单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件
海藻病毒（Marine algae viruses）是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分，在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里，我们关注的是一个主要的海藻病毒群，单链DNA（ssDNA）病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus的衣壳结构，以2.4-Å分辨率测定DNA病毒II型（CTENDNAVII）。一种基于结构的系统发育分析支持了以前的理论，即海藻病毒通过水平基因转移从ssRNA病毒获得了衣壳蛋白。衣壳蛋白含有广泛的病毒果冻卷边，但有额外的独特特征；第三个β片和一个长的C末端尾巴。此外，CtenDNAV II基因组的低分辨率重建显示了一种部分卷绕的结构，这种结构以前只描述了dsRNA和dsDNA病毒。总之，这些结果证明了基因重组对ssDNA病毒的出现和进化的重要性，并对决定基因组组织的潜在机制提供了重要的见解。单链DNA病毒（Single strande......阅读全文
半制备规模单链RNA纯化（二）
图2中所示被选中的馏份收集窗表示不同的质量负荷。峰值采集后，样品可以根据需要对等分和干燥，以便长期储存。TEAA的挥发性使离子对缓冲组分的去除非常容易。溶剂蒸发后被纯化的寡核苷酸实际上是不含盐的。 UPLC条件纯化RNA寡核苷酸的纯度通过ACQUITY UPLC系统来验证。如图3所示，我们的纯化方法
单链构象多态性的原理
单链构象多态性（Single-strand conformation polymorphism，SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下，单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象，它影响了DNA在非变性凝胶中的迁
细胞化学词汇双链互补DNA
中文名称：双链互补DNA英文名称：double-strand cDNA;dscDNA定 义：以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
解旋酶打开DNA双链过程破解
美国温安洛研究所近日发布公告称，该所科学家和洛克菲勒大学合作，成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA（脱氧核糖核酸）复制的结构过程，并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究，为生命繁殖之谜提供了全新注解。 温安洛研究所教授李慧琳（音译）从酵母生物体内提
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,用
解旋酶打开DNA双链过程破解
美国温安洛研究所近日发布公告称，该所科学家和洛克菲勒大学合作，成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA（脱氧核糖核酸）复制的结构过程，并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究，为生命繁殖之谜提供了全新注解。 温安洛研究所教授李慧琳（音译）从酵母生物体内提
细胞化学词汇DNA双链体
中文名称：DNA双链体英文名称：DNA duplex定 义：两条以3′，5′-磷酸二酯键相连而成的反向多核苷酸链通过沿着其轴向的互补碱基对的氢键交联在一起形成的双链DNA，通常形成双螺旋的结构。可以共价闭合成环状分子，形成超螺旋DNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学
双链DNA探针切口平移法
当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA
细胞化学词汇DNA三链体
中文名称：DNA三链体英文名称：DNA triplex定 义：DNA的一种特殊的结构，是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对，与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶；第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对；G或C与G≒C碱基对中的G配对
细胞化学词汇DNA四链体
中文名称：DNA四链体英文名称：DNA tetraplex定 义：富含鸟嘌呤序列的四链DNA所形成的一种结构。已发现两种主要的类型，一类为重复的鸟嘌呤序列的回折形成的反平行链；另一类由四条独立的平行链相系而成。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
DNA三链体的结构特点
中文名称DNA三链体英文名称DNA triplex定 义DNA的一种特殊的结构，是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对，与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶；第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对；G或C与G≒C碱基对中的G配对，C必
双链DNA探针标记法介绍
分子生物研究中，最常用的探针即为双链DNA探针，它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。1. 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的
限制性内切酶消化DNA实验——单酶单DNA样品消化
实验方法原理限制性内切酶种类虽然很多 , 但反应条件都十分相似 。一般需要较纯的底物DNA、Mg2+、Tris-HCl 缓冲液, 通常在37℃保温以酶解DNA 。实验材料限制性内切酶DNA片段试剂、试剂盒TE酶切缓冲液EDTA仪器、耗材恒温水浴锅实验步骤1. 混合下列溶液于一个无菌的微量离心管中（
单链构象多态性分析(SSCP)技术
SSCP是一种简便快速的检测DNA或cDNA突变的技术。 其技术原理和过程是：将PCR扩增到的待测DNA或cDNA片段变性，成为单链DNA，在一定条件下，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将单链DNA变性。 由于单链DNA的空间构象与分子内碱基组成密切相关，一个碱基的差异即可形成不同
单链构象多态性的实验步骤
利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链（其中一个PCR引物被磷酸化，这条链将被去除）。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。
单链构象多态性的实验步骤
利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链（其中一个PCR引物被磷酸化，这条链将被去除）。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。
单链构象多态性的应用介绍
单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序，并与数据库中已知序列比对。
单链重组因子VIII可有效控制出血
A型血友病是一种经典的遗传疾病，当患者（主要是男性）的体内缺乏合成正常关键凝血因子VIII的基因时，就会出现严重凝血障碍，导致出血不止。在所有血友病患者中，A型血友病是最为常见的类型。单链重组因子VIII （rVIII）是一种单个多肽链带有截断B域，其允许共价桥的因子VIII重链和轻链连接，VW
单链构象多态性的原理简介
单链构象多态性（Single-strand conformation polymorphism，SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下，单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象，它影响了DNA在非变性凝胶中
筛选解离速率优化的单链抗体（scFv）
选择3~5轮后，随机挑取克隆加入96孔微量滴定板中 并诱导表达可溶性scFv.然后，在包被有相关抗原的96孔微量滴定板中，用ELISA分析含有可溶性scFv的细菌上清。此过程可以识别出那些结合了抗原的scFv.但即便采用上述严谨性选择后，ELISA阳性克隆中仅有部分克隆的亲和力比野生型高。ELI
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高： 可能为系统性红斑狼疮，还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病： 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高： 可能为系统性红斑狼疮，还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病： 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值
Farr法结合活性小于或等于20%。 间接免疫荧光法阴性。 斑点免疫结合试验小于1:40（阴性）。 （注具体参考值请根据各实验室而定。）
抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程
检查方法：测定抗双链dSDNA的方法有多种，如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值
Farr法结合活性小于或等于20%。 间接免疫荧光法阴性。 斑点免疫结合试验小于1:40（阴性）。 （注具体参考值请根据各实验室而定。）
抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程
检查方法：测定抗双链dSDNA的方法有多种，如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。
如何判断提取的DNA是高纯度的双链DNA
首先：可以通过分光光度计A 260 / A 280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是 280 nm.纯净的样品,比值大于 1.8（DNA）或者2.0（RNA）.如果比值低于 1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响.A 230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚
抗双链DNA抗体(aniDNA)的注意事项
检查时要求：一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行，即病情活动时，抗DNA抗体效价升高，病情缓解时，效价降低。由于各地测定的方法不同，所以正常值也不同，一般来说，结合率要大于20%以上才有临床意义。 检测技术的特异性都不是100%的。例如，绿蝇短膜虫动基体中虽不含ssDNA，但可能含少量组蛋白
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高： 可能为系统性红斑狼疮，还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病： 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。