科研人员开发出分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及相关特征(如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等)对于研究基因功能和物种演化具有重要意义,是理解不同物种、不同基因家族以及不同功能基因之间差异的数据基础。 近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics正式上线,旨在对序列组分的动态变化提供综合、全面的展示,以多物种的系统性比较分析为基础,为深入的分子演化研究提供参考和启示。研究成果以CompoDynamics: a comprehensive database for characterizing sequence composition dynamics为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。 CompoDynamics针对RefSeq数据库的基因组注释信息,分别计算分析了基因和基因组层面的3类序列组分特征......阅读全文
科研人员开发出分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与蛋白质分子的序列组分及相关特征(如GC/AG含量、密码子使用偏好、蛋白质物理化学性质等)对于研究基因功能和物种演化具有重要意义,是理解不同物种、不同基因家族以及不同功能基因之间差异的数据基础。 近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的分子
序列图谱的定义
随着遗传图谱和物理图谱的完成,测序就成为重中之重的工作。DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程。通过测序得到基因组的序列图谱。
科研人员研发出新型抗菌候选药物分子
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515104.shtm
海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱
近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱,标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉,目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图
pUCmT质粒图谱和序列
pUC质粒载体是重要的大肠杆菌质粒载体之一,一起看下pUCm-T质粒图谱 和序列吧。 pUCm-T质粒图谱 pUCm-T载体 序列
首个CRISPR/Cas9靶序列数据库
近期,来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员,在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中,首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。 CRISPR及CRISPR相关蛋白(Cas9),是在古细菌和细菌中发现的
我国科研人员绘制和破译世界首例双峰驼全基因组序列图谱
记者11月17日从内蒙古农业大学获悉,我国科研人员近日完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作。专家表示,这项成果将对野生骆驼保护和家养骆驼品种改良起到重要指导作用,并将进一步推动骆驼产业的健康发展。 据了解,这个研究项目由内蒙古农业大学、上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究
基因序列排序与整理、数据库比对与意义
由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后,再利用DNA扩增的方式原理,在扩增的同时借由侦测萤光的方式(将不同碱基原料接上萤光讯号,只要这有接讯号的碱基被合成了,即会发出不同强度的萤光讯号)即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基
科研人员发现首个真菌多组分DNA病毒
真菌病毒是一类以真菌为宿主的病毒。4月3日,《科学进展》在线发表了首个三组分环状单链DNA病毒FgGMTV1,这种病毒的寄主是小麦赤霉病的主要病原真菌禾谷镰刀菌。发现者中国农业科学院植物保护研究所(以下简称植保所)研究员郭立华团队,利用克隆载体成功构建了该病毒的侵染性克隆。 多组分真菌RNA病
细胞组分的分析方法——核酸序列的原位杂交
一.基本原理 核酸分子杂交技术是目前分子生生物学、细胞生物学和生物化学研究中应用最广泛的技术之一,是定性、定量和定位检测两条来源不同的聚核苷酸链上碱基顺序同源性的一种手段。DNA分子是高度有序的双键分子。一条链的碱基与另一条链的碱基以氢键配对相连.形成腺嘌呤与胸腺嘧啶(A.T),鸟嘌呤与胞嘧啶(G
MF6A型多组分动态配气系统
HYDAC线圈跟着科技的兴旺线圈这个行业也对比广泛, 市场上的任何有关电子方面许多都有用到线圈,线圈的效果是很大的,一个小小的线圈在一些场合的运用都是能够表现着对比主要的效果的。线圈的运用路径对比广泛,能够表现的效果是对比大的,线圈的生产是对比严厉的,优异的线圈才干被运用于需求的范畴当中,线圈的
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域,时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用,其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日,中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法,显著提高了长期时间序列预测的准确性
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域,时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用,其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日,中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法,显著提高了长期时间序列预测的准确性
牡蛎全基因组序列图谱绘制完成
牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物 牡蛎养殖 近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,
草鱼全基因组序列图谱绘制完成
近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一
科研人员研制出单组分暖白光LED
近日,中科院大连化学物理研究所副研究员杨斌与山东大学研究员刘锋等合作,开发出了具有高效白光发射的新型双钙钛矿材料,并制备了基于该材料的单组分暖白光发光二极管(LED)。相关研究成果发表在《德国应用化学》上。 电气照明占全球电力消耗的15%,释放了全球5%的温室气体。采用更加高效、低成本的照明技术可缓
为青年科研人员开“机会之源”节“时间之流”
科技部、财政部等五部门发布《关于开展减轻青年科研人员负担专项行动的通知》,这是4年来有关部门开展的第三轮科研人员减负专项行动(减负行动3.0),旨在聚焦青年科研人员,推动减负行动效果持续深化,保障青年科研人员将主要精力用于科研工作。 近年来,我国科技人才队伍持续保持并加速呈现年轻化特征。科研人员
分子遗传学词汇核心序列
中文名称:核心序列英文名称:core sequence定 义:重复序列共有的核苷酸序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇回文序列
中文名:回文序列外文名:Palindromic sequence定义:遗传学上讲的回文序列指的是双链DNA或RNA分子中的特定的核苷酸片段,该片段在其中一条链上按5'到3'读取的序列与其互补链上按相同的5'到3'读取的序列一致。回文序列的单链DNA或RNA,存在对称中
分子标记基于图谱克隆基因
图位克隆(Map—bascd cloning))是近几年随着分子标记遗传图谱的相继建立和基因分子定位而发展起来的一种新的基因克隆技术。利用分子标记辅助的图位克隆无需事先知道基因的序列,也不必了解基因的表达产物,就可以直接克隆基因。图位克隆是最为通用的基因识别途径,至少在理论上适用于一切基因。基因
科研人员开发出RNA基础语言模型
在真核生物中,RNA转录、剪接、翻译和降解等生物学过程受到顺式调控元件、RNA结构和反式作用因子的调控。解析RNA多层次调控,对研究基因表达分子机制和设计RNA药物具有重要意义。但是,由于调控复杂和数据量不足,构建RNA调控的预测模型面临挑战。 近日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员张国庆
科研人员开发出地热计算器
地热能清洁稳定、潜力巨大。地热数值模拟软件流程复杂、操作难度大,限制了数值模拟新技术在生产实践中的广泛应用。针对这一问题,中国科学院地质与地球物理研究所等开发了地热计算器数值模拟软件。该软件基于应用场景,将繁复的模拟流程整合起来,将概念模型、数值模型剖分、目标优化等交给计算机自动完成。团队提出两种设
科研人员绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱
乳酸 (lactate) 是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物,在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多。其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应(Warburg effect)”而得到广泛关注。2019年,芝加哥大学Yingming Zhao教授团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成一
我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制
4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱
天然产物与生物来源图谱数据库NPBS-Atlas发布
据统计,超过50%的上市小分子药物均直接或间接源自天然产物或其化学结构启发。这些由植物、动物、微生物在亿万年进化中淬炼出的天然分子,拥有人工合成难以企及的复杂结构与强大生物活性,是创新药物发现的源泉。近日,中国科学院上海有机化学研究所发布了天然产物与生物来源图谱数据库——NPBS Atlas。NPB
瑞典开发出绘制免疫图谱新方法
瑞典卡罗林斯卡医学院、皇家理工学院、国家生命科学实验室(SciLifeLab)联合开发了一种识别免疫细胞受体并定位其组织位置的新方法,为识别和预测免疫细胞在病理过程中的作用机制,开发新免疫治疗方法提供了新工具和思路,研究成果发表在《科学》期刊。 单细胞技术允许在细胞水平上研究抗原受体,但缺乏空
瑞典开发出绘制免疫图谱新方法
瑞典卡罗林斯卡医学院、皇家理工学院、国家生命科学实验室(SciLifeLab)联合开发了一种识别免疫细胞受体并定位其组织位置的新方法,为识别和预测免疫细胞在病理过程中的作用机制,开发新免疫治疗方法提供了新工具和思路,研究成果发表在《科学》期刊。 单细胞技术允许在细胞水平上研究抗原受体,但缺乏空间分
中国开放最新家蚕基因组研究数据
“我们通过网络,以开放的姿态与世界共享家蚕基因组最新研究成果”,中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀26日介绍,包含有最新研究数据的中国家蚕遗传数据库目前已收到来自国内外科研人员的访问25万余次。 向仲怀介绍,中国家蚕遗传数据库由西南大学家蚕基因研究团队和深圳华大基因研究院合
分子遗传学词汇旁侧序列
中文名称:旁侧序列英文名称:flanking sequence定 义:结构基因两侧的核苷酸序列,对基因的表达及表达水平具有调控作用。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇上游激活序列
中文名称:上游激活序列英文名称:upstream activating sequence,定义:是真核基因中一类顺式调控序列,通常被认为与增强子相关,临近TATA box的上游,可以结合转录激活子