叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
全球海洋鱼类群落对气候变化的响应获揭示
近日，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）魏辅文院士团队全面分析了20世纪60年代以来全球海洋鱼类群落的监测数据，揭示了气候变化和渔业活动对全球海洋鱼类群落特征的深远影响。相关成果发表于《保护生物学》（Conservation Biology）。气候变化正在重塑全球海洋生态系统，引起鱼类群落物种的
全球海洋鱼类群落对气候变化的响应获揭示
近日，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）魏辅文院士团队全面分析了20世纪60年代以来全球海洋鱼类群落的监测数据，揭示了气候变化和渔业活动对全球海洋鱼类群落特征的深远影响。相关成果发表于《保护生物学》（Conservation Biology）。气候变化正在重塑全球海洋生态系统，引起鱼类群落物种的
中国科研人员在兰科植物研究方面获得进展
中科院成都生物研究所植物多样性研究团队利用Illumina测序技术分别研究了极小种群之一的巴郎山杓兰和对叶杓兰的叶绿体基因组特征，并基于叶绿体基因组数据重建了兰科植物5个亚科中的47个物种的系统发育树，为阐明杓兰属和兰科植物的系统发育关系和分类关系作出了重要贡献。 据了解，兰科是被子植物中最大
亚热带森林植食者寄生蜂群落相互作用研究获进展
近日，中国科学院成都生物研究所副研究员王明强以鳞翅目幼虫-寄生蜂互作系统为研究对象，与合作者一起基于BEF-China中国亚热带森林树种多样性实验平台，利用振布法采集的4年（2021-2024）的昆虫样本，室内饲养观察数据，分析了树种丰富度、功能多样性、鳞翅目幼虫丰富度、寄生蜂丰富度及寄生率对植
水生所揭示斑马鱼肠道微生物群落构建及演替规律
生物多样性的形成和维持机制一直以来都是生态学研究的重要内容。针对群落的构建规律，生物多样性的时空格局是研究的重点，其中关注最多的是物种-面积理论，但主要是针对动、植物在典型岛屿的分布规律，而微生物方面的研究相对较少。由于动物消化道最开始是无菌的，之后通过迁入、迁出形成了特定的群落并维持
武汉植物园在昆栏树目叶绿体基因组研究方面取得新进展
真双子叶植物基部类群昆栏树目(Trochodendrales)仅包含两个单种属，水青树属(Tetracentron)和昆栏树属(Trochodendron)，是研究被子植物系统与进化的重要和关键类群之一。 与大多数被子植物相比，昆栏树目植物叶绿体DNA的反向重复区(IRs)包含了更多的基因
造礁石珊瑚纯净基因组构建技术获突破
近日，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）魏辅文院士团队在珊瑚生物学研究方面取得重要进展，开发出珊瑚纯净基因组构建的新技术框架，克服了珊瑚基因组学研究中长期存在的复杂共生体污染问题，将助力珊瑚组学研究迈向新的高度。相关成果发表于《创新》（The Innovation）。构建造礁石珊瑚纯净基因组的新
武汉植物园在淫羊藿叶绿体基因组研究中获进展
淫羊藿为小檗科淫羊藿属植物，是我国常用大宗中药材，具有较多的药用价值和广阔的开发前景。当前淫羊藿药材主要依靠野生资源，存在基原植物混乱、质量参差不齐等问题。叶绿体基因组信息可以用于植物的系统分类、品种鉴定，但目前还没有对我国淫羊藿属植物开展过叶绿体基因组的研究。 中国科学院武汉植物园副研究员张
野生动物肠道噬菌体群落对于食性变化获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519434.shtm濒危野生动物如何适应食性的季节性变化，直接关乎其在野外的生存，进而影响生物多样性的保护。近日，中山大学生命科学学院教授范朋飞和黄立南团队研究揭示了天行长臂猿肠道噬菌体群落对食性季节性变
野生动物肠道噬菌体群落对于食性变化获揭示
濒危野生动物如何适应食性的季节性变化，直接关乎其在野外的生存，进而影响生物多样性的保护。近日，中山大学生命科学学院教授范朋飞和黄立南团队研究揭示了天行长臂猿肠道噬菌体群落对食性季节性变化的适应机制。相关成果发表于《自然-通讯》。论文共同通讯作者范朋飞表示，天行长臂猿是由我国科学家命名的唯一一种类人猿
玉米根际微生物群落组装策略获揭示
近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队揭示了养分胁迫下玉米根际微生物群落以功能需求为原则的组装策略。相关成果发表在《新植物学家》（New Phytologist）上。作物通过调控根际微生物群落结构和功能，可以有效提高作物养分利用效率。然而，根际微生物组在不同土壤类型和养分水平下的组
生物多样性大样地合作协议签订
生物多样性大样地监测研究合作协议签约仪式 实地考察大样地拟建地址 近日，成都生物研究所所长赵新全一行赴四川省雅安市石棉县，与石棉县人民政府副县长帅伟就合作建设石棉西南山地生物多样性监测研究基地开展了交流洽谈。成都生物所生态中心常务副主任潘开文与石棉县栗子坪国家级自然保护区管理处
叶绿体基因组的特点介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
以桃金娘构建的生态防控植物群落方法获发明ZL
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472614.shtm 由中国科学院华南植物园熊秉红等科研人员完成的“一种以桃金娘为优势种构建农业面源污染生态防控植物群落的方法”，近日获国家发明ZL授权。 该发明构建的农业面源污染生态防控植物群落
研究揭示伯乐树历史谱系分化和基因组脆弱性
中国科学院华南植物园研究员康明团队在广东基础与应用基础研究旗舰项目的资助下，对伯乐树谱系分化和基因组脆弱性研究取得新进展，揭示了伯乐树的历史谱系分化和基因组脆弱性。相关成果近日发表于《进化应用》（Evolutionary Applications）。东亚亚热带森林以其丰富的物种多样性和特有性而著称，
叶绿体蛋白转运与质量控制的新机制获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481871.shtm 近日，中科院植物研究所研究员杨文强团队与合作者在《植物细胞》发表了最新研究成果，揭示了莱茵衣藻叶绿体基因组最大基因编码的蛋白Orf2971参与蛋白转运和质量控制的重要分子机制。
华南植物园研究预测森林树种对气候变化响应
近日，中科院华南植物园研究员王宝生课题组以我国广泛分布的壳斗科栎属物种麻栎为研究对象，利用生态基因组学方法预测森林树种对气候变化的响应。相关研究发表于《分子生态学》。 全球气候的快速变化是生物多样性面临的严重威胁之一。森林树种在维护生态系统稳定、提升生态系统服务功能方面扮演着重要角色。了解森林
FDA构建新的基因组检测监管框架获称赞
Lander说，美国食品和药物管理局需要时间来构建监管框架，来应对基于NGS的检测，但是他也指出，当FDA2013年通过基于Illumina的MiSeqDx测序平台的两个相关的实验试剂盒的时候，该机构已经“采取了小，但是显著的步骤”。 Lander是总统科学技术委员会的联合主席，其认为，FD
科学家构建新的生命树
4月11日在《Nature Microbiology》发表的一项研究中，科学家们构建了了一种新的生命之树，显示了所有已知生物之间的关系，通常分类学家们分成三个领域：真核生物、细菌和古生菌。这个新的生命树的最大分支，是由对科学界来说全新的细菌组成。延伸阅读：首个包含230万种物种的生命之树发布；
海马冷泉区底栖生物群落组成及其营养关系获揭示
海马冷泉区底栖生物群落主要存在四种类型：贻贝床、蛤床、细管虫丛和大管虫丛群落。近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室（LMB）谭烨辉研究团队，研究揭示了海马冷泉区大型底栖生物的群落组成及营养关系。相关研究发表于《深海研究》。冷泉是指从海底沉积物中渗漏出的富含甲烷、硫化氢或其他
植物群落垂直结构复杂地理格局及驱动机制获揭示
日，东北林业大学教授何念鹏和中国科学院华南植物园“全球变化与陆地碳循环”团队在第二次青藏高原综合科学考察研究和国家自然科学基金的支持下，在青藏高原开展了大规模的野外调研并揭示了植物群落垂直结构复杂性的地理格局及驱动机制。相关成果发表于《通讯生物学》（Communications Biology）。论
海马冷泉区底栖生物群落组成及其营养关系获揭示
海马冷泉区底栖生物群落主要存在四种类型：贻贝床、蛤床、细管虫丛和大管虫丛群落。近日，中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室（LMB）谭烨辉研究团队，研究揭示了海马冷泉区大型底栖生物的群落组成及营养关系。相关研究发表于《深海研究》。 冷泉是指从海底沉积物
新研究预测森林树种应对气候变化的响应
近日，中国科学院华南植物园研究员王宝生课题组以我国广泛分布的壳斗科栎属物种麻栎（Quercus acutissima）为研究对象，利用生态基因组学方法预测森林树种应对气候变化的响应。相关研究发表于《分子生态学》（Molecular ecology）。 全球气候的快速变化是生物多样性面临的严重威胁
新研究预测森林树种应对气候变化的响应
近日，中国科学院华南植物园研究员王宝生课题组以我国广泛分布的壳斗科栎属物种麻栎（Quercus acutissima）为研究对象，利用生态基因组学方法预测森林树种应对气候变化的响应。相关研究发表于《分子生态学》（Molecular ecology）。 全球气候的快速变化是生物多样性面临的严重威
科学家解析温带竹子分支系统发育关系
温带竹子分支(the temperate bamboo clade)包括23-32属，约546种，主要分布于东亚地区（特别是喜马拉雅）和东南亚地区，少数种类分布到印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加，以及北美洲东部的低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该分支近500种，是其多样化中心，中国西南特有
叶绿体基因组－－cpDNA的相关介绍
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。 每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝
Nature：藻类基因组解读叶绿体秘史
我们初学生物时接触得最早的就是光合作用，光合作用利用二氧化碳、水和太阳能合成有机物。世界上最重要的光合作用真核生物(植物)多半并不是自己演化出光合作用能力的，它们的叶绿体是从其他生物中“拿来”的。 这些叶绿体来源于真核宿主吞食的光合细菌，这一过程被称为初级内共生。随后，红藻和绿藻中的叶绿体
细胞化学基础叶绿体基因组－－cpDNA
叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA（cpDNA）是双链环状，缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
热带森林转变过程土壤碳固持的机制获揭示
近日，中国科学院华南植物园研究员刘占锋团队联合日本国立环境研究所研究员梁乃申基于马来西亚森林研究所的帕索森林保护区，研究揭示了热带森林转变下功能碳库调控土壤有机碳来源机制。相关研究发表于《整体环境科学》。植物（如木质素）和微生物代谢产物（如氨基糖）是土壤有机碳库的重要来源，由于微生物来源碳具有较高的