构建cDNA文库的反转录的注意事项

这是构建cDNA文库中最贵的一步,也是核酸质变的一步,它将易降解的RNA变成了不易降解的cDNA。反转录不成功,说明一次文库方案的夭折。反转录效率不高表现在一是部分mRNA被反转录了,但还有相当一部分本该反转录的mRNA未被反转总的全长cDNA太少,这就难以构建好的全长cDNA文库。少量程度的mRNA降解或反转录不完全在SMART 4等试剂盒及手工方法构建中对文库的滴度影响不大,但对文库的全长性则有很大影响。Invitrogen公司基于去磷酸化、去帽、RNA接头连接后再反转录的新技术(可参考其GeneRacer说明书)从原理上是保证最终获得全长cDNA的最好方法,但对mRNA的完整性要求非常高,理论上讲必须是带有帽子结构和Poly A结构的全长mRNA且反转录完全,才能进入文库中。反转录完成后点样检测cDNA的浓度及分子量分布是很重要的。......阅读全文

cDNA文库组标准流程五:cDNA双链和载体的连接

1.连接:根据载体和cDNA的电泳定量结果,每个样品设置3个比例的连接,即:insert/vector=1/3  incert/vector=1/1   insert/vector=3/1按以下体系依次加入:      ddH2O                      xulT4 ligase

cDNA文库组标准流程二:mRNA的分离

1.Oligotex mRNA Kits  (QIAGEN)法 准备工作:1.将Oligotex Suspension 置于37℃水浴中,旋转混匀,溶解Oligotex.,然后置于室温。2.将OBB Buffer置于37℃水浴中,旋转混匀,重溶沉淀物,然后置于室温。3.将OEB Buffer 置于7

人VL基因文库的构建

[器材和试剂]●  PCR试剂和设备●  cFv基因文库单链模板DNA,制备自pHENl中的天然scFv文库(10ng/u1)●  Gelleclean试剂盒(Qbiogene)●  Wtzard PCR纯化试剂盒(ProlneSa)●  RJHl/2Xho引物:  5'-GGC ACC C

YAC实验——YAC文库构建

YAC带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个DNA复制起点,两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA,这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验步骤1.  尽管当插入片段大于10

cDNA文库组标准流程一:Total-RNA的提取

1.试剂配制准备工作:1、研钵、5ml/10ml/ 25ml移液管、100ml/250ml量筒、250ml/100ml容量瓶、药匙、 试剂瓶等玻璃制品均用锡纸包裹口部,置于烤箱内,180℃,烤6小时。2、50ml/1.5ml离心管、枪头等塑料制品用0.1‰DEPC水浸泡过夜后,121℃ 20mins

怎样来鉴别反转录cDNA的质量

用内参引物做一下Realtime PCR就行了,常见的ACTB、GAPDH、18S都可。一般大型实验室都会有自己独门的内参引物。如果Ct值在9~18之间,一般质量都不会有太大问题。

反转录后的cDNA能保存多久

这要看你们实验室的保存条件是什么!一般情况下将反转录产物稀释一部分放置-20℃用于日常实验,这部分面临的就是不停的冻融,它的保存时间一般也就2个月左右吧!另一部分剩余的cDNA可以保存在-80℃,它放置几年都没有问题!希望我的解释对你有帮助!

反转录后的cDNA能保存多久

这要看你们实验室的保存条件是什么!一般情况下将反转录产物稀释一部分放置-20℃用于日常实验,这部分面临的就是不停的冻融,它的保存时间一般也就2个月左右吧!另一部分剩余的cDNA可以保存在-80℃,它放置几年都没有问题

BAC文库构建方法与技巧

  基因组DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。   一、分离基因组DNA

BAC文库构建方法与技巧

基因组DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。一、分离基因组DNA(gDNA)

BAC文库构建方法与技巧

  基因组DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。   一、分离基因组DNA

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

一次双向消减,需要总量为 2ug 的基因组 DNA 或 cDNA。大多数分离 RNA 和基因组DNA 的方法都适用于本实验(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚仪器、耗材 热循环仪水浴箱琼脂糖凝胶电泳所需的试剂与设备实验步骤 第1阶段:RNA和DNA的分离一次双向消减,需要总量为2ug的基因组DNA或cDNA。大多数分离RNA和基因组DNA的方法都适用于本实验(Sambrooketal

消减-cDNA-或基因组-DNA-文库的制备实验

            试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 仪器、耗材

cDNA文库组标准流程六:电转化流程

1.电转化感受态细胞的制备1.      用枪头挑取单克隆菌落,投入盛有10ml LB液体培养基的50ml离心管中。(同时做培养基和枪头的空白对照)2.      37℃,220rpm,培养14-16个小时。3.      第二天,以1:100的比例将这10ml菌液倒入1000ml LB液体培养基中

cDNA文库组标准流程四:载体制备

1.pBlueScriptII的提取1.取1ul商品的pBlueScriptII,转化入大肠杆菌宿主菌中,取5ul转化产物均匀涂布在含AMP的LB平板上,37℃培养过夜。2.第二天取一只无菌的50ml离心管,加入10ml AMP抗性的LB液体培养基,挑单克隆于离心管中,37℃,250rpm,培养过夜

人VL基因文库(genomic-library)的构建

[器材和试剂] ● PCR试剂和设备 ● cFv基因文库单链模板DNA,制备自pHENl中的天然scFv文库(10ng/u1) ● Gelleclean试剂盒(Qbiogene) ● Wtzard PCR纯化试剂盒(ProlneSa) ● RJHl/2Xho引物: 5'-GGC ACC CT

基因组DNA文库构建的基本流程

基因组  DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。 一、分离基因组DN

反转录合成单链-cDNA-实验

cDNA 合成反应的体积,依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案,适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合,调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNART主体混合液仪器、耗材薄壁PCR管离心管

反转录合成单链-cDNA-实验

            试剂、试剂盒 RNA RT主体混合液 仪器、耗材 薄壁PCR管 离心管 热循环仪

反转录合成单链-cDNA-实验

试剂、试剂盒 RNART主体混合液仪器、耗材 薄壁PCR管离心管热循环仪实验步骤 一、材料1.核酸和寡核苷酸来自方案2的RNA为每个单独的H-T11M引物,分别配制RT主体混合液蒸馏水                                28.2ul5XRT缓冲液            

构建人VH基因节段文库

构建人VH基因节段文库[器材和试剂]● PCR试剂和设备● 自pHENl中天然scFv文库制备的scFv基因文库模板DNA(单链和双链DNA 10ng/ul)● Genecle&n试剂盒(Qbiogene)● PVH3FoR1引物: 5'-TCG CGC GCA GTA ATA CAC GG

cDNA文库组标准流程七:快速鉴定、菌落PCR

1.质粒快速鉴定  试剂:Protoplasting buffer:30mM Tris-HCl, pH8.0                   0.33ml/1.0M      5mM EDTA                               0.1ml/0.5M      50mM

片段化处理mRNA纯化手法的思路

mRNA纯化之后的文库构建通常有两种思路,一种是先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化,另外一种则是先将mRNA打断,再结合随机引物进行反转录。 1.先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化:此方法先得到长片段的cDNA,反转成双链cDNA之后再利用

真核表达文库的构建与筛选实验

            实验材料 宿主细胞 质粒或λ噬菌体表达载体 包装提取物 电转化感受态大肠杆菌 试剂、试剂盒

真核表达文库的构建与筛选实验

实验材料 宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体包装提取物电转化感受态大肠杆菌试剂、试剂盒 限制性内切核酸酶缓冲液限制性内切核酸酶通过 poly(A)+富集的 mRNAcDNA 文库含适当抗生素的 Terrific 球脂平板含适当抗生素的 Terrific 肉汤培养基仪器、耗材 cDNA 合成试剂盒实验步骤

真核表达文库的构建与筛选实验

类似方案 1、方案 2 描述了在真核表达载体上进行 cDNA 文库构建与筛选的方法, 流程分为以下两个阶段:1. 在真核表达载体上构建 cDNA 文库;2. 在真核表达载体上构建的 cDNA 文库的筛选。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体

DNA文库构建和Illumina测序化学原理

单细胞测序方法和原理系列:所谓DNA文库,实际上是许多个DNA片段,在两端接上了特定的DNA接头,形成的DNA混合物。文库有2个特点:1. 当中这一段插入的DNA,它的序列是各种各样的。2. 它的两头的街头序列,是人工特异加上去的,是已知的。要构建文库,首先需要把基因组DNA用超声波打断,之后把两端

单域抗体|纳米抗体|VHH文库构建

单域抗体,也称为VHH(Variable domain of heavy chain of HCAb)抗体或纳米抗体,是一种小型抗体分子。与传统抗体相比,VHH具有更小的分子尺寸、更高的稳定性和更易于工程化的特点,具有广泛的生物医学应用潜力。单域抗体文库的构建是开发和优化这些抗体的关键步骤之一。 一

筛选质粒载体构建表达文库实验

            试剂、试剂盒 封闭缓冲液 氯仿 裂解缓冲液 检测抗原-抗体复合物所用试剂 SM TNT 缓冲液 洗涤缓冲液