北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库
随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息，服务生物医学基础研究领域需求，构建标准化数据分析流程和结构化元信息审编模型，建立面向多物种基因转录特征的数据集成与管理资源十分必要。 近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心在Nucleic Acids Research上，发表了题为Gene Expression Nebulas (GEN): a comprehensive data portal integrating transcriptomic profiles across multiple species at both bulk and single-cell lev......阅读全文
牡蛎全基因组序列图谱绘制完成
牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划（OGP）团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物 牡蛎养殖 近日，牡蛎基因组计划（Oyster Genome Project，OGP）项目组宣布，
－首个越南人基因组图谱绘制完成
越南科学家日前首次成功绘制出一名越南人的基因组图谱。 越通社报道说，来自河内国家大学下属科技大学的研究小组1月16日公布了这份基因组图谱绘制与分析的初步结果。 该研究组主任黎士荣表示，2013年年底，研究小组收到一名越南人的基因组数据，在此基础上对其进行分析排序，成功绘制出基因组图谱
历经13年－小麦基因组图谱绘制完成
经过１３年努力，来自２０个国家７３个研究机构的２００多名科学家终于绘制完成完整的小麦基因组图谱。这项“里程碑”工作为培育产量更高、营养更丰富、气候适应性更强的小麦品种奠定基础。 国际小麦基因组测序协会１６日在说，他们以一种叫做“中国春”的小麦遗传研究模式品种为材料，研究整合了２１条小麦染色
新研究解析栽培草莓“祖先”基因组图谱
草莓具有重要的经济价值和营养价值，现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种——弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹课题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关成果在线发表于《自然-植物》。 朱安丹表示，由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体
研究解析栽培草莓“祖先”的基因组图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507227.shtm草莓具有重要的经济和营养价值，现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹专题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化
Nature新文章绘制油棕榈基因组图谱
一个由多国科学家组成的研究小组，确定了一种称之为Shell的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源，并且是最有前景的生物燃料来源之一。 新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱，并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努
首个棉花泛基因组图谱助力分子育种
近日，华中农业大学棉花遗传改良团队发表了题为“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究论文，公布了目前为止变异类型最丰富的棉花遗传变异数据集。文章
高质量的巴戟天基因组图谱发布
中药材巴戟天来源于茜草科植物巴戟天（Morinda officinalis How）的干燥根，是我国著名的“四大南药”和“十大广药”之一，具有1700余年药用历史，并收载于历版《中华人民共和国药典》。巴戟天在广东省的栽培面积最大，产量占全国总产量的90%以上，肇庆市高要、德庆等地为历史道
研究解析栽培草莓“祖先”的基因组图谱
草莓具有重要的经济和营养价值，现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹专题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关研究成果在线发表于《自然-植物》。朱安丹表示，由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全
黄种人将有首张基因组图谱
我国科学家绘制完成 有利实现个性化诊治 世界上第一个黄种人基因组序列图即将由中国科学家绘制完成，这项工作正在位于深圳市盐田区的深圳华大基因研究院内紧锣密鼓地进行着。 该研究计划被命名为“炎黄一号”。计划发言人叶佳说，以黄种人的基因组图谱为研究目标，将为黄种人的
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试
本报讯 日前，中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台（hevea.catas.cn）上线运行，并在国际橡胶研究与发展委员会（IRRDB）各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试，数据库平台各项指标保持稳定，运行可靠，达到
武汉科研团队破译并公布莲基因组数据库
近日，武汉市园林科学研究院和中科院武汉植物园携手研发出破译荷花遗传密码的莲基因组数据库。日前，该数据库在国际知名学术期刊公布，供各国荷花研究人员免费共享。 据介绍，水生植物莲是地球上最早出现的开花植物之一。研究发现，早在约1.4亿年前蕨类植物和恐龙称霸地球的时代，在北半球许多水域已有莲的分布。
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》（PLoS ONE）期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试
日前，中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台（hevea。catas。cn）上线运行，并在国际橡胶研究与发展委员会（IRRDB）各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试，数据库平台各项指标保持稳定，运行可靠，达到预期效果。
世界最大的自闭症基因组数据库公布
自闭症，或称为自闭症谱系障碍，是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知，自闭症分好多亚型，大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计，每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然，目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
科研人员开发出分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及相关特征（如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等）对于研究基因功能和物种演化具有重要意义，是理解不同物种、不同基因家族以及不同功能基因之间差异的数据基础。 近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的分子
美科学家绘制出瓜类基因组图谱
炎炎夏日，以西瓜为代表的各种瓜类成为人们最爱。美国科研人员最新报告说，他们绘制出了西瓜等瓜类的基因组图谱，将来有望利用基因技术开发出更甜、更可口、更健康的瓜类新品种。 得克萨斯农机大学科研人员在新一期《美国园艺科学协会杂志》上报告说，此前法国和西班牙研究人员曾经完成了瓜类某些DNA(脱氧核
中外科研人员绘出老虎基因组图谱
一个国际科研团队最近报告说，他们完成了对一只东北虎的基因组测序。这是人类首次获得老虎的全基因组图谱，有助研究大型猫科动物的遗传多样性和保护濒危动物。 这项研究由韩国、中国、俄罗斯、蒙古国等国科研人员共同完成，测序目标是韩国首尔一家动物园中一只9岁的雄性东北虎，历时三年绘制出它的完整基因组图
黄种人基因组图谱有望在深圳面世
记者昨天（２９日）获悉，人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深圳面世，并计划在今年高交会期间向全世界发布。为实现这一目标，目前，百余位深圳华大基因研究院科学家正在紧张有序地进行相关工作。 人类的基因图谱非常复杂，但破解人类的基因组图谱，对制药和医疗等方面的作用非常巨大。基因工程技
接近完整：高质量白菜基因组图谱发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组，揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》（Plant Biotechno
迄今最全面的非编码基因组图谱问世
生命科学 非编码 DNA 延伸段在发育和基因调控中发挥着关键作用。2 月 3 日发表在《自然》（Nature）上的一项新研究称，来自美国麻省理工学院（MIT）的研究团队发表了迄今为止最全面的非编码基因组图谱，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
中国科学家成功绘制人参基因组图谱
3月4日，在钓鱼台国宾馆中国人参基因组图谱新闻发布会上，中科院基因组所副所长、世界知名基因组学专家于军向媒体公布：经过吉林省通化市政府、中科院北京基因组研究所、吉林紫鑫药业的共同努力，于2月底成功绘制出人参基因组图谱，揭开了人参的神秘面纱，为人参的种植、防病、开发与人参产业发展振兴提供
我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制
4月15日，深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱，这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后，我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只，这一研究成果将对于挽救和保护朱
《Cell》：如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日，这一计划已经取得了许多成果，最新Cell杂志公布了泛癌症图谱（Pan-Cancer Atlas），这也是癌症基因组图谱（TCGA）的收官项目，同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表，以及相关的一些主要发现（每种肿瘤类型的标记论文）。 生物通报道：2005年美国国立
科学家完成糜子全基因组精细图谱
1月25日，《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图
光滑双脐螺免疫细胞基因组图谱完成
科技日报北京12月20日电 （记者张梦然）施普林格自然出版社旗下《免疫遗传学》杂志近日公布了世界上第一份曼氏血吸虫中间宿主免疫细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）的比较基因组学和转录组学科学成果，该成果是由中国北部湾大学和加拿大阿尔伯塔大学共同主持。 光滑双脐螺是世界上排名第二的最重大
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
中国科学家成功破译飞蝗基因组图谱
1月14日，由中国科学院动物研究所康乐院士领衔， 深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究，成功破译了飞蝗(Locusta migratoria)的全基因组序列图谱，这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息，这项研究还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。研究成果
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道，2月6日，美国加州Illumina生物技术公司宣布，他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前，科学家已经对两位白人男性（James Watson和Craig Venter）和一位中国男性进行了全基因组测序，但从未对非洲人进行研究。因此，这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男