古DNA技术如何“浪里淘金”
重建已灭绝古人类——尼安德特人和丹尼索瓦人的全基因组、绘制全球人群迁徙交流历史、挖掘最古老东亚现代人“田园人”的遗传结构、揭示东亚人群末次盛冰期前后适应性基因的变化、追溯中国南北方人群格局的形成、溯源南岛语系人群的中国南方起源……在过去十余年里,研究人员利用古DNA技术发掘出那些遗落了成千上万年的遗传信息,从中抽丝剥茧,不断刷新人类对自身演化历程的认知。 7月21日,《细胞》发布特刊讨论了最新生物技术的前沿发展。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹团队受邀领衔古DNA前沿领域针对古DNA技术发展与未来发表评述性论文。文章回顾了古DNA技术的发展历史和突破,探讨了目前的技术瓶颈和解决方案,以及未来古DNA技术的发展方向与前景。 高通量测序将古DNA领域“一网打尽” 高通量测序,又叫二代测序,是一种快速测定大量DNA序列的技术。在高通量测序普及之前,古DNA领域只能依赖PCR技术测定少数特定DNA片段的序列。 ......阅读全文
昆虫全基因组DNA的提取
实验概要利用改进的CTAB 法提取昆虫全基因组DNA。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司生产]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2ED
古DNA帮你看清剑齿虎
研究人员分析了两种剑齿虎科动物的完整线粒体基因组,他们对这些动物在过去5万年里的历史有了新视角。近日,发表在《当代生物学》杂志上的数据表明,在2000万年前,剑齿虎与现存猫类有共同的祖先。但这两种剑齿虎大约在1800万年前就分道扬镳了。 德国波茨坦大学Johanna Paijmans说:“从线
大洋海底首次发现古DNA
海底世界中,不仅有化石,还有微小生物的古DNA。图片来源: F. Lejzerowicz等,《生物学快报》 在广阔的南大西洋中,有一片海域几乎没有生命迹象:没有鸟类,极少的鱼类,甚至浮游生物也不多见。但是研究人员日前报道,他们发现了埋藏在海底的珍宝:海床之下淤泥中的古DNA。 古DNA来
古DNA技术如何“浪里淘金”
重建已灭绝古人类——尼安德特人和丹尼索瓦人的全基因组、绘制全球人群迁徙交流历史、挖掘最古老东亚现代人“田园人”的遗传结构、揭示东亚人群末次盛冰期前后适应性基因的变化、追溯中国南北方人群格局的形成、溯源南岛语系人群的中国南方起源……在过去十余年里,研究人员利用古DNA技术发掘出那些遗落了成千上万年
古DNA-图谱描绘人类农业“黎明”
考古学和遗传学证据表明,1.2万年前的某个时候,中东的游牧狩猎采集者完成了人类历史上最重要的转变之一——不再游荡,开始定居务农。这种转变后来也独立出现在世界其他地区,被称为新石器革命(农业及畜牧出现)。古代基因组学研究曾暗示,这些“中东农民”起源复杂,涉及不同地方的狩猎采集群体,具有不同的遗传序列。
古DNA技术如何“浪里淘金”
重建已灭绝古人类——尼安德特人和丹尼索瓦人的全基因组、绘制全球人群迁徙交流历史、挖掘最古老东亚现代人“田园人”的遗传结构、揭示东亚人群末次盛冰期前后适应性基因的变化、追溯中国南北方人群格局的形成、溯源南岛语系人群的中国南方起源……在过去十余年里,研究人员利用古DNA技术发掘出那些遗落了成千上万年
古DNA考古将改变整个行业
一项铁器时代的大规模屠杀考古发现,正在改变学界对史前暴力的认知,也凸显古DNA技术如何重塑整个考古行业。在塞尔维亚北部的戈莫拉瓦(Gomolava)遗址,研究者发现一处埋葬着77名以上遇难者的墓葬,其中多数是妇女与儿童。 这些个体约在2800年前被合葬。他们身上的钝器创伤与刺伤表明,死于一场研究者
古DNA分析将改变整个行业
一项围绕英国南部罗马时期古人类遗骸“比奇角女性”(Beachy Head Woman)的长期谜团,如今终于有了更清晰的答案。最新的高质量DNA分析显示,这位年轻女性很可能是一位来自罗马时期不列颠本地的普通女性,而非此前学界长期猜测的撒哈拉以南非洲或地中海后裔。这一结论借助更先进的基因测序技术与新近发
古DNA揭示埃及人祖先
在一项研究中,科学家对埃及一座墓葬中的一名古埃及人进行了全基因组测序。这些数据可追溯至古埃及第三至第四王朝,揭示了其与北非及中东地区,包括美索不达米亚古人群的亲缘关系,为早期埃及人的遗传多样性研究提供了新线索。科学家在7月2日出版的《自然》杂志报道了这一研究成果。古埃及的古王国时期(公元前2686-
从全血中纯化基因组-DNA-实验方法
试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%,室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去
从全血中纯化基因组-DNA-实验方法
用于从全血(10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除,随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A
从全血中纯化基因组-DNA-实验方法
试剂、试剂盒 乙醇 异丙醇 RNA 酶 A 全血 仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳
古DNA揭示神秘迦南人命运
迦南人到底怎样了?众所周知,他们在圣经记载的就耶利哥城而起的最著名的一场冲突中输掉了。迦南人生活在更北的地方,但由于他们的领土在古代遭到多次入侵,因此其最终的命运一直是个谜。如今,科学家在居住在黎巴嫩的现代人群中发现了迦南人的DNA。相关成果日前发表于《美国人类遗传学杂志》。 很多考古学家执迷
古DNA揭示美洲人的“根”
大约1.3万年前,古人类在美洲迅速扩张。而且,这个故事延续了数千年,人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而,并没有文献记录下这些历史。 几十年来,科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况,但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。 近日,发表在《细胞》和《科学》的两项独立研
古DNA揭示美洲人的“根”
大约1.3万年前,古人类在美洲迅速扩张。而且,这个故事延续了数千年,人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而,并没有文献记录下这些历史。 几十年来,科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况,但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。 近日,发表在《细胞》和《科学》的两项独立研
Illumina推出Nextera-DNA-Flex全基因组测序制备产品
近日,Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex,它让全血和唾液样本省去了样本制备,也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤,比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程,适合广泛的应用,
定位全基因组范围DNA修复的新方法
北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析,可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序(XR-seq)的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。 这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人
古DNA揭示德系犹太人起源
一个国际科学家小组从人类遗骸牙齿中提取了古代DNA,研究了德国埃尔福特一个曾经繁荣的中世纪德系犹太人社区的生活。相关成果近日发表于《细胞》,证明埃尔福特犹太社区的基因多样性比现代德系犹太人要多。“今天,如果你比较来自美国和以色列的德系犹太人,你会发现他们在基因上非常相似,就像是同一群人,无论他们住在
古DNA研究照亮斯瓦希里人种起源
一千年前,在季风和地理因素的推动下,非洲东部的斯瓦希里(Swahili)海岸成了水上贸易网络的关键节点,该贸易网络连接了来自非洲、中东和南亚的商人。在斯瓦希里海岸有一个名叫“石头城(stone towns)”的地方,这里是贸易交易往来的核心地之一,遍布着用珊瑚块建造的房子,这座繁荣的城市从索马里摩加
古DNA破解美第奇家族谋杀之谜
1587年10月一个温暖的日子,意大利托斯卡纳大公弗朗切斯科·德·美第奇因高热不治而亡。接诊医生初步判定死因是疟疾,但很快坊间流言四起,不少人猜测他是遭心怀嫉妒的弟弟费迪南多下毒谋害。如今,全新的科学证据彻底敲定了罪魁祸首,为这桩百年迷案画上句号。近日发表于iScience的一项研究,通过分析包括弗
研究显示:古DNA技术揭示史前家族关系
乌普萨拉大学研究团队通过分析瑞典哥特兰岛5500年前的墓葬DNA,发现史前狩猎采集者社会中扩展亲属关系扮演着重要角色,许多合葬者并非直系亲属而是二三级亲属,颠覆了此前的假设。 一位年轻女子与两个小孩合葬在一起。多年来,人们自然地认为他们是母子关系。但DNA检测讲述了一个不同的故事——两个孩子之
小量全血DNA提取方法
1 RNAi 慢病毒介导)服务2 筛选稳定细胞系方法3DNA提取试剂盒4RNA提取试剂盒5PCR相关产品6DNA Marker 产品7TA克隆产品8蛋白研究产品 储存事项: 1. 结合液CB或者抑制物去除液IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可
基因分析揭示古猫迁徙历史
对古代猫的脱氧核糖核酸(DNA)进行的第一次大规模研究表明,在猫咪主宰互联网文化的几千年之前,这种动物便已经通过早期农民、古代水手乃至维京人遍布古代欧亚大陆和非洲。 这项研究对生活在距今15000年前至18世纪之间的200多只猫的基因组进行了测序。研究人员在9月15日召开的一次会议上公布了这
古基因组改写大象历史
古基因组改写大象历史 灭绝大象DNA揭示物种间复杂关系 本报讯 一个神秘古化石的基因组已经动摇了大象的家族树。 现代大象被划分为3个种:亚洲象(Elephas maximus)和两种非洲象——森林象(Loxodonta cyclotis)以及那些生活在热带草原的草原象(Loxodonta
进击的古基因组研究
今年5月,《科学》在线发表了一项中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(以下简称古脊椎所)领衔的关于华夏族群探源的突破性研究成果,它揭开了有关中国南北方史前人群格局及迁移与混合这一重大学术问题上的若干谜团;两个月后,该团队又发布最新发现:通过古基因组研究最新发现距今约1.1万年的中国南方未知现代人群
从全血和体液中提取基因组DNA的操作步骤
提取DNA需要的仪器和试剂: ⑴ 1.5ml 离心管⑵ 移液管: 1000μl, 200μl, 40μl 各一支和移液管尖头: 100-1000μl, 1-200μl 各一盒⑶ 微型滤柱(备用)⑷ 小型旋转混合器一台⑸ 小型离心机: 可放入1.5ml 离心管和2ml收集管.⑹ 恒温水浴⑺ 电冰箱:
从全血中提取基因组DNA用到各试剂的作用
全血基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)作用原来具体是这样的:独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA
古DNA显示玛雅人用男童献祭
位于墨西哥的奇琴伊察是古玛雅城邦遗迹,废墟上布满了祭祀仪式的痕迹。这座古城的球场附近有一幅版画,绘有一个被砍下的头颅,鲜血喷涌而出。数百名受难者的遗骸已经从一个60米宽的天坑“圣井”中找到。现在,来自奇琴伊察最年轻受害者的古DNA为这个故事增添了新线索。6月12日,发表于《自然》的一项研究分析了从现
古DNA揭秘新疆人群的五千年
公元前2世纪末,丝绸之路途经新疆,使后者正式成为了亚欧大陆东西部文化传播、经济贸易以及人群交流的桥梁。可事实上,很久以前新疆就是不同人群交汇的“十字路口”。 青铜时代人群是新疆早期的古代人类遗存,这些古老“居民”究竟从哪里来?他们如何与“邻里”互动?考古学家、人类学家都非常好奇。 由中国科
最大规模古DNA分析揭示英国历史
近日,美国哈佛大学、英国约克大学和奥地利维也纳大学等机构领导的一项迄今为止最大规模的古代DNA分析显示,青铜时代晚期,大批人口从现在的法国迁移到英格兰和威尔士,同时可能将凯尔特语传播到了英国。相关研究结果发表于《自然》。铁器时代凯尔特山丘堡垒 在此之前,英国曾发生过两次大规模的人口迁移,第一次