CancerDiscov|结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

北京大学汤富酬及周鑫共同通讯在Cancer Discovery(IF 28)在线发表题为“Single-cell chromatin accessibility analysis reveals the epigenetic basis and signature transcription factors for the molecular subtypes of colorectal cancers”的研究论文,该研究利用单细胞染色质可及性分析揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子。 图片 结直肠癌形成了一个高度异质性的肿瘤群,分为不同的基因组亚型、表观基因组亚型和最近的转录组亚型。在CRC分类的不同方面,遗传和转录组学的变化得到了更广泛的研究和更好的理解。2015年,基于大量肿瘤样本的转录组谱,建立了CRC的共识分子亚型(CMS)。CRC分为4个CMS 类别(CMS1-4),分别以免疫浸润、WNT和MY......阅读全文

揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制

  结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。  近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛

Science:发现易患结直肠癌的遗传因子

        结肠直肠癌是工业化国家最常见的癌症。8月14日在线出版Science杂志刊发了最新研究论文,揭示了TGFBR1基因的变异体是促使某些人易患结肠直肠癌的遗传因子。        以前的研究已知,TGF-beta 信号通路对结肠直肠癌和其他肿瘤细胞的生长具有调控作用。而TGFB

武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子

  结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日,武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果,揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子,为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子,相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。  据介绍,目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转

科学家将血浆核小体表观遗传标记用于结直肠癌诊断

  结直肠癌是全球常见癌症,患者死亡率高,肿瘤转移是患者死亡的主要原因,早期筛查和诊断对于改善患者预后至关重要。常规的检查方法如肠镜和组织活检是侵入性的,过程痛苦且存在风险。因此,需要发展更有利于临床开展的结直肠癌检测方法。  近期,以色列魏兹曼科学研究所和希伯来大学研究团队在《Nature Bio

靶向表观遗传因子显奇效!

  12月11日,研究人员《Journal of Cell Biology》上发表了该项研究成果,文章标题为“SUV420H2 Is an Epigenetic Regulator of Epithelial/Mesenchymal States in Pancreatic Cancer ”(“SU

研究揭示先锋转录因子在协调心肌细胞表观遗传记的机制

   从单个全能受精卵产生广泛不同和特化的细胞类型涉及大规模转录变化和染色质重组。先锋转录因子在编程表观基因组中起关键作用,并在连续细胞谱系规范和分化步骤中促进其他调节因子的募集。  2019年4月25号,同济大学心律失常教育部重点实验室、同济大学附属东方医院课题组长孙云甫教授、梁兴群教授团队等在C

表观遗传学开关控制基因节律性转录

  当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。   Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期

分子遗传学词汇​转录因子

真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,TF

AJHG:科学家鉴别出新型的遗传性结直肠癌风险因子

  近日,一项刊登在国际杂志the American Journal of Human Genetics上的研究报告中,来自MIT博德研究所等机构的研究人员对将近3800名结直肠癌患者进行研究揭示了有望改善疾病风险筛查的机会及治疗手段,这是迄今为止最大的一项种系研究。个体患结直肠癌的风险有30%都是

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇转录延伸因子

中文名称:转录延伸因子英文名称:transcriptional elongation factor定  义:能够使基因转录不断进行的因子。如激活RNA聚合酶活性的蛋白质。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇通用转录因子

中文名称:通用转录因子 外文名称:general transcription factors, GTFs定义:通用转录因子(general transcription factors, GTFs)  。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子  。

揭开癌症转移的新面纱-原来他是“披着羊皮的狼”

  肿瘤转移是指肿瘤细胞从原发部位向渐进定植的远处器官移动,是导致肿瘤病人死亡的主要原因。据统计,大约有90%的肿瘤病人死于转移。转移过程中,癌细胞从原位组织浸出扩散,定殖于与原位组织不同的远端组织。  一百多年前,英国的外科医生Stephan Paget提出了关于肿瘤转移的“种子与土壤”学说,即转

表观遗传学:癌细胞耐药性,有我一份力!

   表观遗传学同药物之间作用  近日,美国范德比尔特大学科学家发现了一种肿瘤对西妥昔单抗(用于治疗晚期结直肠癌)产生抗性的非遗传因素。  该研究对应文章发表于最新上线的Nature Medicine杂志上,名为“lncRNA MIR100HG-Derived miR-100 and miR-125

南京大学权威期刊发表癌症研究新成果

  癌症中的表观遗传学改变一直备受关注,人们希望从中找出更好的生物学指标,为癌症的诊断和治疗提供帮助。南京大学的研究团队在结直肠癌(colorectal cancer)中发现了新的表观遗传学指标,为人们提供了治疗这种疾病的新指标。  研究人员发现,异染色质蛋白HP1γ对结直肠癌的细胞增殖非常关键,其

清华大学王栋-鲁志Cell-Res发文揭示肿瘤转移新模型

  肿瘤转移是指肿瘤细胞从原发部位向渐进定植的远处器官移动,是导致肿瘤病人死亡的主要原因。据统计,大约有90%的肿瘤病人死于转移。转移过程中,癌细胞从原位组织浸出扩散,定殖于与原位组织不同的远端组织。  一百多年前,英国的外科医生Stephan Paget提出了关于肿瘤转移的“种子与土壤”学说,即转

分子遗传学词汇转录起始因子

中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定  义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Cancer-Cell:Smyd3-为肝癌和结直肠癌发展提供帮助

  近来几篇文章发现与癌症相关的一些特异基因表达由一些表观遗传调控因子所介导。Smyd3(Smad3)是一种胞质赖氨酸甲基转移酶,在肝癌和结直肠癌患者表达量明显升高。去年一篇Nature文章指出在小鼠Ras诱导肿瘤生成的模型中,Smyd3的表达及功能对肿瘤发生是必需的,并提到可将Smyd3作为一个潜

【结直肠癌】治疗手法

    治疗    (一)手术治疗    手术切除仍然是结、直肠癌的主要治疗方法。    直肠内超声检查的开展使术前明确早期结、直肠癌的浸润深度和范围成为可能,为结、直肠癌内镜治疗的选择提供了依据。    1.右半结肠癌的手术    右半结肠癌应包括盲肠、升结肠、结肠肝曲部癌,右半结肠癌除因癌肿巨大

【结直肠癌】检查方法

    检查    常用的检查方法有以下几项:    (1)大便隐血试验 大规模普查时或对一定年龄组高危人群作为结、直肠癌的初筛手段。阳性者再做进一步检查。    (2)肿瘤标记物 结、直肠癌诊断和术后监测较有意义的肿瘤标记物是癌胚抗原(CEA)。但认为CEA作为早期结、直肠癌的诊断缺乏价值。血

遗传性结直肠癌基因突变研究获突破

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所医学机器人与微创手术器械研究中心赵国如团队在中国人群中基因胚系突变与家族性腺瘤性息肉病的基因型与表型关系图谱研究领域取得突破。相关工作分别在Oncotarget杂志与《科学报告》发表。  家族性腺瘤性息肉病(FAP)的发生主要由APC基因的胚系突变导致,早

科学家绘出表观遗传和转录起始研究“框架图”

10月7日,《科学》在线发表复旦大学教授徐彦辉课题组的研究成果。研究人员解析了包含+1核小体的PIC-Mediator复合物结构,首次展示了转录起始复合物与+1核小体的紧密结合,表明+1核小体对转录起始复合物在染色质上组装的重要调控作用,建立了表观遗传和转录起始的直接关联。作为基因表达调控的核心,转

长海医院遗传性结直肠癌筛查防治和遗传性肿瘤中心成立

  1月20日,在刚刚结束的2019年第二届上海市结直肠癌规范化治疗论坛暨长海医院“遗传性结直肠癌筛查防治中心”和“遗传性肿瘤家庭阻断中心”成立大会中, 进行了中心成立的揭牌仪式,并颁发了聘书。  该中心是由长海医院肛肠外科、生殖医学中心、消化内科、消化内镜中心、病理科和统计教研室共同整合而成。由李

什么是表观遗传?

表观遗传学是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达的可遗传的变化的一门遗传学分支学科。表观遗传的现象很多,已知的有DNA甲基化(DNA methylation),基因组印记(genomic imprinting),母体效应(maternal effects),基因沉默(gene silen

陈玲玲研究员Cell-Res解析癌相关lncRNA

  报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实,人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。   论文的通讯作者是中科院上海生命科学院

上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能

  生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的

什么是表观遗传调节?

中文名称表观遗传调节英文名称epigenetic regulation定  义与DNA排列顺序的变化无关的,调节基因表达的频率、速度或者表达度的过程。如DNA甲基化、组蛋白修饰等。这种调节不能通过种系或生殖细胞传递,但可通过细胞分裂传给子代,在静止细胞的细胞质中也能稳定地自我繁殖。这种调节的失误或减

表观遗传研究指南(二)

  今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因