为人类表型组大科学计划打造“四大支柱”

6月5日,人类表型组国际大科学计划两位共同发起人——上海国际人类表型组研究院院长、复旦大学校长金力院士与美国国家科学院院士、“拉斯克奖”获得者胡德(Leroy Hood),率领中美双方科学家团队,围绕人类表型组大科学计划的最新进展举行双边交流会。自2018年启动以来,人类表型组计划在全球科学家的共同推动下,已经取得了显著进展。为使中美两国科学家团队在科技进展、技术平台、数据协同分析、临床队列选择、表型组技术标准化等关键问题上进一步加强沟通与协同,上海国际人类表型组研究院和美国表型组健康组织(Phenome Health)联合主办了本次表型组双边在线交流活动——表型组思享会(Phenome Retreat 2022),来自中美两国的20余位专家学者深度互动,密集探讨了人类表型组学的前沿进展,并就进一步加快推进人类表型组国际大科学计划的重点合作领域达成了新共识。经过4个多小时的深入交流,会议商定,中美双方科学团队将在数据分析、技术平......阅读全文

科学家全面绘制人类健康与疾病蛋白质组图谱

复旦大学附属华山医院教授郁金泰、毛颖团队与复旦大学类脑智能科学与技术研究院研究员程炜、教授冯建峰团队合作,全面绘制了人类健康与疾病蛋白质组图谱,并结合人工智能大数据分析方法构建了疾病诊断预测模型以及发现了26个药物治疗新靶点,为精准医学的实施提供了重要科学依据。11月22日,相关研究发表于《细胞》。

植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例

植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对

研究发现通过肠道细菌等绘制人类微生物组药物代谢图谱

  2019年6月,美国耶鲁大学医学院微生物发病机理和微生物科学研究所Andrew L. Goodman教授团队在国际顶尖杂志Nature上发表了题为“Mapping human microbiome drug metabolism by gut bacteria and their genes”

解读“生命之书”--新发现填补人类基因组图谱空白

  美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱,确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型,并注释了非编码DNA变异的风险,有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。  此前,科学家在公布最新的被称为“生命之

Science:首次全方位揭示人类蛋白组亚细胞定位图谱

导 语在亚细胞水平获得蛋白质空间分布的准确信息对于理解蛋白质功能、相互作用及细胞活动机制具有重要意义。2017年5月11日,Science 杂志在线发表了瑞典皇家理工学院题为 A subcellular map of the human proteome的最新研究成果论文。研究者整合转录组、免疫荧光

“拼”出全人类生命奥秘的完整拼图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511568.shtm 如果有一对双胞胎,一个从小在赤道的低海拔地区长大,一个在高纬度高海拔地区长大,他们不仅外表会产生差异,蛋白、代谢和器官功能也会发生不同变化。这就是环境因素对人的表型的影响,而这些影

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predi

最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm   ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图   日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学

-Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱

  多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。  来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面

干细胞和基因编辑强强联手,绘制人类基因组图谱

  胚胎干细胞是一种独特的资源,它们可以变成我们身体中任何成体细胞。它的多才多艺造就了再生医学、疾病模型和新药发现。  与人类胚胎干细胞的发现并行的另一项生物里程碑是人类基因组测序和赋予我们遗传身份的全套基因鉴定。“人类基因组计划”让我们有机会深入了解基因在基因组中的功能。如今,科学家们正在尝试将二

Science:发布首个全分辨率的人类基因组遗传图谱

  在一项新的研究中,来自冰岛基因解码公司(deCODE genetics)、冰岛大学和雷克雅未克大学的研究人员发布了首个使用全基因组序列数据开发出来的全分辨率人类基因组遗传图谱。  该图谱提供了迄今为止关于人类进化的两个关键驱动因素之间的位置、速率和关联性的最详细观察:重组(recombinati

十年大型项目,绘制人类蛋白质组图谱

  由瑞典皇家理工学院的Mathias Uhlén领导的一项长达十年之久的研究项目——人类蛋白质图集(Human Protein Atlas,HPA)项目,在本周发布了1300万张全身人类蛋白质“图像”。通过制备出荧光标记抗体,将其应用于保存组织的薄切片,观察组织的颜色以及附着在组织上的抗体,研究人

人类血浆蛋白质组遗传图谱公开-有助鉴定新的治疗靶点

  英国《自然》杂志6月6日发表了一项遗传学最新成果:剑桥大学研究团队量化了人体血浆中的3000多种蛋白质,成功绘制出人类血浆蛋白质组遗传图谱,其中89%前所未知。该研究发现的遗传变异与个体蛋白水平之间的联系,或意味着可以借此鉴定出新的治疗靶点,并将现有药物用于治疗新的疾病。  血浆蛋白是指血浆中的

Science绘制人类融合史遗传图谱

  来自牛津大学和伦敦大学学院的研究人员绘制出了一张人类遗传史交互图,详细地描述了跨越4千年历史长河整个欧洲、非洲、亚洲和南美95个种群之间的遗传融合史。   这项发表在本周《科学》(Science)杂志上的研究,确定及标识出了种族之间遗传融合发生的时间及特征。为此,研究人员开发出了一些先进的统计

Science:首个!人类肾脏免疫图谱绘制

  根据最近一项研究,科学家通过绘制了将近70,000个来自早期生命和成年个体的肾脏细胞图谱之后,创建了首个人类肾脏免疫系统图谱。这项研究由来自剑桥大学、Wellcome-Sanger研究所的研究人员等机构研究者完成,它首次显示了我们的肾脏免疫系统早在胚胎时期是如何发展,并如何在出生后和成年后逐渐增

古DNA-图谱描绘人类农业“黎明”

考古学和遗传学证据表明,1.2万年前的某个时候,中东的游牧狩猎采集者完成了人类历史上最重要的转变之一——不再游荡,开始定居务农。这种转变后来也独立出现在世界其他地区,被称为新石器革命(农业及畜牧出现)。古代基因组学研究曾暗示,这些“中东农民”起源复杂,涉及不同地方的狩猎采集群体,具有不同的遗传序列。

表型组学技术:精准挖掘玉米抗旱基因

  随着测序技术普及和待测材料的规模化,传统的干旱表型性状获取手段已经不能满足植物抗逆基因组学研究的需求,严重阻碍玉米抗旱资源的挖掘。  近年来,以智能化、高通量、动态无损测量为主要特征的表型组学技术迅猛发展,使得多时空多尺度表型检测成为可能,可实现作物全生育期表型动态精准鉴定。  近日,《基因组生

作物表型组学研究技术方案与应用

手持式、便携式仪器无疑是作物表型分析性价比高、使用灵活方便的设备,如手持式FluorPen叶绿素荧光仪、手持式SpectraPen/PolyPen高光谱仪、IQ智能手持式高光谱成像仪、FluorCam便携式叶绿素荧光成像仪等。PlantScreen温室紧凑型或大型传送带式植物表型成像分析平台集植物自

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

人类发育中肝脏的细胞图谱揭秘人类胎儿肝脏造血

  在一项新的研究中,英国研究人员在世界上首次构建出人类发育中肝脏的细胞图谱,它提供了关于胎儿中血液和免疫系统如何产生的重要见解。这种图谱描绘了在妊娠的头三个月和第二个三个月之间的发育中肝脏的细胞景观变化,包括来自肝脏的干细胞如何播种到其他组织,以支持生长所需的高氧气需求。相关研究结果近期发表在Na

Nature:人类细胞图谱研究先锋Aviv-Regev

  Aviv Regev是一位生物分析专家。现在,她正致力于绘制人体的每一个细胞。  计算生物学家Aviv Regev喜欢做一些看似不可能完成的任务。2011年,她与分子遗传学家Joshua Levin合作,测试了RNA测序的几种方法。科学家们在测试几种技术的极限,以查看哪种方法表现最佳。他们用降解

迄今最精确人类大脑图谱出炉

  美国圣路易斯华盛顿大学的一个研究小组称,他们绘制出迄今最全面、最精确的人类大脑图谱,其中97个人类大脑皮层区域此前从未描述过,属于首次公布。  一直以来,科学家试图描绘出一幅包含人脑连接性、功能和微观结构的高清图谱,但由于技术难度过大,这一设想一直未能成真。目前,绝大多数的大脑图谱都从较小的人群

迄今最精确人类大脑图谱出炉

  美国圣路易斯华盛顿大学的一个研究小组称,他们绘制出迄今最全面、最精确的人类大脑图谱,其中97个人类大脑皮层区域此前从未描述过,属于首次公布。   一直以来,科学家试图描绘出一幅包含人脑连接性、功能和微观结构的高清图谱,但由于技术难度过大,这一设想一直未能成真。目前,绝大多数的大脑图谱都从较小的人

Nature重磅成果:人类心脏细胞的图谱

砰……砰……砰”尽管大多数时候我们几乎没有注意到它,但是我们体内稳定的心跳声其实是一种复杂的机理表现,就像是乐团一样,成千上万的细胞必须掌握各自的演奏节奏,并共同努力。近,一组科学家创建了人类心脏细胞的个图谱,这些图集展示了将近50万个心脏细胞,确定了每种细胞在心脏交响乐中的作用!研究人员检查了14

人类肾脏最详尽单细胞图谱绘制

来自美国费城儿童医院及宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院的科学家,成功绘制出人类肾脏最详尽的单细胞图谱,以前所未有的水平捕捉了健康和患病肾脏的复杂性,并在病程早期预测了慢性肾病(CKD)的进展。最新研究有望为CKD患者提供更好的诊断和精确的治疗。相关论文发表于近日出版的《自然·遗传学》杂志。研究示意图。图

科学家构建人类发育细胞图谱

  目前,发育生物学的研究主要基于模式生物。由于实践上存在的挑战,人类的胚胎发育(从受精卵到胎儿出生)仍是一个知之甚少的“黑匣子”。近期,来自多国研究机构的一项联合研究阐述了人类发育细胞图谱及妊娠期参考图谱构建的路线图,相关成果发表在《Nature》杂志,标题为“A roadmap for the

Science:15万数据汇总!科学家绘制出人类基因组新图谱

   众所周知,世界上没有两个完全相同的有机体,每个人都是独一无二的,而造成人类DNA多样性的机制有两种:基因重组和新突变,或新的非遗传基因变异。随着利用全基因组序列数据开发的新基因图谱,安进基因研究子公司deCODE Genetics的科学家们发现了这两个过程的模式,为未来的医学研究提供了新的见解

第一张人类基因组印记基因图谱出炉

来自杜克大学的研究人员创造了第一张人类基因组印记基因(imprinted genes)图谱,并且他们表示其成功的关键在于一个称为机器学习(machine learning)的人工智能形式:dern-day Rosetta stone。这项研究新发现了四倍于之前识别的印记基因,并即将公布在12月3日《

“人类基因组图谱”20年——30亿碱基“拼出”大科学时代

   20年前,2001年2月,被誉为生命科学“登月计划”的“人类基因组计划”(HGP)发布首张人类基因组图谱。  这是人类生命科学发展历史上的重要“分水岭”。  20年来,曾作为单一学科独立发展的生命科学迎来多学科交叉融合、新技术前沿汇聚的“大科学”时代。  中国科学院北京基因组研究所特聘研究员于

全新猕猴脑网络组图谱绘成

作为研究人类认知功能机制和模拟人类脑部疾病的理想模型,猕猴在遗传学、生理学和脑结构上与人类高度相似。记者9日从中国科学院自动化研究所获悉,该所科研人员在猕猴脑部空间组织架构研究方面取得重要突破,绘制出全新的猕猴脑网络组图谱。相关研究成果在线发表于《科学通报》杂志。目前,大量脑科学研究将猕猴等非人灵长