Cell：绘制人类单细胞染色质可及性图谱
在人类细胞中，总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体，并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候，DNA才会从组蛋白中释放出来，裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录，染色质的这种特性叫做染色质可及性，暴露的区域被称为“开放染色质”。作为转录调控的核心区域，顺式作用元件附近的染色质通常具有较高的可及性，利用全基因组染色质可及性检测技术可鉴定出潜在的顺式作用元件。 近日，发表在《Cell》上的一项题为“A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome”的研究中，来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究团队利用单细胞测序技术在30个人类组织中分析了约60万个细胞，并通过与之前数据的集成分析识别了222个细胞亚型并注释了近120万个顺式作用元件，绘制了目前最大规模的人类单......阅读全文
Ecosphere：科学家首次绘制出了人类疾病全球图谱
近日，一篇发表在国际杂志Ecosphere上的研究论文中，来自北卡罗来纳州立大学的研究人员通过研究首次绘制了引发人类疾病的病原菌图谱，该图谱中研究人员将世界分为许多不同疾病发生的区域。 研究者表示，依据传播媒介相关的人类疾病，世界可以被分为7大区域，这些疾病媒介都包括通过害虫进行的传播，比如蚊
Ecosphere：科学家首次绘制出了人类疾病全球图谱
Ecosphere：科学家首次绘制出了人类疾病全球图谱 近日，一篇发表在国际杂志Ecosphere上的研究论文中，来自北卡罗来纳州立大学的研究人员通过研究首次绘制了引发人类疾病的病原菌图谱，该图谱中研究人员将世界分为许多不同疾病发生的区域。 研究者表示，依据传播媒介相关的人类
研究成果：灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱绘制
海马体作为脑的重要组成部分，在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长，海马功能逐渐退化，导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂，细胞组成具有高度异质性，传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外，由于伦理及样本来源的限制，不同年龄
科学家构建人类发育细胞图谱
目前，发育生物学的研究主要基于模式生物。由于实践上存在的挑战，人类的胚胎发育（从受精卵到胎儿出生）仍是一个知之甚少的“黑匣子”。近期，来自多国研究机构的一项联合研究阐述了人类发育细胞图谱及妊娠期参考图谱构建的路线图，相关成果发表在《Nature》杂志，标题为“A roadmap for the
Nature：科学家构建人类发育细胞图谱
目前，发育生物学的研究主要基于模式生物。由于实践上存在的挑战，人类的胚胎发育（从受精卵到胎儿出生）仍是一个知之甚少的“黑匣子”。近期，来自多国研究机构的一项联合研究阐述了人类发育细胞图谱及妊娠期参考图谱构建的路线图，相关成果发表在《Nature》杂志，标题为“A roadmap for the
Nature：科学家构建人类发育细胞图谱
目前，发育生物学的研究主要基于模式生物。由于实践上存在的挑战，人类的胚胎发育（从受精卵到胎儿出生）仍是一个知之甚少的“黑匣子”。近期，来自多国研究机构的一项联合研究阐述了人类发育细胞图谱及妊娠期参考图谱构建的路线图，相关成果发表在《Nature》杂志，标题为“A roadmap for the
Cancer－Discov－|－结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子
北京大学汤富酬及周鑫共同通讯在Cancer Discovery（IF 28）在线发表题为“Single-cell chromatin accessibility analysis reveals the epigenetic basis and signature transcription f
自动化所等绘制全新人类脑图谱
中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其它团队通过6年的努力，成功绘制出全新的人类脑图谱：脑网络组图谱。该图谱包括246个精细脑区亚区，以及脑区亚区间的多模态连接模式，突破了100多年来传统脑图谱绘制思想，引入了脑结构和功能连接信息对脑区进行精细划分和脑图谱绘制的全新思想和方
中国科学家绘制出全新人类脑图谱
中国科学院自动化所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其它团队通过6年的努力，成功绘制出全新的人类脑图谱：脑网络组图谱。该图谱包括246个精细脑区亚区，以及脑区亚区间的多模态连接模式，突破了100多年来传统脑图谱绘制思想，引入了脑结构和功能连接信息对脑区进行精细划分和脑图谱绘制的全新思想和方法，
中国科学家绘制出全新人类脑图谱
中国科学院自动化所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其它团队通过6年的努力，成功绘制出全新的人类脑图谱：脑网络组图谱。该图谱包括246个精细脑区亚区，以及脑区亚区间的多模态连接模式，突破了100多年来传统脑图谱绘制思想，引入了脑结构和功能连接信息对脑区进行精细划分和脑图谱绘制
保罗·艾伦的野心：绘制人类意识的基因图谱
在一个小房间黑色帘幕的后面，一台钛宝石激光发射器已经做好了向一个很出人意料的小目标发射激光的准备，这个目标就是通过手术植入一只活小鼠头骨内一个半厘米大的玻璃窗。如果一切正常，那么，小鼠在一个像跑步机一样的白球里跑动并看着一块计算机屏幕的时候，激光就会每千万亿分之一秒对目标照射一次。得益
生物物理所等绘制人类海马体发育细胞图谱
1月16日，《自然》（Nature）在线发表了题为Decoding the development of the human hippocampus 的研究论文。该工作系统阐明了人海马体胚胎发育过程中的基因表达调控网络和细胞命运决定因子，绘制了高精度发育细胞图谱，解析了海马发育过程中的不同细胞类
eLife：绘制出有史以来最为详细的人类抗体产生图谱
当病毒和细菌侵入人体时，免疫系统发起反击。B细胞涌入受影响的区域，释放寻求摧毁这些入侵者的抗体分子。这种抗体库的特色是存在许多种特定类型的抗体：一些抗体包裹入侵的病原体，或者阻断它们侵入健康的细胞，而其他的抗体产生能够加快愈合过程的炎症。如今，在一项新的研究中，来自美国斯坦福大学的研究人员首先绘制出
Cell头条：首张人类蛋白复合物图谱
来自加拿大多伦多大学，英国伦敦大学的研究人员采用了一种综合性整体蛋白质组分析方法，构建了三千多个人可溶性蛋白之间多达上万个高可信度的物理相互作用，这添补了之前科学家们对于人类蛋白复合物知之甚少的空白，为深入了解核心生物进程提供了重要信息。相关成果公布在Cell杂志上。 领导这项研究的是包括
农科院生物所研究团队绘制水稻根组织单细胞图谱
近日，中国农业科学院生物技术研究所谷晓峰团队和合作者绘制了单子叶模式植物水稻首个根组织单细胞分辨率转录组图谱，为研究植物细胞类型特化、功能和进化提供了新的途径。相关结果发表在国际学术期刊《分子植物（Molecular Plant）》上。 在植物整个生命过程中，根尖在不断地分化发育，形成的根系从
科学家绘制根瘤单细胞图谱，发现共生固氮新机制
生物固氮是农业可持续发展的重要方向之一，其中，豆科植物与根瘤菌共生固氮是全球生物固氮总量贡献最大的模式。根瘤是豆科植物与根瘤菌共生固氮的场所，在这一特殊器官中发生着复杂的物质、能量、信息交流与转化。根瘤可分为定型根瘤（如大豆、百脉根等）和不定型根瘤（如苜蓿、豌豆等），其中不定型根瘤呈现为棒状，
单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系
2019年10月8日，美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr
华人博士Cell绘制第三类脂肪遗传图谱
来自达纳法伯癌症研究所的科学家们从成人体内分离出了一种新型能量消耗脂肪细胞，他们称这种细胞可能具有治疗肥胖的潜力。相关成果发布在7月12日的《细胞》(Cell)杂志上，并将出版在7月20日的纸质版上。 文章的资深作者是著名的哈佛学者Bruce Spiegelman，其研究小组长期从事脂
有哪些常用的基准单细胞测序数据集？
以下是一些常用的基准单细胞测序数据集：Human Cell Atlas（HCA）：这是一个大规模的项目，旨在绘制人体所有细胞类型的图谱，包含了来自多个组织和器官的单细胞测序数据。10x Genomics 提供的一些公开数据集，例如 PBMC（外周血单核细胞）数据集。Mouse Cell Atlas：
浙大郭国骥团队绘制世界首个人类细胞图谱
近日，世界首个人类细胞图谱在浙大绘制成功。 北京时间2020年3月26日，浙江大学医学院郭国骥教授团队的这项研究成果在线发表于《自然》。 而在两年前，该研究团队在《细胞》上发表了世界首个小鼠细胞图谱。 “这项工作概括地说就是人体细胞数字化。”郭国骥表示，“我们能用数字矩阵描述每一个细胞的特
中外科学家Nature绘制人类肠道菌群图谱
所有人的肠道中都生存着上万亿的细菌。如果要以一个尺度来衡量它们，它的重量大约达到了1.5 kg。由于从前很难或是不太可能在实验室中培养它们，大部分的这些“看不见的乘客”都不为人所知。但在过去的5年里，由法国农业科学研究院(INRA)Jouy-en-Josas研究中心的S. Dusko
Nature重磅！利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱
肝脏是人体最大、功能最多的器官之一，在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是，肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%，就能够完全再生的内脏器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一，也是导致死亡的主要原因。 尽管肝脏对人类健康极为重要，但健康
Nature重磅！利用单细胞RNA测序构建人类肝脏细胞图谱
肝脏是人体最大、功能最多的器官之一，在人体的新陈代谢及免疫过程中发挥着关键作用。更值得关注的是，肝脏还是人体唯一一种仅需原体积的25%，就能够完全再生的内脏器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在内的各类肝病是当今世界最大的健康问题之一，也是导致死亡的主要原因。 尽管肝脏对人类健康极为重要，但健康
Nature：浙大领衔在构建人类单细胞图谱方面取进展
在一项新的研究中，来自中国浙江大学等研究机构的研究人员朝构建全面的人类单细胞图谱迈出了一大步。相关研究结果于2020年3月25日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在这
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎
高通量单细胞ChIPseq确定了乳腺癌染色质状态的异质性
近日，法国巴黎文理研究大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章，利用高通
汤富酬－乔杰再发文：绘制人类心脏高精度发育细胞图谱
人类胚胎发育是一个极其复杂的过程，从一个单细胞的受精卵开始，首先经过着床前胚胎发育产生胚内和胚外组织，再到着床后原肠胚阶段三个胚层的特化，进而到器官发生、分化、成熟，及至新生命的诞生。整个两百八十天的胚胎发育过程从一个单细胞受精卵增殖发育形成含有上万亿个细胞的婴儿，期间基因表达受到严密、精准的调
Cell、Nature－Medicine：绘制第三大常见癌症肠道细菌全图谱
很早，我们就知道癌症是由于不良生活习惯引起的，比如不健康的饮食或吸烟。近年来生活在我们身体内和身体上的微生物作为关键参与者进入了这个研究舞台，比如科学家们发现胃癌可以由单一细菌物种：幽门螺杆菌引起，但是关于全世界第三大常见癌症——结直肠癌的肠道细菌的影响，一直还没得到解答。 为了回答这个问题，
80后浙大教授《Cell》全球首次绘制哺乳动物细胞图谱
来自浙江大学医学院干细胞与再生医学中心，浙江大学生命科学研究院等处的研究人员发表了题为“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq”的文章，利用低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序平台，全球首次绘制出了哺乳动物细胞图谱。 这一研究成果公