我国科学家揭示特殊DNA的合成机制
脱氧核糖核酸(DNA)是生命体的遗传物质,决定生物的特征和多样性。生命的遗传信息存储在由腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)四种碱基组成的DNA序列中。1977年前苏联科学家在感染蓝细菌的一株噬菌体中发现由2,6-二氨基嘌呤(Z)、G、C、T组成的DNA,该类特殊DNA中的Z完全取代了正常的A,且Z与T配对形成更稳定的三个氢键,极大地改变了DNA的物理化学特征。长期以来,特殊DNA的合成机制及存在的普遍性和生理意义一直是未解之谜。 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项“新天然与人工产物的定向挖掘和高效合成的平台技术”项目在该特殊DNA的合成机制研究上取得重大进展。天津大学研究团队联合上海科技大学、美国伊利诺伊大学等研究团队,解析了该特殊DNA的合成机制,其中包括关键酶参与的2,6-二氨基嘌呤脱氧核糖核苷酸(dZTP)的生成和脱氧腺苷三磷酸(dATP)的消除,并发现这种特殊DNA遍布全球,大量能感染细菌......阅读全文
Differential-Display-of-Cotton-Transcripts
Plant MaterialsCotton ovules (Gossypium hirsutum cv. Coker 312) were collected 8, 15, and 20 days after anthesis. Total RNA was extracted from strippe
用-dUTP-净化-PCR-产物的实验
在 PCR 扩增过程中将 dUTP 掺入复制子是最为有效和广泛使用的净化 PCR 产物的方法(Longoetal.1990;HartleyandRashtchian1995)。下面介紹这一方法的详细操作过程。本实验来源于PCR实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒dNTP 溶液MgCl
5端RACE升级版
实验概要完成这个RACE需要全套反转录系统,当然选一个好的反转录酶(无RNase H),dUTP,taq酶,Uracil DNA glycosylase ,还有这几条引物: Adapter A AUCUCGAGUUCGCGCCGGAUCC(T) 25 VN cDNA synthesis and ad
探针的非放射性标记技术2
一;仪器:同上 二:试剂:ECL标记盒,其余同上 三:操作:1:将待标记的DNA稀释至10ng/ml 2:将上述DNA在100℃5分钟,冰浴5分钟 3:离心后加入10ulECL标记混合物,混合均匀 4:加10ul戊二醛溶液混匀,37℃20分钟,此反应
DNA-labeling-by-nick-translation
DNA labeling by nick translationreagents: DNA for labeling (concentration c > 150 ng/µl) modified nucleotides: Biotin-16-dUTP, Digoxigenin-11-dUTP, co
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的试剂介绍
(1)基因扩增技术—聚合酶链反应— 引物:决定扩增的特异性。根据检测的DNA不同,选用不同引物,每种病原微生物都有自己特异的引物。 (2)基因扩增技术—聚合酶链反应— 耐热的DNA聚合酶:此酶是从耐热细菌中分离出来的,能耐受高温90℃-100℃。 (3)基因扩增技术—聚合酶链反应— 10×P
PCR测序方法详细介绍
直接测序法 一、原理 PCR扩增获得双链DNA产物经变性形成单链,测序引物与其中一条模板链上的互补序列退火。退火的引物在低进行性反应条件下(如低温和低dNTP浓度),通过DNA聚合酶催化作用延伸20——80个核苷酸;由于此反应体系中掺入放射性标记的dNTP,能使新合成的DNA链中含有多个
知名华裔教授Nature点评癌症重要发现
细胞代谢会产生活性氧,可引起DNA ,RNA,蛋白质和脂质的氧化损伤。而癌细胞的代谢又比正常细胞更快一些,因此更加会给这些分子带来高水平的损伤,这不仅威胁到了核酸,而且还对NTP产生影响,生成的氧化DNA也有可能与DNA和RNA错配。 之前的研究表明MTH1酶能通过选择性清除NTP池中
PCR扩增制备带标记探针
实验概要用标记脱氧单核苷酸部分代替PCR反应体系中的脱氧核苷酸(一般是带标记的dUTP代替dTTP),经PCR扩增后标记基团随机搀入扩增产物-DNA探针中。这样使探针浓度高,可检测标记基团量多,灵敏度高,与缺口平移法制备探针相比,具有方便简捷的特点,并且由于具高灵敏度因此在检测低丰度,低拷贝数的目的
DNA-Immunoprecipitation-for-the-Determination-of-DNABinding-Specificity
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho
“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”
"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代,用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥? 科学家们发现,人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子,它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性
DNA-Fingerprinting,-DNA-Barcoding,-and-Next-Generation-Sequencing-...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的,用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键,而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”这一观念便形
DNA连接酶(DNA-ligase)介绍
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA
DNA重组(DNA-recombination)技术:工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶(restriction endonucleases,RE)是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶,能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。(一)命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现,根据来源进行命名,限制酶的第一个字母(大写,斜体)为宿主菌的属名,第二、第三
DNA提取方法洗涤-DNA(或-RNA)
当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤
DNA定序分析
目的对于许多重组DNA的实验,知道DNA的序列常是进一步操作所必备的。 本实验将定出你所选殖之cDNA的序列,并进行数据库比对分析。其目的在教导学生如何从事DNA定序分析及DNA序列的计算机分析。原理本实验所使用之方法为F. Sanger所发展之dideoxy定序法。 此法乃是将一引子黏合到
基因测序仪相关原理
普通的PCR反应体系中,加入的核苷酸单体为4种2′-脱氧核苷三磷酸(dATP,dCTP,dGTP,dTTP)。测序反应体系中,加入的核苷酸单体为2',3双脱氧核苷三磷酸( ddNTP)。与dNTP相比,ddNTP在脱氧核糖的位置上缺少个羟基,反应过程中虽然可以在DNA聚合酶作用下,通过其
分子生物学常用实验技术(十七)
第二节T7 DN A 聚合酶测序技术一、概述 T7 DNA 聚合酶最初具有5'→3'聚合酶活性以及单链和双链3'→5'外切酶活性。当T7 DNA 聚合酶用适当方法处理后,可使3'→5'外切酶活力明显下降。改造后的T7 DNA 聚合酶又称T7
核酸、蛋白技术参数资料和分子量标准1
核酸及蛋白质常用数据 1.核苷三磷酸的物理常数 化合物 分子量 λmax(pH7.0)
分子杂交技术随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切
DNA提取方法DNA-提取后纯化:将-DNA-与色谱柱结合
离液盐对于裂解至关重要,而且对于将 DNA(或 RNA)与色谱柱结合也是如此。此外,为了增强和影响核酸与二氧化硅的结合,还添加了酒精。大多数情况下这是乙醇,但有时可能是异丙醇。乙醇百分比和体积有很大的影响。太多,你会带入大量降解的核酸和小物种,这会影响 A260 读数并降低你的一些产量。太少,可能难
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验1
一个DNA位点识别探针被用来从表达文库中检测合适的重组克隆,并对 之进行纯化,证明其中编码了具有一定序列特异性的DNA结合域。这种策略排除了为 分离其基因而对序列特异性DNA结合蛋白进行纯化的过程;只需要一个合适的构建于 λgtll载体中的cDNA文库和一个DNA识别位点的探针。用位点识别DNA筛选
分子杂交技术--1
互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。 杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA或总RNA。根据使用的方
TA克隆常见问题及解决方案
TA克隆方法(Original TA Cloning Kit)把PCR片断与一个具有3-T突出的载体DNA连接起来的方法。因为PCR反应中所适用的聚合酶具有末端转移的活性,通常在3加上A。例如:Taq聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,PCR反应时在每条PCR扩增产物的3端自动添加一个3-A突
Phage-DNA
IntroductionThe phage lysate from the plate contains bacterial DNA and RNA, as well as phage DNA encased in the phage coat. The following procedure, d
DNA重组
目的:简单介绍了DNA重组技术的一些方法。包括重组质粒、PCR等。包括细胞结构、DNA,DNA如何改点等。
DNA定量
Characterization of dnaLEVEL IMaterialsDNA sampleSSC bufferUV spectrophotometer 3 and quartz cuvettesProcedureDissolve a small quantity of your extrac
DNA转染
DNA转染· Transfection of Mammalian Cells Using Lipofectamine (LTI)· Guide to Eukaryotic Transfections with Cationic Lipid Reagents (PDF)
DNA转化
DNA转化Chemical Transformation· Transformation of Competent Cells (RbCl2 Method) (Goldberg Lab)Very nice protocol for E. Coli transformation inc