引物TM值和PCR程序问题

tm值和引物中的GC含量有关 只要相差不是太大就行 设定时取平均值就可以;你可以根据引物的长度和GC的百分比来确定一下哪个更准确。不知道你用的那个公司的机器,一般是的在退火温度后面的空格里,输入你每个循环升或降的温度,后面还有加减号代表升或降。......阅读全文

引物的Tm值是什么

负责引物合成的公司会给你引物的详细信息,其中有理论tm值,应该是和这个公式tm=2*(a+t)+4*(g+c)计算的一样,你在进行调整优化即可。

如何计算引物的Tm值?

   引物设计软件都可以给出Tm,与引物长度、碱基组成及所使用缓冲夜的离子强度有关。    长度为25base以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)    对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:    Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+]

引物的TM值如何计算

Tm值就是DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构在热变性过程中紫外吸收值达到最大值的1/2时的温度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。核酸Tm值(解链温度)计算评价标准是核酸所吸收的光线量达到其所增加吸收260nm光线的量的两倍达到的温度,当核酸达到Tm值

如何计算引物的Tm值?

引物设计软件都可以给出Tm,与引物长度、碱基组成及所使用缓冲夜的离子强度有关。长度为25base以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+] + 0.41 (GC%) –

引物TM值和PCR程序问题

tm值和引物中的GC含量有关 只要相差不是太大就行 设定时取平均值就可以;你可以根据引物的长度和GC的百分比来确定一下哪个更准确。不知道你用的那个公司的机器,一般是的在退火温度后面的空格里,输入你每个循环升或降的温度,后面还有加减号代表升或降。

引物Tm值与PCR产物Tm值有什么区别

引物TM是设值和合成引物时的Tm值,也就是理论值。而PCR产物tm值是在实际操作中摸索出来的温度值引物Tm值与PCR产物Tm值这两个不同的引物当然退火温度也不相同,一般在设计引物的时候,程序就会显示出Tm值是多少.在做PCR的时候,将退火温度设定的稍微低于Tm值一点,降低引物的特异性,可能会好点.当

引物的浓度和TM值的技术

引物浓度的计算:引物保存在高浓度的状况下比较稳定。引物一般配制成10-50pmol/ul。一般情况下,建议将引物的浓度配制成50pmol/ul,加水的体积(微升)按下列方式计算:V (微升)= OD数*(乘)33 *(乘)*(乘)20000 / (除) 引物的分子量。引物的分子量可以从合成报

引物的Tm值,到底有多少意义

Tm较低,而且熔解温度范围较宽;离子强度较高时,Tm较高,熔解温度范围较窄。DNA溶液中离子强度低时,Tm较低,而且熔解温度范围较宽;离子强度较高时,Tm较高,熔解温度范围较窄。因此,在表示某一来源DNA的Tm值时,必须指出其测定条件。在一定条件下Tm高低由DNA分子中的G-C含量所决定。G-C含量

退火温度与引物的TM值有什么联系

退火温度与引物的TM值的关系主要和DNA聚合酶与其buffer有关。有些退火温度要比TM低5度、3度,有些还会高3度,有些是一模一样的。主要参考不同公司所生产的DNA聚合酶的说明书。

如何确定引物二聚体和扩增产物的Tm值

最近在做qPCR,今天遇到个样品的浓度很低,想看看能不能做出样品10倍梯度稀释的曲线,于是照常做了。结果最后的溶解曲线发现,头三个的Tm是84,之后的5个样品时77。从Ct值来看,也是头三个还有点像样,后面的Ct都是33-34.很显然后面的5个应该不是扩增产物,应该是奈不住寂寞的引物二聚体之类的非目

Tm值的影响Tm值的因素

Tm值的影响因素如下:(1)G—C的含量:在一定条件下Tm高低由DNA分子中的G-C含量所决定。G-C含量高时,Tm值比较高,反之则低。这是因为G-C之间的氢键较A-T多,解链时需要较多的能量之故。Tm值和G-C的含量可用二一个经验公式表示:(G—C)%=(Tm-69.3)×2.44在一定条件下(p

怎么计算Tm值

引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度有关。长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:Tm = 81.5 + 16.6 x Log10[Na+] + 0.41 (%GC) – 600/size公式中,Siz

怎么计算Tm值

公式:(G—C)%=(Tm-69.3)×2.44在一定条件下(pH7.0,0.165MNaCl中)Tm值与(GC)%含量呈正比关系。因此,通过测定Tm值,可以推算出DNA分子中的碱基百分组成。在一定条件下Tm高低由DNA分子中的G-C含量所决定。G-C含量高时,Tm值比较高,反之则低。这是因为G-C

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

日立台式电镜TM4000/TM4000Plus申报ANTOP奖

  洒下的汗水是青春,埋下的种子叫理想。守在悉心耕耘的“大地”,用创新留下丰碑,静待收获的时节。2019 ANTOP奖正方兴未艾,多家科学仪器企业竞相参与申报,这里将为您介绍ANTOP奖项“打榜”产品。  日立台式电镜TM4000/TM4000Plus开始申报ANTOP奖!  第一台台式电子显微镜可

tm值与退火温度

我用primer 5设计出来的Tm值从来都是直接当退火温度用。用引物primer-blast的话我都是直接贴序列上去。有其他菌的匹配很正常,有些进化亲缘性很近的,只要在同一物种中没有匹配上的问题应该不大!

qPCR溶解曲线TM值

tm>80℃_芙馇叻治隹梢杂美慈范ú煌姆从Σ铮ǚ翘匾煨圆铩?_芙馇?(Dissociation curve):随温度升高,DNA的双螺旋结构降解程度的曲线。全部DNA双螺旋结构降解一半的温度称为溶解温度(Tm)。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。不排除极度

qPCR溶解曲线TM值

tm>80℃随温度升高,DNA的双螺旋结构降解程度的曲线。全部DNA双螺旋结构降解一半的温度称为溶解温度(Tm)。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。不排除极度偶然的情况:1.两个序列的溶解曲线一样 2.没有目标产物,只有一种非特异产物。

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

LifeTechnologies推出GlobalFiler(TM)Exp...

  全球身份鉴定解决方案领导者 Life Technologies Corporation(美国生命技术公司,NASDAQ: LIFE)今天推出了GlobalFiler™ Express 试剂盒,这种新的 DNA 试剂盒将为全球犯罪实验室进行法医鉴定的方式带来革命性变化 -- 使实验室可以更

DNA的Tm值测定实验

紫外分光光度法             实验方法原理 当DNA 的稀盐溶液加热到80~100 ℃ 时, 双螺旋结构即发生解体, 两条链分开, 形成无规线团。一系列物化性质也发生

什么是TE、TM、TEM-mode

TE叫做横电模,指的是电场方向与传播方向垂直。TM叫做横磁模,指的是磁场方向与传播方向垂直。TE和TM可以合称LP,线性偏振模。TEM叫做横电磁模,指的是电场、磁场方向都和传播方向垂直。

DNA的Tm值测定实验

实验方法原理 当DNA 的稀盐溶液加热到80~100 ℃ 时, 双螺旋结构即发生解体, 两条链分开, 形成无规线团。一系列物化性质也发生改变: 260 nm 区紫外吸收值增高(增色效应) , 粘度降低, 浮力密度降低等。DNA 的变性的特点是爆发式的, 变性作用发生在一个很窄的范围。通常把D

什么是上游引物和下游引物

虽然这个问题很简单,但我怎么发觉挺难回答的......上游引物就是和要扩增基因片断上游序列结合的引物(引物就是单链寡聚核苷酸,基因扩增需要从引物开始),同理,下游引物指与目的基因片断下游序列结合者。具体示意如下:(上下两条长线代表DNA模板)5'-----------------------

快速了解反转录引物随机引物

  随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一非特异的引物来拷贝全长mRNA。  1.特异性引物一般在增低丰度目的基因才选择使用,用得比较少。一般都推荐用Oligo(dT)或随机引物代替基因特异性引物。由于rna的二级结构破坏不完全,导致特异性

pcr退火温度是根据什么原则设计?

在模板变性后温度快速冷却至40℃~60℃(某个退火温度 )的时候,可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞,这就使PCR后期的过程成为可能。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。对于20个核苷酸