多物种转录图谱综合数据库已对用户免费开放

随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构建标准化数据分析流程和结构化元信息审编模型,建立面向多物种基因转录特征的数据集成与管理资源十分必要。 近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心在Nucleic Acids Research上,发表了题为Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell lev......阅读全文

国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”

  2013年11月19日,深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome,Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题,助力科研人员开发出新的技术及策略,以更好地应对鱼类

关于基因库的基本介绍

  基因库(gene pool)是一个群体中所有个体的全部基因的总和。有性生殖支撑了一种独特的基因库构建与运行模式,减数分裂通过修修补补、程序性突变(如复制错误、缺失、插入、重复等,这些与辐射诱变等比较,相对温和)等增加种群内基因的多样性以及等位基因的多态性,并分散保存于种群之中(种群规模越大,容纳

国家基因库正式试运行

  据《21世纪经济报道》消息,6月18日,坐落于深圳大鹏新区的国家基因库正式投入试运行。据介绍,国家基因库已初步建成40多个数据库,如中国肿瘤基因组(CCGC)数据库、癌症数据库等。其中,中国肿瘤基因(CCGC)现已收集了超过25种癌症类型数据,近3000例样本数据,近5万条变异信息。

法葡萄基因库面临拆迁威胁

Domaine de Vassal葡萄园有2300个不同的葡萄品种       近日,不确定性笼罩着一个全世界最大且最重要的葡萄庄园。位于法国地中海海岸的Domaine de Vassal葡萄园,已有138年的历史,由法国国家农业研究所(INRA)管理。该葡萄园对于研究法国及全世界的葡萄

全球最大豆类基因库成立

哥伦比亚设立了一个新的种子基因库。图片来源:ALLIANCE OF BIOVERSITY AND CIAT/JUAN PABLO MARIN 近日,来自各国的科学家和官员在哥伦比亚为名为“未来之种”的基因库揭幕。该基因库将成为全球最大的豆

国家海洋基因库落户青岛

  青岛市与深圳华大基因研究院日前签署协议,华大基因正式入驻青岛西海岸新区中德生态园,将在这里启动国家海洋基因库建设,发展大健康、现代农业等生命经济产业,打造华大基因北方示范基地。  华大基因是全球基因研究的领跑者,代表中国参与了人类基因组计划、组建了国家基因库、搭建了全球最大的基因组平台。按照约定

中国首个国家基因库开业在即

  国家基因库将于9月22号正式运营,这将是中国首个获批筹建的国家基因库,同时也是目前为止的唯一一个。该基因库由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、原卫生部联合批复,并由华大基因最终负责承建运营。  在开业前夕,新浪科技受邀前往国家基因库所在地,并实地与国家基因库执行主任、华大基因研究院院长徐讯

基因库的物种形成机制介绍

  遗传系统和基因组本身被认为是一种关系整体,是适应和各种调节的中心:遗传单位与其说是基因组本身,毋宁说是某一“种群”的“基因库”或基因组聚合的相互作用;反过来,基因库也要适应和整合,并成为全部调节和不断再平衡的源泉,因此,它构成(或如某些著名理论家所说)个体与物种之间结合的中间水平(皮亚杰1989

国家基因库拟组建“生物谷歌”

  12月13日至15日,筹备已久的第一届深圳国际生物科技创新论坛暨展览会在深圳会展中心举办。来自美国、英国、德国等18个国家和地区的133家企业和机构参展,其中海外企业共有34家,占展商总数的25.6%。   “如何应对生物信息带来的大数据的挑战?”在这个平台上,国家超级计算天津中心主任刘光明在

国家基因库:揭秘中国“诺亚方舟”

在深圳东南部大鹏新区的观音山脚下,矗立着一座依山而建的白色建筑,建筑呈阶梯状向上攀延,从建筑的高处望去,对面是茂密的青山,远处能看见海。在这平静的外表下,建筑内庞大的高通量基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房等正在日以继夜地运转着,它们负责存储和管理着我国特有的遗传资源、生物信息和基因数据。这

我国首个国家基因库落户华大基因

  6月17日,我国首个国家基因库及国际科技合作基地两个重大生物科技基础平台落户深圳华大基因研究院。   据国家发改委方面介绍,深圳国家基因库是服务于国家战略需求的国家级公益性科研和产业基础设施。建立国家基因库是为了有效保护、开发和利用我国珍贵的遗传资源,提高我国生命科学研究水平,促进我国生物产业

国家基因库:揭秘中国“诺亚方舟”

   ■本报记者 张文静 赵广立  在深圳东南部大鹏新区的观音山脚下,矗立着一座依山而建的白色建筑,建筑呈阶梯状向上攀延,从建筑的高处望去,对面是茂密的青山,远处能看见海。在这平静的外表下,建筑内庞大的高通量基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房等正在日以继夜地运转着,它们负责存储和管理着我国特有的遗

国家基因库揭牌仪式在深圳举行

  22日,深圳国家基因库开业仪式在深圳大鹏新区隆重举行。深市市委常委、市政府党组成员田 夫致辞,祝贺基因库主体建筑完工并正式投入使用,对国家基因库筹建5年来取得的成绩表示肯定,并与广东省发改委副主任吴道闻、深圳市市政府副秘书长刘胜、 华大基因董事长汪建,深圳国家基因库主任梅永红,执行主任徐讯等一起

中国国家基因库正式对外运营

22日,位于广东省深圳市的中国国家基因库正式运营,这是中国首个获批筹建的国家基因库。国家基因库的数据库统一检索系统也将于同日正式开通运行,将公开发布癌症数据集成与整合分析平台等多个数据库,成为为国家生命科学研究和生物产业发展提供基础性服务的公益性平台。存生物资源样本一千万份国家基因库坐落于被称为深圳

基因库的杂交与分化的介绍

  基因库的差异越大(或一般来说,物种间亲缘关系越远),物种间能成功进行杂交的可能性越小。但是,有些种群隔离时间虽久,如果基因库分化不大,也许仍然能成功交配。一些人相信存在自交或近交衰退,就必定会逻辑地相信存在所谓的“杂交优势”,历史悠久的农学育种正是为了寻找与利用一些所谓的对人类“有益的”优势性状

青岛将建我国首个国家海洋综合基因库

  近日,青岛市与深圳华大基因研究院签署战略合作协议。双方将在青组建青岛华大基因研究院(国家海洋基因库),搭建包括基因资源挖掘、基因组测序在内的技术支撑平台。   据了解,这是我国首个国家海洋综合基因库,将着力构建“1+10”基因组学产业体系:“1”是国家海洋基因库,“10”是依托基因库搭建大海洋基

揭秘搭载生物遗传密码的国家基因库

   9月20日,一名工作人员走过国家基因库的展厅。  在西方神话中,诺亚建造了一艘方舟,带着各种牲畜、鸟类等,躲避了大洪水,安然渡过“世界末日”。  一粒种子、一个细胞、一管血液、一口唾沫、一段脱氧核糖核酸、一条数据……这些不起眼的“现在”可能是构建未来生物科技和产业的砖石。在现实世界中,美国、欧

关于基因库的三种形式介绍

  1、在一定的地域中,一个物种的全体成员构成一个种群。种群的主要特征是种群内的雌雄个体能通过有性生殖而实现基因的交流。一个种群全部个体所带有的全部基因的总和就是一个基因库(gene pool)。  2、细胞培养物、种子、冷冻精子或卵子等的收集物,作为保持有任何一种生物的代表性基因组的手段来加以保存

全球最大古人类基因库创建

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515887.shtm

转录图谱的转录图谱的意义

在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D

RNA的转录和逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA复制、转录与逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

山西建成小麦优良性状动态基因库

  创新是科技发展的动力源泉。矮败小麦是继杂交水稻之后,我国农业领域又一重大发明,其高效育种技术体系的建立是小麦育种技术的重大突破。矮败小麦含有太谷核不育小麦的败育基因Ms2和矮变1号小麦的矮秆基因Rht10,这两个基因在4D染色体短臂呈紧密连锁,其交换率仅为0.18%,因而矮败小麦具有雄性败育彻

国家基因库参与人类胚胎基因编辑研究

   8月3日,由俄勒冈健康与科学大学、韩国基础科学研究院、美国Salk生物学研究所和深圳国家基因库合成与编辑平台合作完成的人类胚胎基因编辑最新重量级研究成果发表于《自然》杂志。在中国、美国、韩国的国际合作组的通力协作下,科学家第一次成功的利用CRISPR-Cas9系统在人类早期胚胎中对导致肥厚型心

基因库对于战胜气候变化至关重要

  基因库帮助保存生物多样性   农业科学家M. S. Swaminathan说,基因库在保存培育抵御气候变化的作物所需的生物多样性方面具有关键作用。   全球粮食系统在很大程度上依赖于少数作物,诸如水稻和小麦。Swaminathan说,但是遗传同质性让它们很容易受到与气候变化有关的环境压力

土耳其建世界第三大种子基因库

  土耳其将在首都安卡拉建造世界第三大种子基因库,可保存25万种植物的基因。   土耳其农业和农村事务部部长穆罕默德·迈赫迪·埃克尔说,土耳其的种子基因库将成为世界第三大种子基因库,仅次于美国和中国的种子基因库。它将从国内外收集并保存种子,用于科学实验,帮助土耳其开发农业潜力。   埃克尔说,土

探秘国家基因库:在这里读懂“生命天书”

  早已灭绝的猛犸象还能复活吗?利用在冻土层里发现的猛犸象完整个体,通过基因技术和干细胞技术获得猛犸象胚胎细胞,再为该细胞寻找合适的“代孕妈妈”,或许人们有一天可以见到这种在地球上曾经生活过的庞然大物。  过去,生物的遗传信息好像一本艰深的“生命天书”。现在,人们可以“读懂”乃至“编写”它。2011

转录因子的转录调控区的介绍

  同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。  转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10

关于体外转录的转录条件介绍

  转录模板必须满足:  1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列;  2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高;  3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。

关于转录因子的转录抑制区的介绍

  也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。  转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核