多物种转录图谱综合数据库已对用户免费开放
随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构建标准化数据分析流程和结构化元信息审编模型,建立面向多物种基因转录特征的数据集成与管理资源十分必要。 近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心在Nucleic Acids Research上,发表了题为Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell lev......阅读全文
基因库对于战胜气候变化至关重要
基因库帮助保存生物多样性 农业科学家M. S. Swaminathan说,基因库在保存培育抵御气候变化的作物所需的生物多样性方面具有关键作用。 全球粮食系统在很大程度上依赖于少数作物,诸如水稻和小麦。Swaminathan说,但是遗传同质性让它们很容易受到与气候变化有关的环境压力
土耳其建世界第三大种子基因库
土耳其将在首都安卡拉建造世界第三大种子基因库,可保存25万种植物的基因。 土耳其农业和农村事务部部长穆罕默德·迈赫迪·埃克尔说,土耳其的种子基因库将成为世界第三大种子基因库,仅次于美国和中国的种子基因库。它将从国内外收集并保存种子,用于科学实验,帮助土耳其开发农业潜力。 埃克尔说,土
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
核转录分析
实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase
RNA-反转录
实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
转录的特点
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
核转录分析
实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS
RNA-反转录
实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶 或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo
体外转录
· In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
RNA的转录与逆转录相关介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
国家基因库研发线粒体基因组重要新应用
继启动万种动物线粒体基因组计划(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法(mitochondrial metagenomics,以下简称“全线粒体混合多样性分析法”)。此方法高效、准确且可
国家基因库全国出生缺陷联盟搭建健康大平台
国家基因库自2013年3月开始筹建“国家基因库全国出生缺陷联盟”(以下简称:“联盟”),同年7月联盟宣布正式启动,至今已累积收集出生缺陷样本12,731份,获取基因数据5000份,建设完成中国最大的出生缺陷样本库以及数据库。联盟已支撑了43项科研项目,发表了24篇科研论文。 出生缺陷是指婴
国家基因库全国出生缺陷联盟搭建健康大平台
从国家基因库获悉,自去年7月“国家基因库全国出生缺陷联盟”正式启动至今,已累积收集出生缺陷样本12731份,获取基因数据5000份,建设完成中国最大的出生缺陷样本库以及数据库。 据《中国出生缺陷防治报告(2012)》估计,目前我国出生缺陷发生率在5.6%左右,每年新增出生缺陷数约90万例。
中国首座国家基因库落户深圳-首期投资1500万
深圳生物产业又有重磅好消息。1月30日,国家发改委已批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库,这是中国首次建立国家级基因库,首期投资为1500万元。 目前,全球仅美国、日本和欧洲建有三个国家级基因库。业内人士预计,随着深圳国家基因库的组建,中国在生命科学研究及生物信息安全领域的水
对话深圳国家基因库主任王韧:基因“存读写”
如果一定要给王韧加一个标签的话,了解他的人大多数会选“国际化”。1982年,他成为中国农科院第一批留美博士,随后历任中国农科院生物防治研究所研究员、博士生导师,英国国际生物防治所副所长,中国农业科学院副院长,国际水稻研究所常务副所长,国际农业研究磋商组织秘书长兼任世界银行国际农业研究基金秘书处执
信使RNA的反转录酶与反转录过程
定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录 1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。 2.反转录酶与反转录过程 反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合
RNA复制的转录与逆转录的过程介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成
转录物的概念
中文名称转录物英文名称transcript定 义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
什么是转录作图?
中文名称转录作图英文名称transcription mapping定 义标明转录物序列在基因组上的位置。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
转录图谱的原理
所有生物性状和疾病都是由结构或功能蛋白质决定的,而已知的所有蛋白质都是由mRNA编码的,这样可以把mRNA通过反转录酶合成cDNA或称作EST的部分的cDNA片段,也可根据mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段,然后,再用这种稳定的cDNA或EST作为“探针”进行分子杂交,鉴别出与转录有关的基
转录物的定义
中文名称转录物英文名称transcript定 义在DNA模板上由RNA聚合酶催化转录生成的mRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
3.3-核转录分析
核转录失控分析时,在体外将细胞核分离出来,然后在放射性同位素标记的核苷酸存在下进行转录,所合成的 KNA 均因掺入同位素而被标记,此混合 RNA 与固定在硝酸纤维素滤膜 h 的某一特定甚因的 DNA 探针杂交,就可以反映出该基因的转录狀态和转录速率。实验材料cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜酵
转录的定义介绍
转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,进行转录时,一个基因会被读取并被复制为mRNA,即特
胞外转录反应
实验概要RNA聚合酶由一条多胜肽 (polypeptides)所构成,其在进行转录反应时所须辨认的启动子长度仅20bp左右,而且转录起始位置非常明确,转录效能良好,成了目前进行胞外转录反应时的最佳选择。要进行胞外转录反应时,仅需将目标基因次选殖 (subclone)至带有SP6,T3或T7启动
共转录的定义
中文名称共转录英文名称cotranscription定 义(1)原核生物的基因以多顺反子或操纵子形式存在,被转录为一个共同的信使核糖核酸(mRNA)。(2)通过基因操作使不同的基因同时在细胞或组织中一起转录。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
tRNA转录加工过程
主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna