古老DNA追溯黑死病起源
一项对古代基因组的研究显示，14世纪在现在的吉尔吉斯斯坦暴发的一场瘟疫中，许多人死于引起鼠疫的耶尔森氏菌菌株，该菌株产生的病原体在几年后又导致了黑死病。 “这就像找到了所有菌株聚集的地方。”该研究的共同负责人、德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的古遗传学家Johannes Krause说，该研究6月15日发表于《自然》。 1346年至1353年间，黑死病肆虐欧亚大陆西部，一些地区的死亡人数高达60%。历史记录表明，黑死病起源于东部：克里米亚半岛的卡法在1346年被蒙古帝国军队围攻期间暴发了最早的瘟疫，高加索和中亚其他地区则被认为是潜在的震中。 中国拥有世界上最具遗传多样性的现代鼠疫杆菌菌株，这暗示黑死病起源于东亚。“文献中有各种各样的假设。我们确实知道它的确切来源。”Krause说。 几年前，英国斯特林大学的经济和环境历史学家、该研究的共同主要作者Philip Slavin在吉尔吉斯斯坦的一对14世纪......阅读全文
古老DNA追溯黑死病起源
一项对古代基因组的研究显示，14世纪在现在的吉尔吉斯斯坦暴发的一场瘟疫中，许多人死于引起鼠疫的耶尔森氏菌菌株，该菌株产生的病原体在几年后又导致了黑死病。 “这就像找到了所有菌株聚集的地方。”该研究的共同负责人、德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的古遗传学家Johannes Kraus
古DNA分析：黑死病大流行或源于欧亚大陆中部
中新网北京6月16日电 (记者 孙自法)国际著名学术期刊《自然》最新发表一篇微生物学论文称，研究人员对7名死于14世纪个体开展的DNA分析显示，14世纪曾席卷欧亚大陆的黑死病可能源于欧亚大陆中部。 该论文介绍，黑死病是由鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)引起，在公元1346年至
失去的基因或能解释黑死病的起源
大约六千年前，一种细菌经历了基因变化，它的生存环境因此从老鼠的内脏扩大到了跳蚤。此类的基因变化一直发生着，但这次的特别之处是它最终导致了黑死病，在14世纪杀死了三分之一的欧洲人口。导致黑死病的鼠疫耶尔森菌（Yersinia pestis）是从另一种叫假结核耶尔森菌的细菌演变而来。演变发生在中国的
大数据预知下一次“黑死病”？
用电脑预测传染病爆发听起来特别科幻，但科学家们就要做到了。在这项新研究中，科学家利用机器学习，用大数据拟合动物的生存模式，对哪种动物可能携带危险病毒、细菌或真菌做出准确预测。 新型传染病的爆发常常是病原微生物由动物突然传到人类的情况，这种传染病被称为人畜共患病。如果可以对人畜共患病的跨物种传染
关于鼠疫杆菌的研究过程介绍
黑死病14世纪在欧洲夺去上千万人生命，占当时欧洲总人口将近三分之一。一个国际研究小组利用脱氧核糖核酸(DNA)和蛋白质分析方法确认，鼠疫杆菌是这场瘟疫以及之后400年间多场瘟疫的罪魁祸首。 黑死病死者样本中发现鼠疫杆菌特有基团 麻风病等传染病致人死亡后，即使过去多年，研究人员仍可从死者遗骸中
古老的黑死病至今仍影响人的免疫系统！基因有阴暗面？
传染病是推动人类进化最强大的选择压力之一，包括历史上有记录以来的一次最大死亡事件——第二次瘟疫大流行的爆发，通常称为黑死病，其由鼠疫耶尔森菌引起。这场瘟疫对非洲-亚欧大陆甚至产生了毁灭性的影响，造成多达30-50%的人口死亡，尽管已经过去几个世纪，但其影响似乎至今仍然在蔓延。黑死病在人类遗传学上留下
关于鼠疫杆菌的最新进展介绍
黑死病曾是人类历史上最严重的瘟疫之一。而黑死病的罪魁祸首是鼠疫杆菌。最近，研究者从伦敦公墓四具死于黑死病的中世纪古尸牙齿中，提取出鼠疫杆菌，重建了病菌的DNA，从而对这个历史上可怕的疾病的真实面貌有了更深入的理解。 [10] 2014年7月，在伦敦的一处专门埋葬瘟疫病人的公墓里，研究者们找到了
让人闻风丧胆的黑死病－肆虐人间竟已长达4000年
在俄罗斯萨马拉地区，科学家们发现了两具死于黑死病的遗体，距今已有3800年。该发现表明黑死病危害人类已经长达4000年。图片来源于网络 一项于6月8日发表在杂志《自然•通讯》的研究表明，这是两具感染了鼠疫杆菌的遗体。这个发现使得黑死病的源头又提早了1000年，也就是说黑死病肆虐人间已经长达40
死神的无声低语:英国在人类遗址中发现四千年前鼠疫DNA
在一项重大发现中，来自弗朗西斯-克里克研究所的研究人员与牛津大学、莱文斯地方历史小组以及韦尔斯和门迪普博物馆合作，发现了迄今为止英国最古老的鼠疫证据。该小组在萨默塞特和坎布里亚的人类遗骸中发现了三个4000年前的鼠疫耶尔森氏菌（导致鼠疫的细菌）病例。弗朗西斯-克里克研究所的研究人员在今天（5月30日
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶： 1．大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题：①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组技术(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切与连接（1）酶切反应：同质粒DNA 的鉴定，只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切，则成比例增加。（2）加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀，-20℃2h以上。（3）15000rpm离心15min，弃上清。（4）加入75%乙醇洗涤2次，离心弃
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶，将不同来源的DNA分子进行特异地切割，获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接，从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞，在宿主细胞中进行无性增殖，获得大量的目的基因或DNA片段，此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定2
（1）CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子（如Ca2+、Mg2+等）低渗溶液中时，细菌细胞膨胀成球形，处于感受态；此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面，重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面，在丰富培养基中生长数小时后，球状细胞恢复原
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时，破坏此酶的N端阅读框架，产生无α互补功能的N端片段，因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色，见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短，不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框，有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体3
在作为载体时，这些噬菌体有一个很大的优点，即克隆到M13mp载体的外源DNA片段（双链），在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆，可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板：①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板；②制备仅有一条
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体，大多数具有编码多种蛋白质的基因，能利用宿主细胞的蛋白质合成体系，进行生长和增殖。构建的噬菌体载体，以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA，全部序列已知，共编码50多个基因。其中约一半基因参与
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体1
载体（vector）是携带靶DNA（目的DNA）片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型，亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
DNA合成（DNA－synthesis－）技术介绍
蛋白质概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照预定核苷酸的顺序，将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸，可自动化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
DNA－指纹的概念高变区DNA与DNA指纹
人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后，用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ，然后将样品进行
《科学》评选2022年十大突破
仰望星空、俯耕大地、探微解密... ...近日，《科学》公布了2022年十大科学突破，用科学视角带领人们上天入地、溯古追今。 窥视深空的“黄金之眼” 2021年12月25日发射升空的詹姆斯·韦布空间望远镜（JWST），在遭受了小型太空岩石撞击的波折下，依然在2022年产出了诸多令人惊叹的成
“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”
"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代，用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥？ 科学家们发现，人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子，它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性
DNA－Fingerprinting,－DNA－Barcoding,－and－Next－Generation－Sequencing－...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的，用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键，而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”这一观念便形
DNA重组（DNA－recombination）技术：工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶（restriction endonucleases，RE）是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶，能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。（一）命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现，根据来源进行命名，限制酶的第一个字母（大写，斜体）为宿主菌的属名，第二、第三
DNA提取方法洗涤－DNA（或－RNA）
当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤
DNA连接酶(DNA－ligase)介绍
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶，借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外)，而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA
DNA－Immunoprecipitation－for－the－Determination－of－DNABinding－Specificity
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho