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如何进行兽医检测荧光定量PCR实验?

实时荧光定量PCR技术(real-time fluorescent quantitative PCR,后文简称qPCR)作为目前核酸检测和定量中最主要的分子生物学工具之一,以其特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、自动化程度高、速度快等多个优点在疾病快速检测、食品安全检测、靶向用药基因检测等多种应用领域中一直发挥着巨大的作用。 自2018年8月起,国内爆发非洲猪瘟疫情,非洲猪瘟具有多种表现形式,最常见的是急性发病形式,相关致死率高达 100%。非洲猪瘟严重威胁着养猪业的健康生产和相关供应链的发展,但目前还不存在有效的疫苗或治疗方法,专业人员意识到仅靠传统的临床症状判断,并不能有效的控制疫情,人们的目光越来越多的集中到了具有准确、灵敏、快速等优势的实时荧光定量PCR技术。 qPCR作为一项成熟的实验技术,实验操作看起来也并不复杂,但知易行难......阅读全文

如何进行兽医检测荧光定量PCR实验?

实时荧光定量PCR技术(real-time fluorescent quantitative PCR,后文简称qPCR)作为目前核酸检测和定量中最主要的分子生物学工具之一,以其特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、自动化程度高、速度快等多个优点在疾病快速检测、食品安全检测、靶向用药基因检测等多种应

如何做好荧光定量PCR实验

荧光定量PCR实验指南 一、基本步骤: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对; 2、引物、探针的设计; 3、引物探针的合成; 4、反应体系的配制; 5、反应条件的设定; 6、反应体系和条件的优化; 7、荧光曲线和数据分析;

如何做好荧光定量PCR实验

荧光定量PCR实验指南一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键:1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;从

荧光定量PCR实验时,荧光基团如何选择?

 原则一    每个反应只检测一个基因的,方法就比较简单,对5’端荧光基团的选择以及3’端淬灭基团的选择余地都是比较大的。比如5’-FAM  +  3’-BHQ,就是比较常见的方案。    下表为常用荧光染料(基团)的颜色及波长参数,供参考。        原则二    如果在每个反应中要检测的目的

核酸检测实验室如何评价荧光定量PCR仪!

  荧光定量PCR的检测是一系列从采样、保存运输、样品处理、核酸提取、扩增等一系列流程的组合,任何一个环节出现问题都会导致最终结果的错误。虽然在前面一系列的文章中讲述了提取试剂、扩增试剂的评价但是这些仍远远不够,因此我在后续的文章中会尽可能覆盖到所有的检测环节。  荧光定量PCR的检测离不开荧光定量

如何做好荧光定量PCR实验?(六)

其他问题:1)、文献上找到的引物和探针序列能否直接使用?通常国外的文献可信度比较高,可直接使用;但为了保险起见,最好用blast对引物探针的序列进行必要的验证;或者再进一步用primer软件对引物探针的二级结构和退火温度进行分析,这样更有利于您对整个实验的把握。2)、在实验之前要进行哪些准备工作?首

如何做好荧光定量PCR实验?(一)

荧光定量PCR实验指南一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备;二、技术关键: 1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;从h

如何做好荧光定量PCR实验?(五)

5、反应体系配制:ð  A2010A0101试剂盒:(探针体系)FQ-PCR MasterMix-UNG混合物(2X) 25ul(终浓度为1×);上游引物(终浓度为50~900nM),下游引物(终浓度为50~900nM);探针(终浓度为200nM);待检样品 5ul(终浓度为10~100ng);无菌

如何做好荧光定量PCR实验?(三)

3.3 引物、探针的纯度和稳定性定制引物的标准纯度对于大多数PCR应用是足够的。部分应用需要纯化,以除去在合成过程中的任何非全长序列。这些截断序列的产生是因为DNA合成化学的效率不是100%。这是个循环过程,在每个碱基加入时使用重复化学反应,使DNA从3'到5'合成。在任何一个循环都

如何做好荧光定量PCR实验?(四)

3.7 模板浓度起始模板的量对于获得高产量很重要。对大多数PCR扩增和荧光PCR扩增,104到106个起始目的分子就足以观测到好的荧光曲线(或在溴化乙锭染色胶上观察到)。所需的最佳模板量取决于基因组的大小(下表)。举例说,100ng到1μg的人类基因组DNA,相当于3×104到3×105个分子,足以

如何做好荧光定量PCR实验?(二)

2.4 实时多重PCR探针的选择:多重实时PCR的多种含意有两种:一为选择保守的探针和引物,利用不同的染料标记探针,在检测时可根据荧光的颜色来判定不同的产物。另一种为选择保守的引物,扩增不同长度的目的片段,反应中加入SYBRN染料,最后根据不同目的片段的Tm值来判定不同的物品。多重实时PCR的荧光探

使用荧光定量PCR方法进行核酸检测的步骤

进行核酸检验,需要经过取样、留样、留存、核酸提取、上机检测五个步骤。    核酸检测的第一步就是采集人体分泌物,用鼻试子或咽试子擦拭鼻腔或咽后壁及双侧咽扁桃体处。    第二步医务人员进行留样,将试子头浸入细胞保存液中,折断尾部后立即旋紧管盖。    第三部要将样本放入密闭袋中,保存好并及时送检。 

荧光定量PCR实验步骤

  1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)  1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。  2)取100mg组织,加入到匀浆器中。  3)充分研磨直至无可见组织块。  4)12000rpm离心10min取上清。  5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管

荧光定量PCR检测方法

  所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。  检测方法  1.SYBRGreenⅠ法:  在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信

如何选择荧光定量PCR仪?

荧光定量PCR 因操作方便、运行速度快、实验结果准确,受到越来越多的分子生物学研究者青睐。在实验技术成熟的今天,也许对你来说,最难得不是实验技术上的问题——而是选择哪一种荧光定量PCR仪——你要征询实验室成员的意见、分析实验室目前乃至将来的需求、平衡实验室的预算,更要详细研究各种极富诱惑力的宣传

荧光定量PCR实验指南-1

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备; 二、技术关键: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;

荧光定量PCR实验设计

 设置对照组:荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。对照组是实验的监控系统,监测实验是否有存在异常,也是排除实验异常关键所在;实验对照设置: 通常有阳性对照,阴性对照组等。      具体可根据实验类型进行对照组的设置;对

荧光定量PCR具体实验步骤

荧光定量PCR具体实验步骤,1 样品RNA的抽提①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色

荧光定量PCR实验指南-2

2.3TaqmanMGB探针设计介绍MGB探针的优点:²MGB探针较短(14-20bp),更容易找到所有排序序列的较短片段的保守区。²短片段探针(14-20bp)加上MGB 后,Tm值将提高10℃,更容易达到荧光探针Tm值的要求。²MGB探针的设计原则²探针的5’端避免出现G,即使探针水解为单个碱基

荧光定量PCR实验指南-5

您可以选择荧光染料SYBGREEN体系,具体请参照说明书。您可灵活使用20-50ul间其他体积,注意保证终浓度相同。A2010A0106试剂盒:反应体系终浓度(自配热启动荧光系统):1-2U的hotstartTaq酶、3-5.5mM的Mg2+ 、0.2mM的dNTPs、1×PCRbuffer(A

荧光定量PCR实验指南-3

3.3 引物、探针的纯度和稳定性定制引物的标准纯度对于大多数PCR应用是足够的。部分应用需要纯化,以除去在合成过程中的任何非全长序列。这些截断序列的产生是因为DNA合成化学的效率不是100%。这是个循环过程,在每个碱基加入时使用重复化学反应,使DNA从3'到5'合成。在任何一个循环都

荧光定量PCR实验指南-4

3.8 防止残余(Carry-over)污染PCR易受污染的影响,因为它是一种敏感的扩增技术。小量的外源DNA污染可以与目的模板一块被扩增。当前一次扩增产物用来进行新的扩增反应时,会发生共同来源的污染。这称之为残余污染。从其他样品中纯化的DNA或克隆的DNA也会是污染源(非残余污染)。可以在PCR过

荧光定量PCR实验基本步骤

1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;    4、反应体系的配制;    5、反应条件的设定;    6、反应体系和条件的优化;    7、荧光曲线和数据分析;    8、标准品的制备;

荧光定量PCR检测流程

荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。    

如何做实时荧光定量 PCR (realtime PCR)

  标签: 实时 荧光定量 PCR realtime PCR 本生生物   所谓实时荧光定量 PCR 技术,是指在 PCR 反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个 PCR 进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。   原理及材料:   实验材料:细胞样品   试剂、

如何看荧光定量PCR的结果

按公式计算:对照组-ΔΔCt =对照组(Ct 目的基因-Ct 内参基因)-对照组(Ct 目的基因-Ct 内参基因)

如何看荧光定量PCR的结果

按公式计算:对照组-ΔΔCt =对照组(Ct 目的基因-Ct 内参基因)-对照组(Ct 目的基因-Ct 内参基因)

实时荧光定量pcr数据如何统计

首先你这样做出来的统计没有意义。应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR。如果3次试验,每次重复3次(取平均值算一次)。然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样(都是15),而TNF的CT值对照组是20,而模型组是19,则相对量是2(对照组为1)。△△ct

荧光定量PCR体系如何加样?

 PCR反应体系中,各试剂加样量是如何确定的,DNA模板怎么提取,PCR体系。这个小小管子里都有什么东西、需要加多少呢?今天一起来看一下关于PCR体系的加样各种问题。    关于体系    PCR技术问世于上世纪80年代。问世之初的PCR体系比较大,动辄以毫升计。现在的PCR体系要精巧多了,总体积可

荧光定量PCR

  荧光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR,RTFQ PCR) 是1996 年由美国Applied Biosystems 公司推出的一种新定量试验技术,它是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结