PNAS：赵新生等揭示双链DNA中错配碱基自发翻转的规律
近日，北京大学生科院生物动态光学成像中心赵新生、高毅勤两个课题组通力合作，近日在《美国科学院院刊》PNAS上发表重要论文，利用新颖的单分子实验手段重新测算了双链DNA错配碱基自发反转的速率，并运用动力学模拟方法对其分子机理进行了深入研究。对于阐明酶对碱基进行修复的分子机理具有重要价值。 如果在双链DNA中有一错配的碱基对，其中的一个碱基是否可以自发地翻转出来？如果可以，其速率是多少？这不仅是DNA运动的一个基本问题，而且具有重要的生物学意义。细胞自身和环境的各种因素会造成DNA的损伤而导致错配碱基对的形成。碱基错配会引发细胞的病变甚至死亡，因此需要通过酶的作用及时给予修复。为了回答酶如何找到错配位点进而完成修复这一问题，需要了解双链DNA中错配碱基自发翻转的动力学。过去仅有的实验数据来源于NMR基于质子交换速率的测量，但这一解释受到理论研究的强烈质疑。人们一直期待着用更可靠的实验方法对双链DNA中错配碱基自发翻转速率进行新......阅读全文
PNAS：赵新生等揭示双链DNA中错配碱基自发翻转的规律
近日，北京大学生科院生物动态光学成像中心赵新生、高毅勤两个课题组通力合作，近日在《美国科学院院刊》PNAS上发表重要论文，利用新颖的单分子实验手段重新测算了双链DNA错配碱基自发反转的速率，并运用动力学模拟方法对其分子机理进行了深入研究。对于阐明酶对碱基进行修复的分子机理具有重要价值。 如果在
化学裂解错配碱基法介绍
化学裂解错配碱基法（chemical cleavage mismatch,CCM) 通过化学修饰并切割异源DNA双链中错配碱基，达到检测点突变的目的。其原理是末端标记的DNA片段暴露于可以识别并修饰异源双链中错配碱基的化学试剂中（如错配的胞嘧啶可被羟胺修饰，错配的胸腺嘧啶可被四氧化锇修饰），被修
北京大学PNAS解析DNA修复机制
来自北京大学的研究人员在新研究中对双链DNA分子中单个错配碱基对自发翻转（spontaneous flipping）的动力学进行了探测，研究结果发表在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 北京大学的赵新生（Xin Sheng Zhao）教授和高毅勤（Yi Qin Gao）教授是这篇论文的共同
化学错配裂解的概念
中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定 义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性，复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段
什么是化学错配裂解？
中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定 义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性，复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段
错配修复的概念
错配修复可校正DNA复制和重组过程中非同源染色体偶尔出现的DNA碱基错配，错配的碱基可被错配修复酶识别后进行修复。
错配修复的特点
错配修复（mismatch repair，MMR）：在含有错配碱基的DNA分子中，使正常核苷酸序列恢复的修复方式；主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对错配修复的过程需要区分母链和子链，做到只切除子链上错误的核苷酸，而不会切除母链上本来就正常的核苷酸。
化学错配裂解的定义
一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性，复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段，借助变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及放射自显影进行分析。
细胞化学词汇DNA错配
DNA错配是指DNA双链核酸分子中存在的非互补性碱基配对的现象，即一条链上的碱基与另一条链上相应的碱基不是互补的。DNA双螺旋结构中碱基之间的配对不是随意的，总是 腺嘌呤（A)与胸腺嘧啶（T)配对，鸟嘌呤（G)与胞嘧啶（C)配对的原则。若出 现了 A与C或G配对，或T与G或C配对，也称为碱基错配。
人菌错配增加胃癌风险
艺术家笔下的幽门螺旋杆菌。图片来源：Sciepro/Corbis 哥伦比亚小镇Tuquerres坐落于南美洲安第斯山脉，这里拥有全世界最高的胃癌发病率：每10万人中有150名胃癌患者。与此同时，就在200公里之外的沿海城镇Tumaco，这一比例仅为约6∶100000。 根据一项新的研
DNA错配的概念和原则
DNA错配是指DNA双链核酸分子中存在的非互补性碱基配对的现象，即一条链上的碱基与另一条链上相应的碱基不是互补的。DNA双螺旋结构中碱基之间的配对不是随意的，总是 腺嘌呤（A)与胸腺嘧啶（T)配对，鸟嘌呤（G)与胞嘧啶（C)配对的原则。若出 现了 A与C或G配对，或T与G或C配对，也称为碱基错配。
基因组错配扫描的功能
中文名称基因组错配扫描英文名称genome mismatch scanning;GMS定 义从遗传背景有较大差异、但具有相同性状的两个不同个体基因组中筛查高度一致的DNA片段的技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
错配固相化学切割法实验
试剂、试剂盒 退火缓冲液 B&W(结合洗脱）缓冲液 dNTP溶液 甲酰胺染液 羟胺 KMnO4 TEAC 嘧啶
错配固相化学切割法实验
试剂、试剂盒退火缓冲液B&W(结合洗脱）缓冲液dNTP溶液甲酰胺染液羟胺KMnO4 TEAC嘧啶Taq DNA聚合酶Taq DNA聚合酶缓冲液待测和对照基因组DNA仪器、耗材磁力架微孔滴定板或微管振荡器链霉抗生物素蛋白包被的磁珠热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂（1）退火缓冲液，2X:
化学错配裂解的原理和特点
中文名称化学错配裂解英文名称chemical mismatch cleavage;CMC定 义一种测定基因突变的方法。即将同位素标记的野生型DNA分子和突变型DNA或RNA片段混合变性，复性时可形成DNA-DNA或DNA-RNA异源双链、化学修饰突变部位的错配碱基、氮杂环己烷裂解被修饰的DNA片段
二硫键错配怎么还原
用还原剂可以将其打开还原，比如二硫苏糖醇DTT、2-巯-乙醇等。
DNA错配修复蛋白如何运作
当一个细胞准备分裂时，DNA首先分裂，双螺旋“解压缩”成为两个单独的主干。新的核苷酸——腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤或胸腺嘧啶，被填充到主干另一边的缺口中，与它们的对应物配对（腺嘌呤和胸腺嘧啶，鸟嘌呤和胞嘧啶），并为旧的和新的细胞复制DNA。大部分时间核苷酸是正确匹配的，但偶尔（在一百万次中约有一次）
复制后错配修复的定义
中文名称复制后错配修复英文名称post-replicative mismatch repair定 义DNA复制后对错误的碱基配对进行修复。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
月亮如何自行翻转
月球近侧的重力梯度图，其中显示月幔倾覆产生的两股含钛铁矿的累积下降流。图片来源：美国科学促进会网站科技日报北京4月8日电 （记者张佳欣）大约45亿年前，一颗小行星撞上了年轻的地球，将熔岩抛入太空。慢慢地，碎片融合、冷却、凝固，形成了月球。据发表于8日《自然·地球科学》杂志的一项新研究，美国亚利桑那大
细胞化学基础碱基的种类修饰碱基
DNA和RNA分子中还含有核酸链形成后经过修饰形成的其它非主要碱基。这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位甲基化（methylation）或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。DNA中最常见的修饰碱基是5-甲基胞嘧啶（m5C）。RNA中有许多修饰的碱基，包括核苷类假尿苷（Ψ）、二氢尿苷（D）、肌苷
组成碱基对的碱基有哪些？
组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说，碱基对是一对相互匹配的碱基(即A：T，G：C，A：U相互作用)被氢键连接起来。
碱基互补配对原则的碱基互补的介绍
在脱氧核糖核酸分子中，含氮碱基为腺嘌呤(A)，鸟嘌呤(G)，胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。每一种碱基与一个糖和一个磷酸结合形成一种核苷酸。在其双链螺旋结构中，磷酸-糖-磷酸-糖的序列，构成了多苷酸主链。在主链内侧连结着碱基，但一条链上的碱基必须与另一条链上的碱基以相对应的方式存在，即腺嘌呤对应胸
细胞化学词汇复制后错配修复
中文名称：复制后错配修复英文名称：post-replicative mismatch repair定 义：DNA复制后对错误的碱基配对进行修复。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
错配固相化学切割法实验（一）
试剂、试剂盒 退火缓冲液B&W(结合洗脱）缓冲液dNTP溶液甲酰胺染液羟胺KMnO4 TEAC嘧啶Taq DNA聚合酶Taq DNA聚合酶缓冲液待测和对照基因组DNA仪器、耗材 磁力架微孔滴定板或微管振荡器链霉抗生物素蛋白包被的磁珠热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂（1）退火缓冲液，
DNA错配修复的概念和过程
错配修复(mismatch repair,MMR):在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式;主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对错配修复的过程需要区分母链和子链,做到只切除子链上错误的核苷酸,而不会切除母链上本来就正常的核苷酸。
分子的重复机制滑链错配
又称复制滑动，是指DNA复制中的错误产生的短基因序列的重复。在复制期间，DNA聚合酶开始复制DNA。在复制过程中的某个时刻，聚合酶与DNA链解离，复制停顿。当聚合酶重新连接到DNA链时，它将复制链对齐到不正确的位置并偶然复制相同的部分不止一次。重复序列，但只需要几个相似的碱基，通常促进复制滑动。
错配固相化学切割法实验（二）
(二）方法1. 均一标记探针的制备（1）取一无菌离心管置于冰上，加入如下组分。基因组DNA 50~100ng引物5A 20pmol引物5B 20pmoldNTP溶液（10mmol/L)2.5ul
碱基的定义
碱基，在生物化学中又称核碱基、含氮碱基，是形成核苷的含氮化合物，核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对，且彼此堆叠，所以，它们是长链螺旋结构，例如核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）的重要组成部分。
什么是碱基？
碱基，在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子，称为含氮碱基，氨基（-NH2）是最简单的含氮碱基。碱基，在生物化学中又称核碱基、含氮碱基，是形成核苷的含氮化合物，核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对，且彼此堆叠，所以，
什么是碱基？
碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物，是核酸、核苷、核苷酸的成分。