荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C 。##二、 CDNA 合成1.Superscript™ II, RNase H-反 转 录 酶(200 U/(nL; Invitrogen)。 一 20°C下可稳定忙存两年以上。2.5X 第一链合成缓冲液: 250 mmol/LTris-HCI, pH 8. 3, 375 mmol/L K C l, 15mmol,L MgCl2, 贮存于一 20。。 。3.0. lmmol/L 二硫苏糖醇(DTT),贮存于一 20°C 。4.dNTP 混合物: dNTP 各 1 0 mmol/L ,贮存于一20°C 。5.18 碱 基 的 随 机......阅读全文
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(二)
##六、从组织或培养细胞提取 RNARNA可以从各种来源的样本包括培养的细胞(例如神经元细胞、肝细胞等)和组织中分离得到(见 注 释 1) 。 mRNA 的 纯 化 对 FRAP-PCR 方法来说并不需要,因为mRNA 仅占细胞总 R N A 的 3 % 〜5 % (13)。因而在本章所描述
聚合酶链反应的引物设计原则
PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+
随机聚合酶链反应的原理和应用特点
中文名称随机聚合酶链反应英文名称random PCR定 义采用许多序列不相同的(部分随机或全部随机序列)、短的(约10个核苷酸)引物所进行的聚合酶链反应。由于在模板DNA多个不同位置上扩增,所形成的产物长度各异,电泳图谱独特,可用于识别核酸的多态性、研究基因组的物理图谱及分析生物的进化等。应用学科
影响聚合酶链反应的引物设计相关介绍
要扩增模板DNA,首先要设计两条寡核苷酸引物,所谓引物,实际上就是两段与待扩增靶DNA序列互补的寡核苷酸片段,两引物间距离决定扩增片段的长度,两引物的5’端决定扩增产物的两个5’末端位置。由此可见,引物是决定PCR扩增片段长度、位置和结果的关键,引物设计也就更为重要。 引物设计的必要条件是与引
聚合酶链反应(PCR)-技术引物的最终评估
当我们经过初次筛选和二次筛选后得到的那对引物便可以用于合成,合成后我们经过 PCR扩增可以对引物进行最终的评估。一是PCR扩增的特异性和效率。经过PCR条件优化后能否获得特异性条带,即无目的条带之外的多余条带。另外,PCR产物的量是否足够,即无不出带和条带很弱的现象。二是以DNA为模板设计引物时,P
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的引物介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应结果的特异性取决于引物的特异性,扩增产物的大小也是由特异引物限定的。因此,引物的设计与合成对PCR的成功与否起着决定性的作用。合成的引物必须经聚丙烯酰胺凝胶电泳或反向高压液相层析(HPLC)纯化。因为合成的引物中会有相当数量的“错误序列”,其中包括不完整的序列和脱嘌呤产
聚合酶链反应(PCR)-技术引物设计的注意事项
扩增已知基因时经过初次筛选和二次筛选后得到的引物基本上能够满足要求,但是当运用比较基因组学分离新基因时,设计引物还应注意以下两点:① 模板的选择。如果以DNA为模板设计引物, 首先在Genebank中找到与待分离新基因同源的其它物种的该基因。利用工具把已检索到的基因进行同源性比较,根据比较基因组定位
聚合酶链反应(PCR)-技术引物的设计以及初步筛选
①引物的长度一般为15-30 bp,最好在18~24 bp,因为太短易形成错配(False priming) 降低特异性,而太长也会降低特异性,并且降低产量 。②引物在模板内最好具有单一性,也就是说在模板内部没有错配。特别是3’端,一定要避免连续4个以上的碱基互补错配。③引物序列的GC 含量最好在4
聚合酶链反应(PCR)-技术引物的二次筛选
引物的二次筛选是指在初次筛选出的几对引物中进一步筛选出适合我们进行特异、高效PCR扩增的那对引物。本步应注意以下两点,一是得到的一系列引物分别在Genebank中进行回检。也就是把每条引物在比对工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) 的blast nr中进行同源
关于聚合酶链反应引物的量和TaqDNA聚合酶的量的介绍
(一)引物的量 引物在PCR反应中的浓度一般在0.1~1μmol/L之间。浓度过高易形成引物二聚体且产生非特异性产物。一般来说用低浓度引物经济、特异,但浓度过低,不足以完成30个循环的扩增反应,则会降低PCR的产率。 (二)TaqDNA聚合酶的量 典型PCR反应混合物中,所用酶浓度为2.5
随机引物法
此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983,1984)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理此法系可用于从低熔点琼脂糖凝胶中回收 DNA 的放射性标记 ( Feinberg 和 Vogelstein 1
逆转录聚合酶链反应的合成cDNA引物的选择
1. 随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。通常用此引物合成的cDNA中96%来源于rRNA。
何谓实时荧光聚合酶链反应定量检测?
在普通PCR扩增系统中,加入一个与靶基因序列特异互补的双荧光标记探针。5′端标记荧光发射集团,3′端标记荧光淬灭集团,当探针完整时,后者抑制前者而不发光。有靶基因存在时,在PCR复性阶段,探针与靶基因互补,PCR延伸中,由于Taq酶有5′-3′的外切酶活性,引物沿模板延伸至标记探针结合处,将5′端报
通用引物和随机引物是一个意思吗
不是一回事。随机引物:我们在不知道研究目标任何信息情况下,利用合成好了的任意序列的引物(可以买得到),可能扩增出来的产物条带数目不定;随机引物可能会在全基因组范围内有结合位点。通用引物:一般是指某基因外围保守序列。虽然这个基因可能是序列多变的,(如同功酶),但两侧翼序列则是保守的。利用俩侧翼保守序列
随机RNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形成发夹、假结、凸环、G-四聚体等多种空间结 构,它
随机RNA文库的SELEX筛选实验
随机RNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的
随机RNA文库的SELEX筛选实验
实验方法原理 SELEX 技术是一种利用随机寡核苷酸(DNA 或 RNA)文库筛选靶分子的特异性配基的组合化学技术。最常用的是随机 RNA 文库,因为 RNA 分子中除 G-C、A-U 碱基对以外,还有 G-U 等变偶碱基对的存在,可以形
快速了解反转录引物随机引物
随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一非特异的引物来拷贝全长mRNA。 1.特异性引物一般在增低丰度目的基因才选择使用,用得比较少。一般都推荐用Oligo(dT)或随机引物代替基因特异性引物。由于rna的二级结构破坏不完全,导致特异性
逆转录聚合酶链反应(RTPCR,rtpcr)
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)可以:(1)分析基因的转录产物;(2)获取目的基因;(3)合成cDNA探针;(4)构建RNA高效转录系统。实验方法原理逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Tran
mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(1)
1.概 述mRNA差异显示技术(mRNA differetial display)是一种快速有效的克隆差异性表达基因的方法。 方法建立:1992年 Liang P和Pardee首次应用DD技术对比人类乳腺癌细胞与正常细胞所表达的mRNA,以此来克隆癌细胞所特有的基因 目前已应用于个各领域:
随机引物法标记-DNA
实验方法原理 利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样
随机引物法标记-DNA
利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样的频率掺入产物。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法
随机引物法标记-DNA
实验方法原理 利用寡核苷酸作引物,DNA 聚合酶可沿单链模板起始 DNA 的合成(Gotilian 1969)。如果寡核苷酸的序列不均一,它们就可在模板的多位点上与模板杂交。因此模板上每一核苷酸(5' 端的核苷酸除外)的互补物将以同样的频率掺入产物。实验材料 大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ Kl
随机引物法标记探针
实验概要本实验探针标记采用TAKARA公司的随机引物标记试剂盒Ver.2。实验步骤1.于1.5ml离心管中加入5μl H2O,2μl引物(N6),5μl DNA(0.1μg-1μg)。2.充分混匀,98°C 3分钟。3.离心1秒钟,将离心管盖上的汽化水甩下。4.加入2.5μl dNTPs(各2.5m
随机引物的概念和用途
随机引物是指当特定mRNA由于含有使逆转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中所需要的特异性通常用此引物合成的cDNA。
随机引物和oligodt的区别
一般来讲,在做反转录时选用引物Oligo dt与选用随机引物Random 9mers是有差别的:1、Random 9mers : 适用于具有HAIRPIN构造的所有RNA(rRNA、mRNA及tRNA)的反转录反应。并且合成的cDNA,任何特异型Primer Pair都可以用于PCR反应。2、Oli
聚合酶链反应(PCR)详细实验操作步骤
一、实验原理 聚合酶链反应(PCR)技术是在体外进行的由引物介导的酶促DNA扩增反应。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四种脱氧核糖核苷酸(dNTP)及适当浓度的Mg2+存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的体外酶促合成反应。两个引物分别位于靶序列两端,同两条模板的3’端互补,由此限定扩增片