抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法

抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput and high-dimensional single-cell analysis of antigen-specific CD8+ T cells。 研究人员提出了一种对T细胞抗原受体(TCR)高通量、高维度的测序方法(TetTCR-SeqHD),该方法可同时分析数万个单细胞的同源抗原特异性、TCR序列、靶向基因表达和表面蛋白表达。研究人员使用已知抗原特异性、TCR序列的人类多克隆CD8+T细胞,验证该方法对抗原特异性的检测准确度超过98%。研究还评估了抗原特异性的CD8+T细胞、带有病原体靶点表型特征的CD8+T细胞的基因表达水......阅读全文

抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法

  抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput

抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞新的分析方法

  抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput

抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析新方法

  抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput

科学家提出抗原特异性CD8+T细胞的单细胞分析方法

  抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput

单细胞分析技术的成本高吗?

单细胞分析技术的成本相对较高,但随着技术的进步和普及,成本在逐渐降低。在早期,单细胞分析技术所需的仪器设备、试剂耗材以及专业的数据分析等都需要大量的资金投入。例如,单细胞 RNA 测序需要专门的微流控设备、高质量的反转录试剂和测序平台,这些都使得单个样本的分析成本较高。然而,随着技术的不断发展和市场

被“真”单细胞光环掩盖的高通量分析

  01、二代“真”单细胞蛋白质组学质谱:timsTOF Ultra  2023年6月5日,在第71届ASMS会议上,布鲁克公司重磅发布了timsTOF Ultra,“真”单细胞蛋白质组学正式进入第二代。图1:成熟可复制的单细胞蛋白质组学解决方案  布鲁克第二代“真”单细胞蛋白质组学方案,打破单细胞

如何实现高通量的单细胞分选?

 单细胞分选通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。    为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现高通量分选。  首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响激光聚焦,降低空间

科学家揭示衰老抑制T细胞抗肿瘤免疫机制

中国科学院上海营养与健康研究所、中国科学院上海药物研究所等单位的研究人员合作,揭示了衰老影响机体CD8+T细胞抗肿瘤免疫反应的作用和分子机理,探究了衰老个体和PD-1抗体治疗不响应患者的肿瘤免疫防御能力缺陷的机制,并指出衰老调控的关键靶点双功能细胞凋亡调控因子(BFAR)在治疗中具有重要意义。相关研

高通量单细胞技术获得新突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

红细胞血型抗原的特异性

  有一些血型抗体,如抗IH,抗IA,抗IB,抗IP1等,只与带有I抗原及另外一个抗原的细胞发生反应,而不与其中只有一个抗原的细胞发生反应。说明这些抗原为复合抗原,在一个分子上具有两种特异性。  Lewis血型抗原实际上是血浆中的抗原,红细胞上的Lewis抗原是从血浆中吸附来的。I抗原在分泌液中虽有

张锋团队开发出高通量的单细胞RNA测序方法

  去年,Broad研究所的研究人员在《Science》上发表了一种称为sNuc-Seq的单核RNA测序方法。这种方法让人们能够研究那些难以分离的单细胞中的基因表达谱。如今,Broad研究所领导的团队克服了sNuc-Seq应用的一大障碍:规模。  8月28日,研究人员在《Nature Methods

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

单细胞分析技术的几种方法

单细胞分离技术:流式细胞分选术(Flow Cytometry Sorting):通过细胞表面标志物的特异性抗体标记细胞,利用流体力学和激光技术,对细胞进行快速、准确的分离和分选。激光捕获显微切割技术(Laser Capture Microdissection,LCM):利用激光束从组织切片中精确地切

研究提出单细胞多组学新方法实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/INDEL)及染色质三维构象,实现高分辨率、多维度的联合分析。胰腺癌异质性强、进展迅速,临床面临早筛困

台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析

  近日,中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展,研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。  近年来,单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究,然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以

台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析

  近日,中科院大连化物所单细胞分析研究组(1820组)陆瑶研究员团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展,利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。  细胞是生命存在的基础,细胞研究是探索生命健康与疾病的基本条件和起点。长期以来,人们假定细胞群是同类的,但是越来越多的研究表明,即

PNAS:一种高敏感和高特异性的细胞死亡检测方法

  细胞死亡是健康和疾病状态下人类生物学的一个重要特征。它可以预示病理早期阶段(例如形成中的肿瘤或自身免疫疾病/神经退行性疾病的开始),标志疾病进展,反映治疗的成功(如抗癌药物),鉴别治疗意外的毒性作用等等。然而直到现在,都不大可能在特定人类组织中非侵入性地检测细胞死亡。  来自耶路撒冷希伯来大学的

大连化物所:复合电离源实现高覆盖高灵敏单细胞代谢组分析

  近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员许国旺、副研究员胡春秀和副研究员石先哲等在单细胞代谢组分析新技术研究中取得新进展,研发了同轴纳升电喷雾电离-大气压化学电离复合电离源(concentric nanoESI-APCI hybrid source),提高了细胞中低丰度、低电离效率和弱极性代谢物

高通量单细胞转录组测序发展与展望

单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该

布鲁克和景杰生物:单细胞和空间蛋白质组技术推动精准医疗

2023年9月24-27日,为促进蛋白质组学的研究和学科发展,增进国际间合作交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办的第十二届中国蛋白质组学大会在四川成都隆重召开。本次大会的主题是“人体蛋白质组的导航者(π-HuB项目):通往智慧医学之路”。大会聚焦蛋白质组学的最新

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教

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单细胞分析色谱仪分类方法

单细胞分析色谱仪种类有多种。1、按流动相物理状态可分:气相单细胞分析色谱仪和液相单细胞分析色谱仪。2、按洗脱方式可分:等度洗脱单细胞分析色谱仪和梯度洗脱单细胞分析色谱仪。3、按产地可分:国产单细胞分析色谱仪和进口单细胞分析色谱仪。4、按分离规模可分:微型单细胞分析色谱仪、小型单细胞分析色谱仪和大型单

单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响?

单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响:促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台,使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能,从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时,能够促使开发者反思和改进算法,以提高准确性和可靠

我所研发复合电离源实现高覆盖、高灵敏单细胞的代谢组分析

近日,我所生物技术研究部生物分子高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)许国旺研究员、胡春秀副研究员和石先哲副研究员等在单细胞代谢组分析新技术研究中取得新进展,研发了同轴纳升电喷雾电离-大气压化学电离复合电离源(concentric nanoESI-APCI hybrid source),提高了

利用台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析

  近日,中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展,研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。  近年来,单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究,然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以

抗原的异物性与特异性分析原理

抗原的异物性与特异性分析原理(一)抗原的两重特性:免疫原性(immunogenicity)。抗原性(antigenicity)。(二)半抗原(hapten)和载体。抗原的异物性与特异性(一) 异物性抗原的免疫原性的本质是异物性,异物性越强,其免疫原性就越强。自身物质在一定情况下也具有免疫原性。(二)

CD8+T细胞的功能

  IgV 状胞外的CD8 α与I类MHC分子的α 3部分进行交互。这亲和保持T细胞受体的细胞毒性T细胞和抗原特异性激活期间紧密绑定的目标单元格。细胞毒性T细胞和CD8表面蛋白被称为CD8 +T细胞。主要识别站点是一个灵活的循环在MHC分子的α 3域。这被发现的做基因突变分析。灵活的α 3域位于之间