科学家绘出表观遗传和转录起始研究“框架图”
10月7日,《科学》在线发表复旦大学教授徐彦辉课题组的研究成果。研究人员解析了包含+1核小体的PIC-Mediator复合物结构,首次展示了转录起始复合物与+1核小体的紧密结合,表明+1核小体对转录起始复合物在染色质上组装的重要调控作用,建立了表观遗传和转录起始的直接关联。作为基因表达调控的核心,转录起始过程发生在基因启动子区,通过染色质重塑复合物剔除核小体暴露出启动子, 允许转录起始复合物(PIC)的组装, 在中介体(Mediator)的帮助下,组装成PIC-Mediator转录起始超级复合物。PIC-Mediator是转录起始调控的核心,基因表达主要受转录因子和表观遗传调控。其中转录因子结合在增强子和启动子附近促进PIC-Mediator的招募和组装,而表观遗传对转录的调控集中在启动子下游的第一个核小体上(称为+1核小体)。与其他核小体不同,+1核小体含有组蛋白乙酰化和H3K4三甲基化修饰,特征性的组蛋白变体H2A.Z和H3......阅读全文
分子遗传学词汇转录起始因子
中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定 义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇抗转录终止[作用]
中文名称:抗转录终止[作用]英文名称:transcriptional antitermination定 义:使RNA聚合酶得以越过终止密码子而继续转录的过程。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇转录辅激活物
中文名称:转录辅激活物英文名称:transcriptional coactivator定 义:增加序列特异性转录因子活性的蛋白质。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇逆[转录]转座子
中文名称:逆[转录]转座子英文名称:retrotransposon;retroposon定 义:通过RNA中间物进行转座的可移动基因元件。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
分子遗传学词汇转录起始位点
与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基转录的起点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基,研究表明通常为一个嘌呤(A 或G),即5’UTR的上游第一个碱基。
分子遗传学词汇逆转录转座
中文名称:逆转录转座英文名称:retrotransposition;retroposition定 义:RNA介导的转座。转座子RNA中间物转变成DNA拷贝,并随后整合进入基因组的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
表观遗传学开关控制基因节律性转录
当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。 Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期
利用转录组学方法揭示南荻群体遗传
南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带,但其遗传变异丰富,生态适应强,移栽到黄土高原等半干旱地区后,生长良好;由于其根系较浅,种植后不会过度利用深层土壤水分,可以有效减少地表径流,有助于水土保持,发挥重要的生态修复功能。 近日,中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑
分子遗传学词汇选择性转录起始
中文名称:选择性转录起始英文名称:alternative transcription initiation定 义:不同的启动子对RNA聚合酶有不同的亲和力,可在不同的启动子上有选择地启动基因转录。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇转录起始复合体
中文名称:转录起始复合体定义:真核细胞中,启动子上的TATA框与转录因子TFIID结合形成稳定的复合物,然后由其他转录因子(TFIIA,TFIIB,TFIIF,TFIIE,TFIIH等)和RNA聚合酶按一定顺序与DNA结合形成转录起始复合体。
遗传发育所鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
小麦是重要的粮食作物之一。小麦的产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量,是育种改良地重要的选择性状。挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制,对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚,穗发育关键基因挖掘及作用
转录组测序“指证”老年性黄斑变性更多遗传线索
AMD是65岁以上人群视力丧失和失明的主要原因。2月11日发表在Nature Genetics杂志上的这篇文章提供了一幅更广泛和深入的了解AMD遗传贡献的图片,并为治疗提出了新途径。 “在刑事调查中,不同的罪犯被锁定在34个邮政编码的52条街道中,”本研究主要作者、美国国立卫生研究院神经生物学
科学家绘出表观遗传和转录起始研究“框架图”
10月7日,《科学》在线发表复旦大学教授徐彦辉课题组的研究成果。研究人员解析了包含+1核小体的PIC-Mediator复合物结构,首次展示了转录起始复合物与+1核小体的紧密结合,表明+1核小体对转录起始复合物在染色质上组装的重要调控作用,建立了表观遗传和转录起始的直接关联。作为基因表达调控的核心,转
遗传发育所发现调控拟南芥分枝和种子角果发育的转录因子
Dof转录因子家族是一类植物特有的转录因子家族,它们参与调控了多种生长发育过程。在以前的研究中发现,大豆GmDOF4和GmDOF11可提高种子的脂肪酸含量并增加种子千粒重。本研究筛选了在拟南芥种子/花中高表达的Dof转录因子AtDOF4.2并进一步研究其功能。 AtDOF4.
新型冠状病毒的遗传物质会逆转录成DNA
新型冠状病毒是什么?2019新型冠状病毒,即“2019-nCoV”,因2019年武汉病毒性肺炎病例而被发现,2020年1月12日被世界卫生组织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族,已知可引起感冒以及中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS)等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现
遗传发育所解析茉莉酸调控植物免疫的转录重编程机理
茉莉酸是来源于不饱和脂肪酸的植物免疫激素,其生物合成途径和化学结构与高等动物中的免疫激素前列腺素有极高的类似性。在受到机械伤害、咀嚼式昆虫和死体营养型病原菌的侵害时,植物激活茉莉酸信号通路,启动并级联放大茉莉酸介导的转录重编程,从而产生有效的防御反应。但目前对茉莉酸激活植物免疫转录重编程的机理所
遗传发育所解析茉莉酸调控植物免疫的转录重编程机理
茉莉酸是来源于不饱和脂肪酸的植物免疫激素,其生物合成途径和化学结构与高等动物中的免疫激素前列腺素有极高的类似性。在受到机械伤害、咀嚼式昆虫和死体营养型病原菌的侵害时,植物激活茉莉酸信号通路,启动并级联放大茉莉酸介导的转录重编程,从而产生有效的防御反应。但目前对茉莉酸激活植物免疫转录重编程的机理所
上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能
生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的
研究揭示先锋转录因子在协调心肌细胞表观遗传记的机制
从单个全能受精卵产生广泛不同和特化的细胞类型涉及大规模转录变化和染色质重组。先锋转录因子在编程表观基因组中起关键作用,并在连续细胞谱系规范和分化步骤中促进其他调节因子的募集。 2019年4月25号,同济大学心律失常教育部重点实验室、同济大学附属东方医院课题组长孙云甫教授、梁兴群教授团队等在C
遗传发育所发现免疫受体蛋白直接参与抗病转录调控新机制
植物受病原菌侵染后的抗病或感病反应往往伴随细胞内转录重编程,但是免疫受体蛋白激活后如何参与细胞的转录调控、通过哪些直接或间接的下游的组分参与转录调控在国际上报道很少。之前的研究表明,大麦白粉病免疫受体蛋白MLA在细胞核内介导抗病反应(Bai et al., 2012,PLoS pathoge
Cancer-Discov-|-结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子
北京大学汤富酬及周鑫共同通讯在Cancer Discovery(IF 28)在线发表题为“Single-cell chromatin accessibility analysis reveals the epigenetic basis and signature transcription f
遗传发育所发现两个WRKY转录因子差异调控小麦耐逆性
WRKY类转录因子调控植物生长发育的多个方面,其基因表达也受到多种非生物胁迫的影响。但这类转录因子在植物尤其是农作物耐受非生物胁迫方面的作用研究较少。 中科院遗传与发育生物学研究所陈受宜、张劲松和张正斌3个实验室合作分析了小麦中WRKY转录因子基因家族的成员,鉴定了胁迫应答基因,并研究了相
遗传发育所等发现基础转录因子可以特异调控脂类代谢
脂肪是生物体主要的能量储存形式,脂肪能量代谢与多种人类重大疾病(肥胖、糖尿病、癌症等)密切相关。细胞内的脂肪主要储存在脂滴(Lipid Droplet)中。脂滴的大小和动态调控与细胞的功能和代谢状态息息相关。前人的研究在不同模式系统中发现了许多影响脂类储存和脂滴动态变化的分子机制,但是人们对脂类
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足: 1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列; 2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高; 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
甲基化与lncRNA:表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么?circRNA,lncRNA,外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外,现在很多小伙伴们开始了新的玩法,通过多平台联用,将不同层面的东西结合起来,比如,表观遗传与非编码RNA的结合,就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤,特别在中国,