什么叫做鸟枪法
基因测序“鸟枪法”，也俗称“霰弹法”。简单地说，它有点类似生活中玩的拼图游戏。拼图游戏是将一个完整的画面分成杂乱无章的碎块，然后重新拼装复原。而“鸟枪法”则是先将整个基因组打乱，切成随机碎片，然后测定每个小片段序列，最终利用计算机对这些切片进行排序和组装，并确定它们在基因组中的正确位置。......阅读全文
科学家开发出无副作用靶向疗法－有望治疗癌症、自闭症等
近日，一项刊登在国际杂志Neuron上的研究报告中，来自美国弗吉尼亚健康系统大学(University of Virginia Health system)的研究人员通过研究开发了一种新方法能精准靶向作用细胞内的分子，该研究或能为研究人员开发出治疗多种疾病且没有任何副作用的新型安全性疗法。图片来
科学时报：大熊猫研究步入基因组时代
10月11日，深圳华大基因研究院宣布，大熊猫晶晶的基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 深圳华大基因研究院大熊猫基因组项目负责人田埂博士在接受记者采访时表示：“目前的基因组框架图涵盖基因组95%区域，覆盖基因区约98%。虽然这还不是最终的基因
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人
2013值得关注的技术：微生物组功能研究
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
最新Nature完成四个基因组测序成果
高通量低成本测序技术令物种基因组测序研究一日千里，在最新公布的Nature杂志(11月29日)上，就接连公布了四种生物的基因组，它们分别是小麦和大麦，以及两种小型藻类：Bigelowellia natans 和Guillardia theta。 根据来自世界粮农组织的信息，小麦与大麦在
斯坦福牛人开发新方法来检测移植排异
斯坦福大学的Stephen Quake团队开发出一种基于新一代测序的分析，可检测肺移植患者中的无细胞循环DNA，并从中发现排异和感染的迹象。这项成果于本周发表在《美国科学院院报》（PNAS）上。这位牛人科学家是单细胞基因组学领域的先锋，曾测定人类精子的单细胞基因组。 研究人员将他们的方法与目前
植物分子育种主要包括哪些内容
名词概述分子育种，就是将基因工程应用于育种工作中，通过基因导入，从而培育出一定要求的新品种的育种方法。动物分子育种方法主要是以分子标记为基础进行标记辅助选择，然后以转基因技术为基础进行转基因育种。是按照人们的愿望，进行严密的设计，通过体外 DNA重组技术 和 DNA转移技术，有目的地改造生物种性，使
ABI－3730XL测序平台的原理及特点
Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台，应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品，该仪器采用4色荧光同时检测，可不间断24小时运行，自动灌胶，上样，电泳分离，检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外，还可进行多
牦牛基因组研究成果揭示高原适应的遗传学机制
由兰州大学主导、深圳华大基因研究院以及中科院昆明动物所等多家单位联合完成的牦牛基因组研究成果于7月1日在国际著名杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.23
基因测序探索生命奥秘
现在，距离人类基因组草图公布已经过去近20年。2001年2月15日， 中、美、日、德、法、英等6国科学家和美国塞莱拉公司联合发表“人类基因组计划”的结果——人类基因组草图及初步分析，这也是有史以来最准确、最完整的脊椎动物基因组序列。 人类基因组草图的绘就，不仅是人类探索生命奥秘的一个重要里程碑
新型精确质量Q－Exactive－HF液质提高50％以上的扫描速度
2014年6月15日—当今蛋白质组学的研究不断追求突破，不仅要有高的扫描速度，同时仍要有高的数据质量，最新加入赛默飞具有业界领导地位的Q Exactive家族的新成员—Q Exactive HF液相质谱满足了这一需求。该款新品在第62届美国质谱年会上首次亮相，赛默飞公司站位号为12
ABI－3730XL测序平台的原理及特点
Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台，应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品，该仪器采用4色荧光同时检测，可不间断24小时运行，自动灌胶，上样，电泳分离，检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外，还可进
中科院、华大基因Nature子刊测序新成果
来自中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院和亚利桑那大学等机构的研究人员完成了对短花药野生稻(Oryza brachyantha)的全基因组测序，并揭示出了稻属基因组进化的机制。相关成果发表在3月12日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。
中国科学家NatureGenetics发布西瓜基因组草图
来自北京农林科学院、康奈尔大学、深圳华大基因研究院、复旦大学等10多家机构的研究人员组成的一个国际研究小组成功破译了西瓜的遗传密码，绘制出世界上第一张西瓜(watermelon)基因组序列草图。相关论文发表在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上 北京农林
华中农业大学Nature子刊发表测序新成果
来自华中农业大学、新加坡基因组研究员以及加州大学河滨分校等机构的研究人员报告称他们绘出了甜橙(sweet orange)基因组草图，为未来了解及改善许多重要的柑橘性状提供了有价值的资源。相关成果发布在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 领导这一研
华中农业大学Nature子刊公布测序新成果
来自华中农业大学、新加坡基因组研究员以及加州大学河滨分校等机构的研究人员报告称他们绘出了甜橙(sweet orange)基因组草图，为未来了解及改善许多重要的柑橘性状提供了有价值的资源。相关成果发布在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 领导这一研
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日，由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日，北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎（RA）口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节，并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
赛默飞有机质谱用户会在西宁召开－聚焦应用前沿与热点
分析测试百科网讯 2016年9月9日，在第34届中国质谱学会学术年会开幕前夕，赛默飞世尔科技2016年有机质谱用户会在青海省西宁市举行。来自有机质谱行业的近200专家、学者在组学、临床、食药等多个方面共同交流、探讨有机质谱最新的研究成果。会议现场赛默飞即将发布的新产品——Exactive GC
基因测序技术进化史
DNA上承载了关于我们的太多信息：发展史、祖先、特征、疾病易感性、甚至性格和命运。因此很多人迫不及待地想将DNA看得一清二楚。解码人类基因组的第一次郑重尝试是始于1990年的人类基因组计划。尽管合作和艰苦工作无疑扮演了重要角色，但一系列工程上的突破推动了这个项目，以前所未有的速率收集并核对数据。
卢煜明创立的Cirina公司获A轮1200万美元融资
创业公司Cirina在A轮融资中筹集了1200万美元，来开发无创筛查检测，用于癌症和其他疾病的早期发现。 Cirina公司由香港中文大学李嘉诚健康科学研究所所长卢煜明教授创立于2014年，Maneesh Jain担任该公司的首席执行官，在Life Technologies被赛默飞收购之前，Ja
福建农林大学、华大基因Nature子刊发表新成果
由福建农林大学和华大基因(BGI)领导一个国际研究联盟，完成了第一个最具破坏性的芸苔属作物害虫――小菜蛾(diamondback moth，DBM)的基因组序列图谱。这项工作提供了对昆虫适应宿主植物更广泛的见解，为农田有害生物持续性治理开辟了新途径。最新研究在线发表在《自然遗传学》(Natu
新研究发现系统性红斑狼疮患者的肠道菌群特征和致病性
系统性红斑狼疮（SLE）是一种以慢性炎症和多器官损伤为特征、典型的自身免疫性疾病，狼疮患者的自身耐受降低并持续产生自身抗体。狼疮发病过程中复杂的自身免疫应答机制尚未被完全阐明。除某些特定的遗传因素和环境触发因素可能致病之外，肠道菌群对宿主免疫系统的重要调节作用逐渐引起了科学家的注意，但目前仍缺乏
利用完整质体基因组精准鉴定天冬及其9种混伪品
在传统医学的宝库中，天冬（Asparagus cochinchinensis）作为一味重要的中药材，其加工后的块根 —— 天门冬，在东亚地区尤其是中国，有着悠久的药用历史。它不仅能治疗多种疾病，如胃痛、便秘、发热、哮喘等，还被广泛应用于制药和保健品行业，可谓是 “药界明星”。然而，近年来天冬市场却遭
黄三文：蔬菜遗传密码的破译者
黄三文，1971年出生于湖南岳阳。中国农业科学院蔬菜花卉所研究员，博士生导师。1996年硕士毕业于北京农业大学，2005年获荷兰瓦赫宁根大学博士学位。现任深圳农业基因组所副所长，国家“973”项目“主要蔬菜重要品质性状形成的遗传机理与分子改良”首席科学家、国际黄瓜基因组计划首席科学家、国际茄科基
中山大学荒漠特殊生境微生物暗物质资源研究发NPJ
近日，中山大学教授李文均团队在荒漠特殊生境微生物暗物质资源研究方面取得重要进展。相关成果发表于npj Biofilms and Microbiomes。 论文第一作者、中山大学-嘉应学院联合基地博士后李帅表示，荒漠约占全球陆地总面积的1/3，是地球上面积最大、研究最不充分的生境之一，同
西湖大学等绘制世界首张“新冠患者分子全景图”
1月9日，西湖大学生命科学学院郭天南课题组与合作团队（华中科技大学同济医学院附属协和医院胡豫、夏家红、聂秀团队）在《细胞》在线发表了题为《新冠肺炎死亡患者多器官蛋白质组全景图》的论文，报道了2020年初因新冠肺炎去世的患者体内多器官组织样本中蛋白质分子病理全景图。相当于他们将医生在显微镜下看到的
张启发院士Nature子刊发表水稻基因组成果
9月13日，在Nature旗下的开放获取杂志《Scientific Data》发表的一项研究中，来自华中农业大学和美国亚利桑那州大学的研究人员，用PacBio的long read测序数据和Illumina双末端测序数据，构建了两个籼稻参考基因组。 我国著名的植物遗传和分子生物学家，华中农业大学
我科学家主导完成全球首个梨基因组解析
由南京农业大学梨工程技术研究中心、深圳华大基因研究院、浙江省农业科学院等多家科研院所合作完成的砀山酥梨基因组研究成果于 11月 13日在《基因组研究》(Genome Research)上发表。全球首个梨基因组的成功解析及其基因组层面的功能研究将为培育高产、优质和抗病的新品种梨奠定坚实的遗
暨大另类质谱鉴定算法策略大幅提高蛋白质组鉴定能力
鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是蛋白质组研究的标准研究方法。从质谱谱图中鉴定蛋白质需要依赖搜库算法,现有许多算法被开发出来，常见的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P