迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接作用的图谱问世
据最新一期《细胞》杂志报道,由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组,绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱,并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制,并最终开发出治疗和预防方案至关重要。 加拿大高等研究院、美国达纳法博癌症研究中心和哈佛医学院共同完成的此一“人类互作组(human interactome)”新图谱描绘了蛋白质之间的1.4万个直接相互作用。该互作组是由蛋白质和“相互支持”的其他细胞组件所构成的一个网络。新图谱要比以往的同类图谱大4倍以上,包含了比以往所有研究加在一起还要多的高质量相互作用。 科学家们通过实验鉴别出这些相互作用,然后利用计算机模型将目标聚焦于与一个或多个癌症蛋白“相联系”的蛋白质。研究成果首次证实了癌蛋白更有可能彼此相互联系,而不是与随机选择的非癌蛋白相联系。 研究人员表示,与同一疾病相关的一些蛋白更有可能彼此联系,这......阅读全文
相互作用蛋白鉴定实验——相互作用蛋白捕获
实验方法原理实验要经过两次连续大量的酵母菌平板筛选过程。酵母菌含有 LexA 融合探针、报道基因和插入PJG4-5(见图19.1.6)的 GAL 启动子控制下的 cDNA 表达文库。最近,已有可供用于这个系统的文库。实验材料携带适当质粒组合的酵母菌试剂、试剂盒完全(CM)缺失成分液体培养基含有如下指
Science:利用基因共同进化揭示蛋白相互作用网络
如今,在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学和哈佛大学的研究人员找到了一种从已被测序的DNA中提取有用信息的新方法。通过对细菌中成对基因之间共享的细微进化特征进行编目,他们够发现数百种之前未知的蛋白相互作用。这种方法当前正应用于人类基因组,并且可能产生关于人类蛋白如何相互作用的新见解。相关研究结果
蛋白蛋白相互作用技术介绍
技术内容蛋白质并非孤立存在的生物分子,而是具有特定三维空间结构并与其他蛋白质相互作用,共同执行功能。因此,蛋白质的模块及空间组织与其表达水平具有同样的重要性。为了解析蛋白质组的组织结构单元而开发的基于质谱的蛋白质组学方法通常结合了质谱检测与各种生化试验。其中最经典的技术为1999[1]首次报导的亲和
蛋白蛋白相互作用技术内容
技术内容 蛋白质并非孤立存在的生物分子,而是具有特定三维空间结构并与其他蛋白质相互作用,共同执行功能。因此,蛋白质的模块及空间组织与其表达水平具有同样的重要性。为了解析蛋白质组的组织结构单元而开发的基于质谱的蛋白质组学方法通常结合了质谱检测与各种生化试验。其中最经典的技术为1999[1]
相互作用蛋白鉴定实验
鉴定诱饵蛋白(半乳糖苷酶) 鉴定诱饵蛋白(LacZ 的活性分析) 相互作用蛋白捕获 实验方法原理 捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达
蛋白质相互作用
Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System· Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast
相互作用蛋白鉴定实验
实验方法原理 捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为
克隆化基因体外合成蛋白质分析DNA蛋白质相互作用实验
体外合成的蛋白质对于测定一个克隆的基因是否编码一个特异的DNA结合蛋白, 以及分析DNA-蛋白质相互作用都是极为有用的。为了检测DNA的结合能力,可将标 记的蛋白质与特异的DNA片段共温育,用非变性丙烯酰胺凝胶电泳将蛋白质-DNA复 合物与游离的蛋白质分离开来。来源:《精编分子生物学实验指南》第五版
用克隆化基因在体外合成蛋白质分析DNA蛋白质相互作用
基本方案 实验方法原理 实验材料 含有所需结合位点的质粒DNA
相互作用蛋白的捕获实验
基本实验 实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒
相互作用蛋白的捕获实验
相互作用蛋白的捕获试验要经过两次连续大量的酵母菌平板筛选过程。酵母菌含有lexA 融合合探针,报道基因和插入pJG4-5的GAL启动子控制下的cDNA表达文库。实验材料酵母菌试剂、试剂盒CM培养基乙酸锂PEGTEDMSO甘油氨苄青霉素仪器、耗材离心机分光光度计摇床培养箱实验步骤1. 为了转化文库,
相互作用蛋白的捕获实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 CM培养基乙酸锂PEGTEDMSO甘油氨苄青霉素仪器、耗材 离心机分光光度计摇床培养箱实验步骤 1. 为了转化文库,将约20 ml 含pSH18-34和pBait 的酵母菌EGY48培养液接种到Glc/CM-Ura-His 省却成分液体培养基中,于30℃培养过夜。2.
蛋白与蛋白相互作用分析—免疫共沉淀
实验原理免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是以抗体和抗原之间的特异性结合以及细菌蛋白质的“protein A/G"特异性地结合抗体Fc段的现象而开发出来的方法,是研究蛋白质相互作用的经典方法,主要用于确定两种蛋白质在完整细胞内是否存在生理性相互作用。其原理是:当
基因调节蛋白
中文名称基因调节蛋白英文名称gene regulatory protein定 义与基因的DNA序列相互作用调控转录的蛋白质。即反式作用因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验
GST 融合蛋白作为在细菌中表达的重组蛋白,从它们被介绍以来,已用于成千上万个研究项目中(Smith and johnson 1988)。它们常常被用于制备抗体,这些抗体可用于研究蛋白质-蛋白质相互作用以及分析生化反应。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W
用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验
实验材料 结合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白 试剂、试剂盒 碱性缓冲液 封闭缓冲液 相
用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验
实验材料 结合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白试剂、试剂盒 碱性缓冲液 封闭缓冲液 相互作用缓冲液PK 缓冲液还原型谷胱甘肽于 Tris-Cl中洗涤缓冲液 1 洗涤缓冲液 2蛋白酶蛋白激酶 A[y-32P]ATP仪器、耗材 与待筛选蛋白结合的膜或滤膜Sephadex G-50 转柱实验步骤 材
相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(LacZ的活性分析)
实验方法原理捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为一种稳定蛋
JBC:凋亡通路关键蛋白的相互作用
耶路撒冷的希伯来大学和魏茨曼科学研究所的研究人员发现了两种线粒体凋亡通路关键蛋白相互作用的分子机制,提出了诱导细胞凋亡或细胞程序性死亡的新方法,有望引导人们研发新的癌症治疗手段。 凋亡是机体对抗异常细胞(如癌细胞)扩散的必要防御机制,是经由相互作用的蛋白网络发生的复杂生物学过程。癌细胞常常
蛋白质与水的相互作用
水和蛋白质是构成一切生命的基础材料。对人体来说,我们需要有二十种氨基酸才能保证细胞的正常工作。其中,有八种氨基酸是人体无法自行合成,必须由食物中摄取,称作“必需氨基酸”,又称作完全蛋白。资料表明:这八种中如果缺少任何一种,其他则毫无用处。另外十二种是人体可以自行合成的,称作“非必需氨基酸”。人体
蛋白质与水的相互作用
蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多:(1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高于蛋白质的p
酵母双杂交原理(蛋白相互作用)
概述酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立。典型的真核生长转录因子, 如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domain)。前者
人硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)酶联免疫分析(ELISA)
本试剂仅供研究使用 目的:本试剂盒用于测定人血清,血浆及相关液体样本中硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)的含量。实验原理: 本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中人硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)水平。用纯化的人硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)抗体包被微孔板,制成固相抗体,往包被
新策略助力蛋白蛋白相互作用先导化合物设计
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作,提出“强支点占据-杠杆干扰”(FOLP)的蛋白-蛋白相互作用(PPI)先导化合物设计策略,为PPI领域研究提供新的概念和方法,将有助于未来其他PPI调控剂的开发。相关研究8月19日发表于《德国应用化学》,并被推荐为“H
新策略助力蛋白蛋白相互作用先导化合物设计
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作,提出“强支点占据-杠杆干扰”(FOLP)的蛋白-蛋白相互作用(PPI)先导化合物设计策略,为PPI领域研究提供新的概念和方法,将有助于未来其他PPI调控剂的开发。相关研究8月19日发表于《德国应用化学》,并被推荐为“Hot
相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(半乳糖苷酶)
通过确定与之结合的其他蛋白质来理解某种特定蛋白质的功能,常常是十分有用的方法。这可以通过从文库中选择或筛选与靶蛋白相互作用的新蛋白来实现。现有一种特别有用的方法即双杂交系统或相互作用阱, 用来测定新的相互作用蛋白,这种方法采用充当「试管」的酵母菌和一种报道系统的转录激活作用来识别结合蛋白。本方法也可
蛋白质相互作用组研究获进展
蛋白质相互作用组是指蛋白质之间的基本相互作用,对于大多数物种而言,其在很大程度上都是未知的。因而,研究探索膜蛋白潜在的相互作用组必然是一项极具挑战性的工作。 美国斯坦福大学卡耐基科学研究所Jones等研究人员,使用构建好的分裂泛素化酵母试验系统,从拟南芥中筛选鉴定出超过3000个膜蛋白之间的相
质谱研究蛋白质相互作用(一)
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽,从而帮助研究人员识别并测序多肽分子,分析它们的特征,了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的,一些关键的生物学过程,如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为,这些蛋白复合
研究蛋白质相互作用的新技术
近期,来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员,开发出一种新技术,可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起,以同时搜寻数百万个蛋白质配对,用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol
Far-Western分析蛋白质相互作用实验
实验方法原理 实验材料 待分析的样品编码目的蛋白的 cDNA(已经克隆到体外表达载体中)试剂、试剂盒 1 × SDS 上样缓冲液丽春红 S 染液封闭缓冲液 I封闭缓冲液 II体外转录 翻译试剂盒PBS35S-甲硫氨酸探针纯化缓冲液探针稀释缓冲液仪器、耗材 微量过滤离心柱聚偏氟乙烯(PVDF)/硝化纤