影响PCR及荧光PCR的因素
引物的设计和选择符合荧光PCR的探针并进行设计对于实时荧光PCR尤其重要。可以说,不合理的设计意味着绝对的失败。但是,好的设计并不等于好的实验结果,影响PCR和荧光PCR的因素非常多,下面择其重要进行介绍。 3.1 引物退火温度 引物的一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度。Tm对于设定PCR退火温度是必需的。在理想状态下,退火温度足够低,以保证引物同目的序列有效退火,同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般设定比引物的Tm低5℃。 设定Tm有几种公式。确定引物Tm最可信的方法是近邻分析法。大部分计算机程序使用近邻分析法——从序列一级结构和相邻碱基的特性预测引物的杂交稳定性。所有oligo软件会自动计算引物的Tm值。在设置退火温度时可以如......阅读全文
影响PCR及荧光PCR-的因素
引物的设计和选择符合荧光PCR的探针并进行设计对于实时荧光PCR尤其重要。可以说,不合理的设计意味着绝对的失败。但是,好的设计并不等于好的实验结果,影响PCR和荧光PCR的因素非常多,下面择其重要进行介绍。 3.1 引物退火温度 引物的一个重要参数是熔解温度(Tm)。这是当50%的
PCR仪选购的影响因素
在选购基础PCR仪时应该注意的几个关键参数: 对于 选购PCR 仪 来说升降温速率、温控准确性及范围、样本容量及热盖功能等无疑是用户zui为关心的几个关键参数,下面我们就以 领成TCG5基础型PCR仪的相关参数作一说明。 1、zui大(升/降)温速率 :升温速率4℃/s,降温速率3℃/s。
PCR仪选购的影响因素
在选购基础PCR仪时应该注意的几个关键参数: 对于 选购PCR 仪 来说升降温速率、温控准确性及范围、样本容量及热盖功能等无疑是用户zui为关心的几个关键参数,下面我们就以 领成TCG5基础型PCR仪的相关参数作一说明。 1、zui大(升/降)温速率 :升温速率4℃/s,降温速率3℃/s
PCR仪选购的影响因素
在选购基础PCR仪时应该注意的几个关键参数: 对于 选购PCR 仪 来说升降温速率、温控准确性及范围、样本容量及热盖功能等无疑是用户zui为关心的几个关键参数,下面我们就以 领成TCG5基础型PCR仪的相关参数作一说明。 1、zui大(升/降)温速率 :升温速率4℃/s,降温速率3℃/s。
荧光定量PCR检查的影响
1.实时荧光定量PCR无需内标实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品Ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。因此,实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的: 1)Ct值的重现性PCR循
荧光定量PCR检测HBV-DNA准确性的影响因素及解决措施
现在国内多数三级医院都用自动荧光聚合酶链式反应(PCR)扩增仪检测乙型肝炎病毒(HBV)DNA。但在临床实践中发现,不同仪器之间检测结果差异较大。这对在同一医院用同一台仪器检测结果的意义影响不大,但在不同医院用不同仪器检测的结果如果存在差异,则会使医师难以判断患者检测指标的准确意义,从而使患者不得不
PCR检测质量的控制方法及影响因素分析
PCR检测质量的控制是一个系统工程,总体上涉及三个方面:一是试验仪器;二是试验试剂与耗材;三是人员操作。任何一个方面出现问题,都会影响PCR检测质量。 一、试验仪器 PCR仪和紫外凝胶成像系统(紫外分析仪或手提紫外等)以及移液器都可能影响PCR检测的质量。PCR仪是控制PCR反应温度变化的,
影响PCR的主要因素
PCR技术必须有人工合成的合理引物和提取的样品DNA,然后才进行自动热循环,最后进行产物鉴定与分析。引物设计与合成目前只能在少数技术力量较强的研究院、所进行,临床应用只需购买PCR检测试剂盒就可开展工作,PCR自动热循环中影响因素很多,对不同的DNA样品,PCR反应中各种成份加入量和温度循环参数均不
影响PCR特异性的因素
①退火步骤的严格性:提高退火温度可以减少不匹配的杂交,从而提高特异性。 ②减短退火时间及延伸时间可以减少错误引发及错误延伸。 ③引物二聚体是最常见的副产品,降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发,尤其是引物的二聚化。 ④改变MgCl2(有时KCl)浓度可以改进特异性,这可能是提高反应严格性或
影响pcr反应的因素有哪些
1.模板纯度,有较多蛋白或其他杂质时,会一定程度影响pcr效率;2.模板量,过高的模板量反而会降低pcr效率和特异性;3.引物,引物的长度需要再效率和特异性间获得优化,其次要控制引物gc含量;4.聚合酶,要考虑酶的保真率和速度;5.mg离子浓度,mg离子浓度过高会降低特异性,浓度过低会降低效率;6.
RTPCR的影响因素介绍
RT-PCR反应受多个因素影响,如硫酸镁的浓度, 引物退火的温度,扩增的循环数等。1、建议选择0.5-3.0 mM (相差0.5 mM)的硫酸镁作初步实验。2、对于具有较高Tm的引物,增加退火和延伸时的温度对反应有利。较高的温度有利于减少非特异的引物结合,因而提高特异产物的得率。3、大多数目标RNA
RTPCR技术的影响因素
(一)组织或细胞样本不是每种组织或细胞都表达所有的基因,即某些基因的mRNA不存在于某些组织或细胞中。因此,确定所选用的材料中是否含有需扩增的目标mRNA模板是实验成败的关键。(二)引物合成cDNA第一条链时,引物可用随机6聚核苷酸,或下游引物,或poly(dT),其中以6聚核苷酸的随机引物效果最好
普通PCR-梯度PCR-荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR:即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),利用DNA在体外95℃时解旋(变性),55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合(退火),再调温度至72℃左右,DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链(延伸)。PCR仪实际就是一个温控设
普通PCR-梯度PCR-荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR:即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),利用DNA在体外95℃时解旋(变性),55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合(退火),再调温度至72℃左右,DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链(延伸)。PCR仪实际就是一个温控
影响PCR反应的外部因素有哪些?
SDS:离子去污剂,0.01%即可完全抑制PCR反应,0.005%可显著降低产量 苯酚:0.5%即可完全抑制PCR反应,0.2%可显著降低产量 乙醇:大于1%的浓度可抑制PCR反应,但在某些体系里又能增加产量 异丙醇:抑制作用比乙醇稍强 乙酸钠:大于5mM时抑制PCR反应
影响PCR反应的内部因素有哪些?
引物:PCR引物设计是整个反应体系最重要的部分,也是决定一个PCR反应特异性的关键,引物在设计时要遵守一定的原则(长度、扩增跨度、碱基等)。 酶及其浓度:目前有两种Taq DNA聚合酶,一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠杆菌合成的基因工程酶,酶浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低
普通PCR梯度PCR-原位PCR-荧光定量PCR仪的区别
普通PCR仪: 一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。如;(ABI 2720) 梯度PCR仪: 一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称
荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法
接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法,我们如何选择合适的方法?荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类,特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物;而非特异性检测方法是在在PCR反
实时荧光定量PCR(realtime-PCR)
实验方法原理 实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 实验材料
实时荧光定量PCR(realtime-PCR)
实验步骤一、 样品RNA的抽提 1. 取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。2. 两相分离 每1 ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12 000 rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的
实时荧光定量PCR(realtime-PCR)
实验材料 细胞样品试剂、试剂盒 RNA提取试剂盒荧光定量PCR MixTRIZOLdNTP氯仿逆转录酶MMLV异丙醇Taq酶DEPC水ddH2OTEMgCl2琼脂糖溴化乙锭MOPS甲醛乙酸钠EDTAEB溴酚兰仪器、耗材 离心管离心机风光光度计电泳槽凝胶板Realtime PCR仪实验步骤 一、 样品
影响PCR仪器温度控制性能的因素
一、PCR仪器之间的差别对实验结果的影响。如前所述,没有任何两台PCR仪器的温度控制是一模一样的。相对于预设的温度模块温度总是偏高或偏低,就是同一模块不同的孔之间,温度有时也会不一样,相差可能达几摄氏度之多。一些PCR仪温度控制性能的不足造成的后果是:当PCR仪的模块温度在升温时,温度过冲或不足,不
PCR仪器温度控制性能的影响因素
一、PCR仪器之间的差别对实验结果的影响。如前所述,没有任何两台PCR仪器的温度控制是一模一样的。相对于预设的温度模块温度总是偏高或偏低,就是同一模块不同的孔之间,温度有时也会不一样,相差可能达几摄氏度之多。一些PCR仪温度控制性能的不足造成的后果是:当PCR仪的模块温度在升温时,温度过冲或不足,
PCR仪器温度控制性能的影响因素
一、PCR仪器之间的差别对实验结果的影响。如前所述,没有任何两台PCR仪器的温度控制是一模一样的。相对于预设的温度模块温度总是偏高或偏低,就是同一模块不同的孔之间,温度有时也会不一样,相差可能达几摄氏度之多。一些PCR仪温度控制性能的不足造成的后果是:当PCR仪的模块温度在升温时,温度过冲或不
影响PCR仪器温度控制性能的因素
PCR是分子生物学领域的关键技术。温度的准确性对于PCR仪来说很重要。 影响PCR仪器温度控制性能主要有四种因素: 1.PCR仪器之间的差别对实验结果的影响: 没有任何两台PCR仪器的温度控制是一模一样的。相对于预设的温度模块温度总是偏高或偏低,就是同一模块不同的孔之间,温度有时也会不一样,
影响PCR仪器温度控制性能的因素
PCR是分子生物学领域的关键技术。温度的准确性对于PCR仪来说很重要。 影响PCR仪器温度控制性能主要有四种因素: 1.PCR仪器之间的差别对实验结果的影响: 没有任何两台PCR仪器的温度控制是一模一样的。相对于预设的温度模块温度总是偏高或偏低,就是同一模块不同的孔之间,温度有时也会不一样
实时荧光定量pcr仪的PCR优势
样品到达域值水平所经历的循环数称为Ct值(限制点的循环数)。域值应设定在使指数期的扩增效率为最大,这样可以获得最准确,可重复性的数据。如果同时扩增的还有标有相应浓度的标准品,线性回归分析将产生一条标准曲线,可以用来计算未知样品的浓度。
荧光定量PCR
荧光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR,RTFQ PCR) 是1996 年由美国Applied Biosystems 公司推出的一种新定量试验技术,它是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结
荧光PCR原理
1.荧光染料荧光基团通常各自拥有单一的光吸收峰。在光的刺激下,荧光基团吸收光的能量后通常以三种方式释放出能量:1) 光能 许多荧光基团吸收光能后仍旧以光能形式释放能量,并且发射光的峰值大于吸收峰。比如荧光染料Fam的光吸收峰为490nm,而发射峰为530nm。 2) 热能 某些荧光基团吸收光能后,能
实时荧光定量PCR仪【实时荧光定量PCR仪】
【FT-PCR】实时荧光定量PCR仪【实时荧光定量PCR仪】_风途厂家_Kgaoletšo ya dikarolo tše bopago seswantšho tša kgole ya PCR 具体来讲扑杀无害化处理染疫动物,禁止泔水饲喂生猪,加强生猪养殖运输屠宰等各个环节的清洗和消毒,包括养