昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记

温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约600种,分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种,是其多样化中心,其中中国西南特有种就有约180种。温带竹子支系在分子系统学研究中被证明是一个单系类群,但类群内部之间的关系尚未得到很好的澄清。已有的研究结果表明,基于叶绿体片段和核基因联合片段分析,甚至叶绿体全基因组测序结果,都难以很好地解决温带木本竹子支系的内部关系问题。 最近,中国科学院昆明植物研究所郭振华研究组、李德铢研究组利用一种简化基因组测序的方法即RAD (restriction-site-associated DNA) 测序方法,在全基因组水平开发大量的SNPs标记,并初步验证了其在温带木本竹子系统发育分析中的应用。研究人员选择了两种竹子,冷箭......阅读全文

科学家解析温带竹子分支系统发育关系

 温带竹子分支(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约546种,主要分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)和东南亚地区,少数种类分布到印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加,以及北美洲东部的低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该分支近500种,是其多样化中心,中国西南特有

昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记

  温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约600种,分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种,是其多样化中心,其中中国西南特有种

昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定

  竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。  中国科学院昆明植物研究所李德

美国竹子协会学者与版纳园进行竹子苗木交换

  7月1日至3日,两位来自美国竹子协会的学者Clifford Sussman与Robert Saporito对中科院西双版纳热带植物园进行了为期3天的考察访问。   7月2日,Clifford Sussman与Robert Saporito对百竹园进行了实地考察,对版纳园收集保存的部

单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

  2019年10月10日,来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次报道了由胎肝驱动的人胚胎

单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

  2019年10月10日,来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究,首次报道了由胎肝驱动的人胚胎

Nature单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱

  哺乳动物的造血与免疫系统发育是在胚胎发育过程中由多个组织以复杂的协同作用所驱动的【1】。尽管研究界对于人体中这一过程所涉及的功能主体和时间序列都有了较为准确的认识,例如造血干细胞是先从受孕后2至3周的胚胎外卵黄囊(yolk sac)中,以及从3至4周的胚胎主动脉-性腺-中肾区域(aorta-go

核基因和形态学证据揭示我国梨藤竹属的分类学谜团

  竹亚科是禾本科适应森林生境的主要分支之一,广泛分布于亚洲东南部、中南美洲和非洲地区,具有重要的经济、生态和文化价值。为适应多样的生存环境,竹子演化出了多种多样的植株类型,包括乔木状、灌木状和草本竹,其中,有一类竹子因具有攀爬或攀援习性,被称为“藤本竹”。在我国记录过具攀爬或攀缘习性的竹子有6个属

研究揭示竹子茎秆快速生长的遗传机制

  演化创新(evolutionary innovation)贯穿于整个生命之树(Tree of Life),如被子植物的花和鸟类的羽毛分别为植物和鸟类开拓和适应新的生态位提供了重要前提,其如何产生是演化与发育生物学研究的基本问题和主要挑战之一。越来越多研究表明,新基因是演化创新的主要驱动力之一。几

基因系统发育的定义

中文名称基因系统发育英文名称gene phylogeny定  义通过比较DNA序列之间的差异建立的DNA分子之间的一种进化关系。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

竹子“变身”新型高透光电磁屏蔽材料

 原竹转化的新型高透光电磁屏蔽材料。南京林大供图 近日,南京林业大学家居与工业设计学院绿色家居材料制造团队教授吴燕领衔的课题组,通过一种简单高效的处理方式,在保留原竹天然形状和纤维素骨架结构的基础上,将其转化为具有良好光学性能的纤维素复合材料。日前,该项研究成果发表于国际期刊《纳微快报》(Nan

“农民院士”与“竹子教授”的甜笋之旅

  一丛丛翠绿的甜龙竹漫山遍野,一根根碗口粗的主干上迸发出条条初春的嫩枝……在云南保山昌宁县勐统镇勐统社区芒东村,这一根根甜龙竹,将一位“农民院士”和一位“竹子教授”,紧紧地“拴”在了一起。  被澜沧群众称为“农民院士”的朱有勇,是时代楷模、中国工程院院士、云南省科协主席。他曾在云南科技扶贫,7年间

细胞化学词汇基因系统发育

中文名称:基因系统发育英文名称:gene phylogeny定  义:通过比较DNA序列之间的差异建立的DNA分子之间的一种进化关系。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

清华写作课:“听春天竹子拔节的声音”

  “总是在不经意间被学生的成长打动。”这是清华大学写作与沟通教学中心主任梅赐琪在写作课中的感受。  “有一次,我去看学生的结课交流。有一名学生研究老鼠的文化形象。他说,传统认知中老鼠是四害之一,但是在卡通片中它们几乎都是正面形象。这是为什么?我当时就想,这是一个好问题!”  “还有一名学生研究上世

昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进

中科院、国家林业局Nature子刊发布测序新草图

  来自国家林业局、中科院上海生命科学研究院的研究人员成功地绘制出了速生非木材森林物种毛竹(moso bamboo)的基因组草图,从而为研究和遗传改良毛竹提供了一个宝贵的资源。相关成果发布在2月24日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。   国家林业局的江泽慧(Zeh

昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组

  同动物的线粒体基因组相比,植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式,如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前,植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序,需要耗费大量的人力和物力,严重限制了植物线粒体基因组的测序,进而导致对其独特进化方式的研究

戴尔以竹子与麦秸为原料研发新型生物塑料

  解决“白色污染”的一个有效途径就是使用生物降解塑料,在欧盟等发达国家和地区纷纷鼓励使用生物可降解塑料。据悉,由Newlight公司提供的AirCarbon牌塑料是一种新型生物塑料,以竹子和麦秸为原料经特殊工艺制取而成。该种塑料包装生产过程中碳排放量小,对环境不会造成污染。  总部设于美国德克萨斯

国际大合作,竹子快速生长的生物学机制

竹子是世界上生长速度最快的植物之一,如毛竹(Phyllostachys edulis)生长速度最快时每天可达114.5厘米。竹子为何有如此快的生长速度,其生物学机制如何?一直是植物学界科研人员颇感兴趣但仍不清楚的科学问题。 近日,南京林业大学竹类研究所教授魏强课题组联合美国康奈尔大学、国际竹藤中

全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究

  禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,约有12000种,是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源,也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时,禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科(竹子)是禾本科的12个亚科之一,与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP

中国地区熊蜂属系统发育获揭示

近日,中国农业科学院蜜蜂研究所传粉蜂生物学与授粉应用团队利用多基因联合对我国熊蜂属的系统发育进行了研究,揭示了中国地区26种熊蜂种的系统发育,为我国熊蜂属的分类奠定分子基础,同时也为熊蜂多样性和保护策略提供依据。相关研究成果在线发表在Zookeys上。 团队从青藏高原和中国北方不同地区采集了26

新研究揭示瓢虫系统发育及其演化

  华南农业大学林学与风景园林学院副教授陈晓胜与生物防治教育部工程研究中心教授王兴民团队合作,基于多位点分子标记,解析了亚洲小毛瓢虫族的系统发育关系与演化历史,为修订其分类体系提供了新的系统发育框架,对其演化历史提供了新的见解。相关成果近日发表于《分子系统发育与进化》。  小毛瓢虫族部分代表性类群的

浙江科学家成功克隆竹子部分成花基因

浙江林学院研究人员经过10多年研究,日前成功克隆到竹子的部分成花基因,在探究竹子开花奥秘的道路上迈出了重要一步。 竹子开花问题是竹子研究领域的世界性难题。竹子的开花周期可长达60年至120年,且难以预测,使得竹子的分类和杂交育种工作难以有效开展。另一方面,竹子一开花就意味着死亡,弄清竹子开花机理可

竹藤环保材料竹子:低成本低能耗建材

  2010年上海世博会西班牙馆的藤条挂毯外形使得其成为世博园内最吸引人眼球的展馆之一,也是人们参观世博会认识藤条竹子运用在大型建筑上的开端,随着参观展馆的进程,人们惊奇地发现宏大的印度馆穹顶是用竹子搭建而成,越南国家馆也主打竹子牌,挪威馆是用一种叫“黏竹”的工艺,用挪

PNAS:中国科学家揭示为什么大小熊猫都爱吃竹子

  中国科学院动物研究所魏辅文研究员领导的研究团队在1月17日的PNAS在线发表了一篇论文,首次对小熊猫全基因组进行了测序和分析,并将它们与大熊猫基因组进行比较,发现了适应性趋同的分子基础,其结果能够解释为什么亲缘较远的两个物种有类似外表并都爱吃竹子。  虽然大熊猫和大熊猫的名字暗示它们可能是密切相

大熊猫为何一心一意最爱竹子?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/481911.shtm 云南昭通水塘坝始熊猫生态复原(Mauricio Antón绘)右侧个体显示伪拇指抓握功能,左侧个体显示步行姿态 大熊猫抓握和咀嚼竹子(Sharon Fisher摄

云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定

  6月6日,由云南省科技厅主持,邀请有关专家,对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定,经专家组认真审查有关认定资料,听取了团队带头人李德铢的工作汇报。   专家组认为,该创新团队通过三年的实施培养,建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研

研究揭示非模式哺乳动物与其寄生蛔虫协同演化机制

  协同演化(Coevolution)指两个或多个物种通过自然选择的过程相互影响彼此的演化,按种间关系可分为互利的协同演化和拮抗的协同演化。宿主和寄生虫的协同演化就是典型的拮抗协同演化。已有的关于协同演化遗传机制的研究较多集中于候选基因水平,缺乏基因组水平的研究。随着基因组测序技术的发展,一些和人类