定量蛋白质组学的诞生
在现代研究技术，如荧光显微镜，流式细胞仪和蛋白质芯片技术中，抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点，其中最大的限制就是，抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目，比如人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas），Antibodypedia，以及美国NIH研究院的Health Protein Capture Reagents Program等，都在通过分析人类蛋白靶标有关的抗体的系统生发和特征，来寻找解决这些问题的方法。 不过还有另一条路——质谱，这也许是蛋白组学研究中最熟悉的一种技术了，这种方法能用于特异性分析靶标兴趣蛋白。在最成熟的定向分析技术，也就是选择反应监控技术（selected reaction monitoring，SRM）中，一种称为三重四极杆质谱仪（triple quadrupole）技术的质谱方法能检测到独一无二的特异性肽段，帮助研究人员高灵敏度，可重复性的定量监......阅读全文
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组学的样品制备
想要研究蛋白质，首先要得到高度纯化且具有生物活性的目的物质，因此，蛋白样品的制备是重要前提。蛋白提取的质量和效果对后续的研究分析有重要影响。不同种类的样本在制备过程中，存在一些差异，要根据样本特征调整实验方案和操作细节。基本原则样品处理尽量简单，减少蛋白损失；尽量避免蛋白的降解；尽可能提高样品蛋白的
蛋白质组学研究技术
可以说，蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否，很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基（20/ 4）， 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰，如磷酸化和糖基化等，给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外，
蛋白质组学+AI技术
人们在吞咽的时候，颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动，它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目，就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小，但它影响到五脏六腑。数据显示，每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中，约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的，
什么是蛋白质组学
(Marc Wilkins（1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
什么是蛋白质组学
这个概念最早是在1995年提出的，它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的
大连化物所定量蛋白质组学新技术新方法研究取得进展
近日，中科院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组(1809组)邹汉法、叶明亮研究员等人在定量蛋白质组学新技术新方法研究方面取得新进展。相关研究成果发表在最新一期的Angew. Chem. Int. Ed.上(2013年52卷，9205-9209页)。 该项研究工作利用胰蛋
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”，在字典里的意思是识取、读取，放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划（HGP）宣告完成以来，基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据，但实际上绝大
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”，在字典里的意思是识取、读取，放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划（HGP）宣告完成以来，基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据，但实际上绝大多数疾病并不是
蛋白质组学质谱分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
蛋白质组学鉴定技术流程
蛋白质组（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一个基因组（Genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学（Proteomics）以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象，通过高通量的色谱质谱联用技术
蛋白质组学入门问题FAQ
常见问题——— HPLC 篇 1 ． HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足：解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出：可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配：根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多：调整衰减即可。 检测器时间常数太大：解决办法为降低时间
蛋白质组学入门问题集锦
1 ． HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足：解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出：可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配：根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多：调整衰减即可。 检测器时间常数太大：解决
蛋白质组学实验技术大全
每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新，蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多，但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前，先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与
不同标记与非标记蛋白质组学定量准确性分析研究
通过质谱法进行定量蛋白质组分析为生物医学探索研究提供非常重要的途径。 然而，了解生物样品中的定量限制对于准确判断结果非常重要。通过使用加入已知浓度的蛋白质标准品的复杂样本，科学家们研究了无标记（label free）和基于标记（TMT和iTRAQ）的肽定量的定量限制，包括前体混合的评估及其对同重
iTRAQ定量蛋白质组学技术分析抗菌肽F1的抗菌机制研究
本研究利用iTRAQ定量蛋白质组学分析技术，对抗菌肽F1处理的大肠杆菌及空白对照在不同时间段菌体的生长速率以及其产生的蛋白质进行了分析与鉴定，通过比较实验组与对照组蛋白质表达水平差异，以期了解抗菌肽F1的抗菌机制。 抗菌肽在农业和食品工业中受到越来越多的关注，因为它们具有控制病原体的潜力。然而
Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法
瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组，已制定了一个质谱工作流，用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。 据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说，对于多种形态，该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量，提供用于
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
《Nature》：新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度
单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱（SCoPE-MS）是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法，这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签，其中包含了独特的质量条码
蛋白质组学帮你找到衰老的秘密
最近，研究人员发现，正常的和病理性的多肽组学变化，可能会增进我们对于衰老分子机制的理解。蛋白质组学分析与治疗相结合，可能会影响病理性衰老。 这是第一次有研究人员成功地在分子水平上展示了正常衰老和病理性衰老之间的差异。在一项最大的蛋白质组衰老研究中，德国Leibniz衰老研究所 ——Fritz
蛋白质组学研究的策略和范围
蛋白质组学一经出现，就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”，即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质，这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学，也更符合蛋白质组学的本质。但是，由于蛋白质表达随空间和时间不断变化，要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一
蛋白质组学的标准化(下)
蛋白质组学信息学研究组 蛋白质组学信息学研究组的任务是教育蛋白质组学研究实验室最大程度地应用和实践生物信息学方法，向精确和复杂的蛋白质组学数据分析方向发展。iPRG积极地支持和参与开发和提高新的算法、软件工具以及蛋白质组信息学战略，目标是向全体会员教育和介绍这些新技术。iPRG已经发起了两
蛋白质组学的标准化(上)
Tim Wehr 由于人类基因序列的建立已经接近完成，人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域，蛋白质组学将其研究目标定位于：鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质，这样做的预期是，将能发现那些能够成为疾病生物标志物(bioma
蛋白质组学概念的起源和发展
蛋白质组学的诞生和发展，离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括（但不限于）基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来，分子医学、大数据技术和人工智能的发展，进一步加速推动了蛋白质组学的成长，使之在精准医疗领域展示出越来越大的应
人类蛋白质组计划2.0和蛋白质组学驱动的精准医学
“如果说抗生素的发明引发了第一代医学治疗技术革命，影像学和分子医学的发展引发了第二代医学诊断技术革命，那么，由蛋白质组学驱动的精准医学，势必带来精确诊断与精准治疗统一的第三代医学革命。人类蛋白质组计划2.0将在国际范围部署建立蛋白质组学驱动的精准医学技术体系和行业标准，进一步提升对重大、疑难疾病
【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展
自从精准医学概念提出以来，组学研究一直都是全球最热的研究领域，其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初，中国发起了精准医学研究专项课题，目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台，推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时
《自然方法学》：可视蛋白质组学
瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体(Leptospira interrogans)这种病原体中定位蛋白复合物的新方法，称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。 活细胞中的生化进程分为多个功能单元，它们在细胞内有着特定的时间和空间分布。一般来说，这些单元