片段化处理mRNA纯化手法的思路

mRNA纯化之后的文库构建通常有两种思路,一种是先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化,另外一种则是先将mRNA打断,再结合随机引物进行反转录。 1.先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化:此方法先得到长片段的cDNA,反转成双链cDNA之后再利用DNA片段化的方法进行片段化(酶切法或机械法),得到片段化dsDNA之后的建库方法与DNA建库方法完全一致。 2.先将mRNA打断,再结合随机引物进行反转录:此方法中的mRNA打断方法包括碱处理法、金属离子(Mg2+、Zn2+)溶液处理法、酶(RNaseIII)处理法,mRNA片段化之后应立即进行一链cDNA合成,因为mRNA在该体系下非常容易降解。选择金属离子(Mg2+、Zn2+)溶液处理法打断时需根据需要的文库片段大小选择合适的打断温度和时间。(一般设置为150-200bp 94°C,15 min; 200......阅读全文

片段化处理mRNA纯化手法的思路

mRNA纯化之后的文库构建通常有两种思路,一种是先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化,另外一种则是先将mRNA打断,再结合随机引物进行反转录。 1.先用oligo(dT)引物反转录mRNA,再进行cDNA的片段化:此方法先得到长片段的cDNA,反转成双链cDNA之后再利用

mRNA的纯化

实验概要本文介绍了mRNA的纯化方法。实验原理mRNA的分离方法较多,其中以寡聚(dT)-纤维素柱层析法最为有效,已成为常规方法。此法利用mRNA  3‘末端含有Poly(A  )的特点,在RNA流经寡聚(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲液的作用下,mRNA被特异地结合在柱上,当逐渐降低盐的浓度时或在低

mRNA提取、分离纯化

从真核生物的组织或细胞中提取mRNA,通过酶促反应逆转录合成cDNA的第一链和第二链,将双链cDNA和载体连接,然后转化扩增, 即可获得cDNA文库,构建的cDNA文库可用于真核生物基因的结构、表达和调控的分析;比较cDNA和相应基因组DNA序列差异可确定内含子存在和了解转录后加工等一系列问题。总之

DNA片段回收与纯化

    质粒、噬菌体等经酶切,电泳;PCR产物经电泳后,常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化,用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等,也有现成的试剂盒供应。一、冻融法1.  紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条,将切下的胶条(小于0.6g)捣碎,置于

mRNA的分离与纯化

[实验原理]真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或

mRNA的分离与纯化

 真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)

mRNA的分离与纯化

实验概要mRNA的分离与纯化实验原理  真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性

微量柱法纯化DNA片段

实验概要目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术,回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。目前待回收的片断主要有酶切片断和各种PCR片断;回收的介质主要有琼脂糖和PAGE;回收的方法主要有树脂回收、微量柱回收、玻璃奶回收、液氮冻冻融回收及透析袋大量回收等,下面分别介绍树脂、微量柱及液氮冻冻融回收

DNA小片段的纯化回收

DNA 电泳小于100bp的片断通常在电泳时就比较难观察分辨,需要用分辨率很高的琼脂糖或者丙烯酰胺凝胶。比如Cambrex的NuSieve 3:1或者GTG,或者是大名鼎鼎的MetaPhor琼脂糖。所以实际上对于小片断,可以分为两种情况:一个是真的要回收电泳中特别小的片断,这种情况我们前面有提到,比

mRNA的提取及纯化实验

磁珠法 亲和柱层析法 亲和柱层析法             实验材料 mRNA

mRNA的提取及纯化实验

实验材料 mRNA试剂、试剂盒 mRNA分离试剂盒异丙醇NaAC仪器、耗材 仪器水浴离心机取液器分光光度计实验步骤 一、生物素标记的Oligo(dT)探针与mRNA的煺火1.  在DEPC处理过的1.5 ml Eppendof管中,加入0.2-1 mg 的总RNA和无RNase的水至终体积为0.5

制备和纯化-mRNA-显示蛋白实验

实验方法原理 实验材料 DNA 库不含甲硫氨酸的翻译混合物试剂、试剂盒 MgCl2核苷三磷酸溶液转录缓冲液去离子超滤水T7 RNA 聚合酶固体 EDTA尿素缓冲液NaCl乙醇EDTAATPT4 多核苷酸激酶缓冲液T4 多核苷酸激酶T4 DNA 连接酶缓冲液T4 DNA 连接酶乙酸钾溶液兔网织

mRNA的分离和纯化实验(二)

(三) mRNA的分离1、mRNA与Oligo(dT)-纤维素结合:用移液器重新悬浮oligo(dT)-纤维素,取适量的oligo(dT)-纤维素到RNA样品中,盖上盖子,颠倒数次将oligo(dT)-纤维素与RNA混匀。于37℃水浴保温并温和摇荡15min。oligo(dT)-纤维素与RNA所需量

mRNA的分离和纯化实验(一)

实验原理从细胞或组织中得到RNA是一种混合物,其中包括tRNA,rRNA和mRNA,其中RNA为75%~ 85%,tRNA占10%~16%,而mRNA仅占1%~5%,并且mRNA基因序列不同,分子量大小不均一,各基因的表达丰度也不一样。每克细胞可分离出5-10mg RNA。真核生物mRNA具

信使RNA的mRNA提取分离纯化

真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取 ,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)

制备和纯化-mRNA-显示蛋白实验

基本方案             实验方法原理 实验材料 DNA 库 不含甲硫氨酸的翻译混合物

知识分享:mRNA的分离和纯化

  实验原理   从细胞或组织中得到RNA是一种混合物,其中包括tRNA,rRNA和mRNA,其中RNA为75%~ 85%,tRNA占10%~16%,而mRNA仅占1%~5%,并且mRNA基因序列不同,分子量大小不均一,各基因的表达丰度也不一样。每克细胞可分离出5-10mg RNA。   真核生

制备和纯化-mRNA-显示蛋白实验

实验材料DNA 库不含甲硫氨酸的翻译混合物试剂、试剂盒MgCl2核苷三磷酸溶液转录缓冲液去离子超滤水T7 RNA 聚合酶固体 EDTA尿素缓冲液NaCl乙醇EDTAATPT4 多核苷酸激酶缓冲液T4 多核苷酸激酶T4 DNA 连接酶缓冲液T4 DNA 连接酶乙酸钾溶液兔网织红细胞裂解物翻译试剂盒氯化

寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA

实验概要本实验介绍了寡聚(dT)-纤维素柱层析法纯化mRNA。此法利用mRNA 3’末端含有Poly(A )的特点,在RNA流经寡聚(dT)纤维素柱时,在高盐缓冲液的作用下,mRNA被特异地结合在柱上,当逐渐降低盐的浓度时或在低盐溶液和蒸馏水的情况下,mRNA被洗脱,经过两次寡聚(dT)纤维柱后,即

DNA片段纯化与回收常见问题分析

Q:利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段?A:可能有以下几个原因:   1. 胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解;   2. 胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收;   3. 电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适

mRNA的提取及纯化实验——磁珠法

真核细胞的mRAN是单顺反子,其最显著的特征是具有5‘'端帽子结构和3'端的poly A的结构,此poly A结构为mRNA的提取提供了有效的途径。实验材料mRNA试剂、试剂盒mRNA分离试剂盒异丙醇NaAC仪器、耗材仪器水浴离心机取液器分光光度计实验步骤一、生物素标记的Oligo(

从琼脂糖凝胶中纯化-PCR-片段实验

            试剂、试剂盒 乙醇 溴化乙锭 电泳缓冲液 PCR 片段 琼脂糖凝胶 细胞和组织

从琼脂糖凝胶中纯化-PCR-片段实验

Wizard SV 胶和 PCR 纯化系统是利用硅基法从琼脂糖凝胶中或从 PCR 扩增反应混合物中直接纯化 PCR 片段的方法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇溴化乙锭电泳缓冲液PCR 片段琼脂糖凝胶细胞和组织仪器、耗材微量离心管解剖刀紫外灯真空装置实验

从琼脂糖凝胶中纯化-PCR-片段实验

试剂、试剂盒 乙醇溴化乙锭电泳缓冲液PCR 片段琼脂糖凝胶细胞和组织仪器、耗材 微量离心管解剖刀紫外灯真空装置实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂(1)乙酵(95%)(2)嵌入染料,如溴化乙锭(3)TAE 电泳缓冲液         40 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷-醋酸盐,pH8.2 

片段化酶的基本信息

中文名称片段化酶英文名称fragmentin定  义在细胞毒性T细胞和NK细胞中发现的丝氨酸蛋白酶。能在肽链的天冬氨酸位点进行切割。T细胞与NK细胞能杀伤其靶细胞是该酶与穿孔蛋白协同作用的结果。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

片段化酶的基本信息

中文名称片段化酶英文名称fragmentin定  义在细胞毒性T细胞和NK细胞中发现的丝氨酸蛋白酶。能在肽链的天冬氨酸位点进行切割。T细胞与NK细胞能杀伤其靶细胞是该酶与穿孔蛋白协同作用的结果。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

染色体DNA的片段化

实验概要琼脂糖(agarose)或聚丙烯酰胺(PAGE)电泳是分离、鉴定和纯化DNA的标准方法。琼脂糖凝胶的分辨率比聚丙烯酰胺电泳低,但分离范围广,可以分离200 bp一50 kb的DNA。细胞凋亡时染色体从核小体间断裂形成大小为180-200bp整数倍的片段,在琼脂糖凝胶中电泳后可呈现出规

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

            实验材料 mRNA 显示蛋白翻译反应产物 试剂、试剂盒 Oligo 纤维素 Oligo(dT)结合缓冲液

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

实验材料 mRNA 显示蛋白翻译反应产物试剂、试剂盒 Oligo 纤维素Oligo(dT)结合缓冲液Oligo 洗涤缓冲液Ni-NTA 琼脂糖NI-NTA 结合缓冲液Ni-NTA 洗脱缓冲液鲑精 DNABSADNA splintSuperscript Ⅱ 逆转录酶缓冲液DTT脱氧核苷三磷酸S

mRNA-显示蛋白的纯化和逆转录实验

实验材料mRNA 显示蛋白翻译反应产物试剂、试剂盒Oligo 纤维素Oligo(dT)结合缓冲液Oligo 洗涤缓冲液Ni-NTA 琼脂糖NI-NTA 结合缓冲液Ni-NTA 洗脱缓冲液鲑精 DNABSADNA splintSuperscript Ⅱ 逆转录酶缓冲液DTT脱氧核苷三磷酸Supersc