新算法让监控复杂系统变简单
在一个复杂系统中,如包含了2万个互相联系的基因的人类基因组,要想一次监控整个系统几乎是不可能的。据物理学家组织网近日报道,来自美国东北大学、麻省理工大学等单位的研究人员开发出一种新算法,能识别出复杂系统的子单位或必要结点,使监控大型复杂系统成为可能。相关论文发表在最近出版的美国《国家科学院学报》上。 复杂系统如生物基因组、生化反应系统、社会网络等,由许多互相关联的子部分组成,其中任何一个部分有了变化,都会对其余部分造成影响。因此要分析监控一个复杂系统是极为困难的。“复杂系统的本质是连接,各组成部分之间要凭借这些连接,才能将信息分布到整个网络。因此我们不必监控每个部分,也能从整体上把握整个系统。”论文作者之一、东北大学生物学院和计算机与信息科学院物理学教授艾伯特-拉斯洛·巴拉巴斯说,他们设计的方法利用了复杂系统子单位间相互依赖的特性,可超越数量限制观察系统的整体情况。 利用这种新算法,研究小......阅读全文
生物荧光标记法是什么
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操作简
生物荧光标记法是什么
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操作简
抗体的生物素化标记
本法可使抗体或其它蛋白质的ε-氨基通过手臂与酰化的生物素共价结合。其后,生物素化的分子可应用酶标-亲和素或荧光染料-链霉亲和素复合物来检测。小分子的水溶性生物素对细菌蛋白链霉亲和素具有高度亲和力是本法的设计基础。 NHSB:N-羟基琥珀酰亚胺生物素(有商品供应) 0.1 mol/L 碳酸氢钠缓冲液
生物素亲和素标记缺点
灵敏度生物素容易与蛋白质和核酸类等生物大分子结合,形成的生物素衍生物,不仅保持了大分子物质的原有生物活性,而且比恬度高,具多价性。此外,每个亲和素分子有四个生物素结合部位,可同时以多价形式结合生物素化的大分子衍生物和标记物。因此,BAS具有多级放大作用,使其在应用时可极大地提高检测方法的灵敏度。特异
抗体的生物素化标记
本法可使抗体或其它蛋白质的ε-氨基通过手臂与酰化的生物素共价结合。其后,生物素化的分子可应用酶标-亲和素或荧光染料-链霉亲和素复合物来检测。小分子的水溶性生物素对细菌蛋白链霉亲和素具有高度亲和力是本法的设计基础。NHSB:N-羟基琥珀酰亚胺生物素(有商品供应)0.1 mol/L 碳酸氢钠缓冲液,pH
概述肿瘤生物标记物的作用
肿瘤生物标记物的作用贯串整个肿瘤诊疗过程,从肿瘤风险预测、诊断到治疗方案选择和疗效预测都离不开它。更重要的是,肿瘤生物标记物的发现和应用,使得靶向治疗和免疫治疗成为可能并有效改善疗效。 (1) 肿瘤风险预测 目前已经发现一些可用于预测肿瘤高危的生物标记物,例如BRCA1/2基因突变阳性的患者
生物学中标记的概念
为鉴定和检测目的将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价连接到另一种化合物上,通过被标记化合物与待检测物之间的特异性反应形成多元复合物,经与未结合的标记物分离后,即可用较简易的方法鉴定和检测待检测物。
生物荧光标记法是什么
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操作简
美国开发高效法医指纹识别技术新算法
在美国,涉及指纹证据的第一大案是1911年芝加哥的托马斯·詹宁斯谋杀案,因其在犯罪现场留下的指纹而被定罪。在后来的近乎一个世纪里,指纹同时被法庭和公众认为是一个可靠识别方法,然而,最近的研究表明,指纹检查也可能导致错误的结果。如2009年美国科学院的研究报告表明,即使是经验丰富的探员在后来重复检
新AI算法“望舌诊病”成功率达98%
科技日报北京8月15日电 (记者刘霞)“望舌诊病”是最具中医特色的诊断方法之一,已有2000多年历史。在一项最新研究中,该方法获得了人工智能(AI)技术的加持。土耳其和澳大利亚研究人员成功开发出一种新型成像系统,其算法可通过分析患者舌头的颜色,预测他们所患疾病,成功率高达98%。相关论文发表于新一期
新算法为组织发育和疾病研究提供重要支撑
近日,西南华大生命科学研究院科研团队成功开发了推断细胞时空分化轨迹的新算法SpaTrack,该算法可充分整合细胞的转录组和空间信息,构建细胞分化的动态轨迹,为揭示组织发育、器官再生和疾病进展的动态研究提供了有效的方法支持与重要见解。相关成果在线发表于Cell旗下子刊《细胞系统》。空间坐标和取样时间可
新AI算法“望舌诊病”成功率达98%
“望舌诊病”是最具中医特色的诊断方法之一,已有2000多年历史。在一项最新研究中,该方法获得了人工智能(AI)技术的加持。土耳其和澳大利亚研究人员成功开发出一种新型成像系统,其算法可通过分析患者舌头的颜色,预测他们所患疾病,成功率高达98%。相关论文发表于新一期《技术》杂志。研究人员使用5260张图
我国科学家提出DNA数字存储纠错新算法
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA数字存储纠错新算法,成功突破了冗余对纠错能力的限制,将大幅提升DNA存储纠错能力。相关研究成果发表在《国家科学评论》(National Science Review)上。 DNA数字存储以其存储密度高、存储寿命
研究团队开发糖结合位点预测精准新算法
6月17日,中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作,通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite,精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置,有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。 糖类不仅为生物体提供能
新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测
海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域
中科院声学所发现新的频率追踪算法
近期,中国科学院声学研究所噪声与振动重点实验室研究员杨军、孙红灵领导的有源降噪团队提出一种新的基于并型陷波器的多频估计算法,该算法复杂度低、估计结果准确,可以有效地追踪多个变化的噪声频率。相关研究成果已在线发表于国际学术期刊《信号处理》。 噪声通常指不需要的声音,它对人类身心均会构成损害。常规
异交植物基因高效定位新算法工具开发成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519329.shtm近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队联合马铃薯遗传育种与栽培创新团队,通过解析异交(异花授粉)植物杂交1代分离群体的遗传特点,开发了一套新算法工具OcBSA,该工
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在美国,涉及指纹证据的第一大案是1911年芝加哥的托马斯•詹宁斯谋杀案,因其在犯罪现场留下的指纹而被定罪。在后来的近乎一个世纪里,指纹同时被法庭和公众认为是一个可靠识别方法,然而,最近的研究表明,指纹检查也可能导致错误的结果。如2009年美国科学院的研究报告表明,即使是经验丰富的探员在后来重复检
新算法将更好组装DNA序列-检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中,来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配,而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。 这种新方法依赖于一种新算法,其可以非常敏感地检测DNA序列的特异
研究团队开发糖结合位点预测精准新算法
6月17日,中国科学院上海药物研究所研究员程曦、文留青等与临港实验室青年研究员王鼎言合作,通过开发基于深度学习模型的糖结合位点预测算法DeepGlycanSite,精准预测了蛋白质结构上的糖类结合位置,有助于解决糖类与蛋白质相互作用的难题。相关研究发表于《自然—通讯》。糖类不仅为生物体提供能量供应和
Science:新算法有望加快艾滋病疫苗研发
美国研究人员9日在学术期刊《科学》上报告说,他们开发出一种新计算方法,可以更快地发现抵御艾滋病病毒的强力抗体,这一成果有望加快艾滋病疫苗研发。 开发艾滋病疫苗是全球面临的重要任务和挑战。尽管艾滋病病毒已发现30多年,但由于其多变和多样性,迄今还没有一种针对该病的疫苗能离开实验室并大量应用。
新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测
海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国
抑制瞬时射频干扰新算法助力脉冲星观测
脉冲星是一种周期性发射微弱脉冲信号的中子星,长期以来都是天文和物理的前沿研究领域,涉及引力波探测、精确验证广义相对论、限制极端物理条件下的物态方程、高精度时空基准建立等重要问题。但随着近及时年来通讯及数字技术快速发展,人为的射频信号对来自遥远深空的天文信号造成严重干扰,导致射电天文“干净”的观测
刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法
高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz
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心血管疾病风险评估新算法再引争议
美国心脏病学会(ACC)和美国心脏协会(AHA)发布《2013ACC/AHA心血管疾病评估指南》。2013美国心脏协会科学会议(AHA2013)上提出的评估动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)10年风险的新算法遭到质疑,两位研究人员认为可能存在缺陷。 美国波士顿Brigham妇女医院的Pau
微核破坏:癌症诊断新标记物
癌症科学家们知道微核(micronuclei)已有一段时间。这些额外的核结构游离于主核之外,大小约在主核的1/3以下。是由细胞分裂后没有纳入到子细胞中去的染色体片段或整个染色体构成。其与某些特殊的癌症类型相关,预示着预后不良。 在发表在7月3日《细胞》(Cell)杂志上的一项新研究中,来自
2016值得关注的技术:新蛋白标记
今年第一期《Nature Methods》评出了2015的年度技术——单颗粒冷冻电镜(cryo-EM)。除此之外,该杂志还对一些热门技术进行了一番展望,包括细胞内蛋白标记、精准光遗传学、高度多重成像、亚细胞图谱分析等等。 荧光化学染料相对较小,具有很好的光物理性质和光谱跨度。这些特性使荧光染料
动物所发现肺癌精准治疗新标记
发现基因及其编码蛋白质的异常是癌症精准治疗的基础。局部黏着斑激酶(focal adhesion kinase, FAK)是一种重要的非受体型酪氨酸激酶,在几乎所有的细胞中均有表达,可将细胞外的重要信号(如细胞生长、营养等)向细胞内传导,调控细胞的基本生物学功能。FAK在肺癌等肿瘤中表达增高并与病
注水算法
迭代注水算法是由Wei Yu提出的,它是一种多用户功率分配算法。这是一种自私算法,当接收端和发送端没有共享信道信息时,它的实现非常简单,复杂度低。但是,当信道上有共享信 息,需要共享信道,这是网络拓扑就会出现远近效应,这就产生了非平衡状态,引起用户间信号干扰,信息传输效率下降。 迭代注水