易错聚合酶链反应的方法及应用介绍

中文名称易错聚合酶链反应英文名称error-prone PCR定 义应用低保真度DNA聚合酶,并选择适当的反应条件,提高PCR反应中的碱基错配率,由此得到含有随机突变的PCR产物,可以克隆入表达载体,构建随机突变的DNA文库的一种使DNA随机突变的技术。能用于体外分子定向进化、基因或DNA序列功能的研究、筛选得到经突变改良的蛋白质等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)......阅读全文

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的操作程序介绍

  过去标准的基因扩增技术—聚合酶链反应操作程序是将PCR必需反应成份分别加入一微量离心管中,然后置于一定的循环参数条件下进行循环扩增。具体如下:  (1)向一微量离心管中依次加入  DNA模板 102-105拷贝  引物  各1μmol/L  dNTP  各200μmol/L  10×PCR缓冲液

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的特异性介绍

  首次报导的基因扩增技术—聚合酶链反应所用的DNA聚合酶是大肠杆菌的DNAPolymerase I的Klenow大片段,其酶活性在90℃会变性失活,需每次PCR循环都要重新加入Klenow大片段,同时引物是在37℃延伸(聚合)易产生模板—引物之间的碱基错配、致特异性较差,1988年Saiki等从温

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的凝胶电泳介绍

  基因扩增技术—聚合酶链反应产物可通过琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,以前者最常用,通过电泳可以判断扩增产物的大小。在临床检测中,仅通过凝胶电泳判断扩增片段大小即可满足检测的需要。通常制胶方法为100mlTBE加1.5g琼脂糖在微波锅内溶解,稍冷后倒入电泳槽。  电泳后,用溴化乙淀染色20mi

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的缓冲液介绍

  基因扩增技术—聚合酶链反应反应的缓冲液的目的是给Taq DNA聚合酶提供一个最适酶催反应条件。目前最为常用的缓冲体系为10-50mmol/L  Tris-HCl (pH8.3-8.8,20℃) Tris是一种双极性离子缓冲液,20℃时其pKa值为8.3,△pKa值为-0.021/℃。因此,20m

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的微孔板夹心的介绍

  基因扩增技术—聚合酶链反应是通过一固定于微孔板的捕获探针与PCR产物的某一区域特异杂交使产物间接地固定于微孔板上。然后,再用一生物素等非放射性标记物标记的检测探针与产物的另一区域杂交,漂洗后显色即可判断结果,该法需要两个杂交过程来检测一个产物,因此,其特异性较一次杂交的检测法高。该法已用于HBV

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的条件模板核酸的介绍

  基因扩增技术—聚合酶链反应可以以DNA或RNA为模板进行核酸的体外扩增。不过RNA的扩增首先逆转录成cDNA后才能进行PCR循环。不同来源的核酸标本必须经处理后才能用于PCR的扩增,处理不当或处理过程中DNA掉失都会导致PCR扩增失败。采集标本方法不当,未能获得所要检测的靶DNA都会导致出现假阴

聚合酶链反应(PCR)-技术引物的最终评估

当我们经过初次筛选和二次筛选后得到的那对引物便可以用于合成,合成后我们经过 PCR扩增可以对引物进行最终的评估。一是PCR扩增的特异性和效率。经过PCR条件优化后能否获得特异性条带,即无目的条带之外的多余条带。另外,PCR产物的量是否足够,即无不出带和条带很弱的现象。二是以DNA为模板设计引物时,P

实时逆转录聚合酶链反应的简介

  逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而

逆转录聚合酶链反应的操作步骤

1. 总RNA的提取:见相关内容。2. cDNA第一链的合成:试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScript Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试

反转录聚合酶链反应的功能和特点

RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR

何谓实时荧光聚合酶链反应定量检测?

在普通PCR扩增系统中,加入一个与靶基因序列特异互补的双荧光标记探针。5′端标记荧光发射集团,3′端标记荧光淬灭集团,当探针完整时,后者抑制前者而不发光。有靶基因存在时,在PCR复性阶段,探针与靶基因互补,PCR延伸中,由于Taq酶有5′-3′的外切酶活性,引物沿模板延伸至标记探针结合处,将5′端报

逆转录聚合酶链反应所需试剂

1.RMA提取试剂2.第一链cDNA合成试剂盒3.dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM4.Taq DNA聚合酶

聚合酶链反应(PCR)详细实验操作步骤

  一、实验原理  聚合酶链反应(PCR)技术是在体外进行的由引物介导的酶促DNA扩增反应。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四种脱氧核糖核苷酸(dNTP)及适当浓度的Mg2+存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的体外酶促合成反应。两个引物分别位于靶序列两端,同两条模板的3’端互补,由此限定扩增片

革命性传感器PixelSensor在聚合酶链反应-(PCR)-中的应用

概述近几年来,在检验医学和临床领域,point-of-care-testing (POCT) 成为一个比较热门的词汇。它最早出现在美国,意思是在发病或者发生事件的地点进行诊断、监控和治疗,能快速地获得检验结果并及时做出正确的处理。POCT的发展使得紧凑型光学和检测技术的需求不断增

实验室易错操作,正确操作要点

  一、容量瓶:凡要求准确配制一定浓度的溶液时必须使用容量瓶   容量瓶的容量有大有小,均在瓶上标出(如50mL、500mL等)。瓶颈上有一刻度线,表示当液体加到此刻度时就相当于瓶上所标容量。瓶上并标有温度,通常为20℃,表示瓶上所标容量是在20℃时的容量。室温不在20℃时,容量将会有所增减。   

反转录聚合酶链反应(RTPCR)方法中常见的污染问题...

反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法中常见的污染问题及对策反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)是一种体外核酸扩增技术,它具有特异、敏感、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点,能在几个小时内完成从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的目的产物供分析研究和检测鉴定,所以近年来RT-PCR技

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验

实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水

简述基因扩增技术—聚合酶链反应的标本制备

  在将Taq DNA聚合酶引入基因扩增技术—聚合酶链反应反应,并使之达到自动化之后,基因扩增技术—聚合酶链反应反应已变得十分的简单了。但是PCR样品的采集及制备却并非同样简单,而且,许多PCR的失败都归因于标本的制备不当。用于PCR的标本必须经适当处理后才能使用,因为标本中的许多杂质能抑制Taq

实时逆转录聚合酶链反应的操作步骤

  1. 总RNA的提取:见相关内容。  2. cDNA第一链的合成:试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScript Preamplification System for First Strand cDNA Synthes

逆转录聚合酶链反应的注意事项

1. 在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。2. 为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。3. 内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定

反转录聚合酶链反应的操作注意事项

1、合成cDNA的引物:合成cDNA引物时,通常采用随机六核苷酸引物能够有效地指导从RNA有效地合成第一链cDNA:2、避免RNA酶的污染:在合成cDNA第一链时,应使用RNA酶抑制剂,进行RT-PCR时,用于合成cDNA第一链的RNA不会对PCR有影响,因此没有必要用碱或RNA酶处理;3、不同来源

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验

差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod

聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例

聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例1990年Hoshina等首行应用聚合酶链反应(PCR)成功检出胃粘膜活检标本内的Hp。我院从今年1995的1月份开始,在短短3个月中对70例胃镜受检者应用PCR检测幽门螺杆菌,并采用目前广泛使用的快速尿素酶试验作了对比,收到满意效果,报告如下。1 材料和方法1.1 

聚合酶链反应的四种脱氧三磷酸核苷酸介绍

  四种脱氧三磷酸核苷酸(4×dNTPs)  在PCR反体系中dNTP终浓度高于50mmol/L会抑制Taq酶的活性,使用低浓度dNTP可以减少在非靶位置启动和延伸时核苷酸错误掺入,高浓度dNTPs易产生错误掺入,而浓度太低,势必降低反应物的产量。PCR常用的浓度为50~200μmol/L,不能低于

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的影响条件Mg2+的介绍

  Mg2+浓度直接影响着酶的活性与忠实性,这是Taq DNA聚合酶活性所必需的。另外它还影响着引物的退火,模板与基因扩增技术—聚合酶链反应产物的解链温度,产物的特异性,引物二聚体的形成等。Mg2+浓度过低时,酶活力显著降低;过高时,通常会导致非特异性扩增产物的累积。PCR混合物中的DNA模板,引物

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)

实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C

实时逆转录聚合酶链反应的注意事项

  1、在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。  2、为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。  3、内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免R

聚合酶链反应(PCR)-技术引物的二次筛选

引物的二次筛选是指在初次筛选出的几对引物中进一步筛选出适合我们进行特异、高效PCR扩增的那对引物。本步应注意以下两点,一是得到的一系列引物分别在Genebank中进行回检。也就是把每条引物在比对工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) 的blast nr中进行同源

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(二)

##六、从组织或培养细胞提取 RNARNA可以从各种来源的样本包括培养的细胞(例如神经元细胞、肝细胞等)和组织中分离得到(见 注 释 1) 。 mRNA 的 纯 化 对 FRAP-PCR 方法来说并不需要,因为mRNA 仅占细胞总 R N A 的 3 % 〜5 % (13)。因而在本章所描述

聚合酶链反应(PCR)-技术引物的设计以及初步筛选

①引物的长度一般为15-30 bp,最好在18~24 bp,因为太短易形成错配(False priming) 降低特异性,而太长也会降低特异性,并且降低产量 。②引物在模板内最好具有单一性,也就是说在模板内部没有错配。特别是3’端,一定要避免连续4个以上的碱基互补错配。③引物序列的GC 含量最好在4