微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展

中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等,在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展,提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法,可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架(RDF),并构建了基于语义网框架的冠状病毒知识图谱数据库gcCov。gcCov包含六千多万条语义三元组,通过多源异构数据的语义整合,支持大规模数据驱动的知识发现,具备对基因、结构、抗体等数据进行相关性分析的能力,有助于推动未来对基本病毒机制以及药物和疫苗设计的研究。相关研究成果发表在mLife上。 近几十年来,冠状病毒持续威胁全球公共卫生安全。关于新型冠状病毒的研究十分广泛,相关出版物的数量也迅速增长。海量的科研数据促使将不同类型的研究整合到一个可搜索的语义互联的数据集,这颇具挑战性。目前,可用的冠状病毒数据库主要集中在基因组分析领域(如CovDB1和ViPR2......阅读全文

丝状真菌葡萄糖转运系统研究取得进展

  葡萄糖高/低亲和力双转运系统是微生物应对外界环境营养扰动的一种保守的策略。而感应和转运葡萄糖的过程与纤维素降解真菌表达调控纤维酶密切相关。早在上世纪70年代就发现,纤维素降解真菌粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)在应对胞外高、低不同浓度的葡萄糖时,分别启用两套对葡萄糖不同亲和力的转

青海省主要农业资源台账建设研究取得新进展

  9月25日,青海省科技厅组织专家对中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、青海省农牧业项目管理中心完成的“青海省主要农业资源台账建设研究”项目进行成果评价,专家委员会认为,项目成果研究思路清晰、重点突出,具有创新性、可操作性和推广性,同意通过成果评价。  项目深入贯彻落实中办国办《关于创新体制机

加速器驱动嬗变研究装置建设取得阶段性进展

加速器驱动嬗变研究装置项目总工程师、中科院近代物理所直线加速器中心主任何源介绍,目前,超导直线加速器常温前端全部在线设备研制完成,具备集成测试条件;液态散裂靶热工样机和集成测试系统平台研制完成,已进入运行状态并用于开展相关实验研究;次临界反应堆核岛主工艺总体设计完成,非核集成验证装置主设备进入加工阶

合作行为演化动力及其系统维持机制研究获得重要进展

  无论在人类的社会还是自然生物系统中,近代的研究发现合作行为可能是个体间相互作用的基本形式之一。英国科协主席Robert May在2005年的任职演说中,将生物进化过程和人类的社会学中合作关系演化及其系统维持列为进化生物学或社会科学中最为重要的、未被解决的科学问题。从上世纪60年代陆

苏州大学在生物分析检测领域取得新进展

  苏州大学功能纳米与软物质研究院的何耀教授课题组发展了硅基表面增强拉曼检测平台,用于对致癌基因的高灵敏、特异性多元分析检测。相关研究发表在近期的《应用物理快报》(Appl. Phys. Lett. 2012, 100, 203104)。该论文作为APL封面论文发表,并被评为近年来发表在该杂

微生物所在人体肠道细菌耐药基因研究方面取得进展

  人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育

海洋微生物次生代谢的生理生态效应研究取得进展

海洋微生物次生代谢的生理生态效应及其生物合成机制研究取得进展  海洋微生物研究是国际海洋科学研究的前沿领域,关乎海洋生物资源的国家权益保障、创新药物资源安全、生态环境安全与健康修复和国家重大科技战略。   由中科院南海海洋研究所主持的973计划项目“海洋微生物次生代谢的生理生态效应及

苏州纳米所高通量微生物培养芯片研究取得进展

  微生物已经在工业、农业、能源、环境、医药等诸多领域发挥着无可替代的作用。筛选获得优良的菌种是提升相关产业技术水平的重要途径。通常,微生物的液体培养筛选需要同时在数十上百个培养瓶或试管中进行。这使得整个筛选过程劳动强度大,效率较低。   最近,中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所国际实验室的甘明哲

微生物所在水稻抗稻瘟病机制研究中取得进展

  由稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病是危害水稻最严重的真菌病害,每年给水稻生产带来巨大损失,严重发病的田块甚至绝产。在植物抗病机制研究过程中发现,多种植物激素在植物应对外界生物与非生物胁迫过程中发挥重要作用。其中,气体乙烯被认为是一类逆境激素而受到重视。以往有关乙烯对植物

利用工业微生物生产玉米黄素研究取得进展

  玉米黄素(zeaxanthin)是光合生物重要色素,具有保护细胞免受高光损伤的作用。玉米黄素也是视网膜黄斑重要色素,具有保护眼睛、维护视觉和认知等功能。人和动物自身不能合成玉米黄素,必须从食物中摄取。蔬菜和水果是玉米黄素的主要来源,但人体每天数毫克的需求量难以从只含微克量水平的食物中得到。因此玉

微生物所在念珠菌有性生殖研究方面取得进展

  有性生殖是生命进化的主要推动力,是真核生物遗传变异和多样性产生的加速器。有性生殖有利于剔除有害遗传突变,积累有利变异,从而促进物种环境适应能力的提升和长期进化优势的保持。白色念珠菌是一种重要的人体病原真菌,临床菌株具有很高的多样性和致病性。全世界每年由念珠菌引起的阴道炎和鹅口疮等浅部感染病例达到

电子垃圾污染土壤PCBs微生物降解研究取得进展

  粗犷的电子垃圾拆解活动导致大量的持久性有机污染物,如:多氯联苯(PCBs)和多溴联苯醚(PBDEs)释放到土壤中,对生态环境与人体健康构成了严重威胁。微生物降解是土壤中PCBs消减的重要途径。但在实际应用中,PCBs的微生物修复却受到了极大限制,究其原因主要有:一、通过分离培养获得的微生物菌种有

海洋微生物氧杂蒽酮生物合成研究取得进展

中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室海洋微生物代谢工程与生物合成研究团队在海洋微生物氧杂蒽酮生物合成机制研究中取得新进展。相关研究9月14日在线发表于《自然—通讯》。杨春芳副研究员和张丽萍副研究员为该论文共同第一作者,张长生研究员为通讯作者。 包含氧杂蒽酮骨架的天然产物

微生物所免疫细胞癌变机理研究取得新进展

     图片说明:白血病病毒的v-Abl癌基因持续激活了JAK/STAT/Pim和PI3K/AKT1等信号通路,导致细胞转化。研究表明AKT1的突变极大地促进了v-Abl介导的细胞转化,阐明了PI3K/AKT1信号通路与JAK/STAT/Pim信号通路之间存在相互调控的关系。  淋

青岛能源所在微生物燃料电池研究取得系列进展

  近日,在国家自然科学基金和中国科学院知识创新工程重要方向项目等项目支持下,中国科学院青岛生物能源与过程研究所生物传感器团队负责人、中科院“百人计划”入选者刘爱骅等在基于木糖脱氢酶表面展示体系的微生物燃料电池研究取得新进展。  生物燃料电池是指以微生物或酶为催化剂,将生

微生物所在寨卡病毒致病机制研究中取得进展

  中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Contribution of intertwined loop to membrane association revealed by Zika virus full-length NS1

PBDEs原位微生物降解研究中取得新进展

  多溴联苯醚(PBDEs)是目前备受关注的持久性有机污染物(POPs)。微生物降解过程是环境中POPs消减的重要途径,但由于自然环境中污染物来源复杂、微生物降解速度缓慢及传统定性定量分析方法的局限性等问题,目前对于沉积环境中PBDEs的原位微生物降解过程了解甚少。  考虑到野外环境体系的开放性及复

“宁夏中药资源及质量数据库系统研究”取得成功

  为确保宁夏中药材质量,打造“宁夏道地中药材品牌”,宁夏科技厅组织宁夏药品检验所、固原市药品检验所、宁夏种苗生物工程重点实验室和宁夏医科大学药学院,历时3年,完成自治区科技攻关计划项目“宁夏中药资源及质量数据库系统研究”,研究成果日前通过科技厅验收。   项目围绕宁夏有一定竞争优势的50个中药材

我国学者在神经化学单细胞研究领域取得重要研究进展

  在国家自然科学基金项目(项目编号:91649121、91432103、31471014、21775143、21475121、81701068)等资助下,中国科学技术大学熊伟教授研究组与黄光明教授研究组合作,通过单细胞质谱、光遗传、分子生物学、电生理及动物行为学等技术方法,揭示了一条脑内谷氨酸合成

我国大气颗粒结合态汞研究领域研究取得新进展

近日,中国科学院地理科学与资源研究所研究员郭庆军团队在我国大气颗粒结合态汞研究领域取得新进展,对明确全球汞循环和促进水俣公约的实施具有重要意义。相关研究成果发表于Earth-Science Reviews。汞是一种剧毒重金属,可以通过大气在全球范围内进行传输。当大气中的汞与颗粒物结合时,会形成颗粒结

国际合作研究-深度学习与物理研究交叉领域取得新进展

复旦大学高分子科学系张红东课题组李剑锋副教授与加拿大滑铁泸大学陈征宇教授合作,在深度学习与物理研究交叉领域取得新进展,提出了一种全新的概念表征方法。近日,研究成果以《用强关联神经网络进行结构预测与反向设计》(“Structural Prediction and Inverse Design by

微生物所嗜盐微生物合成医学材料研究取得新进展

  地球上存在着一类喜欢生活在高盐环境中的微生物,极端的生活环境使这类嗜盐微生物进化出了特殊的生存能力。对嗜盐微生物的研究不仅为探索生命的极限适应机制提供了重要启示,同时也为其特殊功能和代谢产物的利用提供了可能。  通过10余年的系统工作,中国科学院微生物研究所向华研究组已从基因组层面系统阐明了以地

自然基金资助:微生物生物膜功能代谢组学领域取得进展

  自然基金资助成果:我国科学家在微生物生物膜功能代谢组学领域取得新进展  在国家自然科学基金项目(批准号:81274175,31670031 )等资助下,上海交通大学吕海涛课题组,整合运用精准靶向代谢组学和遗传学整合策略(Precision-Targeted Metabolomics combin

微生物所在古菌基因组复制起始领域取得新进展

  基因组复制是生命得以存在和延续的最重要和最基本的遗传过程。与细菌染色体通常只有一个复制起点不同,真核生物和许多古菌的染色体均具有多个复制起始位点。这些复制起始元件可能具有不同的活性以适应体内外环境的变化,如在真核生物中普遍存在休眠状态的复制起始位点,如何解析这些休眠复制起点的激活机制及

中国科大在玻璃化转变研究领域取得新进展

  液体在快速降温或加压的时候会避免结晶而转变为非晶态的玻璃,几乎所有凝聚态体系都可以形成玻璃态,因此,玻璃化转变是个普遍存在的物理现象。然而,作为非晶液-固转变的代表,玻璃化转变无法简单归类于已知的相变类型,从而使它的相变本质成为困扰凝聚态物理多年的难题。Science在创刊125周年的时候提出了

食品包装行业新材料安全研究领域取得新进展

  日前,从北京市海淀区质监局传来喜讯,其海淀区产品质量监督检验所(国家食品质量安全监督检验中心)的科研成果——《食品包装材料有害物质控制技术研究与应用》荣获中国石油和化学工业联合会科技进步奖二等奖。   据介绍,该项研究由江南大学牵头,国家质检中心主要承担“塑料食品包装容器中有害物(挥发性有机物

新疆理化所在生物基凝油材料研究领域取得进展

  石油及各种油类在社会经济发展中起着十分重要的作用。伴随着人们对各种油品需求量的不断增加,在石油开采、加工、运输等过程中常常会发生溢油、漏油事故,这会严重影响水体安全和生态平衡。采用多孔材料对水面溢油进行吸附,可以简单有效地实现水面清洁、溢油回收,这种方法对汽油等流动性好、粘度低的液体具有较好的吸

深圳先进院在单分子检测研究领域取得新进展

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医药所张春阳研究员领导的研究团队在单分子检测研究领域取得重要进展,研究成果相继发表在Angewandte Chemie International Edition (2013, 52, 691-694)和Journal of the American C

苏州纳米所在可穿戴纤维器件研究领域取得新进展

  作为碳纳米管纤维的重要发展方向,柔性纤维状可编织电学器件正处于蓬勃发展阶段。柔性纤维状的电学器件,如纤维状锂离子电池、纤维状太阳能电池、纤维状记忆存储器及纤维状超级电容器,可以编织成各类织物,与人们日常穿戴结合起来,用于制备智能织物。碳纳米管纤维,以其柔性、质轻、高导电及多级界面等特点非常适合作

中国科大在Ras変构动力学研究领域取得进展

  近日,中国科学技术大学教授龙冬课题组运用液体核磁共振波谱方法在癌基因蛋白Ras活性态変构动力学研究领域取得新进展,相关成果以Extending the Lifetime of Native GTP-Bound Ras for Site-Resolved NMR Measurements: Qua