自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种，称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接，但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且可能出现在一个未有蛋白质的核糖核酸世界。虽然以下两种剪接可以在没有蛋白质的情况下进行，但依然会额外的使用5个RNA分子及超过50多个蛋白质，并水解多个三磷酸腺苷（ATP）分子。使用 ATP 是要提高剪接mRNA的准确性，避免出现错误。......阅读全文
Autophagy（自噬）
自噬是近年来很热门的领域，搜了一下园子，发现没有这方面系统的介绍或讨论，但很多战友有这方面的疑问，加上本人最近对此也非常感兴趣，因此，借本版来专门讨论一下自噬（说实在的，自噬属于丁香园哪一个版块的范围我也选不好），与各位同行或有志于研究自噬的战友共同学习，也欢迎大家提出自己的看法，本人的目的就是交流
自噬分类
根据细胞物质运到溶酶体内的途径不同，自噬分为以下几种。①大自噬：由内质网来源的膜包绕待降解物形成自噬体，然后与溶酶体融合并降解其内容物；②小自噬：溶酶体的膜直接包裹长寿命蛋白等，并在溶酶体内降解；③分子伴侣介导的自噬（CMA）：胞质内蛋白结合到分子伴侣后被转运到溶酶体腔中，然后被溶酶体酶消化。CMA
Autophagy（自噬）
自噬是近年来很热门的领域，搜了一下园子，发现没有这方面系统的介绍或讨论，但很多战友有这方面的疑问，加上本人最近对此也非常感兴趣，因此，借本版来专门讨论一下自噬（说实在的，自噬属于丁香园哪一个版块的范围我也选不好），与各位同行或有志于研究自噬的战友共同学习，也欢迎大家提出自己的看法，本人的目的就是交流
关于细胞自噬的自噬形式的介绍
细胞自噬主要有三种形式：微自噬（microautophagy)、巨自噬（macroautophagy）和 分子伴侣介导的自噬 (Chaperone-mediated autophagy，CMA）。 微自噬 定义 ：指 溶酶体或者液泡内膜直接内陷底物包裹并降解的过程。 作用时间：多在种子成熟
遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展
作为一种重要的基因转录后调控机制，可变剪接在真核生物中普遍发生，在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异，然而，决定这些差异的因素还尚不为人知。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同
聚合酶链反应剪接的原理和应用
中文名称聚合酶链反应剪接英文名称PCR splicing定 义利用聚合酶链反应进行基因剪接以删除DNA中一段特定序列的方法。系设计两组引物，先分别扩增拟删除序列上下游两侧的序列,再用上游序列5′端引物和下游序列3′端引物用PCR反应进行连接。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二
西湖大学在次要剪接体领域再获突破
3月15日，《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题，在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破，这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学讲席教授施一公团队，第一作者是西湖大学副研究员白蕊。 完全组装的次要剪接体的三维结构。课题组供图 如果说，每
西湖大学在次要剪接体领域再获突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519140.shtm3月15日，《科学》以“完全组装的次要剪接体与U12型内含子结合的结构基础”为题，在线发表了剪接体结构与机理研究的一项重大突破，这一研究成果来自西湖大学特聘研究员万蕊雪团队和结构生物学
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 前体 mRNA 底物试剂、试剂盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S10
酵母前体mRNA剪接提取物实验（二）
(12) RNA 洗脱缓冲液：20 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.6)，0.5 mol/L NaCl，10 mmol/L EDTA，2% ( V/V ) 苯酚（Tris EDTA 或 NaAc-EDTA 平衡），4°C 保存。(13) 7.5 moI/L 乙酸铵（NH4Ac）：用 0
tRAS（转录组可变剪接调控深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；根据对照和实验组，系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律，中肯分析所揭示出的重要科学规律；让您快速“发现”所关注的生物学，医学和农业问题的答案。 我们
酵母前体mRNA剪接提取物实验（一）
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。 实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶 试剂、试剂盒 YPT
次要剪接体：不次要的生命“剪辑师”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/496757.shtm 如果把微观生命活动比作一部电影，那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的，它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的，就是基因。而在基因
次要剪接体：不次要的生命“剪辑师”
如果把微观生命活动比作一部电影，那么这部精密而复杂的“影片”就是由无数蛋白质各司其职上演的，它们影响着生命体的健康。而“指挥”这些蛋白质、让它们执行各种功能的，就是基因。而在基因塑造生命的过程中，有个隐秘而伟大的遗传“剪辑师”——次要剪接体。 1.每一次剪接，都关乎细胞“命运” 剪接体的故
酵母前体mRNA剪接提取物实验（一）
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶试剂、试剂盒 YPTris-HCl ETDASD
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。
肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
Pre-mRNA可变剪接是一种增加基因组多样性和调控基因表达的重要机制。在肿瘤的发生发展过程中，许多剪接事件发生异常变化。然而，我们并不清楚这些异常剪接事件是如何产生的，异常剪接产物对肿瘤细胞的生物学功能产生什么影响。肺癌是最常见的恶性肿瘤之一，在全球范围是癌症相关致死的头号杀手。由于缺乏有效的
内含肽的应用剪接调控以作为药物“开关”
含肽作为药物靶标的研究于内含肽这种可调控的作用机制，Bonnanl51为，通过改变剪接结构域上、下游的序列，自主设蛋白质内含肽，可以调控蛋白质的剪接。因为包含内含肽的前体蛋白无活性的，所以那些能阻断剪接的化学物质将具有重要的药用价值。由于目前在动物和人体正常新陈代谢中没有发现内含肽的报道，作为药靶标
显微放射自显影——放射性自显影技术
实验材料小白鼠试剂、试剂盒酒精 二甲苯 Giemsa 染色液 乳胶 显影液 定影液 氚-胸腺嘧啶核苷氚标记胸苷仪器、耗材显微镜 恒温培养箱 电冰箱 干燥箱 电吹风 暗室放射自显影技术是利用放射性同位素所产生的射线作用于感光乳胶的氯化银晶体而产生潜影，再经过显影定影处理，把感光的氯化银还原成黑色的银颗
博文自评
某知名杂志最近提到“微博要考虑其魅力”。 对博文自评如下： 1、道德力量：B 自己的博文总的来说是向上的，不足亦不少。 2、专业含量：A 专业知识(包括国外文献)的广度和深度自己认为比较好，实验室工作经验丰富。 3、语言/文字水平 B 文学功底一般，写东西快，文
什么是自噬？
自噬是溶酶体吞噬细胞器和其他内容物以清除不必要或功能失调的成分的过程。该关键机制允许细胞材料的系统降解和回收。它可以依据不同的环境促进细胞存活或细胞死亡。
细胞自噬过程
细胞自噬(autophagy)是真核生物中进化保守的对细胞内物质进行周转的重要过程。该过程中一些损坏的蛋白或细胞器被双层膜结构的自噬小泡包裹后，送入溶酶体(动物）或液泡（酵母和植物 ）中进行降解并得以循环利用。
什么是自溶？
自溶指的是人死后体内各脏器由于自身酶的作用，逐渐软化和液化的现象。肉眼观察脏器表面发暗，有松软感，切面变得模糊不清，胃肠道黏膜崩溃脱落。显微镜下，早期自溶组织的细胞界限不清，细胞似浊肿状，胞浆中有颗粒或空泡形成，然后出现染色性的改变。晚期的变化类似腐败，细胞失去界限，胞核丧失染色性。
自平衡电桥简介
自平衡电桥，或称半自动电桥。其原理是：利用电流变量器和运算放大器把不平衡信号放大后，仍旧反馈到电桥电路中去补偿其差值，从而使电桥自动地维持平衡。这类电桥器可以做到很高的测量精确度和很宽的量程。但是仍旧要用人工来帮助调节平衡，所以测量速度不能很快。
细胞自噬现象
细胞自噬（autophagy）的过程（以下有视频讲解）1）细胞接受自噬诱导信号后，在胞浆的某处形成一个小的类似"脂质体"样的膜结构，然后不断扩张，被称为Phagophore。2）Phagophore不断延伸，将胞浆中的任何成分，全部揽入，然后"收口"，成为密闭的球状的autophagosome，即"
细胞自噬工具
就像我们会打扫以保持房间整洁一样，细胞也演化出了一系列“清洁”机制，来维持有序的生命活动。自噬（autophage）就是其中最重要的机制之一。自噬于上个世纪60年代被发现，但引起科学界的广泛关注，还是在1990年代日本科学家大隅良典（Yoshinori Ohsumi）做的相关研究。大隅良典也因此获得
细胞自噬过程
a、吞噬泡噬过程存在于膜的形态变化，体现了膜的流动性特点，a正确；b、线粒体是有氧呼吸的场所，氧气在线粒体中被消耗，线粒体功能退化，氧气的消耗量减少，b正确；c、细胞及时清除受损的线粒体，维持了细胞内部环境的相对稳定，c正确；d、当细胞养分不足时，细胞“自噬作用”一般都会增强，为细胞提供更多的养分，
自噬流的变化可以反应自噬的变化吗
检测LC3II/LCI: lc3参与自噬的形成，自噬形成时，胞浆型LC3(即LC3-I)会酶解掉一小段多肽，转变为(自噬体)膜型(即LC3-II)，LC3II升高代表自噬的启动；2.检测P62：P62可以通过自噬来降解，因此P62可以反映自噬的强弱。当LC3 II升高，P62同时降低，表明自噬流通畅
罗氏剪接修饰剂risdiplam在美国进入优先审查！
罗氏（Roche）近日宣布，美国食品和药物管理局（FDA）已受理risdiplam的新药申请（NDA）并授予了优先审查，该药是一种运动神经元生存基因2（SMN2）剪接修饰剂，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的治疗。FDA已指定处方药用户收费法（PDUFA）目标日期为2020年5月24日。之前，FDA