糖基化酶碱基编辑器的机器学习研究中获进展
碱基编辑技术可实现精确的碱基转换,当前,有三类碱基编辑器被广泛应用,包括胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor,CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(adenine base editor,ABE)、糖基化酶碱基编辑器(glycosylase base editor,GBE)。 2020年,中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物技术研究团队与研究员张学礼带领的微生物代谢工程团队开发出GBE,可实现胞嘧啶到鸟嘌呤的碱基颠换,具有纠正3000多个已知致病单核苷酸变异(single nucleotide polymorphism,SNP)的潜力,这或为主要的遗传疾病如abca4相关性视网膜疾病和X-linked视网膜色素变性等提供治疗方案。 为评估GBE在多个位点的编辑情况,提高其应用潜力,研究人员运用高通量细胞建模技术,在哺乳动物细胞中进行6400多个基因组靶点的GBE编辑,建立了人工智能AI机......阅读全文
新疆生地所在绿洲冷岛效应形成机制研究中获进展
土壤水分在陆-气相互作用中起重要作用,土壤水分变化引起的潜热通量和感热通量的变化会影响近地表气温,从而影响干旱区绿洲的冷岛效应。尽管已有研究通过数值模拟和卫星遥感所获取的地表温度数据(LST)对绿洲冷岛效应进行了定量评估,然而,土壤水分如何控制蒸散,进而影响地表气温,并最终主导绿洲冷岛效应的控制
遗传发育所等在个体生长调控研究中获进展
TSC蛋白复合物位于胰岛素/生长素(IIS)信号转导通路中的中心节点,通过GAP蛋白活性来抑制mTOR复合物1 (mTORC1) 的活性,进而调控细胞生长。TSC复合物由三个蛋白质组成,即TSC1/TSC2以及近来鉴定的TBC1D7。其中TSC1/TSC2在人类中突变会导致多发性肿瘤;而TBC1
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(上)
前言:近年来,CRISPR基因编辑技术正在席卷整个生物医学研究领域,上一期我们已先从CRISPR系统开发及机制研究方面梳理了2018年相关大事件。伴随着基础技术不断优化,CRISPR技术的应用也更加广泛,如动物造模、药物筛选、单碱基编辑技术、细胞谱系示踪、基础疾病研究、疾病诊断、体内编辑和遗传病
基因编辑大牛Nature子刊发文:CRISPR单碱基编辑准确!
来自韩国基础科学研究所IBS的研究人员发表了题为“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,证实了最近研发的基因编辑方法的准确性。这一研究成果公布在4月10日的Nature
运动影响学习与记忆能力动物实验的研究进展(二)
2.3 滚筒式网状训练 滚筒式网状训练器为长100cm,直径60cm的圆形网状仪器,中间分为4个格,可同时训练4只鼠,底座有一固定架,一端有一手摇柄,可手摇按5r/min进行转动训练,该器材可训练大鼠的抓握、旋转、行走等功能。 2.4 平衡木训练 平衡木训练采用长170cm,宽2cm的方木棒,平放在
运动影响学习与记忆能力动物实验的研究进展(一)
摘 要: 生理心理学的主要研究途径和方法是通过建立相关动物模型,施加一定的影响因素,运用特殊的测量方法和指标,对实验动物的整体水平或局部器官和组织进行研究。动物实验可以克服人体实验诸多的局限,达到理想的效果。伴随着运动生物科学的不断发展,运动与学习记忆动物模型的制作、反映指标的测定会不断的改
运动影响学习与记忆能力动物实验的研究进展(三)
4.1 与LTP间接相关的物质 4.1.1 细胞凋亡学习与记忆是大脑主要的高级神经功能之一,是由不同而又紧密联系的神经元共同作用的结果。因此,保持神经元的健康和脑细胞的可塑性是学习和记忆的先决条件。已有研究报道,大鼠认知功能受损可能与海马神经元的凋亡有关,脑细胞过早凋亡可引发脑萎缩、老年痴呆、帕金森
西北研究院等在西北干旱区极端降水成因研究中获进展
近日,中国科学院西北生态环境资源研究院冰冻圈科学国家重点实验室联合中山大学、瑞典哥德堡大学、山东师范大学等,依托祁连山站高山区综合观测体系,将降水稳定同位素比率示踪和大气模式模拟相结合,发现并确证西风带控制的玉门关,事件尺度季风入侵可诱发极端降水的事实。 受全球变暖影响,极端天气气候事件呈现频
合肥研究院在三维各向异性材料研究中获进展
近期,中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所功能材料物理与器件研究部在层状MoAlB单晶的生长及三维各向异性研究方面取得进展,相关成果发表在Small上。 三维各向异性功能属性(如磁、电、热、光学等)不仅有利于材料的多种应用,而且有助于丰富材料的调控维度。如何在众多材料体系中探寻具有三维各
合肥研究院在密度极限下m=2磁岛研究中获进展
近日,中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所托卡马克物理研究室,在密度极限下m=2磁岛研究方面取得进展,相关研究成果以Radiation-driven m = 2 island formation and dynamics near density limit in experiment
合肥研究院在三维各向异性材料研究中获进展
近期,中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所功能材料物理与器件研究部在层状MoAlB单晶的生长及三维各向异性研究方面取得进展,相关成果发表在Small上。 三维各向异性功能属性(如磁、电、热、光学等)不仅有利于材料的多种应用,而且有助于丰富材料的调控维度。如何在众多材料体系中探寻具有三维各
李传友研究组在番茄避荫反应调控机制研究中获进展
密植栽培是提高作物单位面积产量的有效途径。但在密植条件下,植株间相互遮荫诱发植物的避荫反应综合征(shade-avoidance syndrome,SAS),如下胚轴和叶柄的伸长、开花时间的提前、分枝的减少等,该适应性反应会对作物产量产生负面影响。因此,阐明植物避荫反应的调控机理,对于培育耐荫、
研究团队在植物对花蜜和花色素重吸收研究中获进展
花朵凋落这一自然现象一直受到关注。“落红不是无情物,化作春泥更护花”,描述了花朵凋落和母体植株营养物质循环利用。 花朵作为植物重要的繁殖器官,是植物繁衍的重要资源投资。虫媒传粉的花朵通常具有较大的花展示和生物量,提供丰富的花蜜报酬、艳丽的色彩吸引传粉动物为其传粉。从植物自身能量投入角度看,花朵
魏江春研究组在地衣型真菌系统学研究中获进展
地衣是由地衣型真菌和相应的藻类或蓝细菌组成的稳定共生生态系统。作为先锋生物,地衣在干热、寒冷、高海拔、强光照等恶劣环境下历经长期演化而形成其独特的适应能力。叶上衣目地衣型真菌(Strigulales)是典型的叶生地衣,主要生长在热带地区的树叶上,是特殊生境的地衣资源,其因分布范围广而成为热带地区
科学家找到基因治疗新利器
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503037.shtm6月16日,华东师范大学生命科学学院教授李大力团队在《自然-生物技术》发表论文,报道了一系列新型腺嘌呤颠换编辑工具(AXBEs和ACBEs),并证明了ACBEs在不同细胞系与小鼠胚胎中
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(二)
5. 优化碱基编辑器实现细胞、类器官和小鼠中的高效编辑2018年7月,Nature biotechnology刊登了一篇新的研究,通过密码子优化和加入额外的核定位序列,重新设计BE3、BE4Gam和xBE3的序列。优化筛选的组成型和诱导型碱基编辑系统极大地提高了C to T的突变效率,重
生物工程学院科研团队在基因编辑与合成生物学领域再出成果
近日,生物工程学院智能生物制造教育部重点实验室基因编辑与合成生物工程课题组刘嵘明教授受邀在生物工程领域国际权威Top期刊《生物技术发展趋势》(Trends in Biotechnology)发表题为“在工业微生物中超越CRISPR-Cas9的新兴基因编辑技术”(Emerging gene edi
酶抑制剂的研究进展
20世纪60年代初,Umezawa提出了酶抑制的概念,从而将抗生素的研究扩大到酶抑制剂的新领域。酶抑制剂新药发现的途径:一是来源于天然化合物,包括动植物和各种微生物等,二是化学合成物。在目前上市的药物中,以受体为作用靶点的药物占52%,以酶为靶点的药物占22%,以离子通道为靶点的药物占6%,以核酸为
多酶生物饲料的研究进展
多酶饲料是生物饲料的一种,饲料中富含多种饲用酶,能够在一定程度上消除饲料原料中的抗营养成分或对动物内源性酶类起到补充作用,从而有利于改善现有饲料的品质、提高饲料的利用率。结合国内外有关资料,就常见饲用酶的种类和作用以及多酶生物饲料的研发工艺、存在问题和研究现状进行了综述,并对多酶生物饲料的发展做出展
RNA编辑疗法加速发展
据英国《自然》杂志网站近日报道,目前至少有3种RNA编辑疗法正在获批或已进入临床试验。支持者认为,该技术可能比CRISPR等基因组编辑技术更安全更灵活。既脆弱又强大RNA是一种脆弱且不稳定的分子,其会快速分解,因此“寿命”短暂。但它拥有广泛的用途,对人类的生存至关重要。RNA编辑技术通过改变RNA序
美国开发出可加速材料创新的机器学习模型
美国罗切斯特大学科研人员开发出一个机器学习模型,可对X射线衍射(XRD)实验产生的大量数据进行分析以加速材料创新。 科研人员利用涵盖了不同实验条件和晶体特性的无机材料实验数据来训练该模型,并根据布拉格定律进行分类以优化模型架构,再使用3个附加评估数据集来测试模型分析训练数据之外材料的性能,使该
成都生物所磁性纳米粒子固定化脂肪酶研究获进展
胰脂肪酶可以催化天然底物油脂水解,生成脂肪酸、甘油和甘油单酯或二酯,是生物体内脂代谢不可缺少的水解酶,在化学工业和制药行业有广泛应用。保持其稳定性、增加酶活力在研发与生产过程中有很重要的意义。固定化酶技术是实现此目标的有效方法之一,在化工领域已经有不少固定化脂肪酶的应用。铁基磁性纳米粒子因具有巨
中科院上海应物所酶分子马达单分子研究获进展
中科院上海应用物理研究所研究人员实现了对界面酶分子的单分子实时荧光成像,并且发现酶分子的趋向运动是平动与转动的竞争平衡结果。相关成果日前发表于《美国化学会志》。 液体中的分子通常作无规则的布朗运动。而对于有催化活性的酶分子而言,它们可利用酶促反应过程中释放的能量驱动其自身运动。但酶分子是否存在
跨损伤DNA聚合酶正确跨越BPDEdG机制研究获进展
烟草、汽车尾气和燃煤排放所产生的苯并芘 (BP) 是一种常见的环境污染物,BP在体内经过代谢产生强致癌产物BPDE,BPDE与DNA上的鸟嘌呤结合形成的加合物(BPDE-dG)与肺癌发生密切相关。跨损伤 DNA 合成 (TLS)聚合酶可以直接在DNA 加合物对面掺入核苷酸,使由于DNA
生物物理所等纳米酶催化肿瘤光声成像研究获进展
12月12日,Nano Letters 杂志在线发表了类外泌体纳米酶小体催化肿瘤光声成像的最新研究成果。研究人员首次利用纳米酶的酶学催化特性,实现了鼻咽癌移植瘤的光声成像。 光声成像结合了纯光学成像的高对比度和纯超声成像的高穿透深度优点,能够提供高对比度和高分辨率的组织成像,是目前非常有应用前
己二酸生物合成关键酶设计优化和应用研究获进展
己二酸是一种重要的二元酸,主要作为单体用于尼龙等聚合材料的合成。目前己二酸主要通过化学法生产,其原料来源于石油基产品,并且硝酸氧化过程会对环境带来严重影响,因此生物法合成己二酸受到人们广泛关注。要实现己二酸的生物合成,获得高效的合成酶是关键。最近,中国科学院天津工业生物技术研究所进化与代谢工程研
罗汉果苷糖基转移酶研究获新进展
中国科学院生物物理研究所李梅课题组与中国医学科学院药用植物研究所马小军/罗祖良课题组合作,揭示罗汉果苷糖基转移酶SgUGT94-289-3的结构和催化特性。相关论文7月30日发表于《自然-通讯》。罗汉果苷是一类来自药用植物罗汉果的三萜皂苷类次生代谢产物,具有高甜度低热量等特点,在食品添加剂领域具有广
Nature:最新发现一类DNA修复酶
今年的诺贝尔化学奖颁给了三位科学家们,以表彰他们在DNA修复的细胞机制方面的研究。十月二十八日在《Nature》杂志上发表的一项最新研究,发现了一类新的DNA修复酶。 当科学家们首次发现DNA的结构时,认为它的化学性质是极其稳定的,这使得它可以作为基因蓝图,将父母的基本特征传递给其后代。尽管这
能预测碱基编辑效果的新模型开发成功
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)动物表观基因组学创新团队研发出一种预测碱基编辑效果的新模型,该模型大幅提升了预测碱基编辑器在基因组内源靶位点编辑效果的准确性。相关研究成果发表在《细胞发现》(Cell Discovery)上。碱基编辑技术是一
力学所等在酸岩溶蚀过程的瞬态表征研究中获进展
酸-岩溶蚀现象在自然过程和工业应用中较为普遍:全球碳循环中的溶蚀碳排放、二氧化碳的矿化封存、油气储层的酸化压裂改造等情景中均存在岩石的酸化溶蚀。真实岩石溶蚀过程所涉及的地球化学反应链复杂,流动、溶质运移和反应耦合紧密,且孔隙结构和形貌改变明显,这些特征为探究酸-岩交互机理和建立反应流模型带来了挑