绘制出有史以来Z大的人蛋白相互作用图谱

在一项新的研究中,来自美国哈佛医学院的研究人员绘制出人5800多个基因编码的蛋白相互作用图谱(或者说网络)。这些基因代表着超过四分之一的人基因组。相关研究结果发表在2017年5月25日的Nature期刊上,论文标题为“Architecture of the human interactome defines protein communities and disease networks”。这个被称作BioPlex 2.0的网络鉴定出56000多种独特的蛋白相互作用,它们中的87%是之前未知的。这个网络是迄今为止zui大的。BioPlex揭示出与基础细胞过程和高血压、癌症等疾病相关联的蛋白群体,并且为努力理解人类生物学特征和疾病提供新的机会。论文共同通信作者、哈佛医学院细胞生物学系主任Wade Harper教授说,“基因并不只是一段DNA。基因也会编码蛋白。除非我们能够理解人蛋白质组,否则我们很难完全搞清楚人基因组。BioPle......阅读全文

武汉病毒所绘制寨卡病毒感染宿主细胞的蛋白应答图谱

  近期,中国科学院武汉病毒研究所肖庚富研究团队在寨卡病毒(ZIKV)感染宿主细胞的定量蛋白质组学研究中取得新进展,绘制了ZIKV感染宿主细胞后宿主蛋白的调控图谱,系统展示了ZIKV与宿主蛋白的相互作用情况。相关论文Quantitative proteomic analysis of mosquit

我国科研人员绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

  肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临

大脑完整基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

  继美国总统奥巴马宣布“推进创新神经技术脑研究计划”(简称BRAIN计划或脑计划)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱。4月3日出版的英国《自然》杂志发表两项相关研究,介绍了哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱。此次的图谱对于研究人类大脑发育和神经回路,从而理解人类的行为和认知

Nature:大脑基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

2013年4月2日奥巴马政府公布“脑计划”,现在一年过去,脑计划出了两项突破性成果:科学家绘制出哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱        在美国总统巴拉克·奥巴马宣布了“使用先进革新型神经技术的人脑研究”(BRAIN)计划 1 年后,《自然》杂志于4月3日发表了两项研究,介

Cell重磅:人类病毒蛋白质相互作用图谱面世

图片来源:《寄生虫》海报  近日,一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样,讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生,其实人体内的寄生事件更是数不胜数,最常见的便是病毒的感染。  病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必须找到合适的活体

德科学家绘制出-首份完整线粒体蛋白质图

  德国科学家最近报告说,他们绘制出了酿酒酵母线粒体内部蛋白质的分布图,这是世界上第一份完整的高清晰度线粒体蛋白质分布图。   线粒体是细胞中提供能量的细胞器,被称作细胞的“能量工厂”。此外,线粒体还参与调控细胞的分化、生长、凋亡和信息传递。弄清线粒体内部的蛋白质分布,对深入理解蛋白质功能和细胞活

瑞典开发出绘制免疫图谱新方法

瑞典卡罗林斯卡医学院、皇家理工学院、国家生命科学实验室(SciLifeLab)联合开发了一种识别免疫细胞受体并定位其组织位置的新方法,为识别和预测免疫细胞在病理过程中的作用机制,开发新免疫治疗方法提供了新工具和思路,研究成果发表在《科学》期刊。  单细胞技术允许在细胞水平上研究抗原受体,但缺乏空间分

小鼠肺发育时空分子图谱绘制成功

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员彭广敦团队同合作者运用高通量空间转录组技术,绘制出小鼠胚胎期主要阶段到出生后P0天的时空分子图谱,从而揭示了肺发育过程中的复杂调控机制。相关成果发表于《科学通报》(Science Bulletin)。哺乳动物肺的功能发育是一个复杂的过程,它依赖于多种细胞

国际科研团队绘制出人类心脏细胞图谱

  一个国际科研团队最近在英国《自然》杂志上发表论文说,他们绘制出迄今最详尽、全面的人类心脏细胞图谱,涵盖心脏的8个部位、75种细胞状态。  该研究由英国惠康桑格研究所等机构参与,属于国际项目“人类细胞图谱”的一部分。新图谱相当于一份分子水平的心脏“导游图”,可帮助深入理解心脏细胞的运作,探究心脏疾

PNAS:单细胞测序绘制大脑的细胞图谱

  斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表文章,介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。  研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法,他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型,并确定神经元的亚型。他们还观察了

科学家绘制果蝇全脑神经图谱

  神经系统科学的一个主要任务就是了解大脑神经元与特定行为间的联系。在一项新的研究中,研究人员使用计算机视觉和机器学习技术,构建出一个大型的全脑神经图谱数据库。这些全脑神经图谱揭示了激活成年果蝇中的一部分神经元的行为影响。相关论文近日发表于《细胞》杂志(论文链接)。  “该研究的终极目标是将神经元回

Nature子刊:绘制细胞“青春之泉”图谱

  与一个国际研究小组展开协作,哥本哈根大学的研究人员第一次绘制出了端粒酶的图谱。这标志着人类朝着对抗癌症迈出了重要的一步。   绘制出细胞青春之泉——端粒酶的图谱,是一个重大国际研究项目所取得的研究成果之一。欧盟投入了5500万丹麦克郎,全球超过1000名研究人员,付诸四年的努力工作,抽取了超过

我国成功绘制全新猕猴脑网络组图谱

猕猴作为研究人类认知功能机制和模拟人类脑部疾病的理想模型,其在遗传学、生理学和脑结构上与人类高度相似。近日,中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心团队延续了“基于脑连接信息绘制图谱”的这一思想,绘制出全新的猕猴脑网络组图谱,这一成果日前在《科学通报》发表。△研究总体思路全新的猕猴脑网络组图谱不仅对脑

美国科学家成功绘制大脑图谱

  给“整个大脑”画图谱   继美国总统奥巴马宣布“BRAIN计划”(又称“脑计划”)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱。两项新研究分别介绍了哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱。   此次提供的人类胎儿妊娠中期的详细大脑基因表达图谱,填补了我们知识中的这一空白;

瑞典开发出绘制免疫图谱新方法

  瑞典卡罗林斯卡医学院、皇家理工学院、国家生命科学实验室(SciLifeLab)联合开发了一种识别免疫细胞受体并定位其组织位置的新方法,为识别和预测免疫细胞在病理过程中的作用机制,开发新免疫治疗方法提供了新工具和思路,研究成果发表在《科学》期刊。  单细胞技术允许在细胞水平上研究抗原受体,但缺乏空

科学家绘制果蝇全脑神经图谱

  神经系统科学的一个主要任务就是了解大脑神经元与特定行为间的联系。在一项新的研究中,研究人员使用计算机视觉和机器学习技术,构建出一个大型的全脑神经图谱数据库。这些全脑神经图谱揭示了激活成年果蝇中的一部分神经元的行为影响。相关论文近日发表于《细胞》杂志。  “该研究的终极目标是将神经元回路与特定的行

Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱

  根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。   研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样

国际科研团队绘制出人类心脏细胞图谱

  一个国际科研团队最近在英国《自然》杂志上发表论文说,他们绘制出迄今最详尽、全面的人类心脏细胞图谱,涵盖心脏的8个部位、75种细胞状态。  该研究由英国惠康桑格研究所等机构参与,属于国际项目“人类细胞图谱”的一部分。新图谱相当于一份分子水平的心脏“导游图”,可帮助深入理解心脏细胞的运作,探究心脏疾

Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱

根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。 研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样本的综合

Cell:科学家绘制出神经元细胞表面所有蛋白全景图谱

  近日,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中,来自霍华德-休斯医学研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法来重点研究特殊细胞表面覆盖的蛋白质,相关研究结果或能帮助阐明机体发育过程中脑细胞如何形成精细化的网络。这就好比是撒了一张小网,如今研究者就能利用这种新技术将果蝇大脑中神经元表面的所有

迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接作用的图谱问世

  据最新一期《细胞》杂志报道,由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组,绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱,并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制,并最终开发出治疗和预防方案至关重要。  加拿大高等研究院、美国达纳法博癌

胰蛋白酶切磷酸化多肽—反向高效液相层析绘制多肽图谱

实验材料胰蛋白酶切样品试剂、试剂盒尿素或盐酸胍仪器、耗材离心机实验步骤1. 加样前。做一次模拟加样,进行整个程序的洗脱,测 OD 初始值。记录所有实验变量:加样量、溶剂梯度、流速、吸收范围等。2. 制备 32P 标记的胰蛋白酶切样品(需要几千 cpm 才能有效地检测到 32P 标记的多肽 )。用 0

中国人肾透明细胞癌蛋白质基因图谱绘制成功

中国是肾癌大国,其中40%的肾癌患者在初诊或随访过程中出现转移,从而导致治疗效果不佳。其中,遗传异质性高、缺乏精准有效治疗靶点是肾癌治疗效果差的主要原因。复旦大学附属肿瘤医院教授叶定伟团队携手复旦表型研究院教授丁琛团队和上海交通大学医学院附属新华医院教授赵健元团队,成功绘制出中国人肾透明细胞癌蛋白质

国内首张氙气物理特性图谱绘制成功

  近日,中国航天科技集团五院502所成功绘制出了国内首张氙气物理特性图谱,获得了氙气在不同状态下温度、压力、密度的变化规律。至此,我国首次掌握了氙气物理特性全面详实的一手资料,为氙气在电推进系统中的应用提供有力支撑。  氙气是卫星电推进系统最常用的工质,其物理特性非常特殊,在电推进系统在轨工作和地

Nature新文章绘制油棕榈基因组图谱

  一个由多国科学家组成的研究小组,确定了一种称之为Shell的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源,并且是最有前景的生物燃料来源之一。   新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱,并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努

科研人员绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱

  乳酸 (lactate) 是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物,在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多。其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应(Warburg effect)”而得到广泛关注。2019年,芝加哥大学Yingming Zhao教授团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成一

荷兰榆树病致病真菌基因图谱绘制完成

  加拿大多伦多大学与病童医院研究所日前成功绘制出荷兰榆树病致病真菌基因图谱,研究论文在线刊登于《BMC基因组学》上。   荷兰榆树病起源于喜马拉雅山,19世纪末期从荷属东印度群岛传播到欧洲,第一次世界大战后不久便在荷兰出现。荷兰榆树病是北美最具破坏力的榆树病,一般大部分树木会在感染后两年内死亡。

Cell:科学家绘制果蝇全脑神经图谱

  神经系统科学的一个主要任务就是了解大脑神经元与特定行为间的联系。在一项新的研究中,研究人员使用计算机视觉和机器学习技术,构建出一个大型的全脑神经图谱数据库。这些全脑神经图谱揭示了激活成年果蝇中的一部分神经元的行为影响。相关论文近日发表于《细胞》杂志。  “该研究的终极目标是将神经元回路与特定的行

《细胞》:世界首个女性个人遗传图谱绘制完成

对人类卵子的两个极体进行高通量测序 第一个人类女性个人遗传图谱 极体基因组测序结果指导异常胚胎筛选   2013年12月20日,著名学术期刊《细胞》杂志发布世界上首个人类女性个人遗传谱图。   在这篇题为“Genome Analyses of single human oocytes”

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一