Science：研究人员利用人工智能成功预测蛋白相互作用
在一项新的研究中，来自美国德克萨斯大学西南医学中心和华盛顿大学等研究机构的研究人员利用人工智能（AI）和进化分析构建出真核生物蛋白相互作用的三维模型。他们首次鉴定出100多种可能的蛋白复合物，并为700多种以前未被描述的蛋白复合物提供了结构模型。对成对或成组的蛋白如何结合在一起执行细胞过程的深入了解可能会带来大量新的药物靶标。相关研究结果于2021年11月11日在线发表在Science期刊上，论文标题为“Computed structures of core eukaryotic protein complexes”。论文通讯作者为德克萨斯大学西南医学中心的Qian Cong博士和华盛顿大学的David Baker博士。论文第一作者为华盛顿大学的Ian R. Humphreys、Minkyung Baek和Aditya Krishnakumar以及德克萨斯大学西南医学中心的Jimin Pei。 Cong博士说，“我们的结果......阅读全文
《自然》发表研究：人工智能破解蛋白质复合物密码
在蛋白质结构预测上，人工智能革命仍在继续。一年前，软件程序首次成功地模拟了单个蛋白质的3D形状，其精确度与几十年前的实验技术测出的一样准确。今年夏天，研究人员利用人工智能程序编程了一个近乎完整的人类蛋白质结构目录。 现在，美国研究人员更进一步，使用人工智能技术确定了不同蛋白质之间可能的相互作用
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
蛋白质复合物的组装
正确组装多蛋白复合物很重要，因为组装错误会导致灾难性的后果。为了研究通路组装，研究人员研究了通路中的中间步骤。一种允许这样做的技术是电喷雾质谱法，它可以同时识别不同的中间状态。这导致发现大多数复合物遵循有序的组装路径。在可能发生无序组装的情况下，由于无序组装导致聚集，从有序状态到无序状态的改变导致复
蛋白质复合物的结构
蛋白质复合物的分子结构可以通过实验技术确定，例如X射线晶体学，单颗粒分析或核磁共振。蛋白质-蛋白质对接的理论选择也越来越多。是通常用于识别一个meomplexes方法是免疫沉淀。最近，Raicu及其同事开发了一种确定活细胞中蛋白质复合物的四级结构的方法。该方法基于确定像素级Förster共振能量转移
蛋白质复合物的类型介绍
专性vs非专性蛋白质复合物如果蛋白质可以在体内自身（没有任何其他相关的蛋白质）形成稳定的折叠良好的结构，则由这种蛋白质形成的复合物称为“非专性蛋白质复合物”。但是，某些蛋白质不能单独产生稳定的折叠结构，而可以作为稳定复合蛋白质的蛋白质复合物的一部分而被发现。这样的蛋白质复合物被称为“专性蛋白质复合物
蛋白质复合物的功能介绍
蛋白质复合物的形成有时起到激活或抑制一个或多个复合物成员的作用，因此，蛋白质复合物的形成可以类似于磷酸化。单个蛋白质可以参与各种不同蛋白质复合物的形成。不同的复合体执行不同的功能，并且相同的复合体可以执行取决于多种因素的非常不同的功能。其中一些因素是：包含复合物时，复合物存在于哪个隔室中复合物存在于
Cell头条：首张人类蛋白复合物图谱
来自加拿大多伦多大学，英国伦敦大学的研究人员采用了一种综合性整体蛋白质组分析方法，构建了三千多个人可溶性蛋白之间多达上万个高可信度的物理相互作用，这添补了之前科学家们对于人类蛋白复合物知之甚少的空白，为深入了解核心生物进程提供了重要信息。相关成果公布在Cell杂志上。 领导这项研究的是包括
蛋白质复合物的特点和功能
蛋白质复合物是一组两个或多个相关联的多肽链。不同的多肽链可以具有不同的功能。这不同于多酶复合物，其中在单个多肽链中发现多个催化结构域。蛋白质复合物是四级结构的 一种形式。蛋白质复合物中的蛋白质通过非共价 蛋白质与蛋白质的相互作用联系在一起，不同的蛋白质复合物随时间推移具有不同程度的稳定性。这些复合物
脑信号传输与核心蛋白复合物有关
人类的大脑就像是一个有机超级计算机，它能有条不紊井然有序迅速地解决从呼吸到猜谜等所有难题。近日科学家首次描述了神经细胞是如何在瞬间管理其信号的传输过程，该研究成果发表在最近出版的《科学》杂志上。 神经系统细胞使用多巴胺、血清素及去甲肾上腺素等小分子神经递质进行沟通。多巴胺与
免疫复合物方法检测酪氨酸蛋白激酶
基 本 方案 酪 氨酸 蛋白 激酶 的免 疫 沉淀 和自 身 磷 酸化 检 测以下步骤可以釆用淋巴或非淋巴细胞、原代细胞或培养的细胞系、活化或非活化的细胞。材 料（带 V 项 目 见 附 录 1)待检测的细胞 冰预冷的 PBS含蛋白酶抑制剂的 I X 细 胞 裂 解 液（新鲜配置并于冰上保存）含蛋白
线粒体呼吸链膜蛋白复合物Ⅰ的结构揭晓
德国科学家成功揭示细胞线粒体呼吸链膜蛋白复合物Ⅰ的结构，并发现了分子复合物中的全新能量转换机制，细胞可通过该机制使用储存在营养中的能量。相关研究成果发表在7月1日的《科学》杂志网络版上。 有氧呼吸是动植物进行呼吸作用的主要形式，细胞在氧的参与下，通过酶的催化作用将糖类等有机
帕金森病之SCF蛋白复合物分解α突触核蛋白聚集物机制
一项新的研究中，来自瑞士苏黎世联邦理工学院、苏黎世大学医院和美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现了脑细胞用来保护它们自己免受蛋白聚集物损伤的新机制。这一新发现可能为新的治疗方法提供基础。相关研究结果近期发表在Science Translational Medicine期刊上，论文标题为“A c
不均一核糖核蛋白复合物的制备实验
实验方法原理 在核内，RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白，不均一核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucUoprotein，hnRNP) 结合形成 hnRNP 复
不均一核糖核蛋白复合物的制备实验
实验方法原理 在核内，RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白，不均一核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucUoprotein，hnRNP) 结合形成 hnRNP 复合物。实验材料 HeLa S3 细胞抗体试剂、试剂盒 免疫
蛋白复合物Paf1：携带基因致病的奥秘
一个人生病的因素有多种多样，但不外乎于内因和外因两类。内在因素中最根本的就是基因，医学研究表明，所有的疾病或多或少都和基因有一些关联，主要是由于基因表达发生突变造成。基因的表达调控如何控制生物体的发育，又是怎样影响人体的健康与疾病？这是世界各国科学家竞相研究的热门课题。图片来源于网络 日前，
不均一核糖核蛋白复合物的制备实验
在核内，RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白，不均一核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucUoprotein，hnRNP) 结合形成 hnRNP 复合物。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理在核内
GPCRG蛋白复合物形成过程的结构见解
G蛋白偶联受体（GPCR）构成最大的细胞表面受体家族，其感知细胞外信号并激活细胞内途径。激动剂结合的GPCR与鸟苷二磷酸（GDP）结合的Gαβγ异源三聚体相互作用，导致GDP释放和鸟苷三磷酸（GTP）结合，然后异源三聚体的功能性解离和下游途径的激活。GPCR通常优先激活调节不同细胞信号传导途径的三种
马尔堡病毒核蛋白RNA复合物形成结构
京都大学领导的研究小组正在利用最近获得的马尔堡病毒核心结构的知识，试图通过它的角提取马尔堡病毒。最近的一项研究结果表明，未来的药物开发可能基于核衣壳形成的目标，这可能会抑制马尔堡病毒的复制能力。“在非洲马堡病毒和埃博拉病毒的零星和反复爆发导致严重出血热的情况下，既没有针对马堡病毒的特殊治疗方法，也没
研究揭示MLL家族蛋白复合物活性调节分子机制
中科院上海生科院生化与细胞所国家蛋白质科学中心（上海）雷鸣、陈勇研究组和中科院大连化学物理研究所李国辉研究组在最新的合作研究中，解析了一类重要的组蛋白甲基转移酶MLL家族蛋白复合物的结构，并阐释了其活性调控的分子机制。相关研究成果2月18日以长文形式在线发表于《自然》。 以基因组DNA和组蛋白
脊椎动物蛋白复合物可激发无疤痕组织修复
疤痕是人体创伤修复中常见的副产物，它不仅会影响容貌美观，还可能导致严重的临床功能障碍。促进组织再生修复、又避免和减少疤痕形成，是人们努力探究的重要课题。8月15日来自中国科学院昆明动物研究所的消息，该所在孔道形成蛋白复合物激发无疤痕组织修复研究方面取得了重要进展。 组织修复是动物生存期间面临的
光合膜蛋白超分子复合物精细结构获解析
5月29日，美国《科学》杂志以封面文章的形式发表了中国科学院植物研究所沈建仁和匡廷云研究团队的一项突破性研究成果，研究人员获得了高等植物光系统I（PSI-LHCI）光合膜蛋白超分子复合物2.8?魡的世界最高分辨率晶体结构。 科研人员经过多年的累积，首次全面解析了高等植物PSI-LHCI光合膜蛋
我科学家成功解析MLL家族蛋白复合物结构
中科院上海生科院生化与细胞所国家蛋白质科学中心（上海）雷鸣、陈勇研究组和中科院大连化学物理研究所李国辉研究组近日成功解析出甲基转移酶MLL家族蛋白复合物的结构，并阐释了其活性调控的分子机制。国际学术期刊《自然》2月18日以长文形式在线发表该成果。 以基因组DNA和组蛋白的共价修饰为主要标志的表
人工智能可从头开始设计灭菌蛋白
美国科学家在最新一期《自然·生物技术》杂志上发表论文指出，他们开发出一款新的人工智能（AI）工具ProGen，其能从头开始设计出已被证明有效的抗菌蛋白质，最新方法有望用于研制新药。 蛋白质由氨基酸链组成，这些氨基酸的顺序决定了蛋白质的形状和功能。在最新研究中，加州生物技术初创公司Profilo
反义亲和层析法纯化及去除核蛋白复合物实验
实验材料 HeLa 细胞试剂、试剂盒 NaCl 洗液Laemmli 上样缓冲液ATP磷酸肌酸无菌蒸馏水尿素缓冲液MD 0.1MD 0.6KCl 洗液链亲和素琼脂糖凝胶封闭缓冲液NP-40仪器、耗材 链亲和素琼脂糖凝胶Dounce 玻璃匀浆器微量透析杯透析袋实验步骤 一、材料与设备1. AAS 法纯化
新质谱技术可获取完整蛋白复合物重要结构信息
本周的《自然―方法学》介绍了一种提高质谱仪分辨率和可用性的改进方法，科研人员可利用该方法获得完整蛋白复合物的重要结构信息。 关于大型蛋白复合物的详细结构信息包括可与之结合的分子有哪些、该复合物是如何组成的等，是可以通过使用能检测高分子量离子的质谱技术来获得的。迄今为止，这项技术的实现需要采用特殊定
德国应用化学：蛋白质复合物原位解析新技术
作为生命活动的执行者，蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和
反义亲和层析法纯化及去除核蛋白复合物实验
实验材料HeLa 细胞试剂、试剂盒NaCl 洗液Laemmli 上样缓冲液ATP磷酸肌酸无菌蒸馏水尿素缓冲液MD 0.1MD 0.6KCl 洗液链亲和素琼脂糖凝胶封闭缓冲液NP-40仪器、耗材链亲和素琼脂糖凝胶Dounce 玻璃匀浆器微量透析杯透析袋实验步骤一、材料与设备1. AAS 法纯化 RNP
临床化学检查方法介绍含甲状腺球蛋白免疫复合物
含甲状腺球蛋白免疫复合物（TG-IC）介绍： 含甲状腺球蛋白免疫复合物测定对诊断甲状腺疾病有一定意义。含甲状腺球蛋白免疫复合物（TG-IC）正常值： 阴性。 (注：具体参考值请根据各实验室而定。)含甲状腺球蛋白免疫复合物（TG-IC）临床意义： 异常结果： 阳性：甲状腺功能亢进症、慢性淋巴
多蛋白复合物的癌症精准治疗范式，有望攻克肿瘤领域
蛋白质是细胞功能的执行者，蛋白互作网络(Protein-Protein Interaction,PPI)通过蛋白之间的相互作用参与基因调节、基因表达、信号传递、代谢及周期调控等各个环节。在肿瘤恶化过程中，细胞中蛋白质互作网络会发生改变，然而，目前并没有针对这种变化的诊断工具。 近日，纪念斯隆