北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库
随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构建标准化数据分析流程和结构化元信息审编模型，建立面向多物种基因转录特征的数据集成与管理资源十分必要。 近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心在Nucleic Acids Research上，发表了题为Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell lev......阅读全文
中国科学家成功破译飞蝗基因组图谱
1月14日，由中国科学院动物研究所康乐院士领衔， 深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究，成功破译了飞蝗(Locusta migratoria)的全基因组序列图谱，这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息，这项研究还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。研究成果
接近完整：高质量白菜基因组图谱发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组，揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》（Plant Biotechno
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道，2月6日，美国加州Illumina生物技术公司宣布，他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前，科学家已经对两位白人男性（James Watson和Craig Venter）和一位中国男性进行了全基因组测序，但从未对非洲人进行研究。因此，这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男
最新Science公布人类基因组重组图谱
来自美国国立卫生研究院NIH，美国健康科学统一服务大学等处的研究人员发表了题为“Recombination initiation maps of individual human genomes”的文章，构建出了一张人类基因组中染色体交换遗传信息的详细图谱，这将有助于解析这些位点如何影响人类基因
科学家破译枸杞子基因组图谱
枸杞作为传统的药食同源植物，含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖（LBPPs）是重要的生物活性成分，具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等功效。尽管枸杞在健康领域应用较多，但对枸杞的遗传图谱、枸杞活性成份LBPPs的合成过程和调控机制知之甚少。这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展与推广。 近日，中国科学院院
迄今最全面的非编码基因组图谱问世
生命科学 非编码 DNA 延伸段在发育和基因调控中发挥着关键作用。2 月 3 日发表在《自然》（Nature）上的一项新研究称，来自美国麻省理工学院（MIT）的研究团队发表了迄今为止最全面的非编码基因组图谱，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
科学家完成糜子全基因组精细图谱
1月25日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图
山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制
山苍子，是我国南方家喻户晓的一种香树，其果实有香气，无毒，可治疗急性肺炎，有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄 4月3日，《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所（以下简称亚林所）研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色
光滑双脐螺免疫细胞基因组图谱完成
科技日报北京12月20日电 （记者张梦然）施普林格自然出版社旗下《免疫遗传学》杂志近日公布了世界上第一份曼氏血吸虫中间宿主免疫细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）的比较基因组学和转录组学科学成果，该成果是由中国北部湾大学和加拿大阿尔伯塔大学共同主持。 光滑双脐螺是世界上排名第二的最重大
《Cell》：如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日，这一计划已经取得了许多成果，最新Cell杂志公布了泛癌症图谱（Pan-Cancer Atlas），这也是癌症基因组图谱（TCGA）的收官项目，同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表，以及相关的一些主要发现（每种肿瘤类型的标记论文）。 生物通报道：2005年美国国立
中国启动十万人基因组计划：绘制国人精细基因组图谱
科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱，来研究疾病健康和基因遗传的关系。 此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区，涉及人群除汉族外，还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。 基因是DNA上有遗传效应的片断，人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和
破译对虾基因组－获国际首个高质量对虾基因组参考图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队，与国内外多家单位共同合作，历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组，获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱，研究成果于1月21日在《自然-通讯》（Nature communications）在线发表，为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
海洋所成功破译对虾基因组并获得国际首个基因组图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队，与国内外多家单位共同合作，历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组，获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱，研究成果于1月21日在《自然-通讯》（Nature communications）在线发表，为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日，由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日，《园艺研究》（Horticulture Research）在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD（http://citgvd.cric.cn/home），这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前，柑桔类物
香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱
香港中文大学7日宣布，该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱，这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况，并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。 鼻咽癌是华南地区常见的癌症，也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍，鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征，60%至70%患者于确诊时已届晚
Science：绘制一张复杂疾病基因组图谱
尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素，但是要解释这些数据，还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。 近期Science杂志发布了最新研究成果，解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络，并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》：有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行
我国公布世界首个辣木基因组图谱
记者从云南农业大学获悉：由云南农业大学、云南省高原特色农业产业研究院等6家单位联合组成的科研团队，经过一年多的努力，破译了辣木的三亿一千六百万对碱基排序，完成了世界上首个辣木基因组精细图谱绘制工作。该基因组的解析，为辣木的育种、药理研究、病虫害防治、推广等提供了重要的依据，将辣木研究带入到分子育
我国完成世界首张－西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头，联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位，共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译，获得了高质量的西瓜基因组序列图谱，成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱，为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源（Molecular Ecology Reso
我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱
华中农业大学今天透露，该校科研人员经过一年多努力，已绘制完成甜橙的全基因组序列图谱。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。这一农业科技基础研究成果，将对加快我国柑橘品种改良，改变柑橘品种大量依赖进口的状况，提升我国柑橘产业的核心竞争力起到重要作用。 据悉，柑橘是世界栽培面积
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
全球首张榨菜高质量基因组图谱问世
9月6日，《自然-遗传》（Nature Genetics）杂志在线发表了浙江大学农业与生物技术学院园艺系教授张明方团队的最新研究成果，课题组通过高通量测序技术，绘制了世界上第一张榨菜全基因组图谱，并从基因组选择与进化层面解答了榨菜“家乡味”的成因，这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前，中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制，探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等，在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物，进化学家推测这些双侧对称动物可能起
致榆树枯萎病真菌基因组图谱绘制完成
据《每日科学》网站近日报道，加拿大多伦多大学研究人员宣布，他们已成功绘制出可引起榆树枯萎病的真菌的基因图谱，该图谱包含有3000万个DNA(脱氧核糖核酸)字符。此项研究成果发表在本周《BMC基因组学》网络版上。 研究报告作者之一、多伦多大学细胞和系统生物学助理教授艾伦·摩西称，从本质上说，
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译，相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。过去，各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
Nature里程碑成果：扩展人类表观基因组图谱
10年前，科学家们宣布人类基因组计划(Human Genome Project)完工。通过这一国际项目人们旨在了解人类独特的四种核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤的组合。这一生物学字母表帮助研究人员确定了人类基因组中大约2.5万个编码基因，然而随着时间的推移，他们开始提出一些关于这些
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源：英国《新科学家》网站 20年前，科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸（DNA），其实，他们漏掉了少许。现在，由于读取DNA方法的改进，科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了！据生物预印本网站（biorxiv）近日报道，美国科学家对全部