Nature年度技术:定向蛋白质组学

时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targeted proteomics)技术。 今年Nature Methods挑选的年度技术与往年都不同,往年强调的是非常新的尖端技术,比如2007年的新一代测序技术,2008年的超高分辨率显微镜,以及 2010年的光遗传学技术。从广义上讲,定向蛋白质组学分析技术其实可以追溯到上个世纪60年代出现的放射免疫分析技术(radioimmunoassay,RIA)。抗体试剂早已被认为是不可或缺的研究工具——能帮助生物学家从复杂生物样品中,筛选出兴趣蛋白,或者从组织切片或Western Blot实验中检测他们的蛋白。 定向蛋白......阅读全文

蛋白质组学几种定量方法的案例解读(二)

经典案例题目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一种基于多胺Hypusine轴(Polyamine-hypusine axis)的新型肿瘤抑制网络)期刊:Nature主要技术:iTRAQ定量文章摘要:

植物蛋白质组学和糖基化实验

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶                                                                  牛胰核糖核酸酶 B                                                            

蛋白质组学几种定量方法的案例解读(三)

经典案例题目:Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells(采用甾醇探针结合SILAC定量技术在哺乳动物细胞中分析胆固醇-蛋白质相互作用)期刊:Nat Methods主要技术:SILAC定量文

蛋白质组学(TMT+labelfree)破译衰老密码

众所周知,干细胞的老化被认为是导致组织和器官老化的根本原因,尤其是在高周转率的生物系统中,比如造血作用。随着干细胞的老化,受损组织被替换的潜能也会随之减弱,在人体中,贫血,适应性免疫系统能力的下降,以淋巴细胞为代价的骨髓细胞的扩张,以及频发的血液系统恶性肿瘤,这些都已经被报道与衰老息息相关。但是这些

蛋白质组学几种定量方法的案例解读(一)

一、Label-free定量Label-free定量,顾名思义就是不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化,通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数(Spectra Co

新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是,到目前为止,大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前,世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在,来自IRCM(Instiut de recherc

蛋白质组学大会及学术研讨会

第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港澳蛋白质组学学术研讨会 会议时间: 2007-8-20 会议地点: 广州 主办单位: 中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO) 承办单位: 南方医科大学 暨南大学 香港大学 香港中文大学 北京蛋白质组研究中心 协办单位: 广州市科学技术协会

最先进的蛋白质组学实验室建立

赛默飞世尔科技公司与英国癌症研究院合作建立最先进的蛋白质组学实验室   2009年7月20号,英国赫默尔亨普斯特德—服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技公司在英国的癌症研究院(ICR)宣布一项整合生物网络的合作。癌症研究院是世界上新型、先进的蛋白质组学实验室,配有完整的Thermo Scientif

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有

我国在单细胞蛋白质组学研究获突破

  浙江大学化学系微分析系统研究所方群教授团队,联合北京大学医学部精准医疗多组学研究中心主任黄超兰教授团队,在单细胞蛋白质组学分析研究领域取得突破性进展。研究论文近日在线发表在美国《分析化学》杂志上。  黄超兰介绍,近年来,基于细胞群体内的蛋白质组学研究,已越来越难以满足对生命功能深入探究的需要。从

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密

巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤,包括动脉疾病。最近,布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析,强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究实验

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验材料植物组织                                                          试剂、试剂盒苯酚                                                  

APAF选择TripleTOF-5600系统推进蛋白质组学研究

  全球生命科学分析技术的 领导者AB SCIEX公司,今天宣布,澳大利亚的蛋白质组分析中心(APAF)选择了AB SCIEX TripleTOF 5600系统,通过显著增加蛋白质组覆盖率来帮助推进蛋白质组学研究。TripleTOF 5600 系统是生命科学产业界最快、最灵敏的高分

APT分享-|-蛋白质组学解锁木薯保鲜新技能

  木薯是热带和亚热带地区的重要作物,与马铃薯和甘薯并称为世界三大薯类作物。当然,在中国大部分地区,我们最常见到的木薯,应该是这个样子出现的:   图1    吃货们看过来~   好,看完美食我们接着聊。木薯虽然不错,但是采后很容易变质,难以贮存。这在吃货界显然是不可以忍受的事!还好,大批科

植物蛋白质组学和糖基化(二)

4. 注释( 1 ) 每个实验均使用新鲜的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化试剂。( 2 ) 要仔细识别蛋白质印迹,因为 WGA 既能识别 N-糖苷的 GlcNAc,也能识别 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纤维素印迹膜上封闭结合位点的溶液应避免糖蛋白污染。所以我们建议在这一步骤中使

蛋白质组学肽段除盐吸头免费领取!

  开学焕新 科研加速高质量的样品前处理是确保实验成功与数据可靠的关键。C18肽段除盐吸头作为蛋白质组学(尤其是基于LC-MS/MS的肽段分析)中常用的脱盐耗材,亦可用于部分蛋白/肽类相关的生物分析质谱前处理,能够帮助科研人员高效实现样品富集与脱盐,提升质谱检测的灵敏度与准确性。新学期伊始,Open

ETD:将成为蛋白质组学研究的标准方法

——访赛默飞ETD技术发明人John E.P. Syka 博士  【导语】质谱已经成为开展蛋白质组学研究的基础平台,更确切地说,具有MS/MS功能的质谱已成为蛋白质组学研究的基础平台。过去,CID/CAD技术是实现MS/MS功能的唯一手段,在蛋白质鉴定的自下而

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)

同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,

2025蛋白质组学大会之Posttranslational-Modifications

  2025年10月14日上午10点10分在广州白云国际会议中心国际会堂珠水厅,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨第三届π-HuB国际大科学计划全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Post-translational Modifications”分论坛顺利拉开帷幕。本论坛由郑州大学附属

APT分享-|-蛋白质组学解锁木薯保鲜新技能

   木薯是热带和亚热带地区的重要作物,与马铃薯和甘薯并称为世界三大薯类作物。当然,在中国大部分地区,我们最常见到的木薯,应该是这个样子出现的:    吃货们看过来~   好,看完美食我们接着聊。木薯虽然不错,但是采后很容易变质,难以贮存。这在吃货界显然是不可以忍受的事!还好,大批科学家上线

蛋白质组学揭示植物干旱胁迫的分子机制

 Significant and unique changes in phosphorylation levels of four leaf phosphoproteins in two apple rootstock genotypes under drought stress.干旱胁迫对

蛋白质组学常用数据库一览

  一蛋白质数据库  1.UniProt (The Universal Protein Resource)  网址:http://www.uniprot.org/  http://www.ebi.ac.uk/uniprot/  简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞

植物蛋白质组学和糖基化(一)

 1. 前言与其他真核细胞一样,植物细胞中,糖基化通常发生在分泌蛋白质上,虽然在细胞质蛋白和核蛋白上也发现一些糖基化反应。根据寡糖部分和蛋白质骨架之间的连接方式,可将糖基化分为两种类型:N -糖基化和 O-糖基化。植物中 N-糖基化研究最多。1.1 N-糖基化与其他真核细胞一样,在植物细胞中,N-糖

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

实验材料植物组织试剂、试剂盒苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材低温粉碎机实验步骤3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在一个 15 ml 的离心管(falcon  tube) 中加入

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)

1. 前言提取蛋白质是蛋白质组学研究的第一步。植物组织的蛋白质含量较低,并且存在多种非蛋白质成分,如细胞壁及贮藏多糖、脂质和酚类化合物,使蛋白质的提取难度增大 。植物蛋白质的可溶性与它们的细胞内定位关系密切,传统的蛋白质提取方法是用水合缓冲液、去垢剂或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质...

顽拗性植物组织的蛋白质组学研究(苯酚法提取蛋白质)实验实验材料 植物组织试剂、试剂盒 苯酚提取缓冲液沉淀液等电聚焦缓冲液仪器、耗材 低温粉碎机实验步骤 3.1 蛋白质提取( 1 ) 新鲜植物组织在液氮中冷冻,然后在自动低温粉碎机中预先冷却的钢杯中将材料研磨成细碎的粉末(见注释 4) 。( 2 ) 在

蛋白质组和蛋白质组学分析

 随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基

“蛋白质组学/脂质组学研究进展网络研讨会”-第一轮通知

  分析测试百科网讯 自从精准医学概念提出以来,组学研究一直都是全球最热的研究领域,其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初,中国发起了精准医学研究专项课题,目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台,推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入