细胞化学基础结构域的基本分类
为了研究蛋白质分子结构的基本规律,人们用不同的方法从不同的角度对已知的蛋白质结构进行分类,有些是基于生物功能,有些是基于结构自身,有些是将二者结合在一起进行分类研究。例如,锌金属蛋白酶是一类可催化肽链内部肽键水解的肽链内切酶,尽管所属的各个亚家族成员的整体空间结构差异显著,但催化活性部位的结构非常类似,故将它们归属于一类蛋白。然而,最为人们熟悉的还是M.Levitt和C.Chothia对蛋白质结构进行的分类。此方法认为二级结构的组合构成了大多数结构域结构的核心,并据此把蛋白质结构分为四类:α型、β型、α/β型以及其它类型的结构域结构。α型结构域结构主要由α-螺旋所构成,例如肌红蛋白的结构等。β型结构域结构主要由反平行的卜回折所构成,通常是两个卜回折相互包裹在一起,例如质体兰素的结构等。α/β型结构域结构则是由α-螺旋所包裹的以平行β-链为主的;β-α-β花样所构成的,例如丙糖磷酸异构酶、葡萄糖异构酶催化结构域的结构等。还有一些蛋......阅读全文
细胞化学基础结构域的基本分类
为了研究蛋白质分子结构的基本规律,人们用不同的方法从不同的角度对已知的蛋白质结构进行分类,有些是基于生物功能,有些是基于结构自身,有些是将二者结合在一起进行分类研究。例如,锌金属蛋白酶是一类可催化肽链内部肽键水解的肽链内切酶,尽管所属的各个亚家族成员的整体空间结构差异显著,但催化活性部位的结构非常类
细胞化学基础结构域的定义和分类
结构域(domain)是位于超二级结构和三级结构间的一个层次。结构域是在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元,通常都是几个超二级结构单元的组合。在较大的蛋白质分子中,由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,进一步折叠形成一个或多个相对独立的致密三维实体,即结构域。结构域与分子整体以共价键相连,一般难以分离
细胞化学基础βαβ结构域
中文名称:β-α-β结构域英文名称:β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 义:蛋白质超二级结构之一,由β折叠-α螺旋-β折叠所构成的功能结构域。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
细胞化学基础结构域的性质
又称基元。蛋白质分子的一种折叠单位,是较大的蛋白质分子或亚基三维折叠中的一个层次或一种相对独立的三维实体。一条长链多肽链最后一步折叠就是结构域缔合(association),而成一个有活性的蛋白质分子或亚基。在一级(维)结构中的氨基酸序列的某些区域相邻的氨基酸残基形成有规则的二级(维)结构(如α-螺
细胞化学基础HMG框结构域
高速泳动族非组蛋白HMG1和HMG2有A、B和C 3个结构域:A、B结构相似,C含有酸性的羧基端尾部,与H1结合。RNA聚合酶Ⅰ相关的转录分子UBF的DNA结合结构域是85个氨基酸残基的重复区,与HMG1和HMG2的A、B结构相似,所以这种特征性结构被命名为“HMG"结构域。中文名称:HMG框结构域
细胞化学基础螺旋袢螺旋结构域
中文名称:螺旋-袢-螺旋结构域英文名称:helix-loophelix motif定 义:存在于转录因子的DNA结合结构域中的一种蛋白质结构域。由两个α螺旋和中间的一个袢组成,识别并结合特异的DNA序列。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
细胞化学基础螺旋转角螺旋结构域
中文名称:螺旋-转角-螺旋结构域英文名称:helix-turnhelix motif定 义:由两个α螺旋间隔以一定角度的转角构成的结构域。其中一个α螺旋可插入DNA大沟中与专一DNA序列结合。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
细胞化学基础卫星DNA的分类
卫星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四类,其浮力密度分别是1.687,1.693,1.697和1.700g/cm3。各类卫星DNA都是由各种不同的重复序列家族所组成。卫星DNA通常是串联重复序列。卫星DNA按其重复单元的核苷酸的多少,可以分为两类。一类是小卫星DNA(minisatel
细胞化学基础核糖核酸分类
人体一个细胞含RNA约10pg(含DNA约7pg)。与DNA相比,RNA种类繁多,分子量较小,含量变化大。RNA可根据结构和功能的不同分为信使RNA和非编码RNA。非编码RNA分为非编码大RNA和非编码小RNA。非编码大RNA包括核糖体RNA、长链非编码RNA。非编码小RNA包括转移RNA、核酶、小
细胞化学基础作用力分类
定义:范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用。其能量计算的经验方程为:U =B/r12- A/r6 (对于2 个碳原子间,其参数值为B =11.5 ×10-6 kJ·nm12/mol ;A=5.96 × 10-3 kJ·nm6/mol;不同原子间A、B 有不同取值)当两原子彼此
细胞化学基础域的定义和分类
域(Domain),分类学术语,生物分类法中最高的类别。所有细胞生物原分为两域:没有核膜的生物(细菌和古细菌)被分入原核生物域,其他为真核生物域。Carl Woese 在 1977 年提出的生物分类中﹐将原核生物分成了两大类﹐起初称为真细菌(Eubacteria)和古细菌(Archaebacteri
细胞化学基础亲水基得分分类
阴离子表面活性剂的亲水基(团)有羧酸基、磺酸基、硫酸基与磷酸基等。阳离子表面活性剂有氨基、季铵基等。非离子表面活性剂有由含氧基团组成的醚基和羟基与羧酸酯、嵌段聚醚还有常见的醛基等。
细胞化学基础腺苷基本信息
中文名称: 腺苷化学名称:9-β-D-呋喃核糖基腺嘌呤英文名称: AdenosineCAS号: 58-61-7分子式: C10H13N5O4分子量: 267.24CAS号:58-61-7MDL号:MFCD00005752EINECS号:200-389-9RTECS号:AU7175000BRN号:93
细胞化学基础α螺旋基本信息
α-螺旋(α-helix):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基
细胞化学基础卫星DNA的基本信息
卫星DNA标记(microsatelliteDNA)是近十多年发展起来的一种新型的分子遗传标记。它具有数量大、分布广且均匀、多态信息含量高、检测快速方便等特点,已经被广泛应用于动、植物基因定位、连锁分析、血缘关系鉴定、遗传多样性评估、系统发生树构建、标记辅助选择等方面。卫星DNA微卫星DNA又称短串
细胞化学基础黄嘌呤基本信息
中文名称:黄嘌呤英文名称:Xanthine别名名称:3,7-二氢-1H-嘌呤-2,6-二酮;黄尿环; 黄嘌 2,6-二氧化嘌呤 ;海生丁; 黄花色精;2,6-Dihydroxypurine ;2,6-Dioxopurine ;2,6-Dioxo-1,2,3,6-tetrahydropurine分子式
细胞化学基础线粒体DNA基本性质
与核基因组相比,线粒体基因组有如下性质:所有的基因都位于一个单一的环状DNA分子上。遗传物质不为核膜所包被。DNA不为蛋白质所压缩。基因组没有包含那么多非编码区域(调控区域或“内含子”)。一些密码子与通用密码子不同。相反,与一些紫色非硫细菌相似。一些碱基为两个不同基因的一部分(重叠基因):某碱基作为
结构域的分类
为了研究蛋白质分子结构的基本规律,人们用不同的方法从不同的角度对已知的蛋白质结构进行分类,有些是基于生物功能,有些是基于结构自身,有些是将二者结合在一起进行分类研究。例如,锌金属蛋白酶是一类可催化肽链内部肽键水解的肽链内切酶,尽管所属的各个亚家族成员的整体空间结构差异显著,但催化活性部位的结构非常类
胞化学基础氢键的分类
同种分子之间现以HF为例说明氢键的形成。在HF分子中,由于F的电负性(4.0)很大,共用电子对强烈偏向F原子一边,而H原子核外只有一个电子,其电子云向F原子偏移的结果,使得它几乎要呈质子状态。这个半径很小、无内层电子的带部分正电荷的氢原子,使附近另一个HF分子中含有负电子对并带部分负电荷的F原子有可
细胞化学基础分配系数基本信息
一定温度下,一种溶质分配在互不相溶的两种溶剂中的浓度比值为一常数。分配定律可由下式表达:分配系数分配系数式中K为分配系数; 为溶质B在溶剂α中的浓度, 为溶质B在溶剂β中的浓度。在分配定律表达式中,溶质在不同溶剂中的浓度可以用“mol/L”或“g/L”为单位来表示。 分配系数可以近似地看做此物质在两
细胞化学基础黄嘌呤基本信息简介
黄嘌呤(英语:xanthine)是一种广泛分布于人体及其他生物体的器官及体液内的一种嘌呤碱,常用作温和的兴奋剂和支气管扩张剂,特别用于治疗哮喘症状。咖啡因、茶碱及可可碱(主要在巧克力中发现)等常见的温和兴奋剂均由黄嘌呤衍生出来。黄嘌呤也是嘌呤代谢後的产物,并会在黄嘌呤氧化酶的作用下转换为尿酸。黄嘌呤
细胞化学基础β转角
β-转角是一种常见的蛋白质二级结构,它通常出现在球状蛋白表面,因此含有极性和带电荷的氨基酸残基。
细胞化学基础嘌呤
嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一种杂环芳香有机化合物,是新陈代谢过程中的一种代谢物。
细胞化学基础腺苷
腺苷,是指由腺嘌呤的N-9与D-核糖的C-1通过β糖苷键连接而成的化合物,化学式为C10H13N5O4,其磷酸酯为腺苷酸。腺苷是一种遍布人体细胞的内源性核苷,可直接进入心肌经磷酸化生成腺苷酸,参与心肌能量代谢,同时还参与扩张冠脉血管,增加血流量。腺苷对心血管系统和肌体的许多其它系统及组织均有生理作用
细胞化学基础碱基
碱基,在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子,称为含氮碱基,氨基(-NH2)是最简单的含氮碱基。碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,
细胞化学基础锌指
锌指是一种常出现在DNA结合蛋白质中的一种结构基元。锌螯合在氨基酸链中形成锌的指状结构。锌是某些酶的活性辅助因子,也是某些蛋白质,包括RNA聚合酶的转录因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、类固醇受体等能结合脱氧核糖核酸(DNA)的蛋白质亦含有锌
细胞化学基础α螺旋
α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第
细胞化学基础核酶
科学家在研究RNA的转录后加工时发现某些RNA有催化活性,可以催化RNA的剪接,这些由活细胞合成、起催化作用的RNA称为核酶。许多核酶的底物也是RNA,甚至就是其自身,其催化反应也具有专一性。已经阐明的天然核酶有锤头状核酶、发夹状核酶、I型内含子、Ⅱ型内含子、丁型肝炎病毒核酶、核糖核酸酶P、肽基转移
细胞化学基础二硫键基本信息
在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成。在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。
细胞化学基础α螺旋的功能
α-螺旋在DNA结合基序(DNA binding motifs)中有非常重要的作用,比如在锌指结构,亮氨酸拉链,螺旋-转角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。这是因为α-螺旋的直径为1.2nm,正好和B-DNA大沟的直径相等,所以能够和B型DNA紧密结合。