至关重要。
卵白蛋白结构的相关介绍
卵白蛋白是一种磷糖球蛋白, 等电点为4.5, 由385个氨基酸组成, 分子量为44.5 ku, 包含约3%的糖基组分。卵白蛋白分子不耐酶解, 用链霉蛋白酶水解其晶体, 可以生成5个含天冬酰胺糖基的组分。 卵白蛋白基因家族及其结构已基本上被人们所了解, 其基因长为7 564 bp, 编码1 87
非编码RNA在调节压力恢复过程中具有微调基因表达的作用
在最近一项研究中,科学家发现非编码RNA在调节压力恢复过程中具有微调基因表达的作用。 当细胞暴露于热或化学胁迫下时,就会形成称为细胞核应激体的细胞器。根据研究人员发表在《EMBO》杂志上的结果,当条件恢复正常时,细胞器会促进称为“内含子(intron)”的RNA片段的保留。 这很重要,因为内
关于内含子归巢的相关解释
在两个亲本任何一个都可发生突变而抑制以上的归巢。突变的结果使杂交后代中出现了正常分离,即ω+和ω-的后代中出现了正常分离,即ω+和ω-的后代数相等。这种突变表明了这个过程的性质。在ω+的品系中突变发生在紧靠着内含子将要插入的位点。在ω+品系中突变发生在内含子的开放读框中,从而阻止了蛋白质的合成。
成熟酶的基本信息
中文名称成熟酶英文名称maturase定 义由内含子所编码的蛋白质因子。与内含子RNA结合使之折叠成有催化活性的结构,从而促进RNA剪接。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
什么是成熟酶?
中文名称成熟酶英文名称maturase定 义由内含子所编码的蛋白质因子。与内含子RNA结合使之折叠成有催化活性的结构,从而促进RNA剪接。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
SOX14基因的结构特点和主要功能
这个无内含子的基因编码一个SOX(SRY相关HMG-box)转录因子家族的成员,该家族参与胚胎发育的调控和细胞命运的决定编码的蛋白质在与其他蛋白质形成蛋白质复合物后可作为转录调节因子。该基因突变可能与眼睑裂、上睑下垂、内眦赘皮综合征(bpes)和mobius综合征有关。
PNAS破解新物种进化的难题
经过将近5000亿次的尝试,美国德克萨斯大学(UT)奥斯汀分校的研究人员,见证了一个罕见的事件,也许解决了一个进化的难题:内含子——位于基因中的非编码DNA序列,在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上,解决了关于新物种进化的基本问题,并可以增进我们对于“基因表达以及癌
抗Sm抗体测定的介绍
在抗核抗体的靶抗原中,Sm抗原、RNP、SS-A、SS-B、Scl-70等10余种核抗原可用等渗盐水自核中提取,故过去将它们统称为可提取性核抗原(extractable nuclear antigen,ENA)。Sm抗原-抗体系统是1966年陈永铭在一SLE患者身上发现的第一个非组蛋白核蛋白抗原
两篇Nature发现内含子的新作用:帮助细胞应对压力
一直以来,科学家们对许多真核蛋白编码基因中散布的没有明显生物学功能的非编码DNA片段到底起什么作用感到困惑。这些被称为内含子的序列通常在转录和翻译的时候,从它们的原始序列剪接出来并在蛋白质产生之前迅速被破坏。 1月16日Nature杂志上发表的两项最新研究意外发现了内含子的新作用(至少在酵母中
HSPA1B基因的结构特点及主要作用
这个无内含子的基因编码一个70kDa热休克蛋白,它是热休克蛋白70家族的一员。与其他热休克蛋白相比,这种蛋白质稳定现有的蛋白质,防止聚集,并介导了新转化的蛋白质在细胞质和细胞器中的折叠。它还通过与富含au元素的rna结合蛋白1的相互作用参与泛素蛋白酶体途径。该基因位于主要的组织相容性复合物iii类区
基因的分类及对应基因编码蛋白质的作用
把基因区分为结构基因和调节基因是着眼于这些基因所编码的蛋白质的作用:凡是编码酶蛋白、血红蛋白、胶原蛋白或晶体蛋白等蛋白质的基因都称为结构基因;凡是编码阻遏或激活结构基因转录的蛋白质的基因都称为调节基因。但是从基因的原初功能这一角度来看,它们都是编码蛋白质。根据原初功能(即基因的产物)基因可分为:①编
NRG1基因编码蛋白质的结构和作用
该基因编码的蛋白质是一种膜糖蛋白,可调节细胞信号传导,并在多器官系统的生长和发育中起到关键作用。通过选择性启动子的使用和剪接,该基因产生了一种不同亚型的特殊变体。这些亚型以组织特异性的方式表达,在结构上有显著差异,分为I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。这种基因的失调与癌症、精神分裂症和双
年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日(北京时间)报道,耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示,一种复杂的RNA(核糖核酸)与蛋白质共同作用,在蛋白质的帮助下能经过整形,重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化,在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档,辅助自己完成功能使命。这项研
《自然》:年轻蛋白质让核糖核酸展现活力
据美国物理学家组织网10月14日(北京时间)报道,耶鲁大学和韦恩州立大学的科学研究显示,一种复杂的RNA(核糖核酸)与蛋白质共同作用,在蛋白质的帮助下能经过整形,重新塑造成合适的形状。这些存在已久的古老RNA通过不断进化,在年轻的蛋白质中寻找合适的搭档,辅助自己完成功能使命。这项
SOX4基因的结构特点和主要功能
这个无内含子的基因编码一个SOX(SRY相关HMG-box)转录因子家族的成员,该家族参与胚胎发育的调控和细胞命运的决定编码的蛋白质在与其他蛋白质(如syndecan结合蛋白(syntenin))形成蛋白质复合物后可作为转录调节因子。该蛋白可能在细胞凋亡途径中发挥作用,导致细胞死亡和肿瘤发生,并可能
关于内含子的基本信息介绍
断裂基因的非编码序列,在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。
SOX1基因编码的功能和结构描述
这个无内含子的基因编码一个SOX(SRY相关HMG-box)转录因子家族的成员,该家族参与胚胎发育的调控和细胞命运的决定编码的蛋白质在与其他蛋白质形成蛋白质复合物后可作为转录激活剂在小鼠中,一种类似的蛋白质调节γ-晶体蛋白基因,对晶状体发育至关重要。This intronless gene enco
Science:科学家成功解析人类剪接体关键结构
看看任何一个真核细胞基因组内的蛋白编码基因,不管是动物,植物,真菌还是原生生物,我们都会发现由于内含子的存在,编码基因被隔断成几个片段。当一个基因发生转录,这些内含子会在蛋白质合成之前从mRNA前体中被移除,虽然关于这些内含子的移除过程已经得到了几十年的深入研究,但是在一些三维动态结构研究技术出
TCF4基因的结构特点和作用
该基因编码转录因子4,一种基本的螺旋环螺旋转录因子。编码的蛋白质识别一个以法鲁西盒(e-box)结合位点(canntg),这是免疫球蛋白增强剂中首次发现的一个基序。该基因广泛表达,可能在神经系统发育中起重要作用。这个基因的缺陷是导致皮特-霍普金斯综合征的一个原因。此外,内含子ctg重复序列通常为10
关于真核基因组的基本信息介绍
真核基因组:由真核基因编码的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒编码的基因组。 真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因。但实际上,人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有