RTPCR技术的简介
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发夹结构的真核细胞mRNA,3种都可。......阅读全文
RTPCR技术的简介
RT -PCR首先经反转录酶的作用以RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RN
RTPCR技术的简介
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR
RTPCR技术简介和RTPCR引物的选择
RT-PCR简介RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cD
RTPCR技术的定义
RT-PCR,反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。
RTPCR技术1
目前已有多种方法用来研究有关细胞和组织中,基因表达产物方面的内容,这些方法主要有Northern印迹、RNase保护分析法、原位杂交、点印迹、S1核酸酶分析法及反转录与PCR扩增串联的RT-PCR技术等。在这些方法中RT-PCR技术具敏感度高和应用范围广的特点,该技术提供给研究人员有效的进行测定转录
RTPCR技术2
三:操作1:反转录反应按下表准备反应液样品 体积 终浓度5×反应缓冲液 10μl 1×dNTP混合液 1μl 0.2mM下游引物 50pmol* 1μm上游引物 50pmol* 1μm25mM MgSO4 2μL 1mMAMV反转录酶 1μl 0.1μ/μlTflDNA聚合酶 1μl 0.1μ/μl
RTPCR技术的操作步骤
1、从RNA(或mRNA)反转录合成cDNA第一链:2、于95℃加热5~10min,灭活反转录酶,使RNA—cDNA杂交体变性,然后迅速冰浴冷却:3、PCR扩增:方法基本同PCR。cDNA第一链合成方法:20ul反应液中含10xPCR扩增缓冲液,2ul;四种dNTP(10 mmol/L)2ul;RN
RTPCR技术的影响因素
(一)组织或细胞样本不是每种组织或细胞都表达所有的基因,即某些基因的mRNA不存在于某些组织或细胞中。因此,确定所选用的材料中是否含有需扩增的目标mRNA模板是实验成败的关键。(二)引物合成cDNA第一条链时,引物可用随机6聚核苷酸,或下游引物,或poly(dT),其中以6聚核苷酸的随机引物效果最好
RTPCR技术的注意事项
1、合成cDNA的引物:合成cDNA引物时,通常采用随机六核苷酸引物能够有效地指导从RNA有效地合成第一链cDNA:2、避免RNA酶的污染:在合成cDNA第一链时,应使用RNA酶抑制剂,进行RT-PCR时,用于合成cDNA第一链的RNA不会对PCR有影响,因此没有必要用碱或RNA酶处理;3、不同来源
RTPCR原理与实验技术
一、知识背景:1. 基因表达:DNA——RNA——Protein单拷贝基因表达存在逐步放大机制,如一个蚕丝心蛋白基因——104个丝心蛋白mRNA(每个mRNA存活4d,可以合成105个丝心蛋白)——共合成109个丝心蛋白 。因此单拷贝基因的mRNA表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。2. PC
RTPCR的指数扩增的技术原理
RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。RT-PCR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。 RT-PCR的关键步骤是在RNA的反转录,要求RNA模版为完整的且不含DNA、蛋白质等杂质。在完成逆转录过程之后,通过PCR进行定量分析的时候,随着
RTPCR技术的进行过程及方法
RT-PCR可以用一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在反转录RT-PCR可以用一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在反转录缓冲液中进行,然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法
RTPCR技术的定义和检测方法
1.定义:是以RNA为模板,联合逆转录反应(reverse transcription,RT)与PCR,可用于检测单个细胞或少数细胞中少于10个拷贝的RNA 模板。 RNA扩增包括两个步骤:在单引物的介导下和逆转录酶的催化下,合成RNA的互补cDNA;加热后cDNA与RNA链解离,然后与另一引
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术
microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术 摘要: 已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分
RNA-提取策略及RT-PCR技术
第一部分RNA 提取策略1、RNA降解的原因内源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因为人体细胞自身就是几十分钟(20min?)mRNA被降解一轮,所以不管是组织还是细胞还是液体状样本在离开其中细胞的最佳生活状态后都应该尽快的被妥善的方法保存起来。外源性RNA酶也是一个需要注意的因素,最常见
RTPCR技术检测猪流感病毒
根据猪流感病毒siv的M 基因的序列,设计合成了1对引物,建立了检测猪流感的RT-PCR方法。应用该方法对Hl、H3、H9亚型的猪流感病毒进行基因扩增,均获得了分子量为460bp的特异性目的片段,而对PRRSV、PCV2、PI 、CSFV进行同条件检测,结果均为阴性;SIV扩增产物测序结果与SIV
定量RTPCR-(Quantitative-RTPCR)
Application: Quantitative RT-PCR is used to quantify mRNA in both relative and absolute terms. It can be applied for the quantification of mRNA expres
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(三)
评估RNA分离的需要,我们直接在miRNA的检测中增加了细胞裂解物。相当于直接在7.5毫升逆转录反应中添加2.5-2500细胞。当检测到,在一些细胞中CT值相关R2>0.998)的RT反应至少有三个数量级(图4)。 图3。总RNA输入的阈值循环(CT)值检测8个miRNA的相关性。每RT反应中,小鼠
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(二)
图1。上图描述的是TaqMan miRNA的检测原理,基于TaqMan实时定量miRNA的包括两个步骤,茎环RT和实时PCR。茎环RT引物结合在miRNA分子的3'端和用反转录酶逆转录。然后,RT产品使用传统的TaqMan PCR定量,其中包括特定miRNA的正向引物,反向引物和
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(一)
摘要:已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分相关的甚至低至一个核苷酸的miRNAs。此外,他们不会受到基因组DNA
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(四)
图5。对热处理细胞,细胞裂解液和10 miRNA实时定量总RNA进行比较。用阈值循环(CT)来衡量miRNA的表达水平。每PCR扩增约400 HepG2细胞进行了分析。 图6。的TaqMan miRNAmiR-16的分析比较来解决以印迹杂交为基础的分析。总RNA来自小鼠肾,肝,肺,脾和睾丸组织。
microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(五)
TaqMan miRNA的检测能力不同,是依据采用let-7a, let-7b, let-7c, let-7d 和let-7e 5个合成miRNA来检测低至一个核苷酸(图7)。每个miRNA的检测对应每个miRNA。相对探测效率是通过计完全匹配和不匹配的目标CT之间的差异,假设完美匹配的效率为1
RT-PCR技术及RNA提取策略3
成功的RT PCR的要素1、高质量RNA 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。RNA的质量决定了你能够转录到 cDNA上的序列信息量的最大值。一般不必使用oligo(dT)选择性分离poly(A)+RNA。不管起始模
RT-PCR技术及RNA提取策略1
第一部分 RNA 提取策略1、RNA降解的原因内源性RNAase是造成RNA降解的最重要原因,因为人体细胞自身就是几十分钟(20min?)mRNA被降解一轮,所以不管是组织还是细胞还是液体状样本在离开其中细胞的最佳生活状态后都应该尽快的被妥善的方法保存起来。外源性RNA酶也是一个需要注意的因素,最常
RT-PCR技术及RNA提取策略2
一般的琼脂糖凝胶电泳,注意不要用甲醛变性电泳(又不是做northern,实在没有必要)。电泳槽注意一定不要用DEPC处理,一定要保证电泳体系中有少量的RNAase存在。分别在加样孔中加入1,2,3μlRNA抽提溶液。在旁边加入DNA marker。1%琼脂糖凝胶,10V/cm的电压,电泳10
RTPCR的原理
原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。RT- PCR(Re
什么是RTPCR,RTPCR的定义与检测方法?
1.定义:是以RNA为模板,联合逆转录反应(reverse transcription,RT)与PCR,可用于检测单个细胞或少数细胞中少于10个拷贝的RNA模板。 RNA扩增包括两个步骤: 在单引物的介导下和逆转录酶的催化下,合成RNA的互补cDNA;加热后cDNA与RNA链解离,然后与另一引物退火
半定量RTPCR-(SemiQuantitative-RTPCR-)
RT-PCR AnalysisSolutions10X RT Buffer10X PCR Buffer100 mM Tris pH 9.0500 mM KCl1% Triton X-10025 mM MgCl2use at a concentration of 1.5 mMLysis Solutio
RTPCR-PROTOCOL
RT-PCR PROTOCOL材料与方法………………………………………………………… 1.材料 ………………………………………………………1.1 供试用组织(细胞)…………………………………1.2 主要仪器设备………………………………………1.3 主要试剂……………………………………………1.
RTPCR步骤
总RNA提取1. 取200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。2. 震荡30s。3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。4. 12000×g,4℃ 离心,15min。5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。6. 加等体积异丙醇,-20℃,3