科学家研发新算法可快速揭示细胞内部结构
借由高功率显微镜和机器学习,美国科学家研发出一种新算法,可在整个细胞的超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。相关论文发表在最新一期的《自然》杂志上。 领导该COSEM(电子显微镜下细胞分割)项目团队的奥布蕾·魏格尔说,这些图像中的细节几乎不可能在整个细胞中手动解析。仅一个细胞的数据就由数万张图像组成,通过这些图像追踪该细胞的所有细胞器,需要一个人花60多年时间。但是新算法可在数小时内绘制出整个细胞。 除了《自然》上两篇文章外,研究团队还发布了一个数据门户“开放细胞器”,任何人都可通过该门户访问他们创建的数据集和工具。这些资源对于研究细胞器如何保持细胞运行非常宝贵,过去科学家们并不清楚不同细胞器和结构怎样排列——它们如何相互接触及占据多少空间。现在,这些隐藏的关系首次变得可见。 在过去十年中,研究团队使用高功率电子显微镜从多种细胞中收集了大量数据,包括哺乳动物细胞。 最新的机器学习工具可在电子显......阅读全文
机器学习技术加速植物精准设计育种
种子被誉为农业的“芯片”,育种科技创新是推动农业发展的核心动力。未来植物育种的新范式是基因组学、基因编辑、合成生物学等生物技术(BT)与数据科学、机器学习、人工智能等信息技术(IT)的多元化融合。农业农村部“十四五”规划将“智慧种业”列在“智慧农业”领域七大攻关任务之首。任务中明确提出:构建数字化育
活细胞成像显微镜
活细胞成像显微镜是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年3月15日启用。 技术指标 固态光源SSI(含7条激发谱线),高精度电动载物台(X、Y:20nm,Z:5nm),CalSnapHQ2 CCD.EMCCD.湿控及CO2系统装置,自动对焦装置(焦距时间100ms,精度25nm)。10×
细胞内钙成像实验
暂未评分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏 3人收藏细胞内钙成像实验标签:钙成像神经生物学实用实验技术 第三章 第七节来源:《神经生物学实用实验技术》
活细胞成像工作站
活细胞成像工作站是一种用于生物学领域的分析仪器,于2015年5月13日启用。 技术指标 1.三维液压微调控制系统:X-,Y-,Z-轴,移动范围最大10mm;操纵杆移动(X-,Y-轴):最大2mm;控制手移动:250um;规格:驱动单元、控制单元、万向节、磁性金属板等。2.显微操纵器粗调系统:
细胞成像微孔板检测系统
细胞成像微孔板检测系统是一种用于生物学、农学、畜牧、兽医科学、基础医学领域的分析仪器,于2016年10月27日启用。 技术指标 孵育温度范围:室温以上5℃-65℃;CO2和O2控制范围:0-20%(CO2);1-19%(O2)控制分辨率:+0.1%(CO2和O2)稳定性:+0.2%at5%C
细胞内钙成像实验
实验方法原理 钙离子是一种重要的细胞内第二信使,参与许多重要的细胞生理活动和病理过程,因此监测细胞内钙离子水平的变化对了解细胞的活动状态非常重要。细胞内钙成像技术是通过向细胞内载入钙指示剂,利用钙指示剂与钙结合后发生荧光强度或波谱性质改变的特征来监测胞内钙离子浓度的变化。目前常用的钙指示剂主要是化学
活细胞成像实验总结,必看!
近年来,活细胞成像活跃于生物学的各个领域。在它的加持下,研究者们可以实时或者在一段时间内观察细胞内部结构和细胞生理过程,从而加深对细胞运作过程的认识。但在各种实验操作和成像条件下,想要成功做好活细胞成像实验并不容易。1、实验前我们先了解一下,什么是活细胞成像,它有哪些作用?通常,我们把使用延时成像技
细胞内钙成像实验
实验方法原理钙离子是一种重要的细胞内第二信使,参与许多重要的细胞生理活动和病理过程,因此监测细胞内钙离子水平的变化对了解细胞的活动状态非常重要。细胞内钙成像技术是通过向细胞内载入钙指示剂,利用钙指示剂与钙结合后发生荧光强度或波谱性质改变的特征来监测胞内钙离子浓度的变化。目前常用的钙指示剂主要是化学荧
基于血清细胞外囊泡微生物组标记物的胰腺癌诊断机器学习模型
胰腺癌,这个 “癌症之王”,一直让医学界头疼不已。它极其善于 “伪装”,在早期几乎没有明显症状,等到患者察觉到身体不适时,往往已经发展到了晚期。目前,胰腺癌的 5 年生存率还不到 8%,主要原因就是缺乏有效的早期筛查手段。传统的检测方法,要么准确性不高,要么对患者身体有创伤,很难满足临床需求。在这样
自动细胞成像系统进行细胞表型的多参数评估
简介自动细胞成像是一种分析化合物对包括细胞形态,活力和标志物表达在内的细胞表型的影响的有效方法。这里,我们将展示ImageXpress® Pico自动细胞成像系统和CellReporterXpress 自动成像分析软件如何应用于化合物影响的表型分析。成像和分析方法可提供工具来鉴定细胞活力,细
使用自动细胞成像系统进行细胞毒性评价和细胞活死测定
简介细胞活 / 死测定被广泛应用于各种研究领域,包括各种化合物的细胞毒性作用、实验处理或基因表达变化的研究。自动细胞成像和分析系统提供了一种评价细胞活性和细胞死亡的最佳方法。在本篇应用文献中,我们介绍了使用 ImageXpress®Pico 自动细胞成像系统以及 CellReporter
机器学习模型首次在太空检测云层变化
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505829.shtm
槟榔、芒果机器学习遥感分类研究取得进展
近日,中国热带农业科学院科技信息研究所智慧农业研究中心在槟榔、芒果机器学习遥感分类研究上取得新进展。该研究在《遥感》(Remote Sensing)上发表。芒果和槟榔是国内重要热带经济作物,对地方农业农村经济发展具有重要意义。及时、准确获取芒果和槟榔种植园的空间结构信息不仅是区域农业结构调整和优化的
机器学习+化学直觉让药物发现更有效
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511579.shtm
机器学习可用更少血液更早筛查癌症
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516631.shtm
准确预测身高?这种机器学习算法能做到
美国密歇根州立大学的研究人员近日开发出一种先进的算法,能够根据个人基因组来预测他们的身高、骨密度,甚至是教育水平。这项成果于近日发表在《Genetics》杂志十月刊上。 这项研究的负责人、密歇根州立大学的Stephen Hsu博士表示这仅仅是开始。“尽管我们现在验证了这一工具的这三个结果,但我
-机器学习的新玩法:可做医疗监控
也许现在多数人们还认为“机器学习”(Machine Learning)是一个相当前沿的概念,但事实上,你接触的若干互联网产品已经使用了与机器学习有关的思维或技术。比如电子邮件服务商就是使用机器学习算法来过滤垃圾邮件的,Google也通过相关的技术来辨别垃圾站点。 对于很多互联网用户来说
机器学习分析出语言多样性成因
人类至少有7000多种不同的语言,这种多样性强加了社会界限,对我们的认知和经济生活、思考方式以及人们之间的互动都产生了深远影响。 瑞士苏黎世大学(UZH)的研究人员在《英国皇家学会学报B》上发表文章称,他们在大型数据集上运用机器学习技术证明,当前的语言多样性在很大程度上是由于过去10000年过
机器学习技术或可解决量子信息难题
今天,记者从上海交通大学获悉,该校教授金贤敏团队与南方科技大学教授翁文康合作,首次将机器学习技术应用于解决量子信息难题,实现了基于人工神经网络的量子态分类器。这一重要研究成果已发表于《物理评论快报》。 量子信息科学与人工智能技术,作为近年来最前沿的研究领域,取得了诸多改变传统信息科学的进展。但如
量子物理与机器学习结合研究取得进展
生成模型(Generative Model)是机器学习领域的重要课题和研究前沿,也被认为是通往人工智能的必由之路。历史上,物理学为生成型学习提供了很多新思路。比如,著名的玻尔兹曼机(Boltzmann Machine)就来自于统计物理中的伊辛模型及相关的反伊辛问题。最近,中国科学院物理研究所/北
常见机器学习算法优缺点比较(四)
缺点 · 当观测样本很多时,效率并不是很高; · 对非线性问题没有通用解决方案,有时候很难找到一个合适的核函数; · 对缺失数据敏感; · 对于核的选择也是有技巧的(libsvm中自带了四种核函数:线性核、多项式核、RBF以及sigmoid核): · 第一,如果样本数量小于特征
常见机器学习算法优缺点比较(二)
常见算法优缺点 1.朴素贝叶斯 朴素贝叶斯属于生成式模型(关于生成模型和判别式模型,主要还是在于是否是要求联合分布),非常简单,你只是做了一堆计数。如果注有条件独立性假设(一个比较严格的条件),朴素贝叶斯分类器的收敛速度将快于判别模型,如逻辑回归,所以你只需要较少的训练数据即可。即使
常见机器学习算法优缺点比较(一)
机器学习算法太多了,分类、回归、聚类、推荐、图像识别领域等等,要想找到一个合适算法真的不容易,所以在实际应用中,我们一般都是采用启发式学习方式来实验。通常最开始我们都会选择大家普遍认同的算法,诸如SVM,GBDT,Adaboost,现在深度学习很火热,神经网络也是一个不错的选择。假如你在
常见机器学习算法优缺点比较(三)
优点:实现简单,计算简单; 缺点:不能拟合非线性数据. 4.最近领算法——KNN KNN即最近邻算法,其主要过程为: 计算训练样本和测试样本中每个样本点的距离(常见的距离度量有欧式距离,马氏距离等); 对上面所有的距离值进行排序; 选前k个最小距离的样本; 根据这k个样本的标签进行
活细胞RNA成像技术获突破
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509263.shtm
活体成像——让肿瘤细胞无处遁形
在科普今天的知识前,不禁让小编回忆起大学校园的美好时光,那个时候小编还是个走在绿树荫下的青涩少年啊,在一次参加关于肿瘤免疫学的学术会议上,看到了类似下面这种图,我就在想,这小鼠是修炼了什么内家功法,被打通任督二脉了?那五颜六色的东东是什么?经过向老师还有身边的小伙伴们请教才知道,这是利用活体成像技术
浅谈DeltaVision-Elite活细胞成像系统
我们知道以往的固定组织或固定细胞成像揭示了非常多的自然秘密,给了我们很大的启示,但现在的科学研究则希望在最真实的条件下观察细胞。纵观显微镜的发展历史,直到15年前,科学家主要还是处理死细胞。现在,活细胞研究的重要性已经越来越被意识到。加拿大McGill大学成像实验室主任Claire M. B
分子细胞卓越中心开发出活细胞DNA成像新工具
7月4日,《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的研究成果(CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multipl
Molecular-Devices在细胞成像系统上检测细胞活性或毒性
EarlyTox™细胞完整性试剂盒由一系列易于识别活细胞和死细胞的优化试剂组成。可用于检测不同处理对细胞活性的影响,也可评估不同机制产生的细胞毒性,包括凋亡和坏死。该试剂盒设计工作于多种细胞类型,贴壁和悬浮均可。简单的操作流程和优异的试剂表现使其能应用到高通量扫描上。试剂盒中使用了两种结合DNA的荧
天津大学研发有触觉的4D打印软体机器人
近日,天津大学材料学院教授封伟研发了一种具备自主行动能力和触觉应变的4D打印软体机器人,该机器人在一次打印成型后即具有热致无约束滚动能力,无需任何其他后续加工程序。 该研究成果在《细胞》出版社旗下顶尖期刊《物质》发表。 传统制造方法限制了软体机器人“智能” 软体机器人是一种新型柔韧机器人,