古DNA揭示美洲人的“根”
大约1.3万年前，古人类在美洲迅速扩张。而且，这个故事延续了数千年，人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而，并没有文献记录下这些历史。 几十年来，科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况，但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。 近日，发表在《细胞》和《科学》的两项独立研究称，研究人员利用最先进的古代DNA研究方法，分析了来自美洲各地的大量新样本，万余年的美洲历史画卷正徐徐展开。 实际上，“人类在美洲的定居过程是非常复杂的”，《科学》论文第一作者、丹麦哥本哈根大学地质遗传学研究中心的José Víctor Moreno Mayar告诉《中国科学报》记者。 该研究描摹出美洲祖先变迁的大致轮廓。美洲原住民分裂为古代的贝林加人和其他美洲原住民，后者又分裂为南北美洲原住民分支。后来，南印第安人向南扩张，北印第安人向北迁移。“但这只是粗略轮廓，美国原住民的人口历史要复杂得多。”Moreno Mayar说。 ......阅读全文
古DNA揭示美洲人的“根”
大约1.3万年前，古人类在美洲迅速扩张。而且，这个故事延续了数千年，人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而，并没有文献记录下这些历史。 几十年来，科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况，但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。 近日，发表在《细胞》和《科学》的两项独立研
古DNA揭示美洲人的“根”
大约1.3万年前，古人类在美洲迅速扩张。而且，这个故事延续了数千年，人类在北美和南美之间进行了数次大规模迁徙。然而，并没有文献记录下这些历史。 几十年来，科学家只能笼统地描述美洲人的历史演变情况，但这些古老人类何时以及如何分布在这片大陆上一直成谜。 近日，发表在《细胞》和《科学》的两项独立研
远古DNA揭示了史前美洲人复杂的基因学
对远古DNA所进行的一个综合性的、跨越半球的研究提示，人类在美洲的定居过程是非常复杂的。根据对首批美洲人基因组的分析结果，南北美洲首批定居者的人群动态无法用简单的人口模型或播散模式进行解释。尽管人们对人类最初迁徙进入北美和南美的时间和数目给予了很多关注，但他们对人群此后在整个美洲大陆的扩张则关注
老骨头揭示美洲人血缘关系
西北太平洋地区的美洲原住民经常宣称在这一地区根基深厚。现在，一位古老水手可能支持了这个观点。科学家测序了一个具有10300年历史的古人类遗骸的DNA，该遗骸发现自美国阿拉斯加州的“膝盖洞穴”，与发现在加拿大不列颠哥伦比亚的3个古老骨架有密切联系，而后者依次与钦西安人、特林吉特人、尼斯加人，以及目
古代矛尖或揭示“最早”美洲人另有归属
一个考古团队利用10年时间，在美国得克萨斯州一条小溪旁边不辞辛劳地挖掘出一层又一层古代石头工具，以寻找最早抵达美洲的居民的痕迹。如今，他们大获成功：11个1.55万~1.35万年前的矛尖。更重要的是，这些形状独特的矛尖被埋在代表克洛维斯文明的工具下面，从而表明克洛维斯人并非像考古学家一直认为的
科学家从古代“口香糖”中成功提取DNA
该技术有望成为考古学研究的重要补充 几十年来，Steven LeBlanc——考古学家、美国马萨诸塞州剑桥市哈佛大学皮博迪博物馆的标本主管——做梦都想找到古代人类的脱氧核糖核酸（DNA），然而存放在博物馆的史前古器物却不可能给他带来任何好运气。直到有一天，LeBlanc想出了一个主意。他将目光投向
－科学家在印加儿童木乃伊中检测到罕见基因
这名男孩在500多年前死亡的时候年仅7岁，他因自己的美貌和健康而被选中，并成为capacocha这种印加仪式上的祭品。在这样的仪式中，孩子们会被例行公事地杀死用来纪念某个重要的场合、预防一场自然灾难、利用皇权并控制当时不断扩张的印加帝国(1438-1533)。1985年，一群登山者在阿根廷门多萨
PCR技术在分子分类学的应用
虽然用核酸序列数据进行分类研究的优点早已被承认,但序列比较数据的积累过 程都是繁琐的。PCR通用引物技术所提供的快速测序法促使分子分类学的范围扩展 到更多的类群。由序列中得出的均一数据为各种类群的生物提供了一个共同的系统发 育框图。序列数据同样也提供了过去的方法所不能提供的分辨率。线粒体DNA的扩增
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶： 1．大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题：①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组技术(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切与连接（1）酶切反应：同质粒DNA 的鉴定，只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切，则成比例增加。（2）加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀，-20℃2h以上。（3）15000rpm离心15min，弃上清。（4）加入75%乙醇洗涤2次，离心弃
基因研究为人类肤色的进化提供了新角度
该研究发表在Nature Communications杂志，发现欧亚大陆人浅肤色的变异独立于不同的遗传背景。 肤色是人类最明显和最易变的特征之一，科学家一直对这种差异是如何演变的感到好奇。现在，一项由伦敦大学学院遗传学家领导的对拉丁美洲不同人群的研究发现了与肤色相关的新遗传变异。 该研究发表
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体，大多数具有编码多种蛋白质的基因，能利用宿主细胞的蛋白质合成体系，进行生长和增殖。构建的噬菌体载体，以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA，全部序列已知，共编码50多个基因。其中约一半基因参与
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶，将不同来源的DNA分子进行特异地切割，获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接，从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞，在宿主细胞中进行无性增殖，获得大量的目的基因或DNA片段，此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体1
载体（vector）是携带靶DNA（目的DNA）片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型，亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定2
（1）CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子（如Ca2+、Mg2+等）低渗溶液中时，细菌细胞膨胀成球形，处于感受态；此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面，重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面，在丰富培养基中生长数小时后，球状细胞恢复原
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时，破坏此酶的N端阅读框架，产生无α互补功能的N端片段，因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色，见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短，不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框，有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体3
在作为载体时，这些噬菌体有一个很大的优点，即克隆到M13mp载体的外源DNA片段（双链），在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆，可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板：①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板；②制备仅有一条
DNA合成（DNA－synthesis－）技术介绍
蛋白质概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照预定核苷酸的顺序，将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸，可自动化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
DNA－指纹的概念高变区DNA与DNA指纹
人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后，用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ，然后将样品进行
“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”
"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代，用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥？ 科学家们发现，人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子，它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性
DNA－Immunoprecipitation－for－the－Determination－of－DNABinding－Specificity
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho
DNA－Fingerprinting,－DNA－Barcoding,－and－Next－Generation－Sequencing－...
DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的，用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键，而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”这一观念便形
DNA提取方法洗涤－DNA（或－RNA）
当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤
DNA重组（DNA－recombination）技术：工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶（restriction endonucleases，RE）是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶，能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。（一）命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现，根据来源进行命名，限制酶的第一个字母（大写，斜体）为宿主菌的属名，第二、第三
DNA连接酶(DNA－ligase)介绍
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶，借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外)，而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA
DNA提取方法DNA－提取后纯化：将－DNA－与色谱柱结合
离液盐对于裂解至关重要,而且对于将 DNA(或 RNA)与色谱柱结合也是如此。此外,为了增强和影响核酸与二氧化硅的结合,还添加了酒精。大多数情况下这是乙醇,但有时可能是异丙醇。乙醇百分比和体积有很大的影响。太多,你会带入大量降解的核酸和小物种,这会影响 A260 读数并降低你的一些产量。太少,可能难
electrophoresis－of－DNA
Agarose Gel Electroporesis of DNA Making the gel: 1. Place casting platform with well former sideways in gel stand where you wish to pour