化学裂解错配碱基法介绍

化学裂解错配碱基法(chemical cleavage mismatch,CCM) 通过化学修饰并切割异源DNA双链中错配碱基,达到检测点突变的目的。其原理是末端标记的DNA片段暴露于可以识别并修饰异源双链中错配碱基的化学试剂中(如错配的胞嘧啶可被羟胺修饰,错配的胸腺嘧啶可被四氧化锇修饰),被修饰的位点随即可被杂氮环已烷等化学物质裂解。DNA修饰裂解后,电泳观察DNA片段长度即可知道突变是否存在。该技术较其他突变检测系统有更多的优越性,可以扫描1~ 2 kb 的大片段DNA并在随后的顺序分析中定位突变位点,其效率可达100%。该手段通常首先对目标DNA和野生型DNA进行PCR 扩增,然后对野生型DNA扩增片段进行末端标记,标记片段作为探针与目标序列复性形成异源双链,用四氧化锇(OsO4) 或羟胺(hydroxylamine) 修饰并用哌啶(piperidine) 切割,聚丙烯酰胺电泳分离不同长度的片段。近年来,有人采用碳化二......阅读全文

化学裂解错配碱基法介绍

  化学裂解错配碱基法(chemical cleavage mismatch,CCM) 通过化学修饰并切割异源DNA双链中错配碱基,达到检测点突变的目的。其原理是末端标记的DNA片段暴露于可以识别并修饰异源双链中错配碱基的化学试剂中(如错配的胞嘧啶可被羟胺修饰,错配的胸腺嘧啶可被四氧化锇修饰),被修

化学错配裂解的概念

中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定  义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性,复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段

什么是化学错配裂解?

中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定  义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性,复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段

化学错配裂解的定义

一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性,复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段,借助变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及放射自显影进行分析。

化学错配裂解的原理和特点

中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定  义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性,复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段

细胞化学词汇DNA错配

DNA错配是指DNA双链核酸分子中存在的非互补性碱基配对的现象,即一条链上的碱基与另一条链上相应的碱基不是互补的。DNA双螺旋结构中碱基之间的配对不是随意的,总是 腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)配对的原则。若出 现了 A与C或G配对,或T与G或C配对,也称为碱基错配。

细胞裂解方法:化学裂解、酶裂解和机械裂解

裂解方法包括化学裂解、酶裂解和机械裂解。化学裂解和酶裂解通常是比较温和的方法,通常会很少使DNA 断裂。这两种方法(包括SDS 和溶菌酶处理等)提取纯化DNA中常用的方法。机械裂解可以更均一的裂解细胞,同化学裂解相比,机械处理具有更高的裂解效率和更低的选择性。机械处理可以更剧烈和全面的裂解细胞,

错配固相化学切割法实验

            试剂、试剂盒 退火缓冲液 B&W(结合洗脱)缓冲液 dNTP溶液 甲酰胺染液 羟胺 KMnO4 TEAC 嘧啶

错配固相化学切割法实验

试剂、试剂盒退火缓冲液B&W(结合洗脱)缓冲液dNTP溶液甲酰胺染液羟胺KMnO4 TEAC嘧啶Taq DNA聚合酶Taq DNA聚合酶缓冲液待测和对照基因组DNA仪器、耗材磁力架微孔滴定板或微管振荡器链霉抗生物素蛋白包被的磁珠热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂(1)退火缓冲液,2X:

分子生物学技术的分类

目前,常用的分子生物学技术有如下几种 : PCR- 单链构象多态性分析(PCR- single strand conformation analysis,PCR- SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR- SSCP 技术凭借突变可引起单链DNA三级构象改变,通过观察单链DN

细胞化学基础碱基的种类修饰碱基

DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化(methylation)或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶(m5C)。RNA中有许多修饰的碱基,包括核苷类假尿苷(Ψ)、二氢尿苷(D)、肌苷

细胞化学基础碱基

碱基,在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子,称为含氮碱基,氨基(-NH2)是最简单的含氮碱基。碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,

细胞化学词汇复制后错配修复

中文名称:复制后错配修复英文名称:post-replicative mismatch repair定  义:DNA复制后对错误的碱基配对进行修复。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

错配固相化学切割法实验(一)

试剂、试剂盒 退火缓冲液B&W(结合洗脱)缓冲液dNTP溶液甲酰胺染液羟胺KMnO4 TEAC嘧啶Taq DNA聚合酶Taq DNA聚合酶缓冲液待测和对照基因组DNA仪器、耗材 磁力架微孔滴定板或微管振荡器链霉抗生物素蛋白包被的磁珠热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂(1)退火缓冲液,

错配固相化学切割法实验(二)

(二)方法1. 均一标记探针的制备(1)取一无菌离心管置于冰上,加入如下组分。基因组DNA              50~100ng引物5A                     20pmol引物5B                     20pmoldNTP溶液(10mmol/L)2.5ul

分子生物学技术的分类

  目前,常用的分子生物学技术有如下几种[1]:  PCR单链构象多态性分析  PCR-单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链

PNAS:赵新生等揭示双链DNA中错配碱基自发翻转的规律

  近日,北京大学生科院生物动态光学成像中心赵新生、高毅勤两个课题组通力合作,近日在《美国科学院院刊》PNAS上发表重要论文,利用新颖的单分子实验手段重新测算了双链DNA错配碱基自发反转的速率,并运用动力学模拟方法对其分子机理进行了深入研究。对于阐明酶对碱基进行修复的分子机理具有重要价值。  如果在

化学裂解法概述

  化学裂解法是DNA序列分析方法之 一。其反应的基本原理是,基于某些化学试 剂可以使DNA链在1个碱基或2个碱基处 发生专一性断裂的特性,精确的控制反应强 度,使一个断裂点仅存在于少数分子中,不 同分子在不同位点断裂,从而获得一系列大小不同的DNA片段,将这些片段经聚丙烯 酰胺凝胶电泳分离。  在

细胞化学基础兆碱基

兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。

细胞化学基础修饰碱基

又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成

细胞化学基础合成碱基

在医学中,几种核苷类似物用作抗癌剂和抗病毒剂。病毒聚合酶将这些化合物与非主要碱基结合。病人服用的核苷类似物进入体内被转化为核苷酸而在细胞中被激活。

细胞化学基础稀有碱基

又称修饰碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。

细胞化学词汇碱基修复

中文名称:碱基修复英文名称:base repair定  义:由于某些原因可导致核酸碱基错配或其他损伤,生物体内有多个系统可修复错配或损伤的碱基,如碱基切除修复。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学基础千碱基

中文名称:千碱基英文名称:kilobase;kb定  义:描述多核苷酸链的长度单位,相当于单链核酸中1000个碱基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学基础互补碱基

互补碱基,碱基间的一一对应的关系叫做碱基互补配对原则就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,Guanine(G,鸟嘌呤)一定与Cytosine(C,胞嘧啶)配对,反之亦然。碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物,是核酸、核苷、核苷酸的成分。DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要

细胞化学词汇兆碱基接头

中文名称:兆碱基接头英文名称:megalinker定  义:一种人工合成的具有特定限制酶识别位点的双链寡核苷酸。具有的限制性核酸内切酶切位点在DNA中出现的概率为百万分之一,在基因工程中可用于获得大片段的DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇碱基堆积

中文名称:碱基堆积英文名称:base stacking定  义:双螺旋核酸结构中,除氢键外,碱基间通过次级键的堆积在一起,构成核酸的高级结构。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇碱基置换

碱基置换(substitution)包括两种类型:转换(transition)是由嘌呤置换嘌呤或嘧啶置换嘧啶。颠换(transversion) 是指嘌呤置换嘧啶或嘧啶置换嘌呤。如碱基置换发生于编码多肽的区,则因可影响密码子而使转录、翻译遗传信息发生变化,因此可以出现一种氨基酸取代原有的某一种氨基酸。

细胞化学词汇碱基配对

中文名称:碱基配对释       义:DNA双螺旋结构和RNA的基础作       用:复制、转录和翻译作用核酸链间腺嘌呤和尿嘧啶(RNA)或胸腺嘧啶(DNA)以及鸟嘌呤和胞嘧啶的专一氢链结合。分子杂交技术就是根据碱基配对的原理设计的。碱基配对后形成碱基对(basepair,bp),常用作DNA分子

细胞化学基础碱基对

碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。然而,它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和