质体基因组多样性演化,提供土壤碳动态新视角

近日,中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象,依托野外长期氮添加控制实验平台,结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来,化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持续的氮输入会显著改变陆地生态系统结构和功能。作为表征微生物生理代谢的重要指标,土壤微生物碳利用效率(CUE)决定着微生物将吸收的碳分配至其生长和呼吸的比例,在很大程度上调控着氮输入背景下的土壤碳固持与分解过程。因此,阐明土壤微生物CUE对氮富集的响应机制是准确预测氮输入背景下土壤碳动态的前提。以往的研究主要关注氮输入引起的土壤酸化和微生物养分限制对CUE的影响,尚不清楚土壤矿物保护及其调节的土壤碳可获取性的作用。在这项研究中,研究人员发现,矿物保护作用减弱引起的土壤碳可获取性增加是导致氮输入背景下微生物CUE增加的关键途径。这一发现并......阅读全文

浙大团队绘制土壤基因组基因相关性网络-解码土壤“黑箱”

  土壤微生物是元素生物地球化学循环过程及其他土壤生态过程的关键驱动因子。由于土壤结构和组成的复杂性,土壤微生物生态过程在研究中一直以来都被作为“黑箱”看待,要清楚阐明土壤生态功能是土壤生态学研究当前面临的一个重大挑战。  近日,浙江大学环境与资源学院徐建明教授团队在微生物学顶级期刊《国际微生物生态

关于土壤基因组DNA提取

土壤样品含有大量的微生物,其中绝大部分的微生物都是无法直接培养进行繁殖和研究。从土壤样品中提取 DNA 是研究土壤微生物zui为有效的方法。目前从土壤样品中提取微生物 DNA 的方法主要有直接法和间接法。直接法是指把土壤样品放在裂解液中,经过有效的破壁方法使微生物的DNA 全部释放到裂解液中,然后再

污泥农用致土壤抗性基因污染

  日前,中国科学院城市环境研究所城市土壤和生物地球化学研究组朱永官团队采用高通量荧光定量PCR系统和高通量测序,研究了长期使用污泥和鸡粪对土壤抗生素抗性基因丰度和多样性的影响。研究成果近日发表在《国际环境》杂志上。  抗生素抗性基因(ARGs)污染的两个主要源头是集约化养殖业和城市污水处理系统。未

土壤耐受重金属毒害关键基因找到

  土壤重金属污染是全球性的重要环境问题之一,被污染土壤中的重金属可被农作物吸收进入食物链,严重影响食品安全并危及人类健康。植物修复基因工程是解决土壤重金属污染的重要途径之一,其中,寻找和发掘耐受重金属毒害且调控重金属超量积累的关键基因并阐明其作用机理,是植物修复基因工程获得成功并从源头上控制农产品

Nature破解土壤中的耐药基因组

  在美国,每年大约有两百万人受到耐药菌的感染,其中有超过两万三千人会因此而死亡。人们发现,耐药菌能够分享对抗生素的抗性,这种现象无疑进一步加重了公共健康所面临的威胁。  近日华盛顿大学医学院的科学家们解析了土壤细菌的耐药基因组(resistome)。他们发现,生活在土壤中的天然细菌拥有大

PNAS:新型DNA分析策略助力土壤宏基因组研究

  对于土壤微生物来说,这是最好的时代。虽然没有人进行过准确的调查,但一勺土壤中就容纳了数千亿个微生物细胞,包含成千上万的物种。密歇根州立大学(MSU)微生物生态学中心的特聘教授Jim Tiedje指出:“土壤是地球上最多样的微生物栖息地,但我们很少了解土壤微生物的身份和功能。”Tiedje和M

土壤基因组DNA提取试剂盒使用说明

本试剂盒提供了从各种来源的土壤中快速简便的提取基因组DNA的方法。土壤样品中存在大量的抑制因子如腐殖酸、金属离子等,这些物质即使微量存在于纯化后的DNA中也会对下游反应,如对PCR、限制性酶切等产生影响。因而纯化土壤DNA的关键在于如何有效的去除土壤中的抑制因子。采用本公司特有的DNA-only硅胶

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

  研究背景    土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

  研究背景    土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生

研究揭示南岭山地特殊土壤生境植物基因组分化机制

  南岭山地是我国植物多样性和特有性中心之一。该地区喀斯特地貌和丹霞地貌等特殊土壤生境丰富多样,较强的土壤、地质异质性孕育了南岭丰富的生物多样性,但关于该地区生物多样性起源和演化机制尚缺乏深入研究。  报春苣苔属(Primulina)是典型的特殊土壤生境植物类群,广泛分布于我国南方喀斯特和丹霞地貌,

土壤“碳饥饿”可促使抗生素抗性基因传播

近日,南京农业大学教授、中国工程院院士沈其荣团队在美国《国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了研究论文,揭示了施用化学肥料和有机肥料对土壤中微生物的有机碳代谢过程、抗生素抗性和病毒—宿主互作过程的长期影响。土壤中有机碳的可利用性对于塑造土壤微生物群落至关重要。然而,关于微生物对不同碳水平的适应以及随

基因泰克达成10亿美元合作-从土壤细菌发现新药

  今日,致力于直接从土壤中微生物的DNA序列信息中鉴定和生产具有生物活性天然产品的医药开发公司Lodo Therapeutics宣布与罗氏集团成员基因泰克(Genentech)达成战略药物发现合作。   Lodo创立于2016年1月,专注于创造来自自然界的新型治疗药物,以惠及世界各地的患者。该公

基因泰克达成10亿美元合作-从土壤细菌发现新药

  今日,致力于直接从土壤中微生物的DNA序列信息中鉴定和生产具有生物活性天然产品的医药开发公司Lodo Therapeutics宣布与罗氏集团成员基因泰克(Genentech)达成战略药物发现合作。   Lodo创立于2016年1月,专注于创造来自自然界的新型治疗药物,以惠及世界各地的患者。该公

《环境科学与技术》:转基因烟草可清理TNT炸药污染土壤

8月15日出版的美国《环境科学与技术》(Environmental Science & Technology)期刊发表的一项研究报告称,科学家发现,经过基因工程技术改良的烟草,可以有效地清理被TNT炸药污染的土壤,说明转基因烟草植物对环境有益。 英国约克大学的尼尔·布鲁斯博士及其同事将一种可以降解T

退化土壤中微生物类群和功能基因的研究

研究背景土壤退化是一个及其严重的全球问题,长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内,每年约有40%的农业土壤发生严重退化,24%的土壤仍在持续恶化。在中国,农业化肥的滥用导致土壤退化,造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生态系统功能的反

土壤甲基砷分布与砷转化基因物种间的联系获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505699.shtm

城市环境所在抗性基因土壤食物链传递中取得进展

  抗性基因(ARGs)的扩散与传播已经引起全球的关注,但人们对其在自然食物网和生态系统中传播的了解仍然有限,且ARGs的扩散可能受到食物网中动物及营养关系的重大影响。跳虫和捕食性螨是自然生态系统中最丰富的两种土壤小节肢类动物,在土壤食物网中占据着重要的营养级地位,在土壤生态过程中(如凋落物的分解和

质体基因组多样性演化,提供土壤碳动态新视角

近日,中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象,依托野外长期氮添加控制实验平台,结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来,化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持

《寂静的土壤》:听土壤“讲”故事

《寂静的土壤》,龚子同、陈鸿昭、张甘霖著,科学出版社2015年11月出版  2015年11月,在世界土壤日前夕,国内首部大型土壤科普著作《寂静的土壤》出版。2016年年底,该书出版一周年之际,第三次印刷版就已上市。这对于一本科普书来说并不容易。图书出版以来,好评如潮。日本土壤学家永塚镇男、久马一刚,

土壤检测土壤物理特性指标介绍

1.土壤物理特性指标由于土壤环境是由固、液、气三相组成的分散体系,三相物质彼此相互影响,形成各种物理性质,这些物理性质的差异是导致土壤环境功能差异的主要原因。反映土壤物理特性的指标主要有土壤的密度、容重和孔隙度等。1.1土壤密度单位体积土壤固相颗粒的重量和同体积水的重量之比(量纲一),就是土壤的相对

土壤墒情监测系统/土壤墒情监测

1.1    产品简介土壤墒情监测是指定点定时对土壤含水量及水势进行测定,及时了解土壤水分过多、适宜、缺少与严重缺乏等情况的一项经常性的农业基础工作,是农作物“三情”(苗情、虫情、水情)监测的重要内容之一,适时掌握土壤墒情,对于合理灌溉、节约用水、抗旱保收、因土施肥具有重要的指导意义。HO-6型土壤

土壤检测

土壤组成  地球表层的岩石经过风化作用,逐渐破坏成疏松的、大小不等的矿物颗粒(称为母质)。 而土壤是在母质、气候、生物、地形、时间等多种成土因素综合作用下形成和演变而成的。土壤组成很复杂,总体来说是由矿物质、动植物残体腐解产生的有机质、水分和空气等固、液、气三相组成的。土壤检测  土壤检测仪分好多种

抗生素抗性基因:可通过土壤食物网影响人类健康

日前,中科院城市环境研究所朱永官团队在环境科学领域期刊Environmental Science & Technology发表文章称,根据其对土壤食物网中动物抗生素抗性基因(ARGs)变化规律的研究,ARGs会通过土壤食物网进行传递,并且土地利用的变化会进一步影响这种传递。 文章第一作者、

抗生素抗性基因的土壤动物肠道迁移研究获进展

  抗生素抗性基因(ARGs)是一种全球污染物,对公众健康构成潜在风险。目前,关于ARGs的研究多集中在废水、污泥和粪肥上。通过废水灌溉和施用有机肥,ARGs会扩散到农业土壤中,进而转移到更广泛的环境和作物中。  土壤动物在土壤功能和生态过程中发挥关键作用,其肠道中栖息着大量微生物。多项研究表明,土

用土壤养分速测仪了解土壤养分情况

土壤养分是指那些主要依靠土壤来供给的植物必需营养元素。1、土壤养分的主要来源。腐殖质既含有氮、磷、 钾、硫、钙等大量元素,还有微量元素,经微生物分解可以释放出来供作物吸收利用。 2、增强土壤的吸水、保肥能力。腐殖质是一种有机胶体,吸水保肥能力很强,一般粘粒的吸水率为50—60%,而腐殖质的吸水率高达

土壤养分速测仪可快速测定土壤养分

土壤养分是指土壤提供给作物生长的必须营养元素,包括氮(N),磷(P),钾(K)等13种元素。土壤养分速测仪是快速测定土壤养分的专用仪器。土壤养分速测仪性能特点:1、功能全。可以测定土壤中碱解氮、铵态氮、硝态氮、速效磷、速效钾、有机质、全氮、PH值、水分等九项;硼、锰、铁、铜、钙、镁、硫、氯、硅、锌(

土壤养分速测仪/土壤养分测定仪

土壤养分速测仪功能简介:*全国*《机箱/药剂一体式铝合金机箱》设计,便于携带、坚固耐用。*土壤养分速测仪可检测土壤及化肥、有机肥、植株中的速效氮、速效磷、有效钾、全氮、全磷、全钾、有机质含量,土壤酸碱度(定性同时定量),含盐量,可对70种全国农业、果树、经济作物的目标产量计算推荐施肥量。*数字化线路

土壤养分速测仪土壤PH值的测定

  1、土壤试样准备:  将土样(可不必风干)剔出大颗粒,称25g放入小烧杯中,视土壤含水量,按风干土重的1:1倍(酸性土可用2:1倍)加蒸馏水,搅拌使土粒充分分散,静置半小时测定。  2、pH试纸测定法  用pH5~9精密试纸浸入土样澄清液中,半分钟后取出,观察试纸颜色与比色板对比。  pH7.0

土壤分析中如何避免土壤采样误差?

土壤分析是判断土壤养分、水分、肥料等情况的重要手段,那么应该怎样进行土壤采样,怎么进行分析测定,分析结果如何应用等等都需要专业的知识来讲解。采集土壤样品和土样的分析测定是保证分析结果准确性的同等重要的两个方面,在某种意义上,采样的重 要性甚于分析测定,因为,分析测定尚有一定规范可循而土壤采样至今还没

土壤粒径分布的土壤粒径分布模型

土壤粒径分布模型可分为两类,即参数模型和非参数模型。参数模型是表征累积质量百分含量与颗粒直径之间关系的包含若干形状参数的数学表达式。非参数模型则不包含形状参数,通常是采用有限的粒级划分的统计学指标。利用粒径分布模型可以对不同来源的颗粒分析资料进行标准化插值和不同粒径分级制之间的转换;另外,利用形状参