《自然》发表研究：人工智能破解蛋白质复合物密码
在蛋白质结构预测上，人工智能革命仍在继续。一年前，软件程序首次成功地模拟了单个蛋白质的3D形状，其精确度与几十年前的实验技术测出的一样准确。今年夏天，研究人员利用人工智能程序编程了一个近乎完整的人类蛋白质结构目录。 现在，美国研究人员更进一步，使用人工智能技术确定了不同蛋白质之间可能的相互作用，以及由这种相互作用产生的“复合体”是什么样子的。相关研究结果发表于《科学》。 斯坦福大学系统生物学家Michael Snyder表示，这项新发现会促进细胞生物学领域产生一系列新观点，并为发现下一代治疗药物指明新方向。 几十年来，精确重现人类蛋白质的形态和结构，一直是研究人员的目标。过去，要追求这个目标是很困难的，需要昂贵且缓慢的实验，如X射线晶体学和核磁共振光谱学实验。而且，即使实验取得进展，也只能得到单个蛋白质某些结构。 计算机专家一直致力于加快实现该目标的速度。借助人工智能和深度学习算法，使用实验解决的蛋白质结构数据库来训......阅读全文
《自然》发表研究：人工智能破解蛋白质复合物密码
在蛋白质结构预测上，人工智能革命仍在继续。一年前，软件程序首次成功地模拟了单个蛋白质的3D形状，其精确度与几十年前的实验技术测出的一样准确。今年夏天，研究人员利用人工智能程序编程了一个近乎完整的人类蛋白质结构目录。 现在，美国研究人员更进一步，使用人工智能技术确定了不同蛋白质之间可能的相互作用
蛋白质复合物的组装
正确组装多蛋白复合物很重要，因为组装错误会导致灾难性的后果。为了研究通路组装，研究人员研究了通路中的中间步骤。一种允许这样做的技术是电喷雾质谱法，它可以同时识别不同的中间状态。这导致发现大多数复合物遵循有序的组装路径。在可能发生无序组装的情况下，由于无序组装导致聚集，从有序状态到无序状态的改变导致复
蛋白质复合物的结构
蛋白质复合物的分子结构可以通过实验技术确定，例如X射线晶体学，单颗粒分析或核磁共振。蛋白质-蛋白质对接的理论选择也越来越多。是通常用于识别一个meomplexes方法是免疫沉淀。最近，Raicu及其同事开发了一种确定活细胞中蛋白质复合物的四级结构的方法。该方法基于确定像素级Förster共振能量转移
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
科学家将人工智能技术成功用于蛋白质复合物结构预测
蛋白质作为构成人体组织器官的支架和主要物质，在人体生命活动中起着重要作用。蛋白质的相互作用能产生许多效应，如形成特异底物作用通道、生成新的结合位点、失活、作用底物专一性和动力学变化等，细胞的代谢、信号传导以及基因表达调控都与错综复杂的蛋白质相互作用网络密切相关。 蛋白质的三维空间结构对蛋白质相
蛋白质复合物的功能介绍
蛋白质复合物的形成有时起到激活或抑制一个或多个复合物成员的作用，因此，蛋白质复合物的形成可以类似于磷酸化。单个蛋白质可以参与各种不同蛋白质复合物的形成。不同的复合体执行不同的功能，并且相同的复合体可以执行取决于多种因素的非常不同的功能。其中一些因素是：包含复合物时，复合物存在于哪个隔室中复合物存在于
蛋白质复合物的类型介绍
专性vs非专性蛋白质复合物如果蛋白质可以在体内自身（没有任何其他相关的蛋白质）形成稳定的折叠良好的结构，则由这种蛋白质形成的复合物称为“非专性蛋白质复合物”。但是，某些蛋白质不能单独产生稳定的折叠结构，而可以作为稳定复合蛋白质的蛋白质复合物的一部分而被发现。这样的蛋白质复合物被称为“专性蛋白质复合物
蛋白质复合物的特点和功能
蛋白质复合物是一组两个或多个相关联的多肽链。不同的多肽链可以具有不同的功能。这不同于多酶复合物，其中在单个多肽链中发现多个催化结构域。蛋白质复合物是四级结构的 一种形式。蛋白质复合物中的蛋白质通过非共价 蛋白质与蛋白质的相互作用联系在一起，不同的蛋白质复合物随时间推移具有不同程度的稳定性。这些复合物
科学家开发蛋白质复合物原位解析新技术
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500192.shtm作为生命活动的执行者，蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显
德国应用化学：蛋白质复合物原位解析新技术
作为生命活动的执行者，蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和
祝贺！人工智能首次成功解析蛋白质结构
生物学界最大的挑战之一——蛋白质三维结构解析如今有望被破解。谷歌旗下人工智能公司DeepMind开发的深度学习程序AlphaFold能够精确预测其三维形状。长久以来，人们需要借助实验确定完整的蛋白质结构，这些方法往往需要数月甚至数年时间。而现在，人工智能也有能力给出精确预测的计算方法，可能只要几
先天免疫相关蛋白质复合物结构与功能研究计划启动
3月27日，蛋白质研究国家重大科学研究计划“先天免疫相关蛋白质复合物结构与功能的研究”项目部署会在北京召开。项目首席科学家清华大学柴继杰教授介绍了项目的总体情况、整体研究目标和课题间的相互衔接和依托关系，并就项目管理、经费使用、课题和单位间的协作互动等提出了具体要求，各课题负责人介绍了课题的准备
研究利用人工智能预测蛋白质“光学指纹”
蛋白质是生命的基石，生物的功能依赖于既稳定而又灵活可变的蛋白质结构。蛋白质的光谱响应信号，尤其是紫外光谱，可以称之为蛋白质骨架的“指纹”。这个“光学指纹”，经过理论模拟的解读，可以揭示出精确的蛋白质结构，为生命科学和医学诊断提供极其重要的信息。 然而，蛋白质的结构极其复杂多变，需要做大量的高精
中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术
近日，中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通
科学家提出蛋白质—配体复合物柔性结构预测方法PackDock
作为细胞的“主力军”，蛋白质往往通过与小分子配体或其他蛋白质发生特异性结合来发挥功能。然而，蛋白质结构具有天然的动态性，配体结合也常伴随构象变化。因此，获得准确的结合构象是基于结构药物设计的重要前提。近日，中国科学院上海药物研究所研究团队提出了蛋白—配体复合物柔性结构建模新方法PackDock。该方
科学家提出蛋白质—配体复合物柔性结构预测方法PackDock
作为细胞的“主力军”，蛋白质往往通过与小分子配体或其他蛋白质发生特异性结合来发挥功能。然而，蛋白质结构具有天然的动态性，配体结合也常伴随构象变化。因此，获得准确的结合构象是基于结构药物设计的重要前提。近日，中国科学院上海药物研究所研究团队提出了蛋白—配体复合物柔性结构建模新方法PackDock。该方
2025蛋白质组学大会之聚焦计算与人工智能蛋白质组学
2025年10月14日上午，计算与人工智能蛋白质组学（Computational and AI Proteomics）专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者谢鹭教授、温翰教授、迟浩教授、曾文锋教授、Yasset Perez-Riverol教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的
人工智能成功预测蛋白质的相互作用
美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出，他们利用人工智能和进化分析，绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型，首次确定了100多个可能的蛋白质复合物，并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型，深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。 研究负责人之一、美国西南大学人类发
人工智能设计的蛋白质能被“武器化”吗？
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518933.shtm人工智能设计的蛋白质能被用作生物武器吗？为了避免这种可能性，以及避免烦琐的政府监管，3月8日，美国研究人员发起了一项倡议，呼吁安全、合乎道德地使用蛋白质设计。美国西雅图华盛顿大学计算生
《科学》：人工智能几秒便可设计“原创”新蛋白质
今年6月，韩国监管机构批准了首款由人类设计的新型蛋白质制成的新冠肺炎疫苗。该疫苗基于一种球形蛋白质“纳米颗粒”，由研究人员在10年前通过劳动密集型试错攻关研制而成。现在，随着人工智能（AI）的巨大进步，美国西雅图华盛顿大学（UW）生物化学家David Baker领导的一个团队，只需几秒钟——而不是几
2025蛋白质组学大会之人工智能与教育
2025年10月13日上午10点10分在广州白云国际会议中心国际会堂揭阳厅，第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会分论坛“人工智能与教育 Artificial Intelligence and Educatin”顺利举办。
基于人工智能的通用蛋白质工程方法成功开发
蛋白质工程基于蛋白质的灵活性，通过人工手段改变氨基酸序列，实现对蛋白质结构和功能的修饰和改造。与基因组工程相比，蛋白质工程可直接对蛋白质分子进行操纵，借助突变的迭代积累，快速完成蛋白功能优化和创新。蛋白质工程改造策略包括结构引导的蛋白质理性设计和定向进化，但这些方法往往依赖经验，存在实验周期长、成本
人工智能首次成功从零生成原始蛋白质
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515806.shtm （图片来源：IAN C. HAYDON）1月26日，美国Salesforce Research、Profluent Bio等机构在《自然-生物技术》上发表了一项研究成果，该研
基于人工智能的通用蛋白质工程方法成功开发
蛋白质工程基于蛋白质的灵活性，通过人工手段改变氨基酸序列，实现对蛋白质结构和功能的修饰和改造。与基因组工程相比，蛋白质工程可直接对蛋白质分子进行操纵，借助突变的迭代积累，快速完成蛋白功能优化和创新。 蛋白质工程改造策略包括结构引导的蛋白质理性设计和定向进化，但这些方法往往依赖经验，存在实验周期
C/D－RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理
上海光源用户研究发现C/D RNA蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理 1月27日，北京生命科学研究所叶克穷实验室在《自然》杂志发表了题为Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA
人工智能算法有助于快速分析蛋白质折叠结构
近日，英国《自然》杂志报道，美国哈佛大学医学院生物学家AlQuraishi开发出新型人工智能算法，能够快速分析预测蛋白质三维结构，大大提高蛋白质三维结构预测的效率，将预测时间从若干小时或几天缩短至几毫秒。 报道称，蛋白质三维结构与蛋白质功能密切相关，当前生物学界一大挑战在于如何基于氨基酸序列预测蛋
蛋白质组学新进展：关键技术和人工智能
蛋白质组学是关于蛋白质组的研究，这是一个不断发展的领域。它提供了对支撑细胞、组织和整个生物体内生物状态的分子过程的全面理解。科学研究的各个领域，包括人类、动物和植物生物学、个性化医学和法医学，都在快速发展的过程中，这主要归功于蛋白质组学技术、数据处理能力和数据共享方面的进步。在这篇文章中，我们将探讨
我所发表功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略综述
近日，我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组（1822组）王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授团队合作，发表了功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略的综述文章。 功能蛋白复合物的发现和结构—功能表征研究在理解和干预生物学过程中发挥着至关重要的作用。亲和纯化质谱（AP-MS）是发现功
蛋白质糖基化检测实验_生物素亲和素复合物观察糖蛋白
用生物素-亲和素复合物观察选择性标记糖蛋白实验材料蛋白样品试剂、试剂盒醋酸钠丙酮实验步骤一、过碘酸钠氧化糖蛋白样品1. 在 0.1 mol/L 醋酸钠 pH 4.5 缓冲液（50 mmol/L 磷酸钠，pH 7.4 ) 中制备蛋白溶液，在冰上预冷。2. 用水制备新鲜的 0.5 mol/L 过碘酸钠原
大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作（Nature Structural & Molecular Biology）基础上，再次与合作者利用结构生物学手段，揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的