基因诊断的聚合酶链反应方法介绍
21世纪,基因分析和基因工程技术有了革命性的突破,这主要归功于聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的发展和应用。应用PCR技术可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小时内体外扩增数十万至百万倍。扩增的片段可以直接通过电泳观察,也可用于进一步的分析。这样,少量的单拷贝基因不需通过同位素提高其敏感性来观察,而通过扩增至百万倍后直接观察到,而且原先需要一、二周才能作出的诊断可以缩短至数小时。 首先应按照欲检测的DNA的5’和3’端的碱基顺序各合成一段长约17-20余个碱基的寡核苷酸作为引物(primer),其次是将待检测的DNA变性后,加入四种单核苷酸(dNTP)、引物和耐热聚合酶。在较低的温度,引物将与待扩增的DNA链复性结合,然后的聚合酶的作用下,利用溶液中的核苷酸原料,不断延伸合成新互补链,这样,一条DNA双链就变成了两条双链。若继续按照变性(92-95℃)→复性(40-60℃)→......阅读全文
基因诊断的聚合酶链反应方法介绍
21世纪,基因分析和基因工程技术有了革命性的突破,这主要归功于聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的发展和应用。应用PCR技术可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小时内体外扩增数十万至百万倍。扩增的片段可以直接通过电泳观察,也可用于进一步的分析。这样,
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的引物介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应结果的特异性取决于引物的特异性,扩增产物的大小也是由特异引物限定的。因此,引物的设计与合成对PCR的成功与否起着决定性的作用。合成的引物必须经聚丙烯酰胺凝胶电泳或反向高压液相层析(HPLC)纯化。因为合成的引物中会有相当数量的“错误序列”,其中包括不完整的序列和脱嘌呤产
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的试剂介绍
(1)基因扩增技术—聚合酶链反应— 引物:决定扩增的特异性。根据检测的DNA不同,选用不同引物,每种病原微生物都有自己特异的引物。 (2)基因扩增技术—聚合酶链反应— 耐热的DNA聚合酶:此酶是从耐热细菌中分离出来的,能耐受高温90℃-100℃。 (3)基因扩增技术—聚合酶链反应— 10×P
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的特点介绍
1、高度敏感 理论上基因扩增技术—聚合酶链反应可以按2n倍数扩增DNA十亿倍以上,实际应用已证实可以将极微量的靶DNA成百万倍以上地扩增到足够检测分析量的DNA。能从100万个细胞中检出一个靶细胞,或对诸如病人口液等只含一个感染细胞的标本或仅含0.01pg的感染细胞的特异性片段样品中均可检测。
Alu聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称Alu聚合酶链反应英文名称Alu-PCR定 义从复杂来源样品中特异扩增人基因组DNA的方法。Alu是人基因组中特有的高度重复序列,散布于整个人的基因组中。设计能识别Alu保守区序列的聚合酶链反应引物,就能特异地扩增获得人基因组DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二
竞争聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称竞争聚合酶链反应英文名称competitive PCR;cPCR定 义在反应体系中加入已知含量的内参照竞争模板,该模板与待测模板可以等效扩增,扩增过程中或扩增结束后,可用某些手段区分和定量待测物和竞争物的扩增产物,比较两者的量即可知待测模板含量的一种定量聚合酶链反应技术。应用学科生物化学与
原位聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称原位聚合酶链反应英文名称in situ PCR定 义在DNA模板分子原来所在的位置处(如细胞、组织中)进行聚合酶链反应的技术。能够直接指示出DNA模板的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
阻抑聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称阻抑聚合酶链反应英文名称suppression PCR定 义抑制非特异扩增、而选择性扩增那些只知道部分序列目的DNA的一种聚合酶链反应方法。即先在所有的DNA 5′端加上人工接头,设计引物一个与人工接头互补,另一个与目的DNA互补,非特异PCR产物由于两端有颠倒重复序列,退火时会自身形成环
阻抑聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称阻抑聚合酶链反应英文名称suppression PCR定 义抑制非特异扩增、而选择性扩增那些只知道部分序列目的DNA的一种聚合酶链反应方法。即先在所有的DNA 5′端加上人工接头,设计引物一个与人工接头互补,另一个与目的DNA互补,非特异PCR产物由于两端有颠倒重复序列,退火时会自身形成环
聚合酶链反应原理介绍
PCR是体外酶促合成特异DNA片段的新方法,主要由高温变性、 低温退火和适温延伸三个步骤反复的热循环构成:即在高温(95℃)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37~55℃)情况下,两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链;在Taq酶的最
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的问题对策介绍
所有实验结果都有成功或失败,实验的失败可能是应该出结果而没有出,我们把它称作假阴性,不该出结果而出了结果我们把它称为假阳性。基因扩增技术—聚合酶链反应实验中最常见的问题就是假阴性和假阳性问题。 1、假阴性 出现假阴性结果最常见的原因是:Taq DNA聚合酶活力不够,或活性受到抑制;引物设计不
基因扩增技术—聚合酶链反应的温度循环参数介绍
1、基因扩增技术—聚合酶链反应— 变性温度与时间 PCR反应中模板DNA的变性十分重要。只有完全性的模板DNA和PCR产物双链完全解开,才能有效的和引物结合。这种结合是PCR扩增的基础。变性温度越高,时间越长变性就越充分。但温度过高、时间过长又会影响Taq DNA聚合酶的活性,所以通常选用变性
临床化学检查方法介绍聚合酶链反应技术介绍
聚合酶链反应技术介绍: 聚合酶链反应技术诊断幽门螺旋杆菌是否存在仅需微量的DNA,而不需要活菌存在(这不同于其他幽门螺旋杆菌检测方法),它不仅可以检测胃内幽门螺旋杆菌,还可望检出胃以外部位,如牙斑、粪便内的幽门螺旋杆菌,还可用于流行病学调查,它的敏感性远远超过了其他方法,有利于确定细菌感染的来源及
差示聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称差示聚合酶链反应英文名称differential display PCR定 义利用组织细胞间基因表达的差异并结合聚合酶链反应技术来筛选和克隆新基因的方法。即先主观设定一对引物(称武断引物),提取两种或多种待比较细胞的mRNA,用3′端武断引物逆转录成cDNA,再PCR扩增,产物用凝胶电泳显
锚定聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称锚定聚合酶链反应英文名称anchored PCR定 义在目的核酸片段一端人工加上确定的序列,以便用与所加序列互补的引物作扩增的聚合酶链反应方法。常用于对目的核酸片段序列本身或旁侧序列不清楚时的扩增。如通过DNA末端转移酶在未知序列DNA的3′端加上多(dG)尾,用含多(dC)的锚定引物对此
平衡聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称平衡聚合酶链反应英文名称balanced PCR定 义为克服在扩增时发生非线性差异而设计的一种聚合酶链反应技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
多重聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称多重聚合酶链反应英文名称multiplex PCR定 义在同一聚合酶链反应的反应管中加入多对引物,扩增同一模板的几个不同的区域的方法。常用于检测很长的特定序列(如人类肌养蛋白基因、视网膜母细胞瘤基因等)的缺失突变等变化。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
巢式聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称巢式聚合酶链反应英文名称nested PCR定 义由两次相继进行的聚合酶链反应组成的一种PCR技术,其中第二次PCR是在第一次PCR反应产物序列范围内进行扩增的,借以提高PCR的成功率和分析的特异性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
易错聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称易错聚合酶链反应英文名称error-prone PCR定 义应用低保真度DNA聚合酶,并选择适当的反应条件,提高PCR反应中的碱基错配率,由此得到含有随机突变的PCR产物,可以克隆入表达载体,构建随机突变的DNA文库的一种使DNA随机突变的技术。能用于体外分子定向进化、基因或DNA序列功能
连接介导聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称连接介导聚合酶链反应英文名称ligationmediated PCR定 义由于样品中核酸含量低或序列不完全清楚,难以分析或使用,因而在样品序列末端连接上已知序列,使用与此已知序列互补的引物专一性地扩增目的DNA片段的方法。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的点杂交的介绍
当扩增产物是多条带时,用点杂交更合适。这种方法的基本过程是,首先将扩增的DNA固定到尼龙膜或硝酸纤维素滤膜上,再用放射性或非放射性标记物标记的探针杂交。点杂交还有助于检测突变DNA的突变类型,用于人类遗传病诊断和某些基因的分型。放射性同位素32P标记的寡核苷酸探针检测的敏感性、特异性和方法的可靠
聚合酶链反应的常规应用介绍
用于治疗感染性疾病,肿瘤及遗传病。感染性疾病PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上,只要样本有一个病原体存在,PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝,而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的
关于聚合酶链反应模板的介绍
单、双链DNA或RNA都可以作为PCR的样品。若起始材料是RNA,须先通过逆转录得到第一条cDNA。虽然PCR可以仅用极微量的样品,甚至是来自单一细胞的DNA,但为了保证反应的特异性,还应用ng级的克隆DNA,μg水平的单拷贝染色体DNA或104拷贝的待扩增片段作为起始材料,模板可以是粗品,但不
聚合酶链反应的循环参数介绍
预变性模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。 [5] 变性步骤循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的影响因素耐热DNA聚合酶的介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应之所以能得到广泛应用,主要是因为Taq DNA聚合酶取代了大肠杆菌DNA聚合酶I大片段。Taq DNA聚合酶是从水生栖热菌Thermus Aquaticus(Taq)中分离出的热稳定性DNA聚合酶,使用Taq DNA聚合酶不仅简化了PCR程序,也极大地增加了基因扩增技术
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的特异性介绍
首次报导的基因扩增技术—聚合酶链反应所用的DNA聚合酶是大肠杆菌的DNAPolymerase I的Klenow大片段,其酶活性在90℃会变性失活,需每次PCR循环都要重新加入Klenow大片段,同时引物是在37℃延伸(聚合)易产生模板—引物之间的碱基错配、致特异性较差,1988年Saiki等从温
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的凝胶电泳介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应产物可通过琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,以前者最常用,通过电泳可以判断扩增产物的大小。在临床检测中,仅通过凝胶电泳判断扩增片段大小即可满足检测的需要。通常制胶方法为100mlTBE加1.5g琼脂糖在微波锅内溶解,稍冷后倒入电泳槽。 电泳后,用溴化乙淀染色20mi
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的缓冲液介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应反应的缓冲液的目的是给Taq DNA聚合酶提供一个最适酶催反应条件。目前最为常用的缓冲体系为10-50mmol/L Tris-HCl (pH8.3-8.8,20℃) Tris是一种双极性离子缓冲液,20℃时其pKa值为8.3,△pKa值为-0.021/℃。因此,20m
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的操作程序介绍
过去标准的基因扩增技术—聚合酶链反应操作程序是将PCR必需反应成份分别加入一微量离心管中,然后置于一定的循环参数条件下进行循环扩增。具体如下: (1)向一微量离心管中依次加入 DNA模板 102-105拷贝 引物 各1μmol/L dNTP 各200μmol/L 10×PCR缓冲液
半巢式聚合酶链反应的方法及应用介绍
中文名称半巢式聚合酶链反应英文名称semi-nested PCR;hemi-nested PCR定 义第二次PCR反应的引物只有一个,另一个是用第一次PCR反应的一个引物的一种PCR技术。此法是在无法获得理想的第二次引物时采用。对提高灵敏度和特异性仍有助益。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科)