Cell突破性成果:基因调控拼图
来自瑞典卡罗琳斯卡医学院的研究人员取得了基因调控研究的突破性进展——他们识别出了结合在调控基因表达的400多个蛋白上的DNA序列,这将有助于解析为什么不同的个体,其基因组对疾病患病风险的影响不同。 2000年,科学家们完成了人类基因组测序,希望能将这整个人类DNA序列信息,迅速转换到临床应用上来,比如新型药物,和能判断有患病风险的个体的预测工具。 然而结果却证明这实际上比预期的更难以实现,其中的一个原因就在于基因组中只有1%的序列用于编码蛋白,其余的大部分都用于了调控这些蛋白在不同的细胞和组织中如何表达。而科学家们又不清楚哪些DNA序列能结合一些特异性蛋白,也就是转录因子,调控基因表达,因此阻挡了临床应用前进的步伐。 “基因组就像是一本用外文撰写的书,我们知道每个字母,却不理解为什么人类基因组造就出的是人,而小鼠基因组生成的是小鼠,”领导这一研究的Jussi Taipale教授表示,“为什么某些人患上常......阅读全文
武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA,目前已在多种生物中发现了大量lncRNA,然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。 中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校,NIH等处的研究人员利用一种新型方法,分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态,从而可以更好研究这一转录因子的功能,这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况,相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果,来自法国国家科学研究中心的François
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
Cell-reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能
近日,来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展,他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ,也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性,促进肿瘤进展。 YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下
转录水平调控的概念和方式
转录水平调控是真核基因表达调控的重要环节。根据真核基因表达是否受环境影响可分为:发育调控和瞬时调控。其中发育调控是指真核生物为确保自身生长、发育、分化等对基因表达按“预定”和“有序”的程序进行的调控,是不可逆的过程;瞬时调控是指真核生物在内、外环境的刺激下所做出的适应性转录调控,是可逆过程。
转录后水平调控包括哪些环节?
尽管转录水平的调控是基因表达调控的最重要的调控方式。然而,大量的实验表明,在 RNA 转录后同样存在着多样化的调控机制。转录后水平的调控一般是指基因转录后对转录产物进行一系列修饰、加工过程,主要包括mRNA 选择性剪接、胞内定位以及mRNA 稳定性调节等环节。1.“加帽”和“加尾”的调控真核生物mR
研究发现植物位置与转录调控有关
奥地利科学院Magnus Nordborg和Yoav Voichek共同合作,近期取得重要工作进展。他们研究提出,植物中广泛存在的位置依赖性转录调控序列。相关研究成果2024年9月12日在线发表于《自然—遗传学》杂志上。 据介绍,人们对真核转录的了解大多来自动物和酵母,然而,植物分别演化了十亿
日找到控制细胞分化转录因子
日本理化研究所4月20日发表新闻公报说,该所研究人员与文部科学省项目小组通过大规模数据分析,找到一群控制细胞分化状态的转录因子,并解开了其中的具体机制。 公报说,研究人员以白血病患者的人体免疫细胞株THP—1为研究对象,借助先进的基因测序技术,按细胞分化过程中不同时间段收集它们从原单核细胞
转录起始因子的功能介绍
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
转录因子的基本信息介绍
RNA的转录合成从化学角度来讲类似于DNA的复制,多核苷酸链的合成都是以5’→3’的方向,在3’-OH末端与加入的核苷酸形成磷酸二酯键,但是,由于复制和转录的目的不同,转录又具有其特点: (1)对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基因,而且每个基因的转录都受到相对独立的控制; (2)转录是
高通量的转录因子活性检测
转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不
转录因子Nanog的双重作用
来自中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的朱学良研究组发表了题为“Nanog suppresses cell migration by downregulating Thymosin β4 and Rnd3”的文章,发现干细胞转录因子Nanog可通过下调下游基因Thymosin
转化生长因子β信转录
磷酸化的RSMAD/coSMAD复合物进入细胞核,与转录启动子及转录辅助因子结合,引起DNA转录。成骨蛋白引起参与骨发生、神经形成及腹部中胚层分化的mRNA的转录。TGF-β引起参与细胞凋亡、细胞外基质再生及免疫抑制的mRNA的转录。它也与细胞周期中的G1期阻滞有关。激活素引起参与性腺生长、胚胎分化
分子遗传学词汇转录因子
真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,TF
转录因子定义和结合位点
定义人类金属巯基因调节区转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。结合位点转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子
通用转录因子的主要种类介绍
TFⅡD该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-associa
精确转录因子结合位点绘图
“掌握转录因子活动控制高等生物发育的基本原理非常有用,”纽约大学生物学系教授Stephen Small说。“更具体地讲,这项机理的发现为由于转录因子受到干扰的突变基因导致胚胎发育深层破坏和一系列疾病提供了一个潜在的治疗途径。” 这项研究发表于《Genes & Development》,参与研究
关于通用转录因子的成员介绍
1、TFⅡD 该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-a
ArrayStar转录因子活性ELISA检测法
ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活性。试剂盒采用96微孔板,标记探针是生物素标记的双链寡核甘酸片段,含有转录因子的特异性DNA结合序列。当标记探针与细胞核抽提物一起孵育时,核抽提物中活性形式的转录因子与探针特异性结合,形成转录因
细胞分泌因子的调控
干细胞的细胞膜表面存在多种细胞因子受体,当细胞因子与其受体结合后,使受体结构发生改变,引起一系列变化,从而调控皮肤干细胞的增殖和分化。角质细胞生长因子,表皮生长因子,转化生长因子和抑制性信号物质(如肾上腺素)等都参与皮肤增殖调控。例如,角质细胞生长因子与其受体结合后可促进其受体的二聚体化以及自身的磷
上海药物所等发现去泛素化酶USP21调控Nanog转录因子机制
Nanog是胚胎干细胞全能性维持和重编程过程中至关重要的核心转录因子。最近的研究提示泛素化修饰系统在干细胞干性维持和分化中有重要作用。Nanog的稳定性的维持同时受泛素化和去泛素化的调控,如泛素连接酶FBXW8可以促进Nanog的泛素化降解进而诱导细胞分化。然而,Nanog的去泛素化酶及其调控机
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调...
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调控醇溶蛋白的表达玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类
测量任一细胞因子转录因子的其他技术
虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较
上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制
5月5日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin
由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老
细胞老化有其独特而明显的分子表型特征,但其诱导机制尚不完全清楚,基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下,开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录,并产生与基因原功能不
“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项
教育部、中科院: 为贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》的部署,经研究,决定批准国家重大科学研究计划“基因转录中止与蛋白质翻译新调控机制”等2个项目立项。 根据国家科技计划管理的统一安排,这批项目将于2013年7月启动实施。请有关单位按照国家重点基础研
由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老
细胞老化有其独特而明显的分子表型特征,但其诱导机制尚不完全清楚,基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下,开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录,并产生与基因原功能不
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描2
Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o
调控基因表达的“染色质环”新因子筛选获进展
中国科学院广州生物医药与健康研究院、生物岛实验室研究员姚红杰课题组通过系统性筛选在基因组上与CTCF共定位的转录因子,鉴定出大量与CTCF存在高共定位率的新转录因子,并选取了转录因子BHLHE40进行后续的功能验证,发现BHLHE40可以调控CTCF在基因组上的结合,进而影响其介导的远距离染色质