叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日,记者从中国科学院华南植物园获悉,该园分子生态学团队及其合作者,基于中国森林监测网络(CForBio)平台,揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉,系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中,为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础,分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差,进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树,或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤,成本较低,但结果中往往会出现较多的多歧分枝;一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
森林类型调控土壤碳库响应外源磷输入机制获揭示
近日,中国科学院华南植物园研究员刘占锋团队在国家自然科学基金等项目的资助下,研究揭示了森林类型调控土壤有机碳组分差异性响应外源磷输入机制。相关成果发表于《整体环境科学》(Science of the Total Environment)。热带森林对外源养分的供应十分敏感,磷与氮的相对有效性在调控热带
中国森林生物多样性监测网络成立20年
6月12日至13日,中国森林生物多样性监测网络(CForBio)成立二十周年学术研讨会在吉林长白山召开。与会专家回顾了CForBio发展历程,总结分享取得的成绩和经验教训,共同探讨森林生物多样性监测和研究的前沿问题。记者从中国科学院生物多样性委员会了解到,截至2024年5月底,CForBio已建立2
新研究揭示森林碳汇的多重限制
中国科学院华南植物园副研究员刘慧与合作者,探讨了不同时空尺度碳汇研究的主导因素和研究趋势,揭示了森林碳汇的多重限制。相关成果发表于The Innovation。 森林是陆地生态系统的最大碳汇,主要通过树木生长增加生态系统碳储量,对减缓气候变化发挥着重要作用。然而,其他全球变化过程同样深刻影响着
昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组
同动物的线粒体基因组相比,植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式,如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前,植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序,需要耗费大量的人力和物力,严重限制了植物线粒体基因组的测序,进而导致对其独特进化方式的研究
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物,属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊,形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
国家自然科学基金委发布林草科学联合基金项目指南
关于发布2025年度国家自然科学基金林草科学联合基金项目指南的通告国科金发生〔2025〕199号国家自然科学基金委员会现发布2025年度国家自然科学基金林草科学联合基金项目指南,请申请人及依托单位按项目指南所述要求和注意事项申请。国家自然科学基金委员会2025年7月1日2025年度国家自然科学基金林
昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定
竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。 中国科学院昆明植物研究所李德
华南植物园等完成麻疯树基因组组装及高密度遗传图谱构建
麻疯树(Jatropha curcas L.)为大戟科木本油料植物,是生产生物柴油的重要能源植物之一。 中国科学院华南植物园研究员吴国江团队联合国内多家单位完成了麻疯树全基因组测序和组装,组装基因组大小为320.5 Mbp,在基因组中共发现了27,172个蛋白编码基因。另外研究人员构建了以麻疯
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉,由该所研究员林强课题组主导,联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究,揭
昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记
温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约600种,分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种,是其多样化中心,其中中国西南特有种
科学家构建高质量金粟兰基因组图谱
11月26日,《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究,这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树,对了解被子植物的
研究揭示叶片内生真菌分子功能多样性调控亚热带森林幼苗存活的机制
作为广泛存在于植物叶片组织中的共生微生物,叶片内生真菌可通过代谢调节、抗逆防护等多种途径影响宿主植物的生长发育。然而,其在分子功能层面如何影响宿主植物的适合度差异与生态位分化,进而调控森林群落的物种共存,目前仍缺乏系统性的实证研究与机制解析。针对上述科学问题,中国科学院植物研究所整合了古田山亚热带森
英国研究构建叶绿体RNA聚合酶原子模型
叶绿体中的RNA聚合酶比较独特,它拥有比蓝藻还多的亚基,转录机制也更复杂。为进一步探究叶绿体RNA聚合酶的结构,英国约翰英纳斯中心科研人员使用冷冻电镜,对从白芥菜提取出来的叶绿体RNA聚合酶样本进行成像,并研究分析了其中的21个亚基等结构的作用,建立了原子水平的数据模型。该模型揭示了超氧化物歧化
英国研究构建叶绿体RNA聚合酶原子模型
叶绿体中的RNA聚合酶比较独特,它拥有比蓝藻还多的亚基,转录机制也更复杂。为进一步探究叶绿体RNA聚合酶的结构,英国约翰英纳斯中心科研人员使用冷冻电镜,对从白芥菜提取出来的叶绿体RNA聚合酶样本进行成像,并研究分析了其中的21个亚基等结构的作用,建立了原子水平的数据模型。该模型揭示了超氧化物歧化
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理 在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。 实验步骤
多重序列比对及系统发生树的构建实验
实验方法原理在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。实验步骤一、用CLUSTALX软件对已知DNA序列做多序列比对。操作步骤:1. 以FASTA格式准
最新研究重写鸟类家谱,构建鸟类生命之树
鸟类是恐龙的后裔。所有其他类群的恐龙在白垩纪末期的大灭绝事件中走向了终结,但绝大多数现生鸟类的祖先却在不到1000万年时间里快速繁衍,分化出非常多的新类群,堪称演化奇迹。在过去一个多世纪里,现生鸟类家谱的内部关系问题一直悬而未决,这成为构建生命之树的代表性难题。4月2日,以我国科学家为发起方和主要参
版纳植物园热带森林树种共存机制研究取得新进展
密度制约效应在热带森林中比较常见,它被认为是一种维持树种多样性的重要机制。然而,对于密度制约在波动环境中是如何变化的仍然所知甚少。 中科院西双版纳热带植物园森林群落结构、功能与动态研究组在西双版纳20hm2热带季节雨林动态监测样地中,以453个1hm2的幼苗样方两年的观测数据
研究揭示叶绿体蛋白转运马达新功能
叶绿体是植物进行光合作用的细胞器。正常发育过程受到核基因组和叶绿体基因组在多个层次的协同调控。核质互作的分子机理是叶绿体生物发生的核心科学问题之一。光合膜蛋白复合体的反应中心亚基通常由叶绿体基因编码,而外周蛋白和天线蛋白由核基因组编码。这些核基因组编码的叶绿体蛋白,在细胞质中合成,而后通过叶绿体
苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究的具体方法
苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究的具体方法如下:样方调查法:设置样方:在需要评估的区域,选取代表性的地点设置一定数量和大小的样方。样方大小根据苔藓的分布特点和研究目的确定,如可以设置边长为 0.5 米或 1 米的正方形样方。物种鉴定与计数:仔细观察样方内的苔藓植物,依据苔藓植物分类学特征,鉴定到种
苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究的具体方法有哪些?
苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究的具体方法如下:样方调查法:设置样方:在需要评估的区域,选取代表性的地点设置一定数量和大小的样方。样方大小根据苔藓的分布特点和研究目的确定,如可以设置边长为 0.5 米或 1 米的正方形样方。物种鉴定与计数:仔细观察样方内的苔藓植物,依据苔藓植物分类学特征,鉴定到种
氮沉降调控森林土壤碳排放的格局及机制获揭示
中科院华南植物园副研究员郑棉海团队联合美国康奈尔大学教授骆亦其等科研人员,研究揭示长期氮沉降调控热带森林土壤碳排放的格局及机制。相关研究12月1日发表于《自然地球科学》(Nature Geosciences)。同月5日该期刊再次以研究简报(Research Briefing)的形式进行了报道。 人类
森林生态系统碳氮磷留存时间的时空规律获揭示
在国家杰出青年基金项目、中科院战略性先导科技专项等项目的资助下,中科院华南植物园鼎湖山站陈洋博士在闫俊华研究员、王应平研究员的指导下,揭示森林生态系统碳氮磷留存时间的时空规律。相关研究发表于《农业与森林气象学》。陈洋为该论文第一作者,闫俊华为通讯作者。 物质元素的输入和输出不仅是维持生态系
科学家揭示秋叶变色调控机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495212.shtm北京农学院城市林业团队联合北京林业大学,解析重要栎属植物-槲树染色体水平基因组,并揭示其秋季叶色转变的调控机制。日前,相关研究成果发表在《新植物学家》上。 ?A槲树基因组特
中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种
从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化
研究揭示森林混交的增产效应
地球上的森林多以多种物种组合、以混交的方式存在(即混交林),少有单一树种组成的群落。在人工林中,混交林因为具有多功能价值也被广泛推崇。相较于单一的纯林,混交林通常能提供更丰富的栖息地环境,更有效地防止病虫害的发生。然而,混交种植是否能促进树木生长和森林生产力?这一理论和实践问题始终未能得到科学
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
植物叶绿体基因组基因表达调控的研究
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式