抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法
抗原特异性对T细胞功能至关重要,但由于技术局限,其在T细胞高通量多组学分析中常常被忽略。美国德克萨斯大学奥斯汀分校的研究团队揭示了一种用于抗原特异性CD8+T细胞的高通量、高维度单细胞分析方法。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:High-throughput and high-dimensional single-cell analysis of antigen-specific CD8+ T cells。 研究人员提出了一种对T细胞抗原受体(TCR)高通量、高维度的测序方法(TetTCR-SeqHD),该方法可同时分析数万个单细胞的同源抗原特异性、TCR序列、靶向基因表达和表面蛋白表达。研究人员使用已知抗原特异性、TCR序列的人类多克隆CD8+T细胞,验证该方法对抗原特异性的检测准确度超过98%。研究还评估了抗原特异性的CD8+T细胞、带有病原体靶点表型特征的CD8+T细胞的基因表达水......阅读全文
Nature子刊:免疫疗法中的液态活检
如今人们知道T细胞能够识别并杀死肿瘤细胞,利用抗肿瘤活性为目的的治疗方法被称为癌症免疫疗法。可通过使用克隆特异性T细胞受体(TCR)来扫描出现在组织相容性复合体(MHC)上的小肽片段,从而实现T细胞检测异常肿瘤细胞。 许多人类肿瘤存在大量的DNA突变,过去研究证明了突变基因编码的 “肿瘤抗原”
免疫疗法中的液态活检
如今人们知道T细胞能够识别并杀死肿瘤细胞,利用抗肿瘤活性为目的的治疗方法被称为癌症免疫疗法。可通过使用克隆特异性T细胞受体(TCR)来扫描出现在组织相容性复合体(MHC)上的小肽片段,从而实现T细胞检测异常肿瘤细胞。许多人类肿瘤存在大量的DNA突变,过去研究证明了突变基因编码的“肿瘤抗原”是当前癌症
宸安生物与鹿明生物达成战略合作,共同推进技术发展
7月29日,上海鹿明生物科技有限公司(简称“鹿明生物”)与上海宸安生物科技有限公司(简称“宸安生物”)在宸安生物上海总部正式完成战略合作签约仪式。此次战略合作致力于推进以质谱流式细胞技术为核心的单细胞蛋白质组学科研技术服务及临床诊断平台布局,运用优势系统加速临床诊断研究及创新药物研究,本次鹿明生
抗原与抗体反应的特异性
而抗体抗原结合区的空间构象是由该区的氨基酸序列来决定。氨基酸的序列则由基因序列决定。产生抗体的B细胞在成熟过程中,编码抗体高变区的序列发生随机的突变。如果突变产生的抗体正好能和抗原提呈细胞表面所提呈的抗原结合,那这株B细胞就得以分化,分裂。这个过程叫做阳性筛选。 所以,所谓抗体的特异性,并不是
抗原特异性免疫应答的简介
机体免疫系统针对抗原所产生的特异性免疫应答。由抗原刺激机体产生,其表现为免疫活性细胞对抗原的特异性免疫应答和免疫记忆。根据参与的细胞类型和效应机制的不同,适应性免疫应答可分为B细胞介导的体液免疫应答和T细胞介导的细胞免疫应答。根据免疫活性细胞对抗原刺激的反应状态和最终效应,可分为正免疫应答和负免
肿瘤特异性抗原的功能介绍
此类抗原可存在于不同个体同一组织类型的肿瘤中,如人恶性黑色素瘤基因编码的黑色素瘤特异性抗原可存在于不同个体的黑色素瘤细胞,但正常黑色素细胞不表达。TSA也可为不同组织学类型的肿瘤所共有,如突变的ras癌基因产物可见于消化道、肺癌等,但由于其氨基酸顺序与正常原癌基因ras表达产物存在差异,可被机体的免
关于肿瘤特异性抗原的概述
肿瘤特异性抗原(tumor specific antigen)指仅表达于某种肿瘤细胞表面而不存在于正常细胞上的新抗原,故又称独特肿瘤抗原(unique tumor antigen)。 此类抗原可存在于不同个体同一组织类型的肿瘤中,如人恶性黑色素瘤基因编码的黑色素瘤特异性抗原可存在于不同个体的黑
抗原的特异性由什么决定
抗原的特异性是由分子表面特定的化学基团所决定的,这些化学基团称为抗原决定簇。抗原决定簇是免疫应答和免疫反应具有特异性的物质基础。抗原决定簇可以是由连续序列(蛋白质一级结构)组成或由不连续的蛋白质三维结构组成,决定抗原性的特殊化学基团,又称抗原表位。抗原决定簇大多存在于抗原物质的表面,有些存在于抗原物
技术强则药物强—单个B细胞抗体制备技术(一)
如今,单克隆抗体药物以其独特的作用机制及高效性,在肿瘤和自身免疫疾病的治疗中发挥了不可估量的作用,成为全球的研发热点,目前已有2400个单克隆抗体药物处于研发及商业化阶段。 1975年杂交瘤技术问世[1]。1986年鼠源单克隆抗体药物Muromonab的上市拉开了单克隆抗体发展的序幕。随后的50年,
利用高通量微流体技术研究单细胞生物系统运作
简介在动态的环境里面,细胞们通过各遗传途径的相互作用交流运转着。哺乳动物免疫反应就是各类不同的细胞协同合作的一个惊人例子。细胞与细胞之间的交流主要是通过信号分子形成时间与空间浓度梯度来介导的,这就要求细胞对一个大范围内的信号强度产生响应。这篇文章采用高通量的微流体细胞培养(high-throughp
Nat-Comm|-张强锋组利用人工智能算法分析单细胞ATACseq数据
近年来,深度学习等人工智能技术在图像识别,自然语言处理等领域取得了令人瞩目的成就。人工智能技术应用于生命科学,对生物信息多个领域产生了重大的影响。深度学习算法借助于生命科学大数据的飞速发展,从海量大数据中自动高效地提取特征进行学习,极大超越了依赖人工提取特征的传统人工智能算法,在医疗图像处理、结
Science-Immunology狙击肿瘤PD1与GITR抗体联事半功倍之妙!
前言 近年来,靶向PD-1/PD-L1抗体的效果无疑戏剧性地引导我们对癌症治疗总体方法和对宿主-肿瘤生物学理解的改变。由于癌症治疗过程中,T细胞会发生功能性障碍,大多数癌症病人单独接受PD-1或者PD-L1抗体治疗后,并不能表现出持久的抗肿瘤反应。因此进行抗体联用策略和治疗无疑成为了靶向可
前列腺特异性抗原
前列腺特异性抗原医学术语,前列腺特异性抗原(Prostatespecific antigen,PSA)是由前列腺上皮细胞合成分泌至精液中,是精浆的主要成分之一。在上个世纪60年代末,在研究免疫避孕过程中Hare等人发现,在前列腺液及精液中含有一种分子量大约34000的精液特异性蛋白质。1979年从前
技术强则药物强—单个B细胞抗体制备技术(二)
3)微雕刻和ISAAC方法分选B细胞微雕刻技术原理[7]是基于软光刻微阵列芯片识别、克隆抗原特异性B细胞的方法。通过刺激多克隆B细胞,并将其逐个分布到芯片孔内进行培养产生抗体,然后将改芯片孔内抗体转印至相应的蛋白芯片,通过与目标抗原反应后,再与荧光抗体反应,最后根据荧光抗体染色结果,通过显微操作将分
Nature-Methods:单细胞TCR研究新进展
引言 今年三月份,来自英国的科学家Michael Stubbington博士和Tapio Lönnberg博士一起,基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据,开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具 ---TraCeR,同时结合T细胞亚群的转录组数据分析,从而进一步
Nature-Methods:单细胞TCR研究进展
引言:今年三月份,来自英国的科学家Michael Stubbington博士和TapioLönnberg博士一起,基于Fluidigm公司C1 mRNA测序样本及相应数据,开发出一套用于研究T细胞基因序列信息的开放型分析工具---TraCeR,同时结合T细胞亚群的转录组数据分析,从而进一步揭示在不同
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
新工具实现贴壁细胞的单细胞分析
美国麻省理工学院的研究人员开发出一种微流体装置,一次能吸取一个细胞内的东西,而不干扰周围的细胞,这为研究人员测定单细胞的生化性质带来了一种新方法。它有助于研究不同干细胞之间的差异,或为什么同一肿瘤的不同细胞有着不同的治疗响应。 MIT电气工程与计算机科学系的Jongyoon
单细胞分析技术的应用领域
肿瘤研究:有助于鉴别癌前侵袭、分析原发性肿瘤的克隆进化、研究肿瘤内异质性、解析肿瘤微环境的重编程、探索肿瘤转移机制和治疗抵抗(耐药性)等。与常规的 RNA 测序分析相比,其优势在于更容易找出在治疗和预后条件下有差异表达基因的细胞,同时可以重建分化谱系和差异表达亚型,推断描述克隆亚结构、克隆谱系、重建
单细胞分析技术的发展趋势
更高的分辨率和灵敏度:不断改进技术以实现对单个细胞内更微量的生物分子(如核酸、蛋白质、代谢物等)进行更精确的检测和定量分析。例如,新一代的测序技术能够检测到更低丰度的 RNA 分子,从而更全面地揭示细胞的转录组信息。多组学整合分析:不再局限于单一类型生物分子的分析,而是将基因组学、转录组学、蛋白质组
单细胞分析技术的发展历程如下:
单细胞分析技术的发展历程如下: -早期阶段:在单细胞分析技术出现之前,人们只能通过显微成像或者流式细胞技术进行细胞水平的研究。显微镜观测或者HE染色、免疫组化、免疫荧光等技术可观察的细胞数量有限。流式细胞术可以高速分析上万个细胞,并同时从一个细胞中测得多个参数,但参数类型和数量都比较局限。 - 单细
单细胞分析技术的应用前景分享
单细胞分析技术具有广阔而令人期待的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够更灵敏地检测到疾病早期阶段细胞层面的细微变化,比如在癌症早期,识别出少量的肿瘤细胞或癌前病变细胞。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,制定个性化的治疗方案,提高治疗效果和减少副作用。例如,针对特定肿瘤细胞的基因突变或蛋白
《自然—方法学》年度方法:单细胞测序
2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道,将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。 近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重
一种用于肿瘤免疫药物高通量筛选的类器官平台建立
尽管近年来针对肿瘤的免疫治疗迅速发展,但用于肿瘤免疫药物高通量筛选的器官模型仍然缺乏。近日,美国印第安纳大学的研究团队在《Nature Biomedical Engineering》发表了题为“An organoid-based screen for epigenetic inhibitors
科学家建立用于肿瘤免疫药物高通量筛选的类器官平台
尽管近年来针对肿瘤的免疫治疗迅速发展,但用于肿瘤免疫药物高通量筛选的器官模型仍然缺乏。近日,美国印第安纳大学的研究团队在《Nature Biomedical Engineering》发表了题为“An organoid-based screen for epigenetic inhibitors
科学家建立用于肿瘤免疫药物高通量筛选的类器官平台
尽管近年来针对肿瘤的免疫治疗迅速发展,但用于肿瘤免疫药物高通量筛选的器官模型仍然缺乏。近日,美国印第安纳大学的研究团队在《Nature Biomedical Engineering》发表了题为“An organoid-based screen for epigenetic inhibitors
CD8+T细胞靶细胞的溶解与死亡原因
主要是靶细胞膜损伤后所致的细胞破裂和DNA断裂引起的核崩解促使靶细胞死亡,至此过程CTL可产生多种细胞毒介质杀伤靶细胞,这些介质包括:穿孔素、丝氨酸酯醇、干扰素和肿瘤坏死因子,这4种介质中,穿孔素的杀伤机制是当杀伤细胞粘着在配细胞膜上,前者胞质含有的穿孔素颗粒在高浓度Ca2+存在下被降解,释放穿
抗原特异性T细胞克隆的制备——间歇循环刺激法
实验概要本实验利用间歇循环刺激法制备了抗原特异性T细胞克隆。实验原理间歇循环刺激法是制备抗原特异性T细胞克隆的传统方法,原理是经抗原间隔刺激多个循环。主要试剂1. 含10%人AB型血清的完全RPMI 1640培养液。主要设备1. 24孔培养板;2. CO2 温箱;3. 高速离心机;4. 96孔板;5