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植物所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱

m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰,与RNA命运相关。近年来,m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而,m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细胞结构的物种,在进化中具有重要地位。绿藻门的莱茵衣藻是一种单细胞、单倍体、且兼具动植物属性的藻类,是常被用作研究有性生殖、光合作用和代谢等重要生物学过程的模式生物。目前,在基因表达水平和蛋白水平的研究揭示了莱茵衣藻有性生殖过程中的许多重要调控蛋白,但关于m6A修饰是否参与莱茵衣藻有性生殖的调控仍然未知。 中国科学院植物研究所杨文强研究组通过MeRIP-seq结合转录组分析,阐明了莱茵衣藻有性生殖过程中m6A表观转录组与转录组的特征,并发现m6A修饰广泛存在于莱茵衣藻的转录本中。进一步的分析显示,m6A修饰在莱茵衣藻转录本......阅读全文

Science:构建出真涡虫细胞类型转录组图谱

  真涡虫是一类相对简单的动物,具有不同寻常的生物学特征:成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞(progenitor cell)。真涡虫获得人们的大量研究,部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whiteh

复旦大学Nature子刊绘制大鼠转录组图谱

  来自复旦大学、美国食品药品监督管理局(FDA)国家毒理学研究中心、洛马林达大学等机构的研究人员,成功绘制出了涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠RNA测序转录组图谱,这一重要的研究成果发表在2月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。   复旦大学的石乐明(

杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立

  近日,北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式,利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱,重构了完整的杨树次生木质部细胞类群,鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子,系统解答了次生木质

上海生科院等建立小鼠早期胚胎空间转录组图谱

  3月22日,国际学术期刊《细胞》子刊《发育细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组与中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组合作的最新研究成果“Spatial Transcriptome for the Molecular Annotati

单细胞转录组测序构建胸腺器官发生的分子图谱

  2019年10月8日,四川大学胡洪波研究组、解放军总医院第五医学中心刘兵研究组与暨南大学基础医学院兰雨研究组合作在Immunity杂志在线发表了题为“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy

研究成果:灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱绘制

  海马体作为脑的重要组成部分,在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长,海马功能逐渐退化,导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂,细胞组成具有高度异质性,传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外,由于伦理及样本来源的限制,不同年龄

植物所揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱

  m6A是广泛存在于真核生物mRNA中的表观修饰,与RNA命运相关。近年来,m6A修饰在植物胚胎发育、茎尖分生组织的命运决定、表皮毛发生、根部发育、叶形态发生、开花转变、胁迫响应、果实成熟及孢子发生等多个生物学过程中发挥重要功能。然而,m6A在藻类中的功能尚不清楚。藻类包含从单细胞到多细胞的多种细

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库

  随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序