单链DNA基因组结构揭示了真核病毒的祖先事件

海藻病毒(Marine algae viruses)是控制海洋生态系统中微生物群落的重要组成部分,在病毒进化的早期起着基础性作用。在这里,我们关注的是一个主要的海藻病毒群,单链DNA(ssDNA)病毒Bacilladnaviridae。我们提出了海藻病毒Chaetoceros tenuissimus的衣壳结构,以2.4-Å分辨率测定DNA病毒II型(CTENDNAVII)。一种基于结构的系统发育分析支持了以前的理论,即海藻病毒通过水平基因转移从ssRNA病毒获得了衣壳蛋白。衣壳蛋白含有广泛的病毒果冻卷边,但有额外的独特特征;第三个β片和一个长的C末端尾巴。此外,CtenDNAV II基因组的低分辨率重建显示了一种部分卷绕的结构,这种结构以前只描述了dsRNA和dsDNA病毒。总之,这些结果证明了基因重组对ssDNA病毒的出现和进化的重要性,并对决定基因组组织的潜在机制提供了重要的见解。单链DNA病毒(Single strande......阅读全文

DNA复制链的延伸

  DNA新生链的合成由DNA聚合酶Ⅲ所催化,然而,DNA必须由螺旋酶在复制叉处边移动边解开双链。这样就产生了一种拓扑学上的问题:由于DNA的解链,在DNA双链区势必产生正超螺旋,在环状DNA中更为明显,当达到一定程度后就会造成复制叉难再继续前进,从而终止DNA复制。但是,在细胞内DNA复制不会因出

研究揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链的机制

  2018年12月27日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表题为Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated

抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的参考值及临床意义

  参考值  正常人:阴性,酶标法  临床意义  抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性,除SLE患者有较高检出率(50%~60%)外,其他风湿病如混合性结缔组织病(mixel connective tissue disease,MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征,类风湿性关节炎等

我国学者揭示Agos蛋白指导导向DNA链切割靶标DNA链机制

  近日,《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,PNAS》杂志在线发表题为“Two symmetric arginine residues play distinct

单链RNA的基本信息

中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定  义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与

单链构象多态性简介

  单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的

单链突出端的定义

中文名称单链突出端英文名称overhang定  义双链核酸末端带有一个或多个未配对核苷酸的单链部分。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

半制备规模单链RNA纯化

  寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

单链丝状噬菌体展示系统

一、单链丝状噬茁体展示系统 1、pIII展示系统及噬苗体抗体 丝状噬茵体是单链DNA病毒,pIII是病毒的次要外完蛋白(minor coatprotein)、位于病毒颗粒的一端,每个病毒颗粒都有3—5个拷贝pIII蛋白,pIII有两个位点可供外源序列插入,即N端和近N端可伸屈胃内。当抗体片段或蛋

半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针

            实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段 限制性内切核酸酶 模板 DNA 寡核苷酸引物 试剂、试

从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针

实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物试剂、试剂盒 乙酸铵DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 电泳缓冲液Tris-ClKlenow 基础缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材 变性聚丙烯酰胺凝胶或碱性琼脂糖凝胶黏性贴片或磷光黏性贴片Sephad

从M13噬菌体模板合成固定长度的单链DNA探针

实验材料大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物试剂、试剂盒乙酸铵DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 电泳缓冲液Tris-ClKlenow 基础缓冲液dNTP 溶液仪器、耗材变性聚丙烯酰胺凝胶或碱性琼脂糖凝胶黏性贴片或磷光黏性贴片Sephadex

DNA母链的复制方式

①时期:有丝分裂间期和减数第一次分裂的间期。②场所:主要在细胞核中。③条件:a、模板:亲代DNA的两条母链;b、原料:四种脱氧核苷酸为;c、能量:(ATP);d、一系列的酶。缺少其中任何一种,DNA复制都无法进行。④过程:a、解旋:首先DNA分子利用细胞提供的能量,在解旋酶的作用下,把两条扭成螺旋的

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

DNA双链末端的概念

中文名称平端英文名称blunt end定  义DNA双链末端平齐而无突出单链。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双链互补DNA的定义

中文名称双链互补DNA英文名称double-strand cDNA;dscDNA定  义以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇双链DNA

中文名称:双链DNA英文名称:double-stranded DNA;dsDNA定  义:由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双链DNA探针标记法

  分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。  双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。  1.切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

抗双链DNA抗体(aniDNA)的简介

  抗DNA抗体包括抗双链DNA抗体、抗单链DNA抗体和抗zDNA抗体。 检验中一般是指与双链DNA和单链DNA都反应的抗双链DNA抗体。 抗双链DNA抗体阳性是系统性红斑狼疮的标志,阳性率达90%以上,有较高的特异性,因而抗双链DNA抗体对系统性红斑狼疮的诊断和治疗监控极重要。抗双链DNA抗体在其

从M13噬菌体模板合成非固定长度的单链DNA探针

实验方法原理 在合成过程中,低浓度的放射性标记的 dNTP 使探针的长度限制为 200~300 个核苷酸。但是新合成的 DNA 可通过改变投入的模板量和 dNTP 的浓度使其长度为 100~1000 个核苷酸,如此长度范围内的探针适用于大多数杂交实验。实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klen

从M13噬菌体模板合成非固定长度的单链DNA探针

            实验方法原理 在合成过程中,低浓度的放射性标记的 dNTP 使探针的长度限制为 200~300 个核苷酸。但是新合成的 DNA 可通过改变投入的模板量和 dNTP 的浓度使其长度为 100~1000 个核苷酸,如此长度范围内的探针适用于大多数

微量热泳动仪MST分析幽门螺杆菌DprA-结合单链DNA结构模型

细菌间的自然转化(NT)是一个复杂的过程,包括结合,吸收,运输和将外源DNA重组到染色体中,因此产生了基因多样性并推进了进化。DNA加工蛋白 A(DprA)几乎存在于所有细菌种类中,其主要参与结合内部单链DNA和在NTs期间促进RecA结合到ssDNA上。这篇文章分别介绍了幽门螺杆菌 DprA蛋白

从M13噬菌体模板合成非固定长度的单链DNA探针

在合成过程中,低浓度的放射性标记的 dNTP 使探针的长度限制为 200~300 个核苷酸。但是新合成的 DNA 可通过改变投入的模板量和 dNTP 的浓度使其长度为 100~1000 个核苷酸,如此长度范围内的探针适用于大多数杂交实验。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理在

单链RNA的基本信息介绍

  一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒(如脊髓灰质炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,转译早期蛋白质,包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正链)为模板

单链构象多态性的应用

单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序,并与数据库中已知序列比对。

PCR单链构象多态性分析

  PCR -单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链DNA三级构象改变,通过观察单链DNA在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移率漂移

单链构象多态性的原理

单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中的迁

半制备规模单链RNA纯化(一)

Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一